НДУФБ2

НДУФБ2
Идентификаторы
Псевдонимы	NDUFB2 , AGGG, CI-AGGG, НАДН:убихиноноксидоредуктазная субъединица B2
Внешние идентификаторы	Опустить : 603838 ; МГИ : 1915448 ; Гомологен : 3341 ; Генные карты : NDUFB2 ; OMA : NDUFB2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	140,722,790 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	39,580,316 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	apex of heart; ; right ventricle; ; right lobe of thyroid gland; ; kidney tubule; ; right auricle; ; prefrontal cortex; ; left lobe of thyroid gland; ; metanephric glomerulus; ; endothelial cell; ; mucosa of transverse colon;
	Top expressed in
	interventricular septum; ; plantaris muscle; ; extraocular muscle; ; choroid plexus of fourth ventricle; ; facial motor nucleus; ; extensor digitorum longus muscle; ; myocardium of ventricle; ; digastric muscle; ; soleus muscle; ; cardiac muscle tissue of left ventricle;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity;
Cellular component	mitochondrial inner membrane; mitochondrial respiratory chain complex I; respirasome; membrane; mitochondrion;
Biological process	mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone; mitochondrial respiratory chain complex I assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4708
	68198
	ENSG00000090266
	ENSMUSG00000002416
	О95178
	Q9ЦП2
	НМ_004546
	НМ_026612 ; НМ_001358797
	НП_004537
	НП_080888 ; НП_001345726
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 бета-субъединица субъединицы 2 митохондрий представляет собой фермент , который у человека кодируется NDUFB2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} НАДН-дегидрогеназа (убихинон) 1-бета-субкомплекс, 2,8 кДа — вспомогательная субъединица комплекса НАДН-дегидрогеназы (убихинон) , расположенная во внутренней мембране митохондрий . Он также известен как Комплекс I и является крупнейшим из пяти комплексов цепи переноса электронов . ^{[ 8 ]}

Структура

Ген NDUFB2, расположенный на q-плече хромосомы 7 в положении 34, имеет длину 9966 пар оснований и состоит из 4 экзонов. ^{[ 7 ]} Белок NDUFB2 весит 12 кДа и состоит из 105 аминокислот. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} NDUFB2 — субъединица фермента НАДН-дегидрогеназы (убихинона) , крупнейшего из дыхательных комплексов. Структура имеет L-образную форму с длинным гидрофобным трансмембранным доменом и гидрофильным доменом периферического плеча, который включает все известные окислительно-восстановительные центры и сайт связывания НАДН. ^{[ 8 ]} NDUFB3 является одной из примерно 31 гидрофобной субъединицы, образующей трансмембранную область Комплекса I. Было отмечено, что N-концевой гидрофобный домен потенциально может сворачиваться в альфа-спираль, охватывающую внутреннюю митохондриальную мембрану с C-концевым гидрофильным доменом. взаимодействующих с глобулярными субъединицами Комплекса I. Высококонсервативная двухдоменная структура позволяет предположить, что эта особенность имеет решающее значение для функции белка и что гидрофобный домен действует как якорь для комплекса НАДН-дегидрогеназы (убихинон) на внутренней митохондриальной мембране. Анализ гидропатии показал, что эта субъединица и еще 4 субъединицы имеют общий гидрофильный характер, хотя они находятся во фракции гидрофобного белка (HP) комплекса I. ^{[ 7 ]}

