NRXN1

NRXN1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3B3Q
Идентификаторы
Псевдонимы	NRXN1 , Hs.22998, PTHSL2, SCZD17, нейрексин 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 600565 ; МГИ : 1096391 ; Гомологен : 21005 ; Генные карты : NRXN1 ; OMA : NRXN1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	51,225,575 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	91,093,071 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; middle temporal gyrus; ; superior frontal gyrus; ; parietal lobe; ; postcentral gyrus; ; Brodmann area 23; ; entorhinal cortex; ; primary visual cortex; ; ventricular zone; ; lateral nuclear group of thalamus;
	Top expressed in
	medial dorsal nucleus; ; medial geniculate nucleus; ; lateral geniculate nucleus; ; anterior amygdaloid area; ; cingulate gyrus; ; primary motor cortex; ; dentate gyrus; ; prefrontal cortex; ; piriform cortex; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	metal ion binding; calcium-dependent protein binding; neuroligin family protein binding; signaling receptor binding; transmembrane signaling receptor activity; cell adhesion molecule binding; protein binding; type 1 fibroblast growth factor receptor binding; calcium ion binding; acetylcholine receptor binding; calcium channel regulator activity; signaling receptor activity;
Cellular component	integral component of membrane; vesicle; nuclear membrane; membrane; endocytic vesicle; axonal growth cone; synapse; cell surface; cell junction; neuronal cell body; endoplasmic reticulum; presynaptic membrane; plasma membrane; integral component of presynaptic membrane; presynapse; integral component of plasma membrane; nucleolus; protein-containing complex; Schaffer collateral - CA1 synapse; glutamatergic synapse; GABA-ergic synapse; integral component of presynaptic active zone membrane;
Biological process	calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; receptor localization to synapse; heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; NMDA glutamate receptor clustering; establishment of protein localization; neuron cell-cell adhesion; gamma-aminobutyric acid receptor clustering; neuronal signal transduction; gephyrin clustering involved in postsynaptic density assembly; postsynaptic density protein 95 clustering; learning; regulation of AMPA receptor activity; negative regulation of filopodium assembly; presynaptic membrane assembly; regulation of NMDA receptor activity; vocalization behavior; neuroligin clustering involved in postsynaptic membrane assembly; adult behavior; positive regulation of synaptic transmission, glutamatergic; postsynaptic membrane assembly; cell adhesion; angiogenesis; positive regulation of excitatory postsynaptic potential; social behavior; guanylate kinase-associated protein clustering; synapse assembly; protein-containing complex assembly involved in synapse maturation; synaptic vesicle clustering; protein localization to synapse; signal transduction; cerebellar granule cell differentiation; positive regulation of synapse assembly; positive regulation of presynaptic active zone assembly; positive regulation of protein localization to plasma membrane; positive regulation of gene expression; negative regulation of gene expression; positive regulation of protein kinase A signaling; neuron projection development; positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; positive regulation of fibroblast growth factor receptor signaling pathway; positive regulation of protein kinase B signaling; positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; cellular response to calcium ion; positive regulation of protein kinase C activity; vocal learning; chemical synaptic transmission; regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus; axon guidance; prepulse inhibition; neuromuscular process controlling balance; positive regulation of synapse maturation; neurotransmitter secretion; regulation of grooming behavior; synaptic membrane adhesion; regulation of synaptic vesicle cycle; regulation of postsynaptic specialization assembly; regulation of presynapse assembly; regulation of postsynaptic density assembly; trans-synaptic signaling by endocannabinoid;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9378
	18189
	ENSG00000179915
	ENSMUSG00000024109
	P58400 ; Q9ULB1 ; Q49A31
	P0DI97 ; Q9CS84
showНМ_001135659 ; НМ_004801 ; НМ_138735 ; НМ_001320156 ; НМ_001320157 ;
	NM_001330077; NM_001330078; NM_001330079; NM_001330081; NM_001330082; NM_001330083; NM_001330084; NM_001330085; NM_001330086; NM_001330087; NM_001330088; NM_001330089; NM_001330090; NM_001330091; NM_001330092; NM_001330093; NM_001330094; NM_001330095; NM_001330096; NM_001330097
showНМ_020252 ; НМ_177284 ; НМ_001346957 ; НМ_001346958 ; НМ_001346959 ;
	NM_001346960; NM_001346961; NM_001346962; NM_001347419
showНП_001129131 ; НП_001307085 ; НП_001307086 ; НП_001317006 ; НП_001317007 ;
	NP_001317008; NP_001317010; NP_001317011; NP_001317012; NP_001317013; NP_001317014; NP_001317015; NP_001317016; NP_001317017; NP_001317018; NP_001317019; NP_001317020; NP_001317021; NP_001317022; NP_001317023; NP_001317024; NP_001317025; NP_001317026; NP_004792; NP_620072; NP_001129131.1; NP_004792.1; NP_620072.1; NP_004792.1; NP_004792.1; NP_620072.1
showНП_001333886 ; НП_001333887 ; НП_001333888 ; НП_001333889 ; НП_001333890 ;
	NP_001333891; NP_001334348; NP_064648; NP_796258; NP_001390248; NP_001390249; NP_001390250; NP_001390251; NP_001390252; NP_001390253; NP_001390254; NP_001390255; NP_001390256; NP_001390257; NP_001390258; NP_001390259; NP_001390260; NP_001390261; NP_064648.3; NP_796258.2
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Нейрексин-1-альфа — это белок , который у человека кодируется NRXN1 геном . ^[5]

