РЕККЛ4

РЕККЛ4
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2KMU
Идентификаторы
Псевдонимы	RECQL4 , RECQ4, RecQ, как геликаза 4
Внешние идентификаторы	Опустить : 603780 ; МГИ : 1931028 ; Гомологен : 3144 ; Генные карты : RECQL4 ; OMA : RECQL4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	144,517,845 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	76,594,748 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; mucosa of transverse colon; ; right testis; ; left testis; ; right hemisphere of cerebellum; ; ganglionic eminence; ; gonad; ; right frontal lobe; ; stromal cell of endometrium; ; putamen;
	Top expressed in
	fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; epiblast; ; tail of embryo; ; primitive streak; ; Paneth cell; ; ventricular zone; ; genital tubercle; ; embryo; ; primary oocyte; ; yolk sac;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	ATP-dependent DNA/DNA annealing activity; nucleotide binding; 3'-5' DNA helicase activity; bubble DNA binding; protein binding; hydrolase activity; ATP binding; helicase activity; nucleic acid binding; four-way junction helicase activity; oxidized purine DNA binding; telomeric D-loop binding; DNA binding; single-stranded DNA binding;
Cellular component	membrane; cytoplasm; nucleus; telomere; chromosome;
Biological process	multicellular organism development; DNA repair; base-excision repair; double-strand break repair via homologous recombination; DNA recombination; DNA replication; DNA duplex unwinding; telomeric D-loop disassembly; telomere maintenance; positive regulation of cell population proliferation; positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle; positive regulation of DNA replication; DNA unwinding involved in DNA replication;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9401
	79456
	ENSG00000160957
	ENSMUSG00000033762
	О94761
	Q75NR7
	НМ_004260
	НМ_058214
	НП_004251
	НП_478121
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

АТФ-зависимая ДНК-геликаза Q4 — фермент , который у человека кодируется RECQL4 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Мутации в RECQL4 связаны с аутосомно-рецессивным заболеванием, синдромом Ротмунда-Томсона , расстройством, которое имеет признаки преждевременного старения. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Помимо синдрома Ротмунда-Томсона, мутации RECQL4 также связаны с синдромами RAPADILINO и Баллера-Герольда . ^{[ 10 ]} Существует два типа синдрома Ротмунда-Томсона, и именно тип 2 возникает у пациентов, несущих вредные мутации в обеих копиях гена RECQL4 . Данное состояние связано с высоким риском развития остеосаркомы (злокачественной опухоли кости). ^{[ 11 ]} RECQL4 получил свое название из-за того, что он гомологичен (общая последовательность) с другими членами семейства геликаз RecQ . Два других генетических заболевания обусловлены мутациями других RECQ-хеликаз. Синдром Блума связан с мутациями гена BLM , а синдром Вернера — с мутациями гена WRN . ^{[ 12 ]}

восстановление ДНК

Двухцепочечные разрывы ДНК потенциально смертельны для клетки и требуют устранения. Восстановление двухцепочечных разрывов путем гомологичной рекомбинации (HR) является важным клеточным механизмом предотвращения этой летальности. RECQL4 играет решающую роль на первом этапе HR, называемом концевой резекцией. ^{[ 13 ]} Когда RECQL4 недостаточен, конечная резекция и, следовательно, HR уменьшаются. Имеющиеся данные свидетельствуют о том, что другие формы репарации ДНК, включая негомологическое соединение концов , эксцизионную репарацию нуклеотидов и эксцизионную репарацию оснований, также зависят от функции RECQL4. ^{[ 9 ]} При синдроме Ротмунда-Томсона связь недостаточной репарации ДНК, опосредованной RECQL4, и преждевременного старения согласуется с теорией старения, связанной с повреждением ДНК .

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000160957 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033762 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Китао С., Осуги И., Итикава К., Гото М., Фуруичи Ю., Симамото А. (февраль 1999 г.). «Клонирование двух новых генов геликазы человека семейства RecQ: биологическое значение нескольких видов у высших эукариот». Геномика . 54 (3): 443–52. дои : 10.1006/geno.1998.5595 . ПМИД 9878247 .
^ Сангрити М.Н., Бернал Дж.А., Мадин М., Филпотт А., Ли Дж., Данфи В.Г., Венкитараман А.Р. (июнь 2005 г.). «Для инициации репликации ДНК необходим белок RECQL4, мутировавший при синдроме Ротмунда-Томсона» . Клетка . 121 (6): 887–98. дои : 10.1016/j.cell.2005.05.015 . ПМИД 15960976 . S2CID 15064074 .
^ «Ген Энтрез: RECQL4, подобный белку RecQ 4» .
^ Лу Х, Фанг Э.Ф., Сикора П., Куликович Т., Чжан Ю., Беккер К.Г., Крото Д.Л., Бор В.А. (2014). «Старение, вызванное дисфункцией RECQL4, способствует проявлениям синдрома Ротмунда-Томсона у мышей» . Смерть клетки Дис . 5 (5): e1226. дои : 10.1038/cddis.2014.168 . ПМК 4047874 . ПМИД 24832598 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Лу Л, Джин В, Ван ЛЛ (2017). «Старение при синдроме Ротмунда-Томсона и связанных с ним генетических нарушениях RECQL4». Старение Рез. Преподобный . 33 : 30–35. дои : 10.1016/J.arr.2016.06.002 . ПМИД 27287744 . S2CID 28321025 .
^ Шаманна Р.А., Сингх Д.К., Лу Х., Мирей Г., Кейзерс Г., Саллес Б., Крото Д.Л., Бор В.А. (2014). «RECQ-хеликаза RECQL4 участвует в негомологичном соединении концов и взаимодействует с Ku-комплексом» . Канцерогенез . 35 (11): 2415–24. дои : 10.1093/carcin/bgu137 . ПМК 4216052 . ПМИД 24942867 .
^ Ван Л.Л., Ганнаварапу А., Козинец К.А. и др. (2003). «Связь между остеосаркомой и вредными мутациями в гене RECQL4 при синдроме Ротмунда-Томсона» . Дж. Натл. Онкологический институт . 95 (9): 669–74. дои : 10.1093/jnci/95.9.669 . ПМИД 12734318 .
^ Китао С., Линдор Н.М., Ширатори М. и др. (2000). «Ген, ответственный за синдром Ротмунда-Томсона, RECQL4: геномная структура и продукты». Геномика . 61 (3): 268–76. дои : 10.1006/geno.1999.5959 . ПМИД 10552928 .
^ Лу Х, Шаманна Р.А., Кейзерс Г., Ананд Р., Расмуссен Л.Дж., Цейка П., Крото Д.Л., Бор В.А. (2016). «RECQL4 способствует резекции концов ДНК при восстановлении двухцепочечных разрывов ДНК» . Представитель ячейки . 16 (1): 161–73. дои : 10.1016/j.celrep.2016.05.079 . ПМК 5576896 . ПМИД 27320928 .

Дальнейшее чтение

Келлермайер Р. (2006). «Универсальный RECQL4» . Жене. Мед . 8 (4): 213–6. дои : 10.1097/01.gim.0000214457.58378.1a . ПМИД 16617241 .
Соукуп Т (1976). «Типы интрафузальных волокон мышечных веретен конечностей крыс: морфологическая и гистохимическая характеристика». Гистохимия . 47 (1): 43–57. дои : 10.1007/BF00492992 . ПМИД 133085 . S2CID 23487130 .
Китао С., Симамото А., Гото М. и др. (1999). «Мутации в RECQL4 вызывают часть случаев синдрома Ротмунда-Томсона». Нат. Жене . 22 (1): 82–4. дои : 10.1038/8788 . ПМИД 10319867 . S2CID 195211275 .
Янкивский В., Марчиняк Р.А., Гуаренте Л., Нефф Н.Ф. (2000). «Ядерная структура в нормальных клетках и клетках с синдромом Блума» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (10): 5214–9. Бибкод : 2000PNAS...97.5214Y . дои : 10.1073/pnas.090525897 . ПМК 25808 . ПМИД 10779560 .
Кавабе Т., Цуяма Н., Китао С. и др. (2000). «Дифференциальная регуляция геликаз семейства RecQ человека в клеточной трансформации и клеточном цикле» . Онкоген . 19 (41): 4764–72. дои : 10.1038/sj.onc.1203841 . ПМИД 11032027 .
Ван Л.Л., Уорли К., Ганнаварапу А. и др. (2002). «Ограничение размера интрона как мутационный механизм при синдроме Ротмунда-Томсона» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 71 (1): 165–7. дои : 10.1086/341234 . ПМЦ 384974 . ПМИД 12016592 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Роверси Дж., Бегини А., Замбруно Дж. и др. (2003). «Идентификация двух новых экзонных SNP RECQL4 и геномная характеристика минисателлита IVS12» . Дж. Хум. Жене . 48 (2): 107–9. дои : 10.1007/s100380300016 . ПМИД 12601557 . S2CID 9960752 .
Ван Л.Л., Ганнаварапу А., Клерикуцио К.Л. и др. (2004). «Отсутствие мутаций RECQL4 при пойкилодермии с нейтропенией у пациентов навахо и ненавахо». Являюсь. Дж. Мед. Жене. А. 118 (3): 299–301. дои : 10.1002/ajmg.a.10057 . ПМИД 12673665 . S2CID 36023058 .
Бегини А., Касторина П., Роверси Г. и др. (2004). «Дефекты процессинга РНК гена геликазы RECQL4 у сложного гетерозиготного пациента Ротмунда-Томсона». Являюсь. Дж. Мед. Жене. А. 120 (3): 395–9. дои : 10.1002/ajmg.a.20154 . ПМИД 12838562 . S2CID 25885145 .
Сийтонен Х.А., Копра О., Кяарияйнен Х. и др. (2004). «Молекулярный дефект синдрома RAPADILINO расширяет фенотипический спектр заболеваний RECQL» . Хм. Мол. Гены . 12 (21): 2837–44. дои : 10.1093/hmg/ddg306 . ПМИД 12952869 .
Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С. и др. (2005). «Описание характеристик транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Нат. Биотехнология . 22 (6): 707–16. дои : 10.1038/nbt971 . ПМИД 15146197 . S2CID 27764390 .
Нишидзё К., Накаяма Т., Аояма Т. и др. (2004). «Мутационный анализ гена RECQL4 при спорадических остеосаркомах» . Межд. Дж. Рак . 111 (3): 367–72. дои : 10.1002/ijc.20269 . ПМИД 15221963 . S2CID 20389854 .
Инь Дж., Квон Ю.Т., Варшавский А., Ван В. (2005). «RECQL4, мутировавший при синдромах Ротмунда-Томсона и RAPADILINO, взаимодействует с убиквитинлигазами UBR1 и UBR2 пути правила N-конца» . Хм. Мол. Жене . 13 (20): 2421–30. дои : 10.1093/hmg/ddh269 . ПМИД 15317757 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Сенгупта С., Симамото А., Косиджи М. и др. (2005). «Опухолевый супрессор р53 подавляет транскрипцию хеликазы RECQ4» . Онкоген . 24 (10): 1738–48. дои : 10.1038/sj.onc.1208380 . ПМИД 15674334 .

Внешние ссылки

Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW о синдроме Ротмунда-Томсона

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000160957 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033762 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9878247-5] Китао С., Осуги И., Итикава К., Гото М., Фуруичи Ю., Симамото А. (февраль 1999 г.). «Клонирование двух новых генов геликазы человека семейства RecQ: биологическое значение нескольких видов у высших эукариот». Геномика . 54 (3): 443–52. дои : 10.1006/geno.1998.5595 . ПМИД 9878247 .

[pmid15960976-6] Сангрити М.Н., Бернал Дж.А., Мадин М., Филпотт А., Ли Дж., Данфи В.Г., Венкитараман А.Р. (июнь 2005 г.). «Для инициации репликации ДНК необходим белок RECQL4, мутировавший при синдроме Ротмунда-Томсона» . Клетка . 121 (6): 887–98. дои : 10.1016/j.cell.2005.05.015 . ПМИД 15960976 . S2CID 15064074 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: RECQL4, подобный белку RecQ 4» .

[pmid24832598-8] Лу Х, Фанг Э.Ф., Сикора П., Куликович Т., Чжан Ю., Беккер К.Г., Крото Д.Л., Бор В.А. (2014). «Старение, вызванное дисфункцией RECQL4, способствует проявлениям синдрома Ротмунда-Томсона у мышей» . Смерть клетки Дис . 5 (5): e1226. дои : 10.1038/cddis.2014.168 . ПМК 4047874 . ПМИД 24832598 .

[pmid27287744-9] Перейти обратно: ^а ^б Лу Л, Джин В, Ван ЛЛ (2017). «Старение при синдроме Ротмунда-Томсона и связанных с ним генетических нарушениях RECQL4». Старение Рез. Преподобный . 33 : 30–35. дои : 10.1016/J.arr.2016.06.002 . ПМИД 27287744 . S2CID 28321025 .

[pmid24942867-10] Шаманна Р.А., Сингх Д.К., Лу Х., Мирей Г., Кейзерс Г., Саллес Б., Крото Д.Л., Бор В.А. (2014). «RECQ-хеликаза RECQL4 участвует в негомологичном соединении концов и взаимодействует с Ku-комплексом» . Канцерогенез . 35 (11): 2415–24. дои : 10.1093/carcin/bgu137 . ПМК 4216052 . ПМИД 24942867 .

[11] Ван Л.Л., Ганнаварапу А., Козинец К.А. и др. (2003). «Связь между остеосаркомой и вредными мутациями в гене RECQL4 при синдроме Ротмунда-Томсона» . Дж. Натл. Онкологический институт . 95 (9): 669–74. дои : 10.1093/jnci/95.9.669 . ПМИД 12734318 .

[12] Китао С., Линдор Н.М., Ширатори М. и др. (2000). «Ген, ответственный за синдром Ротмунда-Томсона, RECQL4: геномная структура и продукты». Геномика . 61 (3): 268–76. дои : 10.1006/geno.1999.5959 . ПМИД 10552928 .

[pmid27320928-13] Лу Х, Шаманна Р.А., Кейзерс Г., Ананд Р., Расмуссен Л.Дж., Цейка П., Крото Д.Л., Бор В.А. (2016). «RECQL4 способствует резекции концов ДНК при восстановлении двухцепочечных разрывов ДНК» . Представитель ячейки . 16 (1): 161–73. дои : 10.1016/j.celrep.2016.05.079 . ПМК 5576896 . ПМИД 27320928 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]