HLA-B39


HLA-B (альфа)-β2MG со связанным пептидом
главный комплекс гистосовместимости (человек), класс I, B39
Аллели	Б*3901, 3902, 3903, . .
Структура (см. HLA-B )
Общие данные
Локус	хр.6 6п21.31

HLA-B39 (B39) представляет собой HLA - B серотип . Серотип идентифицирует более распространенные продукты гена HLA-B*39. ^{[ 1 ]}

B39 представляет собой расщепленный антиген широкого антигена B16 и является сестринским типом B38 . B39 чаще всего встречается в западной части Тихоокеанского региона, в Японии и наиболее часто встречается в Новом Свете. В Европе встречается в Скандинавии и Северной России.

Серотип

Распознавание серотипов B39, B16 и B38
Продукты гена HLA B*39 ^{[ 2 ]}
Б*39	Б39	Б16	Б38	Образец
аллель	%	%	%	размер (Н)
*3901	95			476
*3902	87			96
*3903	77			20
*3905	82			245
*3906	94			508
*3908	48			57
*3909	97			13
*3910	82			127
*3911	69			16
Связь аллелей с базой данных IMGT / HLA в EBI

Серология наиболее распространенных аллелей B39, B*3901 и B*3906, хорошая, но некоторые аллельные продукты выявляются недостаточно хорошо. Учитывая дифференциальное участие этих аллелей в тестировании заболеваний, необходимо использовать типирование с высоким разрешением.

**Частоты HLA B*3906**
		частота
исх.	Население	(%)
^{[ 3 ]}	Венесуэла Гора Перья Бари	23.9
	Мексика Микстек Оахака	8.8
	США Аризона Пима	7.3
	Выходцы из Латинской Америки Южного Техаса США	5.6
	Мексика Заптотек Оахака	4.5
	Нью-Мексико Канонсито Навахо	3.7
	Мой собственный	2.5
	PNG Ванигела	2.3
	Тунис Тунис	2.3
	Коренные жители Северной Америки	1.9
	США латиноамериканцы	1.7
	Бразилия Белу-Оризонти	1.6
	Южная Дакота Лакота Сиу	1.5
	Кубинский белый	1.4
	Азорские острова С. Мария и С. Мигель	1.3
	Австралия Новый Южный Уэльс	1.1
	Финляндия	1.1
	Португалия Север	1.1
	Португальский центр	1.0
	Испания Восточная Андалусия Gipsy	1.0
	Бразилия Рельеф	0.9
	Ирландия Северная	0.9
	Азорские острова Терсейра	0.8
	США Кавказская поп2	0.8
	Бразилия	0.7
	США Филадельфия Кавказс	0.7
	Индия Андхра-Прадеш Голла	0.5
	Таиланд	0.4

