USP4

USP4
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2Y6E, 5CTR
Идентификаторы
Псевдонимы	USP4 , UNP, Unph, убиквитинспецифическая пептидаза 4
Внешние идентификаторы	Опустить : 603486 ; МГИ : 98905 ; Гомологен : 20716 ; GeneCards : USP4 ; OMA : USP4 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	49,340,712 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	108,269,744 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	pancreatic ductal cell; ; endothelial cell; ; sural nerve; ; blood; ; epithelium of colon; ; monocyte; ; tonsil; ; nipple; ; sperm; ; pylorus;
	Top expressed in
	spermatid; ; spermatocyte; ; intestinal villus; ; yolk sac; ; Ileal epithelium; ; granulocyte; ; tail of embryo; ; neural layer of retina; ; ventricular zone; ; esophagus;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	peptidase activity; adenosine receptor binding; hydrolase activity; thiol-dependent deubiquitinase; metal ion binding; cysteine-type peptidase activity; identical protein binding; protein binding;
Cellular component	nucleus; lysosome; plasma membrane; cytoplasm; cytosol;
Biological process	ubiquitin-dependent protein catabolic process; spliceosomal tri-snRNP complex assembly; regulation of protein stability; proteolysis; negative regulation of protein ubiquitination; protein localization to cell surface; protein deubiquitination;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7375
	22258
	ENSG00000114316
	ENSMUSG00000032612
	Q13107
	P35123
	НМ_199443 ; НМ_001251877 ; НМ_003363
	НМ_011678 ; НМ_001311157
	НП_001238806 ; НП_003354 ; НП_955475
	НП_001298086 ; НП_035808
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Убиквитинспецифическая протеаза 4 (USP4) представляет собой фермент , который отщепляет убиквитин от ряда белковых субстратов. ^{[ 5 ]} До стандартизации номенклатуры USP4 был известен как UNP и был одним из первых деубиквитинирующих ферментов, идентифицированных у млекопитающих. ^{[ 6 ]} У мыши и человека белок USP4 кодируется геном, содержащим 22 экзона . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Этот белок является членом семейства цистеинпептидаз C19. Как деубиквитинирующий фермент, он необычен способностью расщеплять связи убиквитин- пролин . ^{[ 10 ]} Это свойство может отражать структурную гибкость активного центра фермента и объяснять его способность расщеплять убиквитиновые цепи различных связей. USP4 содержит субстраты, выполняющие важные функции в ряде клеточных сигнальных путей, включая пути NF-κB , TGF-β , Wnt/β-катенин , p53 и сплайсосомы пути . Другие субстраты включают аденозиновый рецептор A2A и белок Ro52 ( TRIM21 ).

USP4 представляет собой нуклеоцитоплазматический челночный белок , несущий сигнал функциональной ядерной локализации (NLS). ⁷⁶⁶QPQKKKK ⁷⁷² и сигнал ядерного экспорта (NES) ¹³³ВЕВИЛЕЛЛКЛ ¹⁴². ^{[ 11 ]} Эти сигналы инициируют транслокацию USP4 в ядро из цитоплазмы и наоборот соответственно. Соотношение цитоплазматического и ядерного пула USP4 варьируется в зависимости от типа клеток, фазы клеточного цикла и уровня экспрессии белка. ^{[ 11 ]}

Взаимодействия

Было показано, что USP4 взаимодействует с белком-супрессором опухоли pRb и белками, связанными с карманами p107 и p130 . ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000114316 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032612 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Грей Д. (2012). «Глава 462». В Роулингс и Салвесен (ред.). Справочник по протеолитическим ферментам (3-е изд.). Эльзевир. ISBN 9780123822192 .
^ Гупта К., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д., Дженкинс Н.А., Грей Д.А. (август 1993 г.). «Unp, мышиный ген, родственный онкогену tre». Онкоген . 8 (8): 2307–10. ПМИД 8336951 .
^ Ди Фрушио М., Гилкрист Калифорния, Бейкер Р.Т., Грей Д.А. (май 1998 г.). «Геномная структура Unp, мышиного гена, кодирующего убиквитин-специфическую протеазу». Биохим. Биофиз. Акта . 1398 (1): 9–17. дои : 10.1016/s0167-4781(98)00035-9 . ПМИД 9602026 .
^ Пуэнте XS, Санчес Л.М., общий управляющий, Лопес-Отин С. (июль 2003 г.). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Нат преподобный Жене . 4 (7): 544–558. дои : 10.1038/nrg1111 . ПМИД 12838346 . S2CID 2856065 .
^ «Ген Энтреза: убиквитинспецифическая пептидаза 4 USP4 (протоонкоген)» .
^ Гилкрист Калифорния, Грей Д.А., Бейкер Р.Т. (декабрь 1997 г.). «Убиквитин-специфичная протеаза, которая эффективно расщепляет связь убиквитин-пролин» . Ж. Биол. Хим . 272 (51): 32280–5. дои : 10.1074/jbc.272.51.32280 . hdl : 2292/60433 . ПМИД 9405433 .
^ Jump up to: ^а ^б Соболева Татьяна А.; Янс, Дэвид А.; Джонсон-Салиба, Мелани; Бейкер, Рохан Т. (18 октября 2004 г.). «Ядерно-цитоплазматическое челночное перемещение онкогенного мышиного деубиквитилирующего фермента UNP/USP4» . Журнал биологической химии . 280 (1): 745–752. дои : 10.1074/jbc.m401394200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 15494318 .
^ Бланшетт, Паола; Гилкрист, Кэтрин А; Бейкер, Рохан Т; Грей, Дуглас А. (сентябрь 2001 г.). «Ассоциация UNP, убиквитин-специфической протеазы, с карманными белками pRb, p107 и p130» . Онкоген . 20 (39): 5533–5537. дои : 10.1038/sj.onc.1204823 . ISSN 0950-9232 . ПМИД 11571651 .

