HLA-C

HLA-C
Доступные структуры
ПДБ	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3BZF,%%s4NT6,%%s1EFX,%%s1IM9, 1QQD
Идентификаторы
Псевдонимы	HLA-C , D6S204, HLA-JY3, HLC-C, PSORS1, главный комплекс гистосовместимости, класс I, C, MHC
Внешние идентификаторы	Опустить : 142840 ; Гомологен : 133080 ; Генные карты : HLA-C ; ОМА : HLA-C – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	31,272,130 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	blood; ; right lung; ; spleen; ; granulocyte; ; right uterine tube; ; appendix; ; bone marrow; ; upper lobe of left lung; ; lymph node; ; bone marrow cells;
	n/a
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	peptide antigen binding; protein binding;
Cellular component	integral component of membrane; phagocytic vesicle membrane; Golgi apparatus; early endosome membrane; membrane; Golgi membrane; plasma membrane; cell surface; endoplasmic reticulum; MHC class I protein complex; ER to Golgi transport vesicle membrane; integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; extracellular exosome; secretory granule membrane; recycling endosome membrane;
Biological process	antigen processing and presentation; antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; immune system process; interferon-gamma-mediated signaling pathway; antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I; antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent; type I interferon signaling pathway; immune response; regulation of immune response; viral process; neutrophil degranulation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3107
	н/д
showENSG00000204525 ; ENSG00000233841 ; ENSG00000228299 ; ENSG00000225691 ; ENSG00000206435 ;
	ENSG00000237022; ENSG00000206452
	н/д
	P10321
	н/д
	НМ_002117 ; НМ_001243042
	н/д
	НП_001229971 ; НП_002108
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека

HLA-C (человеческий лейкоцитарный антиген-C) принадлежит к MHC класса I. рецепторам тяжелых цепей Рецептор C представляет собой гетеродимер, состоящий из продукта зрелого гена HLA-C и β2-микроглобулина . Зрелая С-цепь закрепляется в мембране. Молекулы MHC класса I, такие как HLA-C, экспрессируются почти во всех клетках и представляют небольшие пептиды иммунной системе, которая ищет чужеродные пептиды.

HLA-C — это локус на хромосоме 6, который кодирует многие аллели HLA-C, которые являются рецепторами MHC класса I. HLA-C, локализованный проксимальнее локуса HLA-B, расположен на дистальном конце региона HLA. Большинство гаплотипов HLA-C:B находятся в сильном неравновесии по сцеплению , и многие из них столь же древние, как и сам человеческий вид.

Ассоциации заболеваний

По серотипу

Cw1: многоузловой зоб ^[3]

По аллелю

C*16: В-клеточный хронический лимфоцитарный лейкоз ^[4]

Номенклатура

С*01

Серотип Cw1 : C*01:02 и C*01:09.
Cw11
С*01:04 до *01:08

С*02

Серотип Cw2 : C*02:02 и *02:08.
С*02:03 до *02:07 и 02:09

С*03

Серотип Cw9 : C*03:03
Серотип Cw10 : C*03:02, *03:04 и *03:06.
Серотип Cw3 : C*03:07
С*03:05 и 03:08

С*04

Серотип Cw4 : C*0401, *0407 и *0410.

С*05

Серотип Cw5 : C*05:01 и *05:02.
C*05:03 до *05:06 и от *05:08 до *05:10

С*06

Серотип Cw6 : C*06:02 и *06:05.
C*06:03, *06:04 и от *06:06 до *06:11

С*07

Серотип Cw7 : от C*07:01 до *07:06, *07:12, *07:14, *07:16.
C*07:07 до *07:11, *07:13, *07:15 и *07:17 до *07:29

С*08

Серотип Cw8 : C*08:01, *08:02 и *08:03.
С*08:05 до *08:12

Другие

С*12:02 до *12:15
С*14:02 до *14:05
С*15:01 до *15:11
С*16:01 до *16:06
С*17:01 до *17:03
С*18:01 и *18:02

Общий гаплотип

Cw4-B35 (от Западной Африки до коренных американцев) Cw7-B7 (Западная Евразия, Южная Африка)Cw7-B8 (Западная Евразия)Cw1-B46 (Китай, Индокитай)Cw5-B44 (Западная Евразия)

Взаимодействия

Было показано, что HLA-C взаимодействует с:

КИР2ДЛ1 , ^[5]^[6]^[7]^[8]
лейкоцитарных иммуноглобулиноподобных рецепторов Семейство :
- особенно активирующий рецептор LILRA1
- ЛИЛРА3 ^[9]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000233841, ENSG00000228299, ENSG00000225691, ENSG00000206435, ENSG00000237022, ENSG00000206452 GRCh38: Версия ансамбля 89: ENSG00000204525, 0000233841, ENSG00000228299, ENSG00000225691, ENSG00000206435, ENSG00000237022, ENSG00000206452 – ансамбль , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Риос А., Родригес Х.М., Моя М.Р., Галиндо П.Дж., Кантерас М., Альварес М.Р., Паррилла П. (2006). «Ассоциации аллелей HLA-C с многоузловым зобом: исследование в популяции из юго-восточной Испании» . Арх Сург . 141 (2): 123–8. дои : 10.1001/archsurg.141.2.123 . ПМИД 16490887 .
^ Монтес-Арес О, Моя-Килес М.Р., Монтес-Касадо М., Герра-Перес Н., Кампильо Х.А., Гонсалес К., Лопес-Бермехо А., Тамайо М., Махадо М.Дж., Паррадо А., Муро М., Марин Л., Альварес-Лопес М.Р. (2006). «Человеческий лейкоцитарный антиген-C при хроническом лимфоцитарном лейкозе B». Br J Гематол . 135 (4): 517–9. дои : 10.1111/j.1365-2141.2006.06334.x . ПМИД 17054674 . S2CID 23018830 .
^ Бойсон Дж.Э., Эрскин Р., Уитмен MC, Чиу М., Лау Дж.М., Купман Л.А., Вальтер М.М., Ангелисова П., Хорейси В., Стромингер Дж.Л. (декабрь 2002 г.). «Димеризация HLA-G, опосредованная дисульфидной связью, на поверхности клетки» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (25): 16180–5. Бибкод : 2002PNAS...9916180B . дои : 10.1073/pnas.212643199 . ПМК 138585 . ПМИД 12454284 .
^ Баба Э., Эрскин Р., Бойсон Дж.Э., Коэн ГБ, Дэвис Д.М., Малик П., Мандельбойм О., Рейберн Х.Т., Строминджер Дж.Л. (декабрь 2000 г.). «N-связанный углевод на лейкоцитарном антигене-C человека и распознавание рецепторами, ингибирующими естественные клетки-киллеры». Хм. Иммунол . 61 (12): 1202–18. дои : 10.1016/s0198-8859(00)00184-1 . ПМИД 11163076 .
^ Валес-Гомес М., Рейберн Х.Т., Мандельбойм М., Стромингер Дж.Л. (сентябрь 1998 г.). «Кинетика взаимодействия лигандов HLA-C с ингибирующими рецепторами естественных киллеров» . Иммунитет . 9 (3): 337–44. дои : 10.1016/s1074-7613(00)80616-0 . ПМИД 9768753 .
^ Fan QR, Long EO, Wiley DC (май 2001 г.). «Кристаллическая структура комплекса KIR2DL1-HLA-Cw4, ингибирующего рецепторы естественных киллеров человека». Нат. Иммунол . 2 (5): 452–60. дои : 10.1038/87766 . ПМИД 11323700 . S2CID 24707532 .
^ Джонс Д.К., Космолиаптсис В., Аппс Р., Лапак Н., Смит И., Коно А., Чанг С., Бойл Л.Х., Тейлор С.Дж., Троусдейл Дж., Аллен Р.Л. (март 2011 г.). «Аллельная последовательность и конформация HLA класса I регулируют связывание Ig-подобных рецепторов лейкоцитов» . Дж. Иммунол . 186 (5): 2990–7. doi : 10.4049/jimmunol.1003078 . ПМИД 21270408 .

Дальнейшее чтение

Гейер М., Факлер О.Т., Петерлин Б.М. (2001). «Структурно-функциональные взаимоотношения при ВИЧ-1 Nef» . Представитель ЭМБО . 2 (7): 580–5. doi : 10.1093/embo-reports/kve141 . ПМЦ 1083955 . ПМИД 11463741 .
Гринуэй А.Л., Холлоуэй Г., Макфи Д.А., Эллис П., Корналл А., Лидман М. (2004). «Контроль Nef ВИЧ-1 клеточных сигнальных молекул: несколько стратегий содействия репликации вируса». Дж. Биоши . 28 (3): 323–35. дои : 10.1007/BF02970151 . ПМИД 12734410 . S2CID 33749514 .
Бенишу С., Бенмера А. (2003). «[Нэф ВИЧ и белки K3/K5 вируса, ассоциированного с саркомой Капоши: «паразиты» пути эндоцитоза]» . Мед Науки (Париж) . 19 (1): 100–6. дои : 10.1051/medsci/2003191100 . ПМИД 12836198 .
Ливитт С.А., Шон А., Кляйн Дж.К., Манджаппара У., Чайкен И.М., Фрейре Э. (2004). «Взаимодействие белков ВИЧ-1 gp120 и Nef с клеточными партнерами определяет новую аллостерическую парадигму». Курс. Белковый пепт. Наука . 5 (1): 1–8. дои : 10.2174/1389203043486955 . ПМИД 14965316 .
Толструп М., Остергаард Л., Лаурсен А.Л., Педерсен С.Ф., Дач М. (2004). «ВИЧ/ВИV ускользают от иммунного надзора: сосредоточьтесь на Нефе». Курс. ВИЧ Рез . 2 (2): 141–51. дои : 10.2174/1570162043484924 . ПМИД 15078178 .
Джозеф А.М., Кумар М., Митра Д. (2005). «Нэф: «необходимый и принудительный фактор» при ВИЧ-инфекции». Курс. ВИЧ Рез . 3 (1): 87–94. дои : 10.2174/1570162052773013 . ПМИД 15638726 .
Андерсон Дж.Л., Хоуп ТиДжей (2005). «Аксессуарные белки ВИЧ и выживание в клетке-хозяине». Текущие отчеты о ВИЧ/СПИДе . 1 (1): 47–53. дои : 10.1007/s11904-004-0007-x . ПМИД 16091223 . S2CID 34731265 .

Внешние ссылки

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000233841, ENSG00000228299, ENSG00000225691, ENSG00000206435, ENSG00000237022, ENSG00000206452 GRCh38: Версия ансамбля 89: ENSG00000204525, 0000233841, ENSG00000228299, ENSG00000225691, ENSG00000206435, ENSG00000237022, ENSG00000206452 – ансамбль , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] Риос А., Родригес Х.М., Моя М.Р., Галиндо П.Дж., Кантерас М., Альварес М.Р., Паррилла П. (2006). «Ассоциации аллелей HLA-C с многоузловым зобом: исследование в популяции из юго-восточной Испании» . Арх Сург . 141 (2): 123–8. дои : 10.1001/archsurg.141.2.123 . ПМИД 16490887 .

[4] Монтес-Арес О, Моя-Килес М.Р., Монтес-Касадо М., Герра-Перес Н., Кампильо Х.А., Гонсалес К., Лопес-Бермехо А., Тамайо М., Махадо М.Дж., Паррадо А., Муро М., Марин Л., Альварес-Лопес М.Р. (2006). «Человеческий лейкоцитарный антиген-C при хроническом лимфоцитарном лейкозе B». Br J Гематол . 135 (4): 517–9. дои : 10.1111/j.1365-2141.2006.06334.x . ПМИД 17054674 . S2CID 23018830 .

[pmid12454284-5] Бойсон Дж.Э., Эрскин Р., Уитмен MC, Чиу М., Лау Дж.М., Купман Л.А., Вальтер М.М., Ангелисова П., Хорейси В., Стромингер Дж.Л. (декабрь 2002 г.). «Димеризация HLA-G, опосредованная дисульфидной связью, на поверхности клетки» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (25): 16180–5. Бибкод : 2002PNAS...9916180B . дои : 10.1073/pnas.212643199 . ПМК 138585 . ПМИД 12454284 .

[pmid11163076-6] Баба Э., Эрскин Р., Бойсон Дж.Э., Коэн ГБ, Дэвис Д.М., Малик П., Мандельбойм О., Рейберн Х.Т., Строминджер Дж.Л. (декабрь 2000 г.). «N-связанный углевод на лейкоцитарном антигене-C человека и распознавание рецепторами, ингибирующими естественные клетки-киллеры». Хм. Иммунол . 61 (12): 1202–18. дои : 10.1016/s0198-8859(00)00184-1 . ПМИД 11163076 .

[pmid9768753-7] Валес-Гомес М., Рейберн Х.Т., Мандельбойм М., Стромингер Дж.Л. (сентябрь 1998 г.). «Кинетика взаимодействия лигандов HLA-C с ингибирующими рецепторами естественных киллеров» . Иммунитет . 9 (3): 337–44. дои : 10.1016/s1074-7613(00)80616-0 . ПМИД 9768753 .

[pmid11323700-8] Fan QR, Long EO, Wiley DC (май 2001 г.). «Кристаллическая структура комплекса KIR2DL1-HLA-Cw4, ингибирующего рецепторы естественных киллеров человека». Нат. Иммунол . 2 (5): 452–60. дои : 10.1038/87766 . ПМИД 11323700 . S2CID 24707532 .

[pmid21270408-9] Джонс Д.К., Космолиаптсис В., Аппс Р., Лапак Н., Смит И., Коно А., Чанг С., Бойл Л.Х., Тейлор С.Дж., Троусдейл Дж., Аллен Р.Л. (март 2011 г.). «Аллельная последовательность и конформация HLA класса I регулируют связывание Ig-подобных рецепторов лейкоцитов» . Дж. Иммунол . 186 (5): 2990–7. doi : 10.4049/jimmunol.1003078 . ПМИД 21270408 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

v т и главного комплекса гистосовместимости Классы
MHC class I	HLA-A HLA-B HLA-C HLA-E HLA-F HLA-G
MHC class II	HLA-DM α β HLA-DO α β HLA-DP α1 β1 HLA-DQ α1 α2 β1 β2 β3 HLA-DR α β1 β3 β4 β5
Other	Human leukocyte antigen Minor histocompatibility antigen Blood transfusion Arrestin Calgranulin Human blood group systems Cell adhesion molecules Cluster of differentiation