Jump to content

Паулинелла

Паулинелла
Научная классификация Изменить эту классификацию
Домен: Эукариоты
Клэйд : потогонные средства
Клэйд : САР
Тип: Церкозоа
Сорт: Вложение
Заказ: Эуглифида
Семья: Паулинеллиды
Род: Паулинелла
Лаутерборн [1] [2]
Типовой вид
Паулинелла хроматофора
Лаутерборн 1895 г. [1]
Разновидность
Синонимы

Каликомонас [6]

Паулинелла - это род не менее одиннадцати человек. [15] [1] [6] [3] виды, включая как пресноводные, так и морские амебоиды . [16] Как и многие представители эвглифид, он покрыт рядами кремнистых чешуек и использует нитевидные ложноножки , чтобы ползать по субстрату донной зоны . [17]

Его наиболее известными представителями являются три фотосинтезирующих вида P. chromatophora , P. micropora и P. longichromatophora , первые два из которых представляют собой пресноводные формы, а третий — морскую форму. [18] которые недавно (в эволюционном плане) приняли цианобактерию в качестве эндосимбионта . [19] [20] В результате они больше не способны осуществлять фагоцитоз , как их нефотосинтезирующие родственники. [21] P. chromatophora была обнаружена в отложениях реки Рейн в канун Рождества 1894 года немецким биологом Робертом Лаутерборном , который назвал ее Паулинеллой в честь своей мачехи Полины. [22] [23] Событие постоянного эндосимбиоза, вероятно, произошло с цианобионтом . [24] Полученная органелла представляет собой фотосинтетический пластид , который часто называют «цианеллой» или хроматофором, и является единственным другим известным событием первичного эндосимбиоза фотосинтезирующих цианобактерий. [18] [16] хотя первичный эндосимбиоз с нефотосинтезирующим цианобактериальным симбионтом произошел в диатомовых семействе Rhopalodiaceae . [25] Эндосимбиотическое событие произошло около 90–140 миллионов лет назад, когда α-цианобактерия (а не β-цианобактерия , от которой произошли пластиды в Archaeplastida ), [26] который отделился около 500 миллионов лет назад от предков своей сестринской клады, состоящей из живых представителей цианобактерий родов Prochromococcus и Synechococcus , [27] [28] [5] [16] навсегда обосновался внутри амебы. [5] [29] Предполагается, что последний общий предок современных фотосинтезирующих видов жил около 60 миллионов лет назад. [30]

Это поразительно, поскольку хлоропласты всех других известных фотосинтезирующих эукариот происходят в конечном итоге от единственной цианобактерии-эндосимбионта, которая была взята примерно 1,6 миллиарда лет назад предковым архепластиданом (и впоследствии принята в другие группы эукариот в результате вторичных событий эндосимбиоза, а затем третичного и третичного эндосимбиоза). четвертичный эндосимбиоз и др.). Единственным исключением является инфузория Pseudoblepharisma tenue , которая помимо фотосинтетического симбионта, представляющего собой захваченные зеленые водоросли, имеет в качестве симбионта еще и фотосинтезирующий прокариот; пурпурные бактерии с уменьшенным геномом вместо цианобактерий. [31]

Геном хроматофора претерпел редукцию и теперь составляет всего одну треть размера генома его ближайших свободноживущих родственников, но все же в 10 раз больше, чем большинство пластидных геномов. Некоторые гены были потеряны, другие мигрировали в ядро ​​амебы в результате эндосимбиотического переноса генов. [32] Подсчитано, что 0,3–0,8% генов паулинелл произошли отего эндосимбионт, помимо небольшого количества генов других организмов. [33] Другие гены деградировали из-за механизма Мюллера – скопления вредных мутаций из-за генетической изоляции и, вероятно, были заменены генами других микробов посредством горизонтального переноса генов . [34] [35] Некоторые из генов, полученных ядром от хроматофора, были многократно умножены с помощью механизма «копирования-вставки», называемого ретротранспозицией , что позволило им функционировать более эффективно и сделало их более устойчивыми к токсичным соединениям, связанным с фотосинтезом. Это настолько изменило метаболизм амебы, что она больше не могла питаться микробами, как ее предки, и стала полностью зависеть от своего эндосимбионта, который, в свою очередь, потерял так много генов, что больше не может выжить вне клетки-хозяина. [36] [37]