Аллели

**Частоты HLA B*3901**
		частота
исх.	Население	(%)
^{[ 3 ]}	Тайвань Сайсиат	54.9
^{[ 3 ]}	Тайвань Цоу	24.5
^{[ 3 ]}	Южная Дакота Лакота Сиу	22.5
^{[ 3 ]}	Тайвань Тароко	21.8
^{[ 3 ]}	Тайвань Атаял	19.8
^{[ 3 ]}	PNG Ванигела	16.7
^{[ 3 ]}	Япония Айны Хоккайдо	16.0
^{[ 3 ]}	Тайвань Это	14.9
^{[ 3 ]}	Нью-Мексико Канонсито Навахо	14.6
^{[ 3 ]}	Тайвань Тао	13.3
^{[ 3 ]}	Тайвань Рукай	13.0
^{[ 3 ]}	Тайвань Ами	10.2
^{[ 3 ]}	США Гавайи Окинава	7.7
^{[ 3 ]}	Папуа-Новая Гвинея Восера	7.0
^{[ 3 ]}	Папуа-Новая Гвинея Маданг	6.4
^{[ 3 ]}	Мексика Микстек Оахака	5.9
^{[ 3 ]}	Тайвань Пуюма	5.0
^{[ 3 ]}	Покинуть Тайвань	4.9
^{[ 3 ]}	Новая Каледония	4.8
^{[ 3 ]}	Центральная Япония	4.4
^{[ 3 ]}	Американское Самоа	4.0
^{[ 3 ]}	США Коренные жители Северной Америки	4.0
^{[ 3 ]}	Тайваньский хакка	3.6
^{[ 3 ]}	негодование Австралийский полуостров Кейп-Йорк	3.5
^{[ 3 ]}	Япония (5)	3.5
^{[ 3 ]}	Филиппины Иватан	3.0
^{[ 3 ]}	Бразилия	2.9
^{[ 3 ]}	Китай Гуанси Маонань	2.8
^{[ 3 ]}	Грузия Тбилиси Грузины	2.8
^{[ 3 ]}	Китай Юньнань Ну	2.6
^{[ 3 ]}	Таиланд	2.5
^{[ 3 ]}	Азорские острова Терсейра	2.4
^{[ 3 ]}	Сингапурский китайский	2.4
^{[ 3 ]}	румынский	2.3
^{[ 3 ]}	Китай Юньнань Возврат	2.2
^{[ 3 ]}	Индиг. Австралийский юэндуму	2.1
^{[ 3 ]}	Китай Гуанчжоу	2.0
^{[ 3 ]}	Хорватия	2.0
^{[ 3 ]}	Юго-Восток Франции	1.9
^{[ 3 ]}	Грузия Сванетия Сваны	1.9
^{[ 3 ]}	PNG Плато Каримуи	1.9
^{[ 3 ]}	Центральные Азорские острова	1.8
^{[ 3 ]}	Испания Восточная Андалусия	1.8
^{[ 3 ]}	Уганда Кампала	1.6
^{[ 3 ]}	Мексика Заптотек Оахака	1.5
^{[ 3 ]}	Сингапур Тайский	1.5
^{[ 3 ]}	Китай Гуанчжоу Хань	1.4
^{[ 3 ]}	Китай Цинхай Хуэй	1.4
^{[ 3 ]}	Чешская Республика	1.4
^{[ 3 ]}	Древесина	1.4
^{[ 3 ]}	Индиг. Австралийская Кимберли	1.3
^{[ 3 ]}	Финляндия	1.1

Болезнь

Предполагается, что B39 является фактором артериита Такаясу и камней в желчном пузыре в Мексике. ^{[ 4 ]} -суставные осложнения Костно бруцеллез , по-видимому, связан с B39. ^{[ 5 ]} Ассоциация со спондилоартропатиями ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} и псориатический артрит ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} наблюдалось в нескольких исследованиях. Псориатический артрит , по-видимому, связан с MICA -A9, который тесно связан с HLA-B39. ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} B39 также, по-видимому, участвует в синдрома Фишера варианте и синдрома Гийена-Барре . ^{[ 12 ]}

B39, по-видимому, защищает от кардиомиопатии при болезни Чаги, что указывает на возможный селективный фактор ее распространения в Новом Свете. ^{[ 13 ]} Болезнь чаги вызывается трипаносомой , переносимой кровососущими насекомыми, обитающими в тропических регионах, где растут пальмы.

Южная Калифорния теперь сообщает о случаях болезни Чаги в результате зараженных переливаний крови и, возможно, уже является средой обитания для переносчика. ^{[ 14 ]}

При артериите Такаясу

Артериит Такаясу , по-видимому, связан с B39. ^{[ 15 ]}^{[ 16 ]} Связь с B*3902 увеличивает риск инфаркта легких , ишемической болезни сердца , аортальной регургитации , системной гипертензии , стеноза почечной артерии , цереброваскулярных заболеваний и нарушений зрения. ^{[ 17 ]} B*3906, распространенный у коренных жителей Мезоамерики, связан с тем же заболеванием. ^{[ 18 ]}