Нейрексины представляют собой семейство белков, которые функционируют в нервной системе позвоночных как молекулы и рецепторы клеточной адгезии. Они кодируются несколькими несвязанными генами, два из которых, NRXN1 и NRXN3 , являются одними из крупнейших известных человеческих генов. Три гена (NRXN1-3) используют два альтернативных промотора и включают множество альтернативно сплайсированных экзонов для генерации тысяч различных транскриптов мРНК и изоформ белка. Большинство транскриптов продуцируются вышестоящим промотором и кодируют изоформы альфа-нейрексина; гораздо меньшее количество транскриптов продуцируется нижестоящим промотором и кодирует изоформы бета-нейрексина. Альфа-нейрексины содержат последовательности, подобные эпидермальному фактору роста (EGF-подобные) и домены ламинина G , и было показано, что они взаимодействуют с нейрексофилинами . Бета-нейрексины лишены EGF-подобных последовательностей и содержат меньше доменов ламинина G, чем альфа-нейрексины. ^[5]

Функция

Нейрексины представляют собой молекулы пресинаптической мембранной клеточной адгезии , которые связываются в первую очередь с нейролигинами , белками, которые связаны с аутизмом . Аутизм характеризуется широким спектром социальных и когнитивных нарушений, которые частично объясняются нарушением синаптической связи между нейронами . ^[6] Отсутствие связи часто связано с мутациями NRXN1. Структурные варианты NRXN1a (нейрексин1 альфа) соответствуют мутациям, предрасполагающим к аутизму. ^[7] Эти альфа-нейрексины участвуют в коммуникации посредством механизмов сопряжения кальциевых каналов и экзоцитоза везикул, обеспечивая правильное высвобождение нейротрансмиттеров. Они особенно необходимы для высвобождения глутамата и ГАМК. ^[8] Последствия участия нейрексина в развитии аутизма были определены посредством делеции кодирующих экзонов NRXN1a, особенно на моделях мышей с нокаутом. У этих мышей наблюдались нарушения социального функционирования, снижение двигательной реакции в новых ситуациях и повышенное агрессивное поведение у самцов. ^[6] Социальное функционирование имело большое значение для этого гена и его связи с расстройствами аутистического спектра .

Геномика

Ген обнаружен в единственной копии на коротком плече хромосомы 2 (2p16.3). Ген имеет длину 1112187 оснований, расположен на цепи Крика (минус) и кодирует белок из 1477 аминокислот (молекулярная масса 161,883 кДа).

Мутации этого гена, прерывающие его экспрессию, связаны с шизофренией , аутизмом и умственной отсталостью ( мутации NRXN1 и расстройства головного мозга ).

Взаимодействия

Было показано, что NRXN1 взаимодействует с NLGN1 . ^[9]^[10]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000179915 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024109 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: нейрексин 1 NRXN1» .
^ Jump up to: ^а ^б Грейтон Х.; Мисслер М.; Коллиер Д.; Фернандес К. (2013). «Измененное социальное поведение мышей, нокаутированных по нейрорексину 1α, напоминает основные симптомы нарушений нервного развития» . ПЛОС ОДИН . 8 (6): e67114. Бибкод : 2013PLoSO...867114G . дои : 10.1371/journal.pone.0067114 . ПМК 3696036 . ПМИД 23840597 .
^ Ян Дж.; Нольтнер К.; Фэн Дж.; Ли В.; Шрёр Р.; Скиннер К.; Цзэн В.; Шварц CE; Лето СС (2008). «Структурные варианты нейрексина 1-альфа, связанные с аутизмом». Неврология Лит. 438 (3): 368–70. дои : 10.1016/j.neulet.2008.04.074 . ПМИД 18490107 . S2CID 7520448 .
^ Мисслер М.; Чжан В.; Рольманн А.; Каттенстрот Г.; Молот РЭ; Готтманн К.; Зудхоф ТЦ (2003). «Альфа-нейрексины соединяют каналы Ca2+ с экзоцитозом синаптических пузырьков». Природа . 423 (6943): 939–948. Бибкод : 2003Natur.423..939M . дои : 10.1038/nature01755 . ПМИД 12827191 . S2CID 10315093 .
^ Комолетти, Давиде; Флинн Робин; Дженнингс Лори Л; Чубыкин Александр; Мацумура Такехито; Хасэгава Хана; Зюдхоф Томас С; Тейлор Палмер (декабрь 2003 г.). «Характеристика взаимодействия рекомбинантного растворимого нейролигина-1 с нейрексином-1бета» . Ж. Биол. Хим . 278 (50). США: 50497–50505. дои : 10.1074/jbc.M306803200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 14522992 .
^ Ищенко, К; Нгуен Т; Зюдхоф ТЦ (февраль 1996 г.). «Структуры, альтернативный сплайсинг и связывание нейрексинов нескольких нейролигинов» . Ж. Биол. Хим . 271 (5). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 2676–2682. дои : 10.1074/jbc.271.5.2676 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 8576240 .

Дальнейшее чтение

Мисслер М, Зюдхоф ТЦ (1998). «Нейрексины: три гена и 1001 продукт». Тенденции Жене . 14 (1): 20–26. дои : 10.1016/S0168-9525(97)01324-3 . ПМИД 9448462 .
Накадзима Д., Оказаки Н., Ямакава Х. и др. (2003). «Создание готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное курирование 330 клонов кДНК KIAA» . ДНК Рез . 9 (3): 99–106. дои : 10.1093/dnares/9.3.99 . ПМИД 12168954 .
Ушкарев Ю.А., Петренко А.Г., Гепперт М., Зюдхоф ТЦ (1992). «Нейрексины: синаптические белки клеточной поверхности, связанные с рецептором альфа-латротоксина и ламинином». Наука . 257 (5066): 50–56. Бибкод : 1992Sci...257...50U . дои : 10.1126/science.1621094 . ПМИД 1621094 .
Ищенко К., Нгуен Т., Зюдхоф Т.К. (1996). «Структуры, альтернативный сплайсинг и связывание нейрексинов нескольких нейролигинов» . Ж. Биол. Хим . 271 (5): 2676–2682. дои : 10.1074/jbc.271.5.2676 . ПМИД 8576240 .
Петренко А.Г., Ульрих Б., Мисслер М. и др. (1996). «Структура и эволюция нейроксофилина» . Дж. Нейроски . 16 (14): 4360–9. doi : 10.1523/JNEUROSCI.16-14-04360.1996 . ПМК 6578849 . ПМИД 8699246 .
Хата Ю, Бутц С, Зюдхоф ТЦ (1996). «CASK: новый гомолог dlg/PSD95 с N-концевым кальмодулин-зависимым доменом протеинкиназы, идентифицированный путем взаимодействия с нейрексинами» . Дж. Нейроски . 16 (8): 2488–94. doi : 10.1523/JNEUROSCI.16-08-02488.1996 . ПМК 6578772 . PMID 8786425 .
Перин М.С. (1996). «Мотивы зеркального изображения опосредуют взаимодействие СООН-конца нескольких синаптотагминов с нейрексинами и кальмодулином». Биохимия . 35 (43): 13808–13816. дои : 10.1021/bi960853x . ПМИД 8901523 .
Нгуен Т., Зюдхоф ТК (1997). «Связывающие свойства нейролигина 1 и нейрексина 1бета обнаруживают функцию молекул гетерофильной клеточной адгезии» . Ж. Биол. Хим . 272 (41): 26032–26039. дои : 10.1074/jbc.272.41.26032 . ПМИД 9325340 .
Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н. и др. (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . ДНК Рез . 5 (1): 31–39. дои : 10.1093/dnares/5.1.31 . ПМИД 9628581 .
Мисслер М., Хаммер Р.Э., Зюдхоф ТЦ (1999). «Связывание нейроксофилина с альфа-нейрексинами. Один домен LNS функционирует как независимая сворачивающаяся лиганд-связывающая единица» . Ж. Биол. Хим . 273 (52): 34716–34723. дои : 10.1074/jbc.273.52.34716 . ПМИД 9856994 .
Клейдерляйн Дж. Дж., Ниссон П.Е., Джесси Дж. и др. (1999). «Повторы CCG в кДНК человеческого мозга». Хм. Жене . 103 (6): 666–673. дои : 10.1007/s004390050889 . ПМИД 9921901 . S2CID 23696667 .
Бидерер Т, Зюдхоф ТЦ (2001). «Мяты как адаптеры. Прямое связывание с нейрексинами и привлечение munc18» . Ж. Биол. Хим . 275 (51): 39803–39806. дои : 10.1074/jbc.C000656200 . ПМИД 11036064 .
Королл М., Ратьен Ф.Г., Фолькмер Х. (2001). «Молекула нейрофасцина, распознающая нервные клетки, взаимодействует с синтэнином-1, но не с синтэнином-2, оба из которых проявляют самоассоциирующую активность» . Ж. Биол. Хим . 276 (14): 10646–10654. дои : 10.1074/jbc.M010647200 . ПМИД 11152476 .
Фукуда М., Микошиба К. (2001). «Характеристика белка KIAA1427 как атипичного синаптотагмина (Syt XIII)» . Биохим. Дж . 354 (Часть 2): 249–57. дои : 10.1042/0264-6021:3540249 . ПМК 1221650 . ПМИД 11171101 .
Фукуда М., Микошиба К. (2001). «Синаптотагминоподобный белок 1-3: новое семейство тандемных белков C2 С-концевого типа». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 281 (5): 1226–1233. дои : 10.1006/bbrc.2001.4512 . ПМИД 11243866 .
Роуэн Л., Янг Дж., Бердит Б. и др. (2002). «Анализ генов нейрексина человека: альтернативный сплайсинг и создание разнообразия белков». Геномика . 79 (4): 587–597. дои : 10.1006/geno.2002.6734 . ПМИД 11944992 .
Табучи К., Зюдхоф ТЦ (2002). «Структура и эволюция генов нейрексина: понимание механизма альтернативного сплайсинга». Геномика . 79 (6): 849–859. дои : 10.1006/geno.2002.6780 . ПМИД 12036300 .
Накаяма М., Кикуно Р., Охара О (2003). «Белко-белковые взаимодействия между крупными белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК» . Геном Рез . 12 (11): 1773–1784. дои : 10.1101/гр.406902 . ПМК 187542 . ПМИД 12421765 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P58400 (Neurexin-1-beta) в PDBe-KB .