Паулинелла демонстрирует как очень медленную скорость роста, так и чувствительность к свету, делится каждые 6–7 дней и предпочитает условия низкой освещенности, вероятно, в качестве защиты от окислительного стресса и другого стресса, связанного со светом, поскольку у нее нет такой же степени фотозащиты механизмов . обнаружен у организмов с фотосинтетическим аппаратом архепластидного происхождения, имеющим гораздо более длительную эволюционную историю. [38] [39]

Ядерные гены P. chromatophora (те области, которые не затрагиваются эндосимбиотическим переносом генов) наиболее тесно связаны с гетеротрофным P. ovalis . [40] P. ovalis — морской гетеротрофный вид Paulinella, который, как было показано, поедает цианобактерии и бактерии. [41] P. ovalis также имеет по крайней мере два гена, подобных цианобактериям, которые, вероятно, были интегрированы в их геном в результате горизонтального переноса генов от его цианобактериальной добычи. Подобные гены могли подготовить фотосинтезирующие виды к принятию хроматофора. [42] Наличие существующих гетеротрофных линий делает Paulinella ценной моделью для разгадки ранних стадий первичного эндосимбиоза и изучения постсимбиотической эволюции генома как пластиды, так и хозяина. [43]

  1. ^ Jump up to: а б с д Лаутерборн, Р. (1895). «Изучение простейших. II. Paulinella chromatophora nov. gen. nov. spec., пресноводное корненожье с сине-зелеными хроматофороподобными включениями». Журнал научной зоологии . 59 :537-544.
  2. ^ Доктор медицины Гири в Guiry, MD & Guiry, GM, 2013. AlgaeBase. Всемирное электронное издание, Национальный университет Ирландии, Голуэй. http://www.algaebase.org ; поиск 4 марта 2013 г.
  3. ^ Jump up to: а б с д и ж г Николлс, Кеннет Х. (ноябрь 2009 г.). «Шесть новых морских видов рода Paulinella (Rhizopoda: Filosea, или Rhizaria: Cercozoa)» . Журнал Морской биологической ассоциации Соединенного Королевства . 89 (7): 1415–1425. Бибкод : 2009JMBUK..89.1415N . дои : 10.1017/S0025315409000514 . S2CID   86359271 . Проверено 18 августа 2022 г.
  4. ^ Jump up to: а б с д и ж г час «Паулинелла» . Интегрированная система таксономической информации . Проверено 28 января 2008 г.
  5. ^ Jump up to: а б с Марин, Б; Новак, ЕС; Глекнер, Г; Мелконян, М. (5 июня 2007 г.). «Предок хроматофора Paulinella получил карбоксисомный оперон путем горизонтального переноса генов от нитрококкоподобной гамма-протеобактерии» . Эволюционная биология BMC . 7 (1): 85. Бибкод : 2007BMCEE...7...85M . дои : 10.1186/1471-2148-7-85 . ПМК   1904183 . ПМИД   17550603 .
  6. ^ Jump up to: а б с Ломанн, Х. (1908). «Исследования по определению полного содержания планктона моря». Комм. З. Научный расследование. D. Немецкие моря в Киле и D. Биологический институт на Гельголанде. Научный Морское обследование, Северная Каролина, Департамент Киля, Том . 10 :131-137.
  7. ^ Вёрс, Ная (1 сентября 1992 г.). «Гетеротрофные амебы, жгутиконосцы и солнечники из района Твярминне Финского залива в 1988–1990 гг.» . Офелия . 36 (1): 1–109. дои : 10.1080/00785326.1992.10429930 . ISSN   0078-5326 . Проверено 19 августа 2022 г.
  8. ^ Ханна, Фиона; Роджерсон, Эндрю; Андерсон, О. Роджер (январь 1996 г.). «Описание Paulinella indentata N. Sp. (Filosea: Euglyphina) из сублиторальных прибрежных донных отложений» . Журнал эукариотической микробиологии . 43 (1): 1–4. дои : 10.1111/j.1550-7408.1996.tb02464.x . ISSN   1066-5234 . S2CID   84358420 .
