Паулинелла
Паулинелла | |
---|---|
![]() | |
Научная классификация ![]() | |
Домен: | Эукариоты |
Клэйд : | потогонные средства |
Клэйд : | САР |
Тип: | Церкозоа |
Сорт: | Вложение |
Заказ: | Эуглифида |
Семья: | Паулинеллиды |
Род: | Паулинелла Лаутерборн [1] [2] |
Типовой вид | |
Паулинелла хроматофора Лаутерборн 1895 г. [1] | |
Разновидность | |
| |
Синонимы | |
Каликомонас [6] |
Паулинелла - это род не менее одиннадцати человек. [15] [1] [6] [3] виды, включая как пресноводные, так и морские амебоиды . [16] Как и многие представители эвглифид, он покрыт рядами кремнистых чешуек и использует нитевидные ложноножки , чтобы ползать по субстрату донной зоны . [17]
Его наиболее известными представителями являются три фотосинтезирующих вида P. chromatophora , P. micropora и P. longichromatophora , первые два из которых представляют собой пресноводные формы, а третий — морскую форму. [18] которые недавно (в эволюционном плане) приняли цианобактерию в качестве эндосимбионта . [19] [20] В результате они больше не способны осуществлять фагоцитоз , как их нефотосинтезирующие родственники. [21] P. chromatophora была обнаружена в отложениях реки Рейн в канун Рождества 1894 года немецким биологом Робертом Лаутерборном , который назвал ее Паулинеллой в честь своей мачехи Полины. [22] [23] Событие постоянного эндосимбиоза, вероятно, произошло с цианобионтом . [24] Полученная органелла представляет собой фотосинтетический пластид , который часто называют «цианеллой» или хроматофором, и является единственным другим известным событием первичного эндосимбиоза фотосинтезирующих цианобактерий. [18] [16] хотя первичный эндосимбиоз с нефотосинтезирующим цианобактериальным симбионтом произошел в диатомовых семействе Rhopalodiaceae . [25] Эндосимбиотическое событие произошло около 90–140 миллионов лет назад, когда α-цианобактерия (а не β-цианобактерия , от которой произошли пластиды в Archaeplastida ), [26] который отделился около 500 миллионов лет назад от предков своей сестринской клады, состоящей из живых представителей цианобактерий родов Prochromococcus и Synechococcus , [27] [28] [5] [16] навсегда обосновался внутри амебы. [5] [29] Предполагается, что последний общий предок современных фотосинтезирующих видов жил около 60 миллионов лет назад. [30]
Это поразительно, поскольку хлоропласты всех других известных фотосинтезирующих эукариот происходят в конечном итоге от единственной цианобактерии-эндосимбионта, которая была взята примерно 1,6 миллиарда лет назад предковым архепластиданом (и впоследствии принята в другие группы эукариот в результате вторичных событий эндосимбиоза, а затем третичного и третичного эндосимбиоза). четвертичный эндосимбиоз и др.). Единственным исключением является инфузория Pseudoblepharisma tenue , которая помимо фотосинтетического симбионта, представляющего собой захваченные зеленые водоросли, имеет в качестве симбионта еще и фотосинтезирующий прокариот; пурпурные бактерии с уменьшенным геномом вместо цианобактерий. [31]
Геном хроматофора претерпел редукцию и теперь составляет всего одну треть размера генома его ближайших свободноживущих родственников, но все же в 10 раз больше, чем большинство пластидных геномов. Некоторые гены были потеряны, другие мигрировали в ядро амебы в результате эндосимбиотического переноса генов. [32] Подсчитано, что 0,3–0,8% генов паулинелл произошли отего эндосимбионт, помимо небольшого количества генов других организмов. [33] Другие гены деградировали из-за механизма Мюллера – скопления вредных мутаций из-за генетической изоляции и, вероятно, были заменены генами других микробов посредством горизонтального переноса генов . [34] [35] Некоторые из генов, полученных ядром от хроматофора, были многократно умножены с помощью механизма «копирования-вставки», называемого ретротранспозицией , что позволило им функционировать более эффективно и сделало их более устойчивыми к токсичным соединениям, связанным с фотосинтезом. Это настолько изменило метаболизм амебы, что она больше не могла питаться микробами, как ее предки, и стала полностью зависеть от своего эндосимбионта, который, в свою очередь, потерял так много генов, что больше не может выжить вне клетки-хозяина. [36] [37]
