HLA-B47
главный комплекс гистосовместимости (человек), класс I, B47
| ||
Аллели | Б*4701 Б*4702 Б*4703 | |
Структура (см. HLA-B ) | ||
Символ(ы) | HLA-B | |
ЭБИ-HLA | Б*4701 | |
ЭБИ-HLA | Б*4702 | |
ЭБИ-HLA | Б*4703 | |
Локус | хр.6 6п21.31 |
HLA-B47 (B47) представляет собой HLA - B серотип . Серотип идентифицирует продукты гена HLA-B*47 (B*4701, B*4702, B*4703). [ 1 ] Сравнение нуклеотидной последовательности B47 с другими последовательностями HLA-B показывает сегмент длиной 228 п.н., идентичный B44 в домене альфа 1, и сегмент длиной 218 п.н., идентичный B27 в домене альфа 2, но только сегмент длиной 91 п.н., идентичный B13. в домене альфа-1. Сложный характер замен и степень их дивергенции указывают на то, что аллели HLA-B13 и HLA-Bw47 не связаны простым мутационным событием. [ 2 ] B47 связан (близко на хромосоме) с геном, вызывающим недостаточность надпочечников. B47 обычно имеет низкую частоту и имеет самые высокие известные частоты в Центральной и Западной Африке. (Помощь по терминологии см. в: Учебное пособие по HLA-серотипам .)
Серотип
[ редактировать ]Б*47 | Б47 | Другой | Образец |
аллель | % | % | размер (Н) |
4701 | 50 | 37 | 317 |
4702 | 40 | 40 | 5 |
4703 | 25 | 50 | 4 |
Серотипирование B47 неудовлетворительно, и типирование лучше всего выполнять с помощью SSP-PCR или секвенирования генов.
Ассоциации болезней
[ редактировать ]B47 связан с дефицитом 21-гидроксилазы надпочечников . [ 2 ] Ген CYP21 расположен рядом с B47 между локусами HLA-B и HLA-DRB1 .
Частоты B*4701
[ редактировать ]частота | ||
исх. | Население | (%) |
[ 4 ] | Бамилеке ( Камерун ) | 2.6 |
[ 4 ] | Сапотек ( Оахака , Мексика ) | 2.2 |
[ 4 ] | Ниохоло Мандинка ( Сенегал ) | 1.6 |
[ 4 ] | Мбензеле Пигмей (ЦАР) | 1.5 |
[ 4 ] | Нанди (Кения) | 1.3 |
[ 4 ] | Суданский | 1.3 |
[ 4 ] | Яунде (Камерун) | 1.1 |
[ 4 ] | Лусака ( Замбия ) | 1.1 |
[ 4 ] | Центральная Португалия | 1.0 |
[ 4 ] | Болгария | 0.9 |
[ 4 ] | Чешская Республика | 0.9 |
[ 4 ] | Острова Зеленого Мыса | 0.8 |
[ 4 ] | Бербер ( Марокко ) | 0.7 |
[ 4 ] | Финляндия | 0.6 |
[ 4 ] | Хвост ( Грузия ) | 0.6 |
[ 4 ] | Бергамо (Италия) | 0.6 |
[ 4 ] | румыны | 0.6 |
[ 4 ] | Северный Дели ((Индия)) | 0.5 |
[ 4 ] | Оркнейские острова ( Шотландия ) | 0.5 |
[ 4 ] | Баскский ( Гипускоа , Испания) | 0.5 |
[ 4 ] | Юго-восточный (Франция) | 0.4 |
[ 4 ] | Мой собственный | 0.4 |
[ 4 ] | Кения | 0.3 |
Оранжевый = от 1 до 3%
Желтый = от 0,1 до 1%
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Марш, СГ; Альберт, Эд; Бодмер, ВФ; Бонтроп, RE; Дюпон, Б.; Эрлих, HA; Фернандес-Винья, М.; Джерати, Делавэр; Холдсворт, Р.; Херли, СК; Лау, М.; Ли, КВ; Мах, Б.; Майерс, М.; Майр, WR; Мюллер, ЧР; Пархэм, П.; Петерсдорф, EW; Сасадзуки, Т.; Строминджер, Дж.Л.; Свейгаард, А.; Терасаки, ИП; Тирси, Дж. М.; Троусдейл, Дж. (2010). «Номенклатура факторов системы HLA , Тканевые антигены . 75 (4): 291–455. дои : 10.1111/j.1399-0039.2010.01466.x . ПМК 2848993 . ПМИД 20356336 .
- ^ Jump up to: а б Земмур Дж., Эннис П.Д., Парэм П., Дюпон Б. (1988). «Сравнение структуры HLA-B47 и HLA-B13 и ее связь с дефицитом 21-гидроксилазы». Иммуногенетика . 27 (4): 281–7. дои : 10.1007/BF00376123 . ПМИД 3257938 .
- ^ получено из IMGT/HLA
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р с т в v В Миддлтон Д., Менчака Л., Руд Х., Комерофски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей» . Тканевые антигены . 61 (5): 403–7. дои : 10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x . ПМИД 12753660 .