  9. ^ Вёрс, Ная (май 1993 г.). «Морские гетеротрофные амебы, жгутиковые и солнечники из Белиза (Центральная Америка) и Тенерифе (Канарские острова) с описаниями новых видов: Luffisphaera Bulbochaete N. Sp., L. Longihastis N. Sp., L. Turriformis N. Sp. и Паулинелла Интермедиа Н. Сп" . Журнал эукариотической микробиологии . 40 (3): 272–287. дои : 10.1111/j.1550-7408.1993.tb04917.x . ISSN   1066-5234 . S2CID   221852241 . Проверено 19 августа 2022 г.
  10. ^ Ким, Сунджу; Пак, Мён Гиль (1 февраля 2016 г.). «Paulinella longichromatophora sp. nov., новая морская фотосинтетическая раковинная амеба, содержащая хроматофор» . Протист . 167 (1): 1–12. дои : 10.1016/j.protis.2015.11.003 . ISSN   1434-4610 . ПМИД   26709891 . Проверено 19 августа 2022 г.
  11. ^ Jump up to: а б «Паулинелла» . Таксономия NCBI . Бетесда, Мэриленд: Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 4 января 2019 г. Линейные (полноценные) клеточные организмы; Эукариоты; Ризария; церкозоа; Имбрикатея; Силикофилоза; Эуглифида; Паулинеллиды
  12. ^ Ли, Дакхён; Ян, Ын Чан; Ким, Чон Им; Накаяма, Такуро; Зуккарелло, Джузеппе; Андерсен, Роберт А.; Юн, Хван Су (апрель 2017 г.). «Разнообразие фотосинтезирующих видов Paulinella с описанием Paulinella micropora sp. nov. и последовательностью генома хроматофора для штамма KR01» . Протист . 168 (2): 155–170. дои : 10.1016/j.protis.2017.01.003 . ISSN   1618-0941 . ПМИД   28262587 .
  13. ^ Вульф, А. (1919). «О мелком планктоне Баренцева моря». Научные морские исследования. Новый выпуск Департамент Гельголанд . 13 :95-125.
  14. ^ Джонсон, Пол В.; Харгрейвс, Пол Э.; Зибурт, ДЖОН МакН. (ноябрь 1988 г.). «Ультраструктура и экология Calycomonas ovalis Wulff, 1919 (Chrysophyceae) и ее переописание как панцирного корненожка, Paulinella ovalis N. Comb. (Filosea: Euglyphina) 1» . Журнал протозоологии . 35 (4): 618–626. дои : 10.1111/j.1550-7408.1988.tb04160.x .
  15. ^ «Поиск видов :: AlgaeBase» . algaebase.org . Проверено 19 августа 2022 г.
  16. ^ Jump up to: а б с Габр, Арва; Гроссман, Артур Р.; Бхаттачарья, Дебашиш (5 мая 2020 г.). Паленик, Б. (ред.). «Паулинелла, модель для понимания первичного эндосимбиоза пластид» . Журнал психологии . 56 (4). Уайли: 837–843. Бибкод : 2020JPcgy..56..837G . дои : 10.1111/jpy.13003 . ISSN   0022-3646 . ПМЦ   7734844 . PMID   32289879 .
  17. ^ Накаяма, Такуро; Арчибальд, Джон М. (2012). «Эволюция фотосинтетической органеллы» . БМК Биология . 10:35 . дои : 10.1186/1741-7007-10-35 . ПМЦ   3337241 . ПМИД   22531210 .
  18. ^ Jump up to: а б Ли, Дакхен; Ха, Джи-Сан; Ким, Сунджу; Пак, Мён Гиль; Бхаттачарья, Дебашиш; Юн, Хван Су (22 февраля 2019 г.). «Эволюционная динамика хроматофорного генома у трех фотосинтезирующих видов Paulinella» . Научные отчеты . 9 (1). Природа: 2560. Бибкод : 2019NatSR...9.2560L . дои : 10.1038/s41598-019-38621-8 . ПМК   6384880 . ПМИД   30796245 .
  19. ^ Лаура Вегенер Парфри ; Эрика Барберо; Элиз Лассер; Мика Данторн; Дебашиш Бхаттачарья; Дэвид Дж. Паттерсон ; Лаура А. Кац (декабрь 2006 г.). «Оценка поддержки текущей классификации эукариотического разнообразия» . ПЛОС Генетика . 2 (12): е220. doi : 10.1371/JOURNAL.PGEN.0020220 . ISSN   1553-7390 . ПМЦ   1713255 . ПМИД   17194223 . Викиданные   Q21090155 .
  20. ^ Маккатчеон, Джон П. (6 октября 2021 г.). «Геномика и клеточная биология внутриклеточных инфекций, полезных для хозяина» . Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития . 37 (1): 115–142. doi : 10.1146/annurev-cellbio-120219-024122 . ISSN   1081-0706 . ПМИД   34242059 . S2CID   235786110 .
