TIMM50

TIMM50
Идентификаторы
Псевдонимы	TIMM50 , TIM50, TIM50L, транслоказа внутренней митохондриальной мембраны 50, MGCA9
Внешние идентификаторы	Омим : 607381 ; MGI : 1913775 ; Гомологен : 57031 ; GeneCards : Timm50 ; OMA : TIMM50 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	39,493,785 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	28,011,497 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	left testis; ; right testis; ; apex of heart; ; muscle of thigh; ; right auricle; ; gastrocnemius muscle; ; right lobe of thyroid gland; ; left ventricle; ; left lobe of thyroid gland; ; mucosa of transverse colon;
	Top expressed in
	right kidney; ; epiblast; ; tail of embryo; ; embryo; ; neural tube; ; embryo; ; ventricular zone; ; yolk sac; ; interventricular septum; ; proximal tubule;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	phosphoprotein phosphatase activity; protein serine/threonine phosphatase activity; interleukin-2 receptor binding; protein binding; RNA binding; protein tyrosine phosphatase activity; ribonucleoprotein complex binding;
Cellular component	integral component of membrane; nuclear speck; membrane; TIM23 mitochondrial import inner membrane translocase complex; nucleoplasm; mitochondrion; mitochondrial inner membrane; nucleus;
Biological process	protein dephosphorylation; protein import into mitochondrial matrix; protein transport; mitochondrial membrane organization; release of cytochrome c from mitochondria; peptidyl-tyrosine dephosphorylation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	92609
	66525
	ENSG00000105197
	Ensmusg00000003438
	Q3ZCQ8
	Q9D880
	NM_001001563 ; NM_001329559
	NM_025616
	NP_001001563 ; NP_001316488 ; NP_001001563.1
	NP_079892
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Митохондриальная импортная внутренняя мембранная субъединица TIM50 - это белок , который у людей кодируется TIMM50 геном . TIM50 является субъединицей транслоказного комплекса TIM23 во внутренней митохондриальной мембране. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Мутации в TIMM50 могут привести к эпилепсии , тяжелой интеллектуальной инвалидности и 3-метилглютаконовой ацидории . ^{[ 7 ]} Экспрессия TIMM50 повышается в клетках рака молочной железы ^{[ 8 ]} и уменьшились в гипертрофических сердцах. ^{[ 9 ]}

Структура

Ген TIMM50 расположен на руке Q хромосомы 19 в положении 13.2 и охватывает 13 373 пар оснований. ^{[ 6 ]} Ген продуцирует белок 39,6 кДа, состоящий из 353 аминокислот . ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} Этот ген кодирует субъединицу транслокационного комплекса внутренней митохондриальной мембраны, которая опосредует транслокацию транспортных пептид-содержащих белков через митохондриальную внутреннюю мембрану . ^{[ 6 ]}

Функция

Белок TIM50 функционирует в качестве рецепторной субъединицы, которая распознает сигнал митохондриального нацеливания или предварительную связь на белковом грузе, который предназначен для митохондриальной внутренней мембраны и матрицы . Нокдаун этого гена в клетках человека приводит к высвобождению цитохрома С и апоптоза . ^{[ 6 ]} Этот белок играет роль в поддержании барьера проницаемости мембраны. Межмембранная космическая область TIM50 вызывает закрытие транслокационной пор канала TIM23. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Клиническое значение

Миссенс-мутации в TIMM50 часто приводят к эпилепсии или эпилептической энцефалопатии , тяжелой интеллектуальной инвалидности, вариабельному митохондриальному дефициту V и 3-метилглутаконовой ацидории, что является ключевым биомаркером для дефектов митохондриальных мембраны и митохондриальной дизфункции. Наследование Timm50 является аутосомно -рецессивным . ^{[ 7 ]} Экспрессия гена TIMM50 повышается в рака молочной железы клетках . В таких клетках сверхэкспрессия белка TIM50 связана с отсутствием клеточного апоптоза и повышенной скоростью пролиферации. ^{[ 8 ]} Снижение экспрессии TIMM50 в клетках сердца может привести к гипертрофии сердца . ^{[ 9 ]}

