HLA-B46




Основной комплекс гистосовместимости (человек), класс I, B46
Аллели	B*4601
Структура (см. HLA-B )
Символ (ы)	HLO-B
Ebi-hla	B*4601
Локус	Chr.6 6p21.31

HLA -B46 ) является HLA - B. серотипом ( B46 Серотип идентифицирует генные продукты аллеля HLA-B*4601. ^{[ 1 ]} B*4601 был вызван редкой, межполушкой, преобразованием генов между B62 , вероятно, B*1501 и аллелем HLA-C . ^{[ 2 ]} B*4601 является наиболее распространенным аллелем HLA-B, который не имеет происхождения в Африке, и, по оценкам, 400 миллионов человек в Восточной Азии несут аллель B46. При обнаружении B*4601 разделяется только с 2 аллелями HLA-CW , ограниченное количество аллелей HLA-A и HLA-DRB1 предполагает, что аллель недавно расширился из группы с ограниченным размером в Se Asia. Чрезвычайно низкие частоты за пределами Восточной Азии являются показателями недавнего расширения B46 из недавно небольшого населения. Распределение частот предполагает, что наследственная популяция B46 находилась в SE в Китае, или, возможно, в Бирме (Мьянма или Лаос, непроверенный). B46 в Азии коррелирует с сельским хозяйством с влажным рисом . Исключения примечательны, это было обнаружено в Нивхи на северо-восточном острове Сакалин, Ainu и связанной с Нивхи (генетически) популяцией Tlinglet Alaska на уровнях следа.

Серотип

B46 Распознавание серотипа некоторых продуктов гена аллельной группы HLA B*46 ^{[ 3 ]}
Б*46	B46	Другой	Образец
аллель	%	%	размер (n)
4601	59	29	1487

Серотипирование плохо для B*4601, и предпочтительнее использовать SSP- PCR . B*46: 01 - один из четырех B -аллелей, который реагирует ни с BW4, ни BW6. Другие B*18: 06 , B*55: 03 и B*73: 01 . ^{[ 4 ]}

B*4601 частоты аллелей

**HLA B*4601 частоты**
		фрейк
рефери	Население	(%)
^{[ 5 ]}	Buyeei ( что -то )	21.6
^{[ 5 ]}	Мяо (Китай)	18.4
^{[ 6 ]}	Он (2) ( Юньнань , Китай )	17.9
^{[ 6 ]}	Тайский (в Сингапуре)	17.2
^{[ 6 ]}	Южные китайцы (на Тайване)	17.2
^{[ 6 ]}	Китайский (в Гонконге )	16.3
^{[ 6 ]}	Хакка (2) (Тайвань)	15.6
^{[ 6 ]}	Гуанчжоу (Китай)	15.5
^{[ 6 ]}	Северо -восточный Таиланд	15.1
^{[ 6 ]}	Миннан (AVG 1 и 2) (Тайвань)	15.0
^{[ 6 ]}	Средний китайский (на Тайване)	15.0
^{[ 6 ]}	Хакка (Тайвань)	13.6
^{[ 6 ]}	Ухан ( Китай )	13.5
^{[ 6 ]}	Маонан ( Гуанси , Китай)	13.4
^{[ 6 ]}	Китайский (в Сингапуре)	13.4
^{[ 5 ]}	вьетнамский	13.2
^{[ 6 ]}	Южный Хан (Китай)	11.5
^{[ 6 ]}	Шанхай (Китай)	11.2
^{[ 6 ]}	Мейчжоу Хан (Гуандун, Китай)	10.0
^{[ 6 ]}	Шидзиажхуан Тяньцзян Хан (Пекин)	9.6
^{[ 6 ]}	Гуанчжоу он (Китай)	9.4
^{[ 6 ]}	Таиланд	9.2
^{[ 6 ]}	Nu ( Юньнань , Китай)	9.0
^{[ 6 ]}	Северный китайский (на Тайване)	8.6
^{[ 6 ]}	Pazeh (Тайвань)	8.2
^{[ 6 ]}	Айхи ( Япония )	7.6
^{[ 6 ]}	Лиза (Юньнон, Китай)	7.2
^{[ 6 ]}	Пекин (Китай)	6.8
^{[ 6 ]}	Накси (Юньнан, Китай)	6.1
^{[ 6 ]}	Хуи ( Цинхай , Китай)	5.9
^{[ 6 ]}	Северный Хан (Китай)	5.7
^{[ 6 ]}	Япония (3)	5.0
^{[ 6 ]}	Hyogo (Япония)	4.7
^{[ 6 ]}	Южная Корея (3)	4.4
^{[ 6 ]}	Человек (Харбин -Сити, Китай)	4.1
^{[ 6 ]}	Siraya (Тайвань)	3.9
^{[ 6 ]}	Центральная Япония	3.6
^{[ 6 ]}	Округ Линкк ( Шандун , Китай)	3.3
^{[ 6 ]}	Тимольский	2.6
^{[ 6 ]}	Внутренняя Монголия (Китай)	2.0
^{[ 6 ]}	Яванский (в Сингапуре)	2.0
^{[ 6 ]}	Олд (Монголия)	1.9
^{[ 6 ]}	Нивхи (Сахалин I, Россия) клевета	1.9
^{[ 6 ]}	Тао (Тайвань)	1.7
^{[ 6 ]}	Riau Malay (в Сингапуре)	1.5
^{[ 6 ]}	Тува (2) (Россия)	1.4
^{[ 6 ]}	Тибетский (Китай)	1.3
^{[ 6 ]}	Опускание ( Uliabatar , Mongolia	1.2
^{[ 6 ]}	Айну ( Хоккайд , Япония)	1.0
^{[ 6 ]}	Окинава (на Гавайях, США)	1.0
^{[ 6 ]}	Коренные народы (Тайвань)	0.9
^{[ 6 ]}	Копия (Монголия)	0.5
^{[ 6 ]}	Брахуи (Пакистан)	0.5