  21. ^ Гагат, Пшемыслав; Мацкевич, Павел (январь 2017 г.). «Cymbomonas Tetramitiformis — своеобразный празинофит со вкусом бактерий, проливает свет на эволюцию пластид» . Симбиоз . 71 (1): 1–7. Бибкод : 2017Symbi..71....1G . дои : 10.1007/s13199-016-0464-1 . ПМК   5167767 . ПМИД   28066124 . Проверено 18 августа 2022 г.
  22. ^ Арчибальд, Джон М. (2017). «Эволюция: импорт белка в зарождающуюся фотосинтетическую органеллу» . Современная биология . 27 (18): Р1004–Р1006. Бибкод : 2017CBio...27R1004A . дои : 10.1016/j.cub.2017.08.013 . ПМИД   28950079 . S2CID   21228029 .
  23. ^ Арчибальд, Джон (2014). Один плюс один равно одному: симбиоз и эволюция сложной жизни . ОУП Оксфорд. ISBN  978-0-19-163628-8 .
  24. ^ Фрис, Ян де; Гулд, Свен Б. (15 января 2018 г.). «Монопластидное узкое место в эволюции водорослей и растений» (PDF) . Журнал клеточной науки . 131 (2): jcs203414. дои : 10.1242/jcs.203414 . ISSN   0021-9533 . ПМИД   28893840 .
  25. ^ Накаяма, Такуро; Инагаки, Юдзи (12 октября 2017 г.). «Геномная дивергенция нефотосинтезирующих цианобактериальных эндосимбионтов ропалодиевых диатомей» . Научные отчеты . 7 (1). Природа: 13075. Бибкод : 2017NatSR...713075N . дои : 10.1038/s41598-017-13578-8 . ISSN   2045-2322 . ПМЦ   5638926 . ПМИД   29026213 .
  26. ^ Новак, Ева СМ; Прайс, Дана С.; Бхаттачарья, Дебашиш; Певица Анна; Мелконян, Михаил; Гроссман, Артур Р. (2016). «Перенос генов от различных бактерий компенсирует редукционную эволюцию генома в хроматофоре Paulinella chromatophora » . Труды Национальной академии наук . 113 (43): 12214–12219. Бибкод : 2016PNAS..11312214N . дои : 10.1073/pnas.1608016113 . ПМК   5087059 . ПМИД   27791007 .
  27. ^ Санчес-Баракальдо, Патрисия; Рэйвен, Джон А.; Пизани, Давиде; Нолл, Эндрю Х. (12 сентября 2017 г.). «Ранние фотосинтезирующие эукариоты населяли местообитания с низкой соленостью» . Труды Национальной академии наук . 114 (37): Е7737–Е7745. Бибкод : 2017PNAS..114E7737S . дои : 10.1073/pnas.1620089114 . ISSN   0027-8424 . ПМК   5603991 . ПМИД   28808007 .
  28. ^ Луис Делэй; Сесилио Валадес-Кано; Бернардо Перес-Саморано (15 марта 2016 г.). «Насколько на самом деле древна Paulinella Chromatophora?» . ПЛОС Токи . 8 . doi : 10.1371/CURRENTS.TOL.E68A099364BB1A1E129A17B4E06B0C6B . ISSN   2157-3999 . ПМЦ   4866557 . ПМИД   28515968 . Викиданные   Q36374426 .
  29. ^ Льюис, Луиза А. (12 сентября 2017 г.). «Держи соль: пресноводное происхождение первичных пластид» . Труды Национальной академии наук . 114 (37): 9759–9760. Бибкод : 2017PNAS..114.9759L . дои : 10.1073/pnas.1712956114 . ISSN   0027-8424 . ПМК   5604047 . ПМИД   28860199 .
  30. ^ Бхаттачарья, Дебашиш; Эттен, Джулия Ван; Бенитес, Л. Фелипе; Стивенс, Тимоти Г. (2023). «Эндосимбиотический храповик ускоряет дивергенцию после возникновения органелл: модель эволюции пластид Паулинеллы» . Биоэссе . 45 (1): 2200165. doi : 10.1002/bies.202200165 . ISSN   0265-9247 . ПМИД   36328783 .
  31. ^ Муньос-Гомес, Серхио А.; Крейц, Мартин; Гесс, Себастьян (11 июня 2021 г.). «Микробный эукариот с уникальным сочетанием пурпурных бактерий и зеленых водорослей в качестве эндосимбионтов» . Достижения науки . 7 (24): eabg4102. Бибкод : 2021SciA....7.4102M . дои : 10.1126/sciadv.abg4102 . ISSN   2375-2548 . ПМЦ   8195481 . ПМИД   34117067 .