Были представлены два пациента, мужские и женские братья и женщины, рожденные для кровных родителей бедуинов, демонстрируя непроизвольные аномальные движения, неспособность процветать, гипсаритмия , двусторонняя оптическая атрофия, 3-метилглютаконовую ацидурию и слегка повышенные уровни лакты в плазме . Оба начали ходить независимо через 3 года и первоначально получали благоприятной терапии АКТГ до тех пор, пока не перешли на лечение вальпроата с Сабрилом или Топамаксом , что привело к тому, что судороги полностью исчезают. Также были представлены еще два пациента, мужские и женские братья и сестры, рожденные от родителей первого сумочки мусульманского происхождения, демонстрируя миоклонические и тонизированные судороги, аномальную ЭЭГ , атрофию мозга, отсроченное психомоторное развитие и 3-метилглютаконовую ацидурию. Лечение ламиктала в сочетании с вальпроатом была эффективной для контроля судорог. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

В рамках комплекса TIM23 субъединица TIM50 напрямую взаимодействует с TIMM23 . Комплекс TIM23 взаимодействует с компонентом TIMM44 комплекса PAM и с DNAJC15 . Изоформа TIM50 взаимодействует с катушкой и SNRNP . ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000105197 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000003438 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Yamamoto H, Esaki M, Kanamori T, Tamura Y, Nishikawa S, Endo T (ноябрь 2002 г.). «TIM50 - это субъединица комплекса TIM23, которая связывает транслокацию белка через внешние и внутренние митохондриальные мембраны» . Клетка . 111 (4): 519–28. doi : 10.1016/s0092-8674 (02) 01053-X . PMID 12437925 . S2CID 18869447 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и «Ген Entrez: TIMM50 трансаза внутренней митохондриальной мембраны 50 гомолога (S. cerevisiae)» .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Shahrour MA, Staretz-Chacham O, Dayan D, Stephen J, Weech A, Damseh N, et al. (Май 2017). «Митохондриальная эпилептическая энцефалопатия, 3-метилглютаконовая ацицихирия и вариабельный комплекс V дефицит V, связанный с мутациями TIMM50» . Клиническая генетика . 91 (5): 690–696. doi : 10.1111/cge.12855 . PMC 8359539 . PMID 27573165 . S2CID 22348518 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} GAO SP, Sun HF, Jiang HL, Li LD, Hu X, Xu XE, Jin W (январь 2016 г.). «Потеря TIM50 подавляет пролиферацию и вызывает апоптоз при раке молочной железы». Опухолевая биология . 37 (1): 1279–87. doi : 10.1007/s13277-015-3878-0 . PMID 26289846 . S2CID 36502903 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Tang K, Zhao Y, Li H, Zhu M, Li W, Liu W, et al. (Апрель 2017). «Транлаказа внутренней мембраны 50 функционирует как новый защитный регулятор патологической гипертрофии сердца» . Журнал Американской кардиологической ассоциации . 6 (4): E004346. doi : 10.1161/jaha.116.004346 . PMC 5532988 . PMID 28432072 .
^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, et al. (Октябрь 2013). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома специализированной базой знаний» . Исследование циркуляции . 113 (9): 1043–53. doi : 10.1161/circresaha.113.301151 . PMC 4076475 . PMID 23965338 .
^ «МИТОХОХОНРИАЛЬНАЯ ИМПОРТА ВНУТРЕННАЯ МЕМБРАНА ТРЕЗЛОКА НАБОТА TIM50» . Сердечный органеллерный белок Атлас База знаний (copakb) . Архивировано из оригинала 2018-07-21 . Получено 2018-07-20 .
^ «TIMM50 - Митохондриальная импортная внутренняя мембрана транслоказа Субъединица TIM50 Precursor - Homo Sapiens (Human) - ген и белок TIMM50» . www.uniprot.org . Получено 2018-07-25 .