Дальнейшее чтение

Д'Андреа А., Пеллман Д. (1999). «Дебиквитинирующие ферменты: новый класс биологических регуляторов». Крит. Преподобный Биохим. Мол. Биол . 33 (5): 337–352. дои : 10.1080/10409239891204251 . ПМИД 9827704 .
Грей Д.А., Инадзава Дж., Гупта К. и др. (1995). «Повышенная экспрессия Unph, протоонкогена в 3p21.3, в опухолях легких человека». Онкоген . 10 (11): 2179–83. ПМИД 7784062 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–174. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Гупта К., Шевретт М., Грей Д.А. (1994). «Протоонкоген Unp кодирует ядерный белок». Онкоген . 9 (6): 1729–31. ПМИД 8183569 .
Сузуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–156. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Ди Донато Ф., Чан Е.К., Асканасе А.Д. и др. (2001). «Взаимодействие между 52 кДа SSA/Ro и деубиквитинирующим ферментом UnpEL: ключ к функционированию». Межд. Дж. Биохим. Клеточная Биол . 33 (9): 924–934. дои : 10.1016/S1357-2725(01)00055-3 . ПМИД 11461834 .
Бланшетт П., Гилкрист Калифорния, Бейкер Р.Т., Грей Д.А. (2001). «Ассоциация UNP, убиквитин-специфической протеазы, с карманными белками pRb, p107 и p130» . Онкоген . 20 (39): 5533–5537. дои : 10.1038/sj.onc.1204823 . ПМИД 11571651 .
ДеСалле Л.М., Латрес Э., Лин Д. и др. (2001). «Дубиквитинирующий фермент Unp взаимодействует с белком ретинобластомы» . Онкоген . 20 (39): 5538–5542. дои : 10.1038/sj.onc.1204824 . ПМИД 11571652 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–16903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–2127. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Вада К., Танджи К., Камитани Т. (2006). «Онкогенный белок UnpEL/Usp4 деубиквитинирует Ro52 за счет своей изопептидазной активности». Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 339 (3): 731–736. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.11.076 . ПМИД 16316627 .
Вада К., Камитани Т. (2006). «UnpEL/Usp4 убиквитинируется Ro52 и деубиквитинируется сам по себе». Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 342 (1): 253–258. дои : 10.1016/j.bbrc.2006.01.144 . ПМИД 16472766 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q13107 (гидролаза с карбоксильным концом убиквитина 4) на PDBe-KB .

статья о гене на хромосоме 3 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000114316 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032612 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] Грей Д. (2012). «Глава 462». В Роулингс и Салвесен (ред.). Справочник по протеолитическим ферментам (3-е изд.). Эльзевир. ISBN 9780123822192 .

[pmid8336951-6] Гупта К., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д., Дженкинс Н.А., Грей Д.А. (август 1993 г.). «Unp, мышиный ген, родственный онкогену tre». Онкоген . 8 (8): 2307–10. ПМИД 8336951 .

[pmid9602026-7] Ди Фрушио М., Гилкрист Калифорния, Бейкер Р.Т., Грей Д.А. (май 1998 г.). «Геномная структура Unp, мышиного гена, кодирующего убиквитин-специфическую протеазу». Биохим. Биофиз. Акта . 1398 (1): 9–17. дои : 10.1016/s0167-4781(98)00035-9 . ПМИД 9602026 .

[pmid12838346-8] Пуэнте XS, Санчес Л.М., общий управляющий, Лопес-Отин С. (июль 2003 г.). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Нат преподобный Жене . 4 (7): 544–558. дои : 10.1038/nrg1111 . ПМИД 12838346 . S2CID 2856065 .

[entrez-9] «Ген Энтреза: убиквитинспецифическая пептидаза 4 USP4 (протоонкоген)» .

[pmid9405433-10] Гилкрист Калифорния, Грей Д.А., Бейкер Р.Т. (декабрь 1997 г.). «Убиквитин-специфичная протеаза, которая эффективно расщепляет связь убиквитин-пролин» . Ж. Биол. Хим . 272 (51): 32280–5. дои : 10.1074/jbc.272.51.32280 . hdl : 2292/60433 . ПМИД 9405433 .

[:0-11] Jump up to: ^а ^б Соболева Татьяна А.; Янс, Дэвид А.; Джонсон-Салиба, Мелани; Бейкер, Рохан Т. (18 октября 2004 г.). «Ядерно-цитоплазматическое челночное перемещение онкогенного мышиного деубиквитилирующего фермента UNP/USP4» . Журнал биологической химии . 280 (1): 745–752. дои : 10.1074/jbc.m401394200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 15494318 .

[12] Бланшетт, Паола; Гилкрист, Кэтрин А; Бейкер, Рохан Т; Грей, Дуглас А. (сентябрь 2001 г.). «Ассоциация UNP, убиквитин-специфической протеазы, с карманными белками pRb, p107 и p130» . Онкоген . 20 (39): 5533–5537. дои : 10.1038/sj.onc.1204823 . ISSN 0950-9232 . ПМИД 11571651 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]