  32. ^ Чжан, Ру; Новак, Ева СМ; Прайс, Дана С.; Бхаттачарья, Дебашиш; Гроссман, Артур Р. (1 апреля 2017 г.). «Влияние интенсивности и качества света на экспрессию хроматофоров и ядерных генов у Paulinella chromatophora, амебы с зарождающимися фотосинтезирующими органеллами» . Журнал растений: для клеточной и молекулярной биологии . 90 (2): 221–234. дои : 10.1111/tpj.13488 . ПМИД   28182317 . S2CID   39165272 .
  33. ^ Новак, ЕС; Фогель, Х.; Грот, М.; Гроссман, Арканзас; Мелконян М.; Глекнер, Г. (2011). «Эндосимбиотический перенос генов и регуляция транскрипции переносимых генов у Paulinella chromatophora» . Молекулярная биология и эволюция . 28 (1): 407–422. дои : 10.1093/molbev/msq209 . ПМИД   20702568 .
  34. ^ Новак, Ева СМ; Прайс, Дана С.; Бхаттачарья, Дебашиш; Певица Анна; Мелконян, Михаил; Гроссман, Артур Р. (25 октября 2016 г.). «Перенос генов от различных бактерий компенсирует редукционную эволюцию генома в хроматофоре Paulinella chromatophora» . Труды Национальной академии наук . 113 (43): 12214–12219. Бибкод : 2016PNAS..11312214N . дои : 10.1073/pnas.1608016113 . ПМК   5087059 . ПМИД   27791007 .
  35. ^ Каллиер, Вивиан (8 июня 2022 г.). «Митохондрии и происхождение эукариот» . Знающий журнал . doi : 10.1146/knowable-060822-2 . S2CID   249526889 . Проверено 18 августа 2022 г.
  36. ^ «Исследование микробов проливает свет на решающий шаг в эволюции жизни на Земле» . Июнь 2022.
  37. ^ «Раскрытие эволюционного процесса, который обеспечил разнообразие растительной жизни на Земле» . Архивировано из оригинала 15 сентября 2022 года . Проверено 15 сентября 2022 г.
  38. ^ Габр, Арва; Зурнас, Апостол; Стивенс, Тимоти Г.; Дисмукс, Г. Чарльз; Бхаттачарья, Дебашиш (2022). «Доказательства наличия устойчивой фотосистемы II у фотосинтетической амебы Паулинеллы » . Новый фитолог . 234 (3): 934–945. дои : 10.1111/nph.18052 . ПМИД   35211975 . S2CID   247106539 .
  39. ^ Макорано, Луис; Новак, Ева СМ (2021). «Паулинелла хроматофора» . Современная биология . 31 (17): Р1024–Р1026. Бибкод : 2021CBio...31R1024M . дои : 10.1016/j.cub.2021.07.028 . ПМИД   34520707 .
  40. ^ Патрик Дж. Килинг (2004). «Разнообразие и история эволюции пластид и их хозяев» . Американский журнал ботаники . 91 (10): 1481–1493. дои : 10.3732/ajb.91.10.1481 . ПМИД   21652304 .
  41. ^ Джонсон, Пол В.; Харгрейвс, Пол Э.; Зибурт, ДЖОН МакН. (ноябрь 1988 г.). «Ультраструктура и экология Calycomonas ovalis Wulff, 1919 (Chrysophyceae) и ее переописание как панцирного корненожка, Paulinella ovalis N. Comb. (Filosea: Euglyphina) 1» . Журнал протозоологии . 35 (4): 618–626. дои : 10.1111/j.1550-7408.1988.tb04160.x . ISSN   0022-3921 .
  42. ^ Смит, Дэвид (1 января 2013 г.). «Укради мое солнышко» . Журнал «Ученый»® . Проверено 18 августа 2022 г.
  43. ^ Габр, Арва; Гроссман, Артур Р.; Бхаттачарья, Дебашиш (август 2020 г.). Паленик, Б. (ред.). «Паулинелла, модель для понимания первичного эндосимбиоза пластид» . Журнал психологии . 56 (4): 837–843. Бибкод : 2020JPcgy..56..837G . дои : 10.1111/jpy.13003 . ISSN   0022-3646 . ПМЦ   7734844 . PMID   32289879 .
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: df0e62b4af049b44dd22c4acce273fb1__1720903740
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/df/b1/df0e62b4af049b44dd22c4acce273fb1.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Paulinella - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)