Дальнейшее чтение

Сюй Х., Сомерс З.Б., Робинсон М.Л., Хеберт М.Д. (июль 2005 г.). «TIM50A, ядерная изоформа митохондриального TIM50, взаимодействует с белками, участвующими в биогенезе SNRNP» . BMC клеточная биология . 6 (1): 29. doi : 10.1186/1471-2121-6-29 . PMC 1177934 . PMID 16008839 .
Guo Y, Cheong N, Zhang Z, De Rose R, Deng Y, Farber SA, Fernandes-Alnemri T, Alnemri Es (июнь 2004 г.). «TIM50, компонент митохондриального транслокатора, регулирует целостность митохондрий и гибель клеток» . Журнал биологической химии . 279 (23): 24813–25. doi : 10.1074/jbc.m402049200 . PMID 15044455 .
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand Po, Bergamini G, Croughton K, et al. (Февраль 2004 г.). «Физическая и функциональная карта человеческого пути передачи сигнала TNF-альфа/NF-Kappa B». Природная клеточная биология . 6 (2): 97–105. doi : 10.1038/ncb1086 . PMID 14743216 . S2CID 11683986 .
Yuryev A, Wennogle LP (февраль 2003 г.). «Новые взаимодействия белка-белка RAF-киназы, обнаруженные с помощью исчерпывающего двухгибридного анализа дрожжей». Геномика . 81 (2): 112–25. doi : 10.1016/s0888-7543 (02) 00008-3 . PMID 12620389 .

Эта статья включает в себя текст из Национальной медицины Соединенных Штатов , которая находится в общественном достоянии .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000105197 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000003438 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid12437925-5] Jump up to: ^а ^{беременный} Yamamoto H, Esaki M, Kanamori T, Tamura Y, Nishikawa S, Endo T (ноябрь 2002 г.). «TIM50 - это субъединица комплекса TIM23, которая связывает транслокацию белка через внешние и внутренние митохондриальные мембраны» . Клетка . 111 (4): 519–28. doi : 10.1016/s0092-8674 (02) 01053-X . PMID 12437925 . S2CID 18869447 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и «Ген Entrez: TIMM50 трансаза внутренней митохондриальной мембраны 50 гомолога (S. cerevisiae)» .

[Shahrour_2017-7] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Shahrour MA, Staretz-Chacham O, Dayan D, Stephen J, Weech A, Damseh N, et al. (Май 2017). «Митохондриальная эпилептическая энцефалопатия, 3-метилглютаконовая ацицихирия и вариабельный комплекс V дефицит V, связанный с мутациями TIMM50» . Клиническая генетика . 91 (5): 690–696. doi : 10.1111/cge.12855 . PMC 8359539 . PMID 27573165 . S2CID 22348518 .

[Gao_2016-8] Jump up to: ^а ^{беременный} GAO SP, Sun HF, Jiang HL, Li LD, Hu X, Xu XE, Jin W (январь 2016 г.). «Потеря TIM50 подавляет пролиферацию и вызывает апоптоз при раке молочной железы». Опухолевая биология . 37 (1): 1279–87. doi : 10.1007/s13277-015-3878-0 . PMID 26289846 . S2CID 36502903 .

[Tang_2017-9] Jump up to: ^а ^{беременный} Tang K, Zhao Y, Li H, Zhu M, Li W, Liu W, et al. (Апрель 2017). «Транлаказа внутренней мембраны 50 функционирует как новый защитный регулятор патологической гипертрофии сердца» . Журнал Американской кардиологической ассоциации . 6 (4): E004346. doi : 10.1161/jaha.116.004346 . PMC 5532988 . PMID 28432072 .

[COPaKB-10] Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, et al. (Октябрь 2013). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома специализированной базой знаний» . Исследование циркуляции . 113 (9): 1043–53. doi : 10.1161/circresaha.113.301151 . PMC 4076475 . PMID 23965338 .

[url_COPaKB-11] «МИТОХОХОНРИАЛЬНАЯ ИМПОРТА ВНУТРЕННАЯ МЕМБРАНА ТРЕЗЛОКА НАБОТА TIM50» . Сердечный органеллерный белок Атлас База знаний (copakb) . Архивировано из оригинала 2018-07-21 . Получено 2018-07-20 .

[12] «TIMM50 - Митохондриальная импортная внутренняя мембрана транслоказа Субъединица TIM50 Precursor - Homo Sapiens (Human) - ген и белок TIMM50» . www.uniprot.org . Получено 2018-07-25 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]