**Частоты HLA B*3902**
Б*3903
		частота
исх.	Население	(%)
^{[ 3 ]}	Мексика Миксе Оахака	38.7
	Мексика Заптотек Оахака	13.4
	Мексика Микстек Оахака	5.9
	Мексика Метисы	1.2
	Япония поп5	0.9
	Кубинский белый	0.7
	Исраэль Ашк. и Нон Ашк. евреи	0.5
	Центральная Япония	0.5
	Сенегал Ниохоло Манденка	0.5
	PNG Новая Британия Рабаул	13.2
	Бразилия Рельеф	11.2
	Аргентина Тоба Росарио	5.2
	Бразилия	0.7
	Финляндия	0.6
	Кения Луо	0.6
	Коренные жители Северной Америки	0.5
Б*3904
	Аргентина Тоба Росарио	1.2
	Грузия Сванетия Сваны	0.6
	Джордан Амман	0.3
	Шицзячжуан Тяньцзянь Хань	0.1
	Центральная Япония	0.1
	румынский	0.1
Б*3905
	Венесуэла Перри Юкпа	36.1
	Мексика Заптотек Оахака	12.7
	Мексика Микстек Оахака	9.8
	Мексика Метисы	4.9
	Аризона Пима	4.5
	Мексика Гвадалахара Метисы	2.4
	Аргентина Тоба Росарио	2.3
	США латиноамериканцы	2.1
	Мексика Миксе Оахака	1.9
	Кубинский белый	1.4
	Мексика Чихуахуа Тараумара	1.1
	США Коренные жители Северной Америки	0.5
	Шицзячжуан Тяньцзянь Хань	0.2
Б*3907
	Шицзячжуан Тяньцзянь Хань	0.6
	Сингапур Тайский	0.5
	Китай Южная Хань	0.2
Б*3908
	Мексика Заптотек Оахака	2.2
	Мексика Метисы	1.2
	Мексика Микстек Оахака	1.0
	Бразилия	0.7
	США латиноамериканцы	0.6
Б*3909
	Венесуэла Перри Юкпа	34.9
	Таиланд поп3	3.1
	Бразилия Рельеф	1.7
	Китай Южная Хань	1.4
	Аргентина Тоба Росарио	1.2
	Китай Цинхай Хуэй	0.9
Б*3910
	Суданский	2.5
	Сенегал Ниохоло Манденка	2.1
	Южноафриканский Натал Зулу	1.5
	Камерун Бети	1.4
	Испания Восточная Андалусия	1.2
	Кения Луо	1.1
	Израильские арабские друзы	1.0
	Кения Нанди	1.0
	Гвинея-Бисау	0.8
	Кения	0.7
	Мали Бандиагара	0.7
	Марокко Надор Металса Класс I	0.7
	Камерун Бамилеке	0.6
	Камерун Яунде	0.5
	Исраэль Ашк. и Нон Ашк. евреи	0.5
	Саудовская Аравия Гураят и Хайль	0.5