A2 -CW11 (1) -B46

Этот гаплотип уникален в некоторых отношениях, в первую очередь и, самое главное, серотип B46 не от Африки, это отличает его от любого другого известного серотипа B. Это результат события рекомбинации между B62 (B*1501) и аллелем HLA-C в Азии. Это событие произошло недавно, так как на частотах происходит только один крупный аллель и второстепенные аллели. Была некоторая рекомбинация между этим гаплотипом, аллелями с а24 и A11, вероятно, в местной (или племенной популяции). B46 находится везде, где проходили азиатские народы влажного риса и встречаются на низких частотах в некоммерческих группах коренных народов. Единственным исключением является Ninhvet Сибири и восточный Tlinglet of Alaska. Этот вклад B46, по -видимому, был недавним. Из-за количества людей, представленных группами выборки, и его относительная высокая частота в этих группах A2-B46 является одним из наиболее частых, если не наиболее частых гаплотипов AB в мире, даже если он отсутствует в коренных популяциях большинства народов в мире.

HLA A2-B46-частоты гаплотипов
		фрейк		Ранга в
рефери	Население	(%)		Поп
^{[ 5 ]}	Это	16.6	¹	1
^{[ 5 ]}	Мяо	13.6		1
^{[ 5 ]}	Сингапур (Китайский)	11.4		2
^{[ 7 ]}	Чаошан	10.1		1
^{[ 5 ]}	Южный Хан	7.8		2
^{[ 5 ]}	Вьетнам	7.8		1
^{[ 5 ]}	Тайский	7.2		1
^{[ 5 ]}	Тайский китайский	4.0
^{[ 5 ]}	Японский	3.3		4
^{[ 5 ]}	Что	3.0
^{[ 5 ]}	Корея	2.8
^{[ 5 ]}	Цивилизованный	2.7
^{[ 5 ]}	Манча	2.6
^{[ 5 ]}	Внутренний монг.	1.9
^{[ 5 ]}	Северный Хан	1.8
¹ Высшая часть. AB HAP в Азии.

Этот гаплотип уникален в некоторых отношениях, в первую очередь и, самое главное, серотип B46 не от Африки, это отличает его от любого другого основного серотипа B, кроме B*48 . Это результат события рекомбинации между B62 ( B*1501 ) и аллелем HLA-C в Азии. Это событие произошло недавно, так как на частотах происходит только один крупный аллель и второстепенные аллели. Была некоторая рекомбинация между этим гаплотипом, аллелями с а24 и A11, вероятно, в местной (или племенной популяции). B46 находится везде, где проходили азиатские народы влажного риса и встречаются на низких частотах в некоммерческих группах коренных народов. Единственным исключением является Ninhvet Сибири и восточный Tlinglet of Alaska. Этот вклад B46, по -видимому, был недавним. Из-за количества людей, представленных группами выборки, и его относительная высокая частота в этих группах A2-B46 является одним из наиболее частых, если не наиболее частых гаплотипов AB в мире, даже если он отсутствует в коренных популяциях большинства народов в мире.

Наиболее распространенный гаплотип, и, вероятно, наследственный гаплотип, учитывая его распределение от Ninhivet в Индонезию:

A *0207 : C *0102 : B *4601 : DRB1 *0901 : DQA1 *0302 : DQB1 *0303

Другой гаплотип, который чаще встречается в Корее и Японии.

A *0207 : C *0102 : B *4601 : DRB1 *0803 : DQA1 *0103 : DQB1 *0601

B46, или тесно связанный аллель, возможно, находился в положительном отборе у рисовых фермеров Азии.

