HLA-DRA

HLA-DRA
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1A6A, 1AQD, 1BX2, 1D5M, 1D5X, 1D5Z, 1D6E, 1DLH, 1FV1, 1FYT, 1H15, 1HXY, 1J8H, 1JWM, 1JWS, 1JWU, 1KG0, 1KLG, 1KLU, 1LO5, 1PYW, 1R5I, 1SEB, 1SJE, 1SJH, 1T5W, 1T5X, 1YMM, 1ZGL, 2FSE, 2G9H, 2IAM, 2IAN, 2ICW, 2IPK, 2OJE, 2Q6W, 2WBJ, 2XN9, 3C5J, 3L6F, 3O6F, 3PDO, 3PGC, 3PGD, 3QXA, 3QXD, 3S4S, 3S5L, 3T0E, 4AEN, 4AH2, 4E41, 4FQX, 4GBX, 4H1L, 4C56, 4H25, 4H26, 4I5B, 4IS6, 4MCY, 4MCZ, 4MD0, 4MD4, 4MD5, 4MDI, 4MDJ, 4OV5, 4Y19, 4Y1A, 4X5X, 4X5W
Идентификаторы
Псевдонимы	HLA-DRA , HLA-DRA1, MLRW, главный комплекс гистосовместимости, класс II, DR альфа
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 142860 ; МГИ : 95900 ; Гомологен : 7751 ; GeneCards : HLA-DRA ; ОМА : HLA-DRA – ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 6 (human) Band 6p21.32 Start 32,439,878 bp End 32,445,046 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in monocyte appendix lymph node granulocyte gallbladder duodenum spleen upper lobe of left lung right lung smooth muscle tissue n/a More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function peptide antigen binding MHC class II receptor activity MHC class II protein complex binding protein binding Cellular component integral component of membrane endocytic vesicle membrane clathrin-coated endocytic vesicle membrane endosome Golgi apparatus trans-Golgi network membrane endoplasmic reticulum membrane membrane late endosome membrane Golgi membrane plasma membrane transport vesicle membrane integral component of plasma membrane cell surface lysosomal membrane endoplasmic reticulum ER to Golgi transport vesicle membrane lysosome integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane endosome membrane extracellular exosome MHC class II protein complex Biological process antigen processing and presentation antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II cognition interferon-gamma-mediated signaling pathway immune system process T cell costimulation antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II immune response peptide antigen assembly with MHC class II protein complex viral process T cell receptor signaling pathway adaptive immune response Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 3122 100504404 Вместе showENSG00000206308 ENSG00000228987 ENSG00000230726 ENSG00000204287 ENSG00000227993 ENSG00000226260 ENSG00000234794 ENSG00000277263 ENSMUSG00000036322 ЮниПрот P01903 P04224 P01904 RefSeq (мРНК) НМ_019111 НМ_010381 RefSeq (белок) НП_061984 НП_034511 Местоположение (UCSC) Чр 6: 32,44 – 32,45 Мб н/д в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Антиген гистосовместимости HLA класса II, альфа-цепь DR представляет собой белок , который у человека кодируется геном HLA-DRA . HLA-DRA кодирует альфа-субъединицу HLA-DR. В отличие от альфа-цепей других молекул MHC класса II человека, альфа-субъединица практически неизменна. Однако у любого человека он может спариваться с бета-цепью трех разных бета-локусов DR, DRB1 и двух любых DRB3 , DRB4 или DRB5 аллелей . Таким образом, существует вероятность того, что любой конкретный человек может образовывать 4 разные изоформы HLA-DR (2 аллели DRB1 и два аллеля DRB3, DRB4 или DRB5).

Функция

Полипептидная , субъединица кодируемая этим геном, принадлежит к HLA класса II альфа-цепи паралогам . Белок класса II представляет собой гетеродимер, состоящий из альфа-(DRα) и бета-цепи (DRβ), закрепленных в мембране. Он играет центральную роль в иммунной системе , представляя пептиды, полученные из внеклеточных белков. Молекулы класса II экспрессируются в антигенпрезентирующих клетках (APC: B-лимфоциты, дендритные клетки, макрофаги).