Ссылки

^ Марш, СГ; Альберт, Эд; Бодмер, ВФ; Бонтроп, RE; Дюпон, Б.; Эрлих, HA; Фернандес-Винья, М.; Джерати, Делавэр; Холдсворт, Р.; Херли, СК; Лау, М.; Ли, КВ; Мах, Б.; Майерс, М.; Майр, WR; Мюллер, ЧР; Пархэм, П.; Петерсдорф, EW; Сасадзуки, Т.; Строминджер, Дж. Л.; Свейгаард, А.; Терасаки, ИП; Тирси, Дж. М.; Троусдейл, Дж. (2010). «Номенклатура факторов системы HLA , Тканевые антигены . 75 (4): 291–455. дои : 10.1111/j.1399-0039.2010.01466.x . ПМЦ 2848993 . ПМИД 20356336 .
^ получено из IMGT/HLA
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также ^и ^аль ^{являюсь} ^а ^к ^ап ^ак ^с ^как ^в ^В ^из ^хорошо ^топор ^{является} ^тот ^нет ^бб Миддлтон Д., Менчака Л., Руд Х., Комерофски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей» . Тканевые антигены . 61 (5): 403–7. дои : 10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x . ПМИД 12753660 .
^ Мендес-Санчес Н., Кинг-Мартинес АС, Рамос М.Х., Пичардо-Бахена Р., Урибе М. (ноябрь 2004 г.). «Гены индейцев в мексиканском населении связаны с развитием желчнокаменной болезни». Являюсь. Дж. Гастроэнтерол . 99 (11): 2166–70. ПМИД 15554998 .
^ Браво М.Дж., Кольменеро Жде Д., Алонсо А., Кабальеро А. (май 2003 г.). «Аллель HLA-B*39 придает предрасположенность к костно-суставным осложнениям при бруцеллезе человека». Дж. Ревматол . 30 (5): 1051–3. ПМИД 12734905 .
^ Собао Ю, Цучия Н, Такигучи М, Токунага К (январь 1999 г.). «Перекрывающиеся особенности связывания пептидов HLA-B27 и B39: доказательства роли пептидного супермотива в патогенезе спондилоартропатий» . Ревмирующий артрит . 42 (1): 175–81. doi : 10.1002/1529-0131(199901)42:1<175::AID-ANR21>3.0.CO;2-7 . ПМИД 9920028 .
^ Альварес I, Лопес де Кастро Х.А. (июль 2000 г.). «HLA-B27 и иммуногенетика спондилоартропатий». Курр Опин Ревматол . 12 (4): 248–53. дои : 10.1097/00002281-200007000-00003 . ПМИД 10910175 .
^ Истмонд CJ (май 1994 г.). «Псориатический артрит. Генетика и антигены HLA». Клиническая ревматология Байера . 8 (2): 263–76. дои : 10.1016/S0950-3579(94)80018-9 . ПМИД 8076387 .
^ Гладман Д.Д., Прощай, VT (июнь 1995 г.). «Роль антигенов HLA как индикаторов прогрессирования заболевания при псориатическом артрите. Многомерная модель относительного риска» . Ревмирующий артрит . 38 (6): 845–50. дои : 10.1002/арт.1780380619 . ПМИД 7779129 .
^ Болоньези Э., Дальфонсо С., Роландо В., Фазано М.Е., Пратико Л., Момильяно-Ричарди П. (октябрь 2001 г.). «Микросателлитные аллели MICA и MICB в расширенных гаплотипах HLA». Евро. Дж. Иммуногенет . 28 (5): 523–30. дои : 10.1046/j.0960-7420.2001.00250.x . ПМИД 11881819 .
^ Гонсалес С., Мартинес-Борра Х., Лопес-Васкес А., Гарсиа-Фернандес С., Торре-Алонсо Х.К., Лопес-Ларреа С. (май 2002 г.). «MICA, а не MICB, TNFA или HLA-DRB1, связана с предрасположенностью к псориатическому артриту» . Дж. Ревматол . 29 (5): 973–8. ПМИД 12022360 . Архивировано из оригинала 4 декабря 2008 г. Проверено 3 августа 2008 г.
^ Юки Н., Сато С., Цудзи С., Огава К., Миятаке Т. (июнь 1993 г.). «Человеческие лейкоцитарные антигены при синдроме Фишера». Энн. Нейрол . 33 (6): 655–7. дои : 10.1002/ana.410330617 . ПМИД 8498847 .
^ Крус-Роблес Д., Рейес П.А., Монтеон-Падилья В.М., Ортис-Муньис А.Р., Варгас-Аларкон Г. (январь 2004 г.). «Гены MHC класса I и II у мексиканских пациентов с болезнью Шагаса». Хм. Иммунол . 65 (1): 60–5. дои : 10.1016/j.humimm.2003.10.008 . ПМИД 14700597 .
^ «Болезнь Шагаса представляет собой новый вызов безопасности поставок крови» .
^ Кимура А., Китамура Х., Дате Ю., Нумано Ф. (август 1996 г.). «Комплексный анализ генов HLA при артериите Такаясу в Японии». Межд. Дж. Кардиол . 54 Приложение: С61–9. дои : 10.1016/s0167-5273(96)88774-2 . ПМИД 9119528 .
^ Ёсида М., Кимура А., Кацураги К., Нумано Ф., Сасадзуки Т. (август 1993 г.). «ДНК-типирование гена HLA-B при артериите Такаясу» Тканевые антигены . 42 (2): 87–90. дои : 10.1111/j.1399-0039.1993.tb02242.x . ПМИД 7903491 .
^ Китамура Х, Кобаяши Ю, Кимура А, Нумано Ф (октябрь 1998 г.). «Ассоциация клинических проявлений с аллелями HLA-B при артериите Такаясу». Межд. Дж. Кардиол . 66 Приложение 1: S121–6. дои : 10.1016/S0167-5273(98)00159-4 . ПМИД 9951811 .
^ Родригес-Рейна Т.С., Суньига-Рамос Х., Сальгадо Н. и др. (октябрь 1998 г.). «Последовательности интрона 2 и экзона 3 могут быть вовлечены в предрасположенность к развитию артериита Такаясу». Межд. Дж. Кардиол . 66 Приложение 1: S135–8, обсуждение S139. дои : 10.1016/S0167-5273(98)00161-2 . ПМИД 9951813 .