статья о гене на хромосоме 2 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000179915 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024109 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: нейрексин 1 NRXN1» .

[Grayton_2013-6] Jump up to: ^а ^б Грейтон Х.; Мисслер М.; Коллиер Д.; Фернандес К. (2013). «Измененное социальное поведение мышей, нокаутированных по нейрорексину 1α, напоминает основные симптомы нарушений нервного развития» . ПЛОС ОДИН . 8 (6): e67114. Бибкод : 2013PLoSO...867114G . дои : 10.1371/journal.pone.0067114 . ПМК 3696036 . ПМИД 23840597 .

[7] Ян Дж.; Нольтнер К.; Фэн Дж.; Ли В.; Шрёр Р.; Скиннер К.; Цзэн В.; Шварц CE; Лето СС (2008). «Структурные варианты нейрексина 1-альфа, связанные с аутизмом». Неврология Лит. 438 (3): 368–70. дои : 10.1016/j.neulet.2008.04.074 . ПМИД 18490107 . S2CID 7520448 .

[8] Мисслер М.; Чжан В.; Рольманн А.; Каттенстрот Г.; Молот РЭ; Готтманн К.; Зудхоф ТЦ (2003). «Альфа-нейрексины соединяют каналы Ca2+ с экзоцитозом синаптических пузырьков». Природа . 423 (6943): 939–948. Бибкод : 2003Natur.423..939M . дои : 10.1038/nature01755 . ПМИД 12827191 . S2CID 10315093 .

[pmid14522992-9] Комолетти, Давиде; Флинн Робин; Дженнингс Лори Л; Чубыкин Александр; Мацумура Такехито; Хасэгава Хана; Зюдхоф Томас С; Тейлор Палмер (декабрь 2003 г.). «Характеристика взаимодействия рекомбинантного растворимого нейролигина-1 с нейрексином-1бета» . Ж. Биол. Хим . 278 (50). США: 50497–50505. дои : 10.1074/jbc.M306803200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 14522992 .

[pmid8576240-10] Ищенко, К; Нгуен Т; Зюдхоф ТЦ (февраль 1996 г.). «Структуры, альтернативный сплайсинг и связывание нейрексинов нескольких нейролигинов» . Ж. Биол. Хим . 271 (5). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 2676–2682. дои : 10.1074/jbc.271.5.2676 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 8576240 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]