Генная структура и полиморфизмы

Альфа-цепь имеет массу примерно 33-35 кДа, а ее ген содержит 5 экзонов . Экзон 1 кодирует лидерный пептид, экзоны 2 и 3 кодируют два внеклеточных домена , а экзон 4 кодирует трансмембранный домен и цитоплазматический хвост. DRA не имеет полиморфизмов в пептидсвязывающей части и действует как единственная альфа-цепь для DRB1 , DRB3 , DRB4 и DRB5 .

Аллели

В человеческой популяции существуют две разные цепи HLA-DRA, кодируемые тремя разными аллелями DRA:

КЕРРИ*01:01 КЕРРИ*01:02:01 КЕРРИ*01:02:02

См. также

• HLA-DR

Дальнейшее чтение

• Бенишу С., Бенмера А. (2003). «[Нэф ВИЧ и белки K3/K5 вируса, ассоциированного с саркомой Капоши: «паразиты» пути эндоцитоза]» . Мед Науки (Париж) . 19 (1): 100–6. дои : 10.1051/medsci/2003191100 . ПМИД   12836198 .
• Толструп М., Остергаард Л., Лаурсен А.Л. и др. (2004). «ВИЧ/ВИV ускользают от иммунного надзора: сосредоточьтесь на Нефе». Курс. ВИЧ Рез . 2 (2): 141–51. дои : 10.2174/1570162043484924 . ПМИД   15078178 .
• Андерсон Дж.Л., Хоуп ТиДжей (2005). «Аксессуарные белки ВИЧ и выживание в клетке-хозяине». Текущие отчеты о ВИЧ/СПИДе . 1 (1): 47–53. дои : 10.1007/s11904-004-0007-x . ПМИД   16091223 . S2CID   34731265 .
• Ли Л., Ли Х.С., Пауза К.Д. и др. (2006). «Роль вспомогательных белков ВИЧ-1 в вирусном патогенезе и взаимодействии хозяин-патоген» . Сотовый Res . 15 (11–12): 923–34. дои : 10.1038/sj.cr.7290370 . ПМИД   16354571 .
• Печь В., Верхасселт Б. (2006). «Моделирование эффектов Nef ВИЧ-1 тимуса». Курс. ВИЧ Рез . 4 (1): 57–64. дои : 10.2174/157016206775197583 . ПМИД   16454711 .
• Мацусима Г.К., Ито-Линдстром Ю., Тинг Дж.П. (1992). «Активация гена HLA-DRA в первичных Т-лимфоцитах человека: новое использование TATA и элементов промотора X и Y» . Мол. Клетка. Биол . 12 (12): 5610–9. дои : 10.1128/MCB.12.12.5610 . ПМК   360500 . ПМИД   1448091 .
• Шайфф В.Т., Хруска К.А., МакКорт Д.В. и др. (1992). «HLA-DR связывается со специфическими стрессовыми белками и сохраняется в эндоплазматическом ретикулуме в отрицательных клетках с инвариантной цепью» . Дж. Эксп. Мед . 176 (3): 657–66. дои : 10.1084/jem.176.3.657 . ПМК   2119345 . ПМИД   1512535 .
• Пиатье-Тонно Д., Гастинель Л.Н., Амблар Ф. и др. (1991). «Взаимодействие CD4 с антигенами HLA класса II и gp120 ВИЧ». Иммуногенетика . 34 (2): 121–8. дои : 10.1007/BF00211424 . ПМИД   1869305 . S2CID   10116507 .
• Нонг Ю., Кандил О., Тобин Э.Х. и др. (1991). «Ядерный белок p24 ВИЧ ингибирует индуцированное гамма-интерфероном увеличение уровней мРНК HLA-DR и тяжелой цепи цитохрома b в моноцитоподобной клеточной линии THP1 человека». Клетка. Иммунол . 132 (1): 10–6. дои : 10.1016/0008-8749(91)90002-S . ПМИД   1905983 .
• Розенштейн Ю., Буракофф С.Дж., Херрманн Ш.Х. (1990). «ВИЧ-gp120 может блокировать адгезию, опосредованную MHC CD4-класса II» . Дж. Иммунол . 144 (2): 526–31. дои : 10.4049/jimmunol.144.2.526 . ПМИД   1967269 .
