Jump to content

U2 вспомогательный фактор 1 малой ядерной РНК

(Перенаправлено с U2AF1 )

U2AF1
Доступные структуры
ПДБ Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы U2AF1 , FP793, RN, RNU2AF35, U2AFBP, U2 вспомогательный фактор 1 малой ядерной РНК
Внешние идентификаторы Опустить : 191317 ; Гомологен : 134334 ; Генные карты : U2AF1 ; OMA : U2AF1 — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_001025203
НМ_001025204
НМ_006758

н/д

RefSeq (белок)

н/д

Местоположение (UCSC) Чр 21: 43.09 – 43.11 Мб н/д
в PubMed Поиск [ 2 ] н/д
Викиданные
Просмотр/редактирование человека

Субъединица фактора сплайсинга U2AF массой 35 кДа представляет собой белок , который у человека кодируется U2AF1 геном . [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]

фактора сплайсинга SR. Этот ген принадлежит к семейству генов [ нужна ссылка ] . U2AF1 является субъединицей комплекса вспомогательного фактора U2 наряду с более крупной субъединицей U2AF2 . U2AF1 представляет собой белок, не являющийся мяРНП, необходимый для связывания U2 мяРНП с сайтом разветвления пре-мРНК . Этот ген кодирует небольшую (~35 кДа) субъединицу, которая играет решающую роль в сплайсинге РНК, распознавая и связываясь с нуклеотидами AG в 3'-сайте сплайсинга, чтобы облегчить сборку сплайсосомы . [ 6 ] альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы. Были идентифицированы [ нужна ссылка ] . Соматические мутации в U2AF1 были обнаружены при ряде видов рака человека, причем характерный характер этих мутаций на «цинковых пальцах» указывает на их функциональную роль при селекции. [ 7 ] При раке легких эти мутации влияют на альтернативный сплайсинг нескольких транскриптов, включая онкогенные ROS1 . слияния [ 8 ] Условная делеция U2af1 в кроветворной системе мыши приводит к ранней летальности, что позволяет предположить, что она важна для гемопоэтических стволовых клеток поддержания и функционирования { https://doi.org/10.1038/s41375-020-01116-x }.

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что вспомогательный фактор 1 малой ядерной РНК U2 взаимодействует с:

  1. ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000160201 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ Лалиоти, М.Д., Гос А., Грин М.Р., Россье С., Моррис М.А., Антонаракис С.Е. (январь 1997 г.). «Ген малой субъединицы 35-кДа вспомогательного фактора мяРНП U2 человека (U2AF1) картируется в критической области прогрессирующей миоклонусной эпилепсии (EPM1) на хромосоме 21q22.3». Геномика . 33 (2): 298–300. дои : 10.1006/geno.1996.0196 . ПМИД   8660980 .
  4. ^ Кальчева И., Пласс С., Саит С., Эдди Р., Шоус Т., Уоткинс-Чоу Д., Кампер С., Сибата Х., Уэда Т., Такаги Н. (декабрь 1994 г.). «Сравнительное картирование импринтированного гена U2afbpL на хромосоме 11 мыши и хромосоме 5 человека». Цитогенетический клеточный генетик . 68 (1–2): 19–24. дои : 10.1159/000133881 . ПМИД   7956352 .
  5. ^ «Ген Энтрез: U2AF1 U2 вспомогательный фактор 1 малой ядерной РНК» .
  6. ^ Замор П.Д., Грин М.Р. (1989). «Идентификация, очистка и биохимическая характеристика вспомогательного фактора малого ядерного рибонуклеопротеина U2» . ПНАС . 86 (23): 9243–9247. Бибкод : 1989PNAS...86.9243Z . дои : 10.1073/pnas.86.23.9243 . ПМК   298470 . ПМИД   2531895 . Ву С., Ромфо СМ, Нильсен Т.В., Грин М.Р. (1999). «Функциональное распознавание 3'-сайта сплайсинга AG фактором сплайсинга U2AF35». Природа . 402 (6763): 832–5. Бибкод : 1999Natur.402..832W . дои : 10.1038/45590 . ПМИД   10617206 . S2CID   4405416 .
  7. ^ Имелински М, Бергер А.Г., Хаммерман П.С., Эрнандес Б., Пью Т.Дж., Ходис Э., Чо Дж., Су Дж., Капеллетти М., Сиваченко А., Суньез С., Оклер А., Лоуренс М.С., Стоянов П., Цибульскис К., Чой К., де Ваал Л, Шарифния Т, Брукс А, Грейлих Х, Банерджи С, Зандер Т, Зайдель Д, Леендерс Ф, Ансен С, Людвиг С, Энгель-Ридель В, Столбен Е, Вольф Дж, Гопарью С, Томпсон К, Винклер В, Квятковски Д., Джонсон Б.Е., Янне П.А., Миллер В.А., Пао В., Трэвис В.Д., Пасс Х.И., Габриэль С.Б., Ландер Э.С., Томас Р.К., Гарравэй Л.А., Гