HLA-ДМБ

HLA-ДМБ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1HDM, 2BC4, 4FQX, 4GBX, 4I0P
Идентификаторы
Псевдонимы	HLA-DMB , D6S221E, RING7, главный комплекс гистосовместимости, класс II, СД бета
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 142856 ; МГИ : 95922 ; Гомологен : 68231 ; GeneCards : HLA-DMB ; ОМА : HLA-DMB – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	32,941,028 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	34,379,204 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	monocyte; ; granulocyte; ; lymph node; ; appendix; ; spleen; ; duodenum; ; gallbladder; ; right lung; ; upper lobe of left lung; ; rectum;
	Top expressed in
	mesenteric lymph nodes; ; spleen; ; blood; ; right kidney; ; ankle joint; ; superior surface of tongue; ; thymus; ; sciatic nerve; ; lip; ; subcutaneous adipose tissue;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	MHC class II protein complex binding; protein binding;
Cellular component	lysosomal membrane; lysosome; membrane; endosome; late endosome membrane; integral component of membrane; MHC class II protein complex;
Biological process	positive regulation of T cell activation via T cell receptor contact with antigen bound to MHC molecule on antigen presenting cell; antigen processing and presentation; MHC class II protein complex assembly; positive regulation of T cell proliferation; antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II; peptide antigen assembly with MHC class II protein complex; immune system process; antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; immune response; adaptive immune response;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3109
	14999
showENSG00000241674 ; ENSG00000226264 ; ENSG00000242574 ; ENSG00000239329 ; ENSG00000234154 ;
	ENSG00000242386; ENSG00000242092; ENSG00000241296
	ENSMUSG00000079547
	P28068
	P35737 ; Q31094
	НМ_002118
	НМ_010387
	НП_002109
	НП_034517
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Антиген гистосовместимости HLA класса II, бета-цепь DM представляет собой белок , который у человека кодируется HLA-DMB геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

бета-цепи HLA класса II HLA-DMB принадлежит к паралогам . Эта молекула класса II представляет собой гетеродимер, состоящий из альфа-(ДМА) и бета-цепи (ДМБ), закрепленных в мембране . Он расположен во внутриклеточных везикулах . DM играет центральную роль в загрузке пептидов молекул MHC класса II, помогая высвободить молекулу CLIP (пептид инвариантной цепи, ассоциированный с классом II) из пептида сайта связывания . Молекулы класса II экспрессируются в антигенпредставляющих клетках (APC: B -лимфоциты , дендритные клетки , макрофаги ). Бета-цепь имеет массу примерно 26–28 кДа , а ее ген содержит 6 экзонов . Первый экзон кодирует лидерный пептид, экзоны 2 и 3 кодируют два внеклеточных домена, экзон 4 кодирует трансмембранный домен, а экзон 5 кодирует цитоплазматический хвост. ^{[ 6 ]}

Клиническое значение

Уровень HLA-DMB повышен в опухолевой ткани пациентов европеоидной расы, но не африканцев. Его роль в иммунологии опухолей не определена, но было показано, что он положительно коррелирует с увеличением инфильтрации Т-клеток и улучшением прогноза при раке яичников. Дифференциальные иммунные процессы, опосредованные HLA-DMB, могут способствовать различиям в исходах рака. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000226264, ENSG00000242574, ENSG00000239329, ENSG00000234154, ENSG00000242386, ENSG00000242092, ENSG00000241296 GRCh38: выпуск ансамбля 89: ENSG00000241674, ENSG00000226264, ENSG00000242574, ENSG00000239329, ENSG00000234154, ENSG00000242386, ENSG00000242092, ENSG00000241296 – Ансамбль , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079547 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Келли А.П., Монако Дж.Дж., Чо С.Г., Троусдейл Дж. (ноябрь 1991 г.). «Новый локус человека, связанный с HLA класса II, DM». Природа . 353 (6344): 571–3. Бибкод : 1991Natur.353..571K . дои : 10.1038/353571a0 . ПМИД 1922365 . S2CID 3065226 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: главный комплекс гистосовместимости HLA-DMB, класс II, СД бета» .
^ Кинсет М.А., Цзя З., Рахматпана Ф., Сойерс А., Саттон М., Ван-Родригес Дж., Меркола Д., МакГуайр К.Л. (январь 2014 г.). «Различия в экспрессии тканей рака простаты афроамериканцев и европеоидов показывают, что строма является местом агрессивных изменений» . Международный журнал рака . 134 (1): 81–91. дои : 10.1002/ijc.28326 . ПМК 3800217 . ПМИД 23754304 .

Дальнейшее чтение

Фогт А.Б., Кропшофер Х (1999). «HLA-DM - эндосомальный и лизосомальный шаперон иммунной системы». Тенденции биохимии. Наука . 24 (4): 150–4. дои : 10.1016/S0968-0004(99)01364-X . ПМИД 10322421 .
Кропшофер Х., Хеммерлинг Г.Дж., Фогт А.Б. (2000). «Влияние неклассических белков MHC HLA-DM и HLA-DO на загрузку молекул MHC класса II». Иммунол. Преподобный . 172 : 267–78. дои : 10.1111/j.1600-065X.1999.tb01371.x . ПМИД 10631952 . S2CID 22216172 .
Пиатье-Тонно Д., Гастинель Л.Н., Амблар Ф. и др. (1991). «Взаимодействие CD4 с антигенами HLA класса II и gp120 ВИЧ». Иммуногенетика . 34 (2): 121–8. дои : 10.1007/BF00211424 . ПМИД 1869305 . S2CID 10116507 .
Розенштейн Ю., Буракофф С.Дж., Херрманн Ш.Х. (1990). «ВИЧ-gp120 может блокировать адгезию, опосредованную MHC CD4-класса II» . Дж. Иммунол . 144 (2): 526–31. дои : 10.4049/jimmunol.144.2.526 . ПМИД 1967269 .
Боуман М.Р., Макферрин К.Д., Шрайбер С.Л., Буракофф С.Дж. (1991). «Идентификация и структурный анализ остатков в области V1 CD4, участвующих во взаимодействии с гликопротеином оболочки gp120 вируса иммунодефицита человека и молекулами главного комплекса гистосовместимости класса II» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 87 (22): 9052–6. дои : 10.1073/pnas.87.22.9052 . ПМЦ 55099 . ПМИД 1978941 .
Клейтон Л.К., Сие М., Пиус Д.А., Рейнхерц Э.Л. (1989). «Идентификация остатков CD4 человека, влияющих на MHC класса II по сравнению с связыванием gp120 ВИЧ-1» . Природа . 339 (6225): 548–51. Бибкод : 1989Natur.339..548C . дои : 10.1038/339548a0 . ПМИД 2543930 . S2CID 4246781 .
Даймонд Д.С., Слекман Б.П., Грегори Т. и др. (1988). «Ингибирование функции CD4+ Т-клеток белком оболочки ВИЧ, gp120» . Дж. Иммунол . 141 (11): 3715–7. дои : 10.4049/jimmunol.141.11.3715 . ПМИД 2846691 .
Андриу Ж.М., Эвен П., Венет А. (1986). «СПИД и родственные синдромы как вирусно-индуцированное аутоиммунное заболевание иммунной системы: нарушение анти-MHC II. Терапевтические последствия». Исследования СПИДа . 2 (3): 163–74. дои : 10.1089/aid.1.1986.2.163 . ПМИД 3489470 .
Улгатт Р., Скармато П., Эль Мархоми С. и др. (1994). «Антигены HLA класса II и гликопротеин оболочки ВИЧ gp120 связываются с одной и той же стороной CD4» . Дж. Иммунол . 152 (9): 4475–88. дои : 10.4049/jimmunol.152.9.4475 . ПМИД 7512597 .
Шаман Дж., фон Шевен Э., Моррис П. и др. (1995). «Анализ мутантов HLA-DMB и геномной структуры -DMB». Иммуногенетика . 41 (2–3): 117–24. дои : 10.1007/BF00182322 . ПМИД 7528727 . S2CID 40078535 .
Чирмул Н., Макклоски Т.В., Ху Р. и др. (1995). «ВИЧ gp120 ингибирует активацию Т-клеток, препятствуя экспрессии костимулирующих молекул-лиганда CD40 и CD80 (B71)» . Дж. Иммунол . 155 (2): 917–24. дои : 10.4049/jimmunol.155.2.917 . ПМИД 7541827 .
Роуэлл Дж. Ф., Стэнхоуп П. Е., Силициано Р. Ф. (1995). «Эндоцитоз эндогенно синтезируемого белка оболочки ВИЧ-1. Механизм и роль в процессинге ассоциации с MHC класса II». Дж. Иммунол . 155 (1): 473–88. дои : 10.4049/jimmunol.155.1.473 . ПМИД 7602119 . S2CID 19994352 .
Шерман М.А., Вебер Д.А., Дженсен П.Е. (1995). «DM усиливает связывание пептида с MHC класса II за счет высвобождения пептида, полученного из инвариантной цепи» . Иммунитет . 3 (2): 197–205. дои : 10.1016/1074-7613(95)90089-6 . ПМИД 7648393 .