• Каллахан К.М., Форт М.М., Оба Э.А. и др. (1990). «Генетическая изменчивость gp120 ВИЧ-1 влияет на взаимодействие с молекулами HLA и рецептором Т-клеток» . Дж. Иммунол . 144 (9): 3341–6. дои : 10.4049/jimmunol.144.9.3341 . ПМИД   1970352 .
• Боуман М.Р., Макферрин К.Д., Шрайбер С.Л., Буракофф С.Дж. (1991). «Идентификация и структурный анализ остатков в области V1 CD4, участвующих во взаимодействии с гликопротеином оболочки gp120 вируса иммунодефицита человека и молекулами главного комплекса гистосовместимости класса II» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 87 (22): 9052–6. дои : 10.1073/pnas.87.22.9052 . ПМЦ   55099 . ПМИД   1978941 .
• Коппельман Б., Крессвелл П. (1990). «Быстрая нелизосомальная деградация собранных гликопротеинов HLA класса II, включающих мутантную альфа-цепь DR» . Дж. Иммунол . 145 (8): 2730–6. дои : 10.4049/jimmunol.145.8.2730 . ПМИД   2212658 .
• Клейтон Л.К., Сие М., Пиус Д.А., Рейнхерц Э.Л. (1989). «Идентификация остатков CD4 человека, влияющих на MHC класса II по сравнению с связыванием gp120 ВИЧ-1» . Природа . 339 (6225): 548–51. Бибкод : 1989Natur.339..548C . дои : 10.1038/339548a0 . ПМИД   2543930 . S2CID   4246781 .
• Даймонд Д.С., Слекман Б.П., Грегори Т. и др. (1988). «Ингибирование функции CD4+ Т-клеток белком оболочки ВИЧ, gp120» . Дж. Иммунол . 141 (11): 3715–7. дои : 10.4049/jimmunol.141.11.3715 . ПМИД   2846691 .
• Тьернлунд У., Шейниус А., Йоханссон С. и др. (1989). «Ответ Т-клеток на очищенное производное белка после удаления клеток Лангерганса из суспензий эпидермальных клеток, содержащих кератиноциты, экспрессирующие трансплантационные антигены класса II». Скан. Дж. Иммунол . 28 (6): 667–73. дои : 10.1111/j.1365-3083.1988.tb01500.x . ПМИД   3266023 . S2CID   25824282 .
• Андриу Ж.М., Эвен П., Венет А. (1986). «СПИД и родственные синдромы как вирусно-индуцированное аутоиммунное заболевание иммунной системы: нарушение анти-MHC II. Терапевтические последствия». Исследования СПИДа . 2 (3): 163–74. дои : 10.1089/aid.1.1986.2.163 . ПМИД   3489470 .
• Дас Х.К., Лоуренс С.К., Вайсман С.М. (1983). «Структура и нуклеотидная последовательность гена тяжелой цепи HLA-DR» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 80 (12): 3543–7. Бибкод : 1983PNAS...80.3543D . дои : 10.1073/pnas.80.12.3543 . ПМК   394085 . ПМИД   6304715 .
• Шамбоек А., Корман А.Дж., Камб А., Строминджер Дж.Л. (1984). «Организация транскрипционной единицы антигена гистосовместимости человека II класса: тяжелая цепь HLA-DR» . Нуклеиновые кислоты Рез . 11 (24): 8663–75. дои : 10.1093/нар/11.24.8663 . ПМК   326615 . ПМИД   6324094 .
• Дас Х.К., Биро П.А., Коэн С.Н. и др. (1983). «Использование синтетических олигонуклеотидных зондов, комплементарных генам HLA-DR альфа и бета человека, в качестве праймеров расширения для выделения 5'-специфичных геномных клонов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 80 (6): 1531–5. Бибкод : 1983PNAS...80.1531D . дои : 10.1073/pnas.80.6.1531 . ПМЦ   393635 . ПМИД   6403940 .