[pmid15787720-1] Марш, СГ; Альберт, Эд; Бодмер, ВФ; Бонтроп, RE; Дюпон, Б.; Эрлих, HA; Фернандес-Винья, М.; Джерати, Делавэр; Холдсворт, Р.; Херли, СК; Лау, М.; Ли, КВ; Мах, Б.; Майерс, М.; Майр, WR; Мюллер, ЧР; Пархэм, П.; Петерсдорф, EW; Сасадзуки, Т.; Строминджер, Дж. Л.; Свейгаард, А.; Терасаки, ИП; Тирси, Дж. М.; Троусдейл, Дж. (2010). «Номенклатура факторов системы HLA , Тканевые антигены . 75 (4): 291–455. дои : 10.1111/j.1399-0039.2010.01466.x . ПМЦ 2848993 . ПМИД 20356336 .

[2] получено из IMGT/HLA

[pmid12753660-3] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также ^и ^аль ^{являюсь} ^а ^к ^ап ^ак ^с ^как ^в ^В ^из ^хорошо ^топор ^{является} ^тот ^нет ^бб Миддлтон Д., Менчака Л., Руд Х., Комерофски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей» . Тканевые антигены . 61 (5): 403–7. дои : 10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x . ПМИД 12753660 .

[pmid15554998-4] Мендес-Санчес Н., Кинг-Мартинес АС, Рамос М.Х., Пичардо-Бахена Р., Урибе М. (ноябрь 2004 г.). «Гены индейцев в мексиканском населении связаны с развитием желчнокаменной болезни». Являюсь. Дж. Гастроэнтерол . 99 (11): 2166–70. ПМИД 15554998 .

[pmid12734905-5] Браво М.Дж., Кольменеро Жде Д., Алонсо А., Кабальеро А. (май 2003 г.). «Аллель HLA-B*39 придает предрасположенность к костно-суставным осложнениям при бруцеллезе человека». Дж. Ревматол . 30 (5): 1051–3. ПМИД 12734905 .

[pmid9920028-6] Собао Ю, Цучия Н, Такигучи М, Токунага К (январь 1999 г.). «Перекрывающиеся особенности связывания пептидов HLA-B27 и B39: доказательства роли пептидного супермотива в патогенезе спондилоартропатий» . Ревмирующий артрит . 42 (1): 175–81. doi : 10.1002/1529-0131(199901)42:1<175::AID-ANR21>3.0.CO;2-7 . ПМИД 9920028 .

[pmid10910175-7] Альварес I, Лопес де Кастро Х.А. (июль 2000 г.). «HLA-B27 и иммуногенетика спондилоартропатий». Курр Опин Ревматол . 12 (4): 248–53. дои : 10.1097/00002281-200007000-00003 . ПМИД 10910175 .