Рэдли Э., Олдертон Р.П., Келли А. и др. (1994). «Геномная организация HLA-DMA и HLA-DMB. Сравнение организации генов всех шести семейств класса II в главном комплексе гистосовместимости человека» . Ж. Биол. Хим . 269 (29): 18834–8. дои : 10.1016/S0021-9258(17)32242-1 . ПМИД 8034636 .
Чен Ю.Х., Бёк Г., Ворнхаген Р. и др. (1994). «Белки, связывающие gp41 ВИЧ-1, и антитела к gp41 могут ингибировать усиление экспрессии MHC класса I и II клеток Раджи человека с помощью gp41». Мол. Иммунол . 31 (13): 977–82. дои : 10.1016/0161-5890(94)90092-2 . ПМИД 8084338 .
Флинг С.П., Арп Б., Благочестивый Д. (1994). «Оба гена HLA-DMA и -DMB необходимы для образования комплекса MHC класса II/пептида в антигенпрезентирующих клетках». Природа . 368 (6471): 554–8. Бибкод : 1994Natur.368..554F . дои : 10.1038/368554a0 . ПМИД 8139690 . S2CID 4307699 .
Чирмуле Н., Ван Х.П., Ху Р. и др. (1994). «Гликопротеины оболочки ВИЧ-1 мешают Т-клеточно-зависимой дифференцировке В-клеток: роль взаимодействия CD4-MHC класса II в эффекторной фазе помощи Т-клеток» . Клетка. Иммунол . 155 (1): 169–82. дои : 10.1006/cimm.1994.1110 . ПМИД 8168144 .
Сандерсон Ф., Поуис Ш., Келли А.П., Троусдейл Дж. (1993). «Ограниченный полиморфизм HLA-DM не затрагивает бороздку для связывания пептида». Иммуногенетика . 39 (1): 56–8. дои : 10.1007/bf00171797 . ПМИД 8225438 . S2CID 27369392 .
Каллахан К.М., Роуэлл Дж.Ф., Солоски М.Дж. и др. (1993). «Белок оболочки ВИЧ-1 экспрессируется на поверхности инфицированных клеток до его обработки и представления Т-лимфоцитам, ограниченным классом II» . Дж. Иммунол . 151 (6): 2928–42. дои : 10.4049/jimmunol.151.6.2928 . ПМИД 8376762 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000226264, ENSG00000242574, ENSG00000239329, ENSG00000234154, ENSG00000242386, ENSG00000242092, ENSG00000241296 GRCh38: выпуск ансамбля 89: ENSG00000241674, ENSG00000226264, ENSG00000242574, ENSG00000239329, ENSG00000234154, ENSG00000242386, ENSG00000242092, ENSG00000241296 – Ансамбль , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079547 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1922365-5] Келли А.П., Монако Дж.Дж., Чо С.Г., Троусдейл Дж. (ноябрь 1991 г.). «Новый локус человека, связанный с HLA класса II, DM». Природа . 353 (6344): 571–3. Бибкод : 1991Natur.353..571K . дои : 10.1038/353571a0 . ПМИД 1922365 . S2CID 3065226 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: главный комплекс гистосовместимости HLA-DMB, класс II, СД бета» .

[pmid23754304-7] Кинсет М.А., Цзя З., Рахматпана Ф., Сойерс А., Саттон М., Ван-Родригес Дж., Меркола Д., МакГуайр К.Л. (январь 2014 г.). «Различия в экспрессии тканей рака простаты афроамериканцев и европеоидов показывают, что строма является местом агрессивных изменений» . Международный журнал рака . 134 (1): 81–91. дои : 10.1002/ijc.28326 . ПМК 3800217 . ПМИД 23754304 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

v т и главного комплекса гистосовместимости Классы
МХК I класса	HLA-А HLA-B HLA-C HLA-E HLA-F HLA-G
МХК класс II	HLA-DM а б ХЛА-ДО а б HLA-DP а1 б1 HLA-DQ а1 а2 б1 б2 б3 HLA-DR а б1 б3 б4 б5
Другой	Человеческий лейкоцитарный антиген Минорный антиген гистосовместимости Переливание крови Арестин Кальгранулин Системы групп крови человека Молекулы клеточной адгезии Кластер дифференциации