Паулинелла демонстрирует как очень медленную скорость роста, так и чувствительность к свету, делится каждые 6–7 дней и предпочитает условия низкой освещенности, вероятно, в качестве защиты от окислительного стресса и другого стресса, связанного со светом, поскольку у нее нет такой же степени фотозащиты механизмов . обнаружен у организмов с фотосинтетическим аппаратом архепластидного происхождения, имеющим гораздо более длительную эволюционную историю. [38] [39]
Ядерные гены P. chromatophora (те области, которые не затрагиваются эндосимбиотическим переносом генов) наиболее тесно связаны с гетеротрофным P. ovalis . [40] P. ovalis — морской гетеротрофный вид Paulinella, который, как было показано, поедает цианобактерии и бактерии. [41] P. ovalis также имеет по крайней мере два гена, подобных цианобактериям, которые, вероятно, были интегрированы в их геном в результате горизонтального переноса генов от его цианобактериальной добычи. Подобные гены могли подготовить фотосинтезирующие виды к принятию хроматофора. [42] Наличие существующих гетеротрофных линий делает Paulinella ценной моделью для разгадки ранних стадий первичного эндосимбиоза и изучения постсимбиотической эволюции генома как пластиды, так и хозяина. [43]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д Лаутерборн, Р. (1895). «Изучение простейших. II. Paulinella chromatophora nov. gen. nov. spec., пресноводное корненожье с сине-зелеными хроматофороподобными включениями». Журнал научной зоологии . 59 :537-544.
- ^ Доктор медицины Гири в Guiry, MD & Guiry, GM, 2013. AlgaeBase. Всемирное электронное издание, Национальный университет Ирландии, Голуэй. http://www.algaebase.org ; поиск 4 марта 2013 г.
- ^ Jump up to: а б с д и ж г Николлс, Кеннет Х. (ноябрь 2009 г.). «Шесть новых морских видов рода Paulinella (Rhizopoda: Filosea, или Rhizaria: Cercozoa)» . Журнал Морской биологической ассоциации Соединенного Королевства . 89 (7): 1415–1425. Бибкод : 2009JMBUK..89.1415N . дои : 10.1017/S0025315409000514 . S2CID 86359271 . Проверено 18 августа 2022 г.
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час «Паулинелла» . Интегрированная система таксономической информации . Проверено 28 января 2008 г.
- ^ Jump up to: а б с Марин, Б; Новак, ЕС; Глекнер, Г; Мелконян, М. (5 июня 2007 г.). «Предок хроматофора Paulinella получил карбоксисомный оперон путем горизонтального переноса генов от нитрококкоподобной гамма-протеобактерии» . Эволюционная биология BMC . 7 (1): 85. Бибкод : 2007BMCEE...7...85M . дои : 10.1186/1471-2148-7-85 . ПМК 1904183 . ПМИД 17550603 .
- ^ Jump up to: а б с Ломанн, Х. (1908). «Исследования по определению полного содержания планктона моря». Комм. З. Научный расследование. D. Немецкие моря в Киле и D. Биологический институт на Гельголанде. Научный Морское обследование, Северная Каролина, Департамент Киля, Том . 10 :131-137.
- ^ Вёрс, Ная (1 сентября 1992 г.). «Гетеротрофные амебы, жгутиконосцы и солнечники из района Твярминне Финского залива в 1988–1990 гг.» . Офелия . 36 (1): 1–109. дои : 10.1080/00785326.1992.10429930 . ISSN 0078-5326 . Проверено 19 августа 2022 г.
- ^ Ханна, Фиона; Роджерсон, Эндрю; Андерсон, О. Роджер (январь 1996 г.). «Описание Paulinella indentata N. Sp. (Filosea: Euglyphina) из сублиторальных прибрежных донных отложений» . Журнал эукариотической микробиологии . 43 (1): 1–4. дои : 10.1111/j.1550-7408.1996.tb02464.x . ISSN 1066-5234 . S2CID 84358420 .
- ^ Вёрс, Ная (май 1993 г.). «Морские гетеротрофные амебы, жгутиковые и солнечники из Белиза (Центральная Америка) и Тенерифе (Канарские острова) с описаниями новых видов: Luffisphaera Bulbochaete N. Sp., L. Longihastis N. Sp., L. Turriformis N. Sp. и Паулинелла Интермедиа Н. Сп" . Журнал эукариотической микробиологии . 40 (3): 272–287. дои : 10.1111/j.1550-7408.1993.tb04917.x . ISSN 1066-5234 . S2CID 221852241 . Проверено 19 августа 2022 г.