Ссылки

^ Marsh, SG; Альберт, изд; Бодмер, WF; Bontrop, re; Dupont, B.; Эрлих, Ха; Fernández-Viña, M.; Geraghty, de; Холдсворт, Р.; Херли, CK; Lau, M.; Ли, KW; Маха, б.; Maers, M.; Mayr, WR; Мюллер, Кр; Parham, P.; Petersdorf, EW; Sasazuki, T.; Strominger, JL; Svejgaard, A.; Терасаки, Пи; Laircy, JM; Trowsdale, J. (2010). "Номенклатура для факторов системы HLA , Тканевые антигены 75 (4): 291–4 Doi : 10.1111/j.1399-0039.2010.01466.x . PMC 2848993 PMID 20356336
^ Hildebrand WH, Domena JD, Shen Sy, et al. (1994). «HLA-B15: широко распространенная и разнообразная семья аллелей HLA-B». Тканевые антигены . 43 (4): 209–18. doi : 10.1111/j.1399-0039.1994.tb02327.x . PMID 7521976 .
^ Аллельный запрос формы IMGT/HLA - Европейский институт биоинформатики
^ Porer, CE; van der Vlies, s; Кик, м; Ван Ден Берг-Лоунен, Эм (октябрь 2000 г.). «Неожиданные модели реакционной способности BW4 и BW6 в новых аллелях». Тканевые антигены . 56 (4): 363–70. Doi : 10.1034/j.1399-0039.2000.560409.x . PMID 11098937 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м ^не ^а ^п ^Q. Сасазуки, Такехико; Цуджи, Кимиёси; Айзава, Мики (1992). HLA 1991: Материалы Одиннадцатого международного семинара по гистосовместимости и конференции, состоявшейся в Йокогаме, Япония, 6–13 ноября 1991 года . Оксфорд [Оксфордшир]: издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-262390-4 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м ^не ^а ^п ^Q. ^{ведущий} ^с ^Т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^Аб ^и ^{объявление} ^Но ^из ^в ^{нравиться} ^это ^к ^и ^ал ^{являюсь} ^анонца ^в ^{доступа} ^вод ^с ^как ^в ^В ^из ^W. ^топор Мидлтон Д., Менчака Л., Руд Х, Комерофски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей» . Тканевые антигены . 61 (5): 403–7. doi : 10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x . PMID 12753660 .
^ Hu SP, Luan JA, Li B, et al. (2007). «Генетическая связь между Чаошаном и другими китайскими популяциями Хана: данные от частоты аллеля HLA-A и HLA-B». Являюсь. J. Phys Антропол . 132 (1): 140–50. doi : 10.1002/ajpa.20460 . PMID 16883565 .

[pmid15787720-1] Marsh, SG; Альберт, изд; Бодмер, WF; Bontrop, re; Dupont, B.; Эрлих, Ха; Fernández-Viña, M.; Geraghty, de; Холдсворт, Р.; Херли, CK; Lau, M.; Ли, KW; Маха, б.; Maers, M.; Mayr, WR; Мюллер, Кр; Parham, P.; Petersdorf, EW; Sasazuki, T.; Strominger, JL; Svejgaard, A.; Терасаки, Пи; Laircy, JM; Trowsdale, J. (2010). "Номенклатура для факторов системы HLA , Тканевые антигены 75 (4): 291–4 Doi : 10.1111/j.1399-0039.2010.01466.x . PMC 2848993 PMID 20356336

[pmid7521976-2] Hildebrand WH, Domena JD, Shen Sy, et al. (1994). «HLA-B15: широко распространенная и разнообразная семья аллелей HLA-B». Тканевые антигены . 43 (4): 209–18. doi : 10.1111/j.1399-0039.1994.tb02327.x . PMID 7521976 .

[3] Аллельный запрос формы IMGT/HLA - Европейский институт биоинформатики

[4] Porer, CE; van der Vlies, s; Кик, м; Ван Ден Берг-Лоунен, Эм (октябрь 2000 г.). «Неожиданные модели реакционной способности BW4 и BW6 в новых аллелях». Тканевые антигены . 56 (4): 363–70. Doi : 10.1034/j.1399-0039.2000.560409.x . PMID 11098937 .

[isbn0-19-262390-7-5] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м ^не ^а ^п ^Q. Сасазуки, Такехико; Цуджи, Кимиёси; Айзава, Мики (1992). HLA 1991: Материалы Одиннадцатого международного семинара по гистосовместимости и конференции, состоявшейся в Йокогаме, Япония, 6–13 ноября 1991 года . Оксфорд [Оксфордшир]: издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-262390-4 .

[pmid12753660-6] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м ^не ^а ^п ^Q. ^{ведущий} ^с ^Т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^Аб ^и ^{объявление} ^Но ^из ^в ^{нравиться} ^это ^к ^и ^ал ^{являюсь} ^анонца ^в ^{доступа} ^вод ^с ^как ^в ^В ^из ^W. ^топор Мидлтон Д., Менчака Л., Руд Х, Комерофски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей» . Тканевые антигены . 61 (5): 403–7. doi : 10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x . PMID 12753660 .

[pmid16883565-7] Hu SP, Luan JA, Li B, et al. (2007). «Генетическая связь между Чаошаном и другими китайскими популяциями Хана: данные от частоты аллеля HLA-A и HLA-B». Являюсь. J. Phys Антропол . 132 (1): 140–50. doi : 10.1002/ajpa.20460 . PMID 16883565 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]