Функция

Ген NDUFB2 человека кодирует субъединицу комплекса I дыхательной цепи , которая переносит электроны от НАДН к убихинону . ^{[ 7 ]} Однако NDUFB2 является вспомогательной субъединицей комплекса, которая, как полагают, не участвует в катализе. ^{[ 11 ]} Первоначально НАДН связывается с Комплексом I и переносит два электрона на изоаллоксазиновое кольцо протезного плеча флавинмононуклеотида (FMN ) с образованием FMNH ₂ . Электроны передаются через серию железо-серных кластеров (Fe-S) в протезной руке и, наконец, к коферменту Q10 (CoQ), который восстанавливается до убихинола (CoQH ₂ ). Поток электронов изменяет окислительно-восстановительное состояние белка, что приводит к конформационному изменению и сдвигу p K ионизируемой боковой цепи, которая выкачивает четыре иона водорода из митохондриального матрикса. ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000090266 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002416 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Эмахазион Т., Бесков А., Гилленстен У., Брукс А.Дж. (ноябрь 1998 г.). «Радиационное гибридное картирование на основе интронов 15 генов комплекса I цепи переноса электронов человека». Цитогенетический клеточный генетик . 82 (1–2): 115–9. дои : 10.1159/000015082 . ПМИД 9763677 . S2CID 46818955 .
^ Леффен Дж.Л., Трипельс Р.Х., ван ден Хеувел Л.П., Шуэльке М., Бускенс К.А., Смитс Р.Дж., Трийбелс Дж.М., Смейтинк Дж.А. (январь 1999 г.). «КДНК восьми ядерно-кодируемых субъединиц НАДН:убихиноноксидоредуктазы: завершена характеристика кДНК человеческого комплекса I». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 253 (2): 415–22. дои : 10.1006/bbrc.1998.9786 . ПМИД 9878551 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д «Ген Энтреза: NDUFB2 НАДН-дегидрогеназа (убихинон) 1 бета-субкомплекс, 2, 8 кДа» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Voet D , Voet JG , Пратт CW (2013). «Глава 18». Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. стр. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7 .
^ Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .
^ «НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 бета-субъединица 1» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) .
^ «NDUFB2-НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 бета-субъединица 2» . UniProt: центр информации о белках . Консорциум UniProt . Проверено 2 апреля 2015 г.

Дальнейшее чтение

Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Yeh CH, Pang JH, Wu YC и др. (2004). «Полимеразная цепная реакция дифференциального дисплея идентифицирует никотинамидадениндинуклеотид-убихиноноксидоредуктазу как ген, регулируемый ишемией / реперфузией в кардиомиоцитах». Грудь . 125 (1): 228–35. дои : 10.1378/сундук.125.1.228 . ПМИД 14718445 .
Шерер С.В., Чунг Дж., Макдональд Дж.Р. и др. (2003). «Хромосома человека 7: последовательность ДНК и биология» . Наука . 300 (5620): 767–72. Бибкод : 2003Sci...300..767S . дои : 10.1126/science.1083423 . ПМК 2882961 . ПМИД 12690205 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Чжан QH, Е М, Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34+ гемопоэтических стволовых клетках/клетках-предшественниках» . Геном Рез . 10 (10): 1546–60. дои : 10.1101/гр.140200 . ПМК 310934 . ПМИД 11042152 .
Центр Сэнгера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, (1999). «На пути к полной последовательности генома человека» . Геном Рез . 8 (11): 1097–108. дои : 10.1101/гр.8.11.1097 . ПМИД 9847074 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000090266 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002416 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9763677-5] Эмахазион Т., Бесков А., Гилленстен У., Брукс А.Дж. (ноябрь 1998 г.). «Радиационное гибридное картирование на основе интронов 15 генов комплекса I цепи переноса электронов человека». Цитогенетический клеточный генетик . 82 (1–2): 115–9. дои : 10.1159/000015082 . ПМИД 9763677 . S2CID 46818955 .

[pmid9878551-6] Леффен Дж.Л., Трипельс Р.Х., ван ден Хеувел Л.П., Шуэльке М., Бускенс К.А., Смитс Р.Дж., Трийбелс Дж.М., Смейтинк Дж.А. (январь 1999 г.). «КДНК восьми ядерно-кодируемых субъединиц НАДН:убихиноноксидоредуктазы: завершена характеристика кДНК человеческого комплекса I». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 253 (2): 415–22. дои : 10.1006/bbrc.1998.9786 . ПМИД 9878551 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б ^с ^д «Ген Энтреза: NDUFB2 НАДН-дегидрогеназа (убихинон) 1 бета-субкомплекс, 2, 8 кДа» .

[Biochem-8] Jump up to: ^а ^б ^с Voet D , Voet JG , Пратт CW (2013). «Глава 18». Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. стр. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7 .

[COPaKB-9] Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .

[url_COPaKB-10] «НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 бета-субъединица 1» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) .

[uniprot-11] «NDUFB2-НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 бета-субъединица 2» . UniProt: центр информации о белках . Консорциум UniProt . Проверено 2 апреля 2015 г.

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]