- ^ Ким, Сунджу; Пак, Мён Гиль (1 февраля 2016 г.). «Paulinella longichromatophora sp. nov., новая морская фотосинтетическая раковинная амеба, содержащая хроматофор» . Протист . 167 (1): 1–12. дои : 10.1016/j.protis.2015.11.003 . ISSN 1434-4610 . ПМИД 26709891 . Проверено 19 августа 2022 г.
- ^ Jump up to: а б «Паулинелла» . Таксономия NCBI . Бетесда, Мэриленд: Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 4 января 2019 г.
Линейные (полноценные) клеточные организмы; Эукариоты; Ризария; церкозоа; Имбрикатея; Силикофилоза; Эуглифида; Паулинеллиды
- ^ Ли, Дакхён; Ян, Ын Чан; Ким, Чон Им; Накаяма, Такуро; Зуккарелло, Джузеппе; Андерсен, Роберт А.; Юн, Хван Су (апрель 2017 г.). «Разнообразие фотосинтезирующих видов Paulinella с описанием Paulinella micropora sp. nov. и последовательностью генома хроматофора для штамма KR01» . Протист . 168 (2): 155–170. дои : 10.1016/j.protis.2017.01.003 . ISSN 1618-0941 . ПМИД 28262587 .
- ^ Вульф, А. (1919). «О мелком планктоне Баренцева моря». Научные морские исследования. Новый выпуск Департамент Гельголанд . 13 :95-125.
- ^ Джонсон, Пол В.; Харгрейвс, Пол Э.; Зибурт, ДЖОН МакН. (ноябрь 1988 г.). «Ультраструктура и экология Calycomonas ovalis Wulff, 1919 (Chrysophyceae) и ее переописание как панцирного корненожка, Paulinella ovalis N. Comb. (Filosea: Euglyphina) 1» . Журнал протозоологии . 35 (4): 618–626. дои : 10.1111/j.1550-7408.1988.tb04160.x .
- ^ «Поиск видов :: AlgaeBase» . algaebase.org . Проверено 19 августа 2022 г.
- ^ Jump up to: а б с Габр, Арва; Гроссман, Артур Р.; Бхаттачарья, Дебашиш (5 мая 2020 г.). Паленик, Б. (ред.). «Паулинелла, модель для понимания первичного эндосимбиоза пластид» . Журнал психологии . 56 (4). Уайли: 837–843. Бибкод : 2020JPcgy..56..837G . дои : 10.1111/jpy.13003 . ISSN 0022-3646 . ПМЦ 7734844 . PMID 32289879 .
- ^ Накаяма, Такуро; Арчибальд, Джон М. (2012). «Эволюция фотосинтетической органеллы» . БМК Биология . 10:35 . дои : 10.1186/1741-7007-10-35 . ПМЦ 3337241 . ПМИД 22531210 .
- ^ Jump up to: а б Ли, Дакхен; Ха, Джи-Сан; Ким, Сунджу; Пак, Мён Гиль; Бхаттачарья, Дебашиш; Юн, Хван Су (22 февраля 2019 г.). «Эволюционная динамика хроматофорного генома у трех фотосинтезирующих видов Paulinella» . Научные отчеты . 9 (1). Природа: 2560. Бибкод : 2019NatSR...9.2560L . дои : 10.1038/s41598-019-38621-8 . ПМК 6384880 . ПМИД 30796245 .
- ^ Лаура Вегенер Парфри ; Эрика Барберо; Элиз Лассер; Мика Данторн; Дебашиш Бхаттачарья; Дэвид Дж. Паттерсон ; Лаура А. Кац (декабрь 2006 г.). «Оценка поддержки текущей классификации эукариотического разнообразия» . ПЛОС Генетика . 2 (12): е220. doi : 10.1371/JOURNAL.PGEN.0020220 . ISSN 1553-7390 . ПМЦ 1713255 . ПМИД 17194223 . Викиданные Q21090155 .
- ^ Маккатчеон, Джон П. (6 октября 2021 г.). «Геномика и клеточная биология внутриклеточных инфекций, полезных для хозяина» . Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития . 37 (1): 115–142. doi : 10.1146/annurev-cellbio-120219-024122 . ISSN 1081-0706 . ПМИД 34242059 . S2CID 235786110 .