[pmid8076387-8] Истмонд CJ (май 1994 г.). «Псориатический артрит. Генетика и антигены HLA». Клиническая ревматология Байера . 8 (2): 263–76. дои : 10.1016/S0950-3579(94)80018-9 . ПМИД 8076387 .

[pmid7779129-9] Гладман Д.Д., Прощай, VT (июнь 1995 г.). «Роль антигенов HLA как индикаторов прогрессирования заболевания при псориатическом артрите. Многомерная модель относительного риска» . Ревмирующий артрит . 38 (6): 845–50. дои : 10.1002/арт.1780380619 . ПМИД 7779129 .

[pmid11881819-10] Болоньези Э., Дальфонсо С., Роландо В., Фазано М.Е., Пратико Л., Момильяно-Ричарди П. (октябрь 2001 г.). «Микросателлитные аллели MICA и MICB в расширенных гаплотипах HLA». Евро. Дж. Иммуногенет . 28 (5): 523–30. дои : 10.1046/j.0960-7420.2001.00250.x . ПМИД 11881819 .

[pmid12022360-11] Гонсалес С., Мартинес-Борра Х., Лопес-Васкес А., Гарсиа-Фернандес С., Торре-Алонсо Х.К., Лопес-Ларреа С. (май 2002 г.). «MICA, а не MICB, TNFA или HLA-DRB1, связана с предрасположенностью к псориатическому артриту» . Дж. Ревматол . 29 (5): 973–8. ПМИД 12022360 . Архивировано из оригинала 4 декабря 2008 г. Проверено 3 августа 2008 г.

[pmid8498847-12] Юки Н., Сато С., Цудзи С., Огава К., Миятаке Т. (июнь 1993 г.). «Человеческие лейкоцитарные антигены при синдроме Фишера». Энн. Нейрол . 33 (6): 655–7. дои : 10.1002/ana.410330617 . ПМИД 8498847 .

[pmid14700597-13] Крус-Роблес Д., Рейес П.А., Монтеон-Падилья В.М., Ортис-Муньис А.Р., Варгас-Аларкон Г. (январь 2004 г.). «Гены MHC класса I и II у мексиканских пациентов с болезнью Шагаса». Хм. Иммунол . 65 (1): 60–5. дои : 10.1016/j.humimm.2003.10.008 . ПМИД 14700597 .

[14] «Болезнь Шагаса представляет собой новый вызов безопасности поставок крови» .

[pmid9119528-15] Кимура А., Китамура Х., Дате Ю., Нумано Ф. (август 1996 г.). «Комплексный анализ генов HLA при артериите Такаясу в Японии». Межд. Дж. Кардиол . 54 Приложение: С61–9. дои : 10.1016/s0167-5273(96)88774-2 . ПМИД 9119528 .

[pmid7903491-16] Ёсида М., Кимура А., Кацураги К., Нумано Ф., Сасадзуки Т. (август 1993 г.). «ДНК-типирование гена HLA-B при артериите Такаясу» Тканевые антигены . 42 (2): 87–90. дои : 10.1111/j.1399-0039.1993.tb02242.x . ПМИД 7903491 .

[pmid9951811-17] Китамура Х, Кобаяши Ю, Кимура А, Нумано Ф (октябрь 1998 г.). «Ассоциация клинических проявлений с аллелями HLA-B при артериите Такаясу». Межд. Дж. Кардиол . 66 Приложение 1: S121–6. дои : 10.1016/S0167-5273(98)00159-4 . ПМИД 9951811 .

[pmid9951813-18] Родригес-Рейна Т.С., Суньига-Рамос Х., Сальгадо Н. и др. (октябрь 1998 г.). «Последовательности интрона 2 и экзона 3 могут быть вовлечены в предрасположенность к развитию артериита Такаясу». Межд. Дж. Кардиол . 66 Приложение 1: S135–8, обсуждение S139. дои : 10.1016/S0167-5273(98)00161-2 . ПМИД 9951813 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]