- ^ Гагат, Пшемыслав; Мацкевич, Павел (январь 2017 г.). «Cymbomonas Tetramitiformis — своеобразный празинофит со вкусом бактерий, проливает свет на эволюцию пластид» . Симбиоз . 71 (1): 1–7. Бибкод : 2017Symbi..71....1G . дои : 10.1007/s13199-016-0464-1 . ПМК 5167767 . ПМИД 28066124 . Проверено 18 августа 2022 г.
- ^ Арчибальд, Джон М. (2017). «Эволюция: импорт белка в зарождающуюся фотосинтетическую органеллу» . Современная биология . 27 (18): Р1004–Р1006. Бибкод : 2017CBio...27R1004A . дои : 10.1016/j.cub.2017.08.013 . ПМИД 28950079 . S2CID 21228029 .
- ^ Арчибальд, Джон (2014). Один плюс один равно одному: симбиоз и эволюция сложной жизни . ОУП Оксфорд. ISBN 978-0-19-163628-8 .
- ^ Фрис, Ян де; Гулд, Свен Б. (15 января 2018 г.). «Монопластидное узкое место в эволюции водорослей и растений» (PDF) . Журнал клеточной науки . 131 (2): jcs203414. дои : 10.1242/jcs.203414 . ISSN 0021-9533 . ПМИД 28893840 .
- ^ Накаяма, Такуро; Инагаки, Юдзи (12 октября 2017 г.). «Геномная дивергенция нефотосинтезирующих цианобактериальных эндосимбионтов ропалодиевых диатомей» . Научные отчеты . 7 (1). Природа: 13075. Бибкод : 2017NatSR...713075N . дои : 10.1038/s41598-017-13578-8 . ISSN 2045-2322 . ПМЦ 5638926 . ПМИД 29026213 .
- ^ Новак, Ева СМ; Прайс, Дана С.; Бхаттачарья, Дебашиш; Певица Анна; Мелконян, Михаил; Гроссман, Артур Р. (2016). «Перенос генов от различных бактерий компенсирует редукционную эволюцию генома в хроматофоре Paulinella chromatophora » . Труды Национальной академии наук . 113 (43): 12214–12219. Бибкод : 2016PNAS..11312214N . дои : 10.1073/pnas.1608016113 . ПМК 5087059 . ПМИД 27791007 .
- ^ Санчес-Баракальдо, Патрисия; Рэйвен, Джон А.; Пизани, Давиде; Нолл, Эндрю Х. (12 сентября 2017 г.). «Ранние фотосинтезирующие эукариоты населяли местообитания с низкой соленостью» . Труды Национальной академии наук . 114 (37): Е7737–Е7745. Бибкод : 2017PNAS..114E7737S . дои : 10.1073/pnas.1620089114 . ISSN 0027-8424 . ПМК 5603991 . ПМИД 28808007 .
- ^ Луис Делэй; Сесилио Валадес-Кано; Бернардо Перес-Саморано (15 марта 2016 г.). «Насколько на самом деле древна Paulinella Chromatophora?» . ПЛОС Токи . 8 . doi : 10.1371/CURRENTS.TOL.E68A099364BB1A1E129A17B4E06B0C6B . ISSN 2157-3999 . ПМЦ 4866557 . ПМИД 28515968 . Викиданные Q36374426 .
- ^ Льюис, Луиза А. (12 сентября 2017 г.). «Держи соль: пресноводное происхождение первичных пластид» . Труды Национальной академии наук . 114 (37): 9759–9760. Бибкод : 2017PNAS..114.9759L . дои : 10.1073/pnas.1712956114 . ISSN 0027-8424 . ПМК 5604047 . ПМИД 28860199 .
- ^ Бхаттачарья, Дебашиш; Эттен, Джулия Ван; Бенитес, Л. Фелипе; Стивенс, Тимоти Г. (2023). «Эндосимбиотический храповик ускоряет дивергенцию после возникновения органелл: модель эволюции пластид Паулинеллы» . Биоэссе . 45 (1): 2200165. doi : 10.1002/bies.202200165 . ISSN 0265-9247 . ПМИД 36328783 .
- ^ Муньос-Гомес, Серхио А.; Крейц, Мартин; Гесс, Себастьян (11 июня 2021 г.). «Микробный эукариот с уникальным сочетанием пурпурных бактерий и зеленых водорослей в качестве эндосимбионтов» . Достижения науки . 7 (24): eabg4102. Бибкод : 2021SciA....7.4102M . дои : 10.1126/sciadv.abg4102 . ISSN 2375-2548 . ПМЦ 8195481 . ПМИД 34117067 .
- ^ Чжан, Ру; Новак, Ева СМ; Прайс, Дана С.; Бхаттачарья, Дебашиш; Гроссман, Артур Р. (1 апреля 2017 г.). «Влияние интенсивности и качества света на экспрессию хроматофоров и ядерных генов у Paulinella chromatophora, амебы с зарождающимися фотосинтезирующими органеллами» . Журнал растений: для клеточной и молекулярной биологии . 90 (2): 221–234. дои : 10.1111/tpj.13488 . ПМИД 28182317 . S2CID 39165272 .
- ^ Новак, ЕС; Фогель, Х.; Грот, М.; Гроссман, Арканзас; Мелконян М.; Глекнер, Г. (2011). «Эндосимбиотический перенос генов и регуляция транскрипции переносимых генов у Paulinella chromatophora» . Молекулярная биология и эволюция . 28 (1): 407–422. дои : 10.1093/molbev/msq209 . ПМИД 20702568 .
- ^ Новак, Ева СМ; Прайс, Дана С.; Бхаттачарья, Дебашиш; Певица Анна; Мелконян, Михаил; Гроссман, Артур Р. (25 октября 2016 г.). «Перенос генов от различных бактерий компенсирует редукционную эволюцию генома в хроматофоре Paulinella chromatophora» . Труды Национальной академии наук . 113 (43): 12214–12219. Бибкод : 2016PNAS..11312214N . дои : 10.1073/pnas.1608016113 . ПМК 5087059 . ПМИД 27791007 .
- ^ Каллиер, Вивиан (8 июня 2022 г.). «Митохондрии и происхождение эукариот» . Знающий журнал . doi : 10.1146/knowable-060822-2 . S2CID 249526889 . Проверено 18 августа 2022 г.
- ^ «Исследование микробов проливает свет на решающий шаг в эволюции жизни на Земле» . Июнь 2022.
- ^ «Раскрытие эволюционного процесса, который обеспечил разнообразие растительной жизни на Земле» . Архивировано из оригинала 15 сентября 2022 года . Проверено 15 сентября 2022 г.
- ^ Габр, Арва; Зурнас, Апостол; Стивенс, Тимоти Г.; Дисмукс, Г. Чарльз; Бхаттачарья, Дебашиш (2022). «Доказательства наличия устойчивой фотосистемы II у фотосинтетической амебы Паулинеллы » . Новый фитолог . 234 (3): 934–945. дои : 10.1111/nph.18052 . ПМИД 35211975 . S2CID 247106539 .
- ^ Макорано, Луис; Новак, Ева СМ (2021). «Паулинелла хроматофора» . Современная биология . 31 (17): Р1024–Р1026. Бибкод : 2021CBio...31R1024M . дои : 10.1016/j.cub.2021.07.028 . ПМИД 34520707 .
- ^ Патрик Дж. Килинг (2004). «Разнообразие и история эволюции пластид и их хозяев» . Американский журнал ботаники . 91 (10): 1481–1493. дои : 10.3732/ajb.91.10.1481 . ПМИД 21652304 .
- ^ Джонсон, Пол В.; Харгрейвс, Пол Э.; Зибурт, ДЖОН МакН. (ноябрь 1988 г.). «Ультраструктура и экология Calycomonas ovalis Wulff, 1919 (Chrysophyceae) и ее переописание как панцирного корненожка, Paulinella ovalis N. Comb. (Filosea: Euglyphina) 1» . Журнал протозоологии . 35 (4): 618–626. дои : 10.1111/j.1550-7408.1988.tb04160.x . ISSN 0022-3921 .
- ^ Смит, Дэвид (1 января 2013 г.). «Укради мое солнышко» . Журнал «Ученый»® . Проверено 18 августа 2022 г.
- ^ Габр, Арва; Гроссман, Артур Р.; Бхаттачарья, Дебашиш (август 2020 г.). Паленик, Б. (ред.). «Паулинелла, модель для понимания первичного эндосимбиоза пластид» . Журнал психологии . 56 (4): 837–843. Бибкод : 2020JPcgy..56..837G . дои : 10.1111/jpy.13003 . ISSN 0022-3646 . ПМЦ 7734844 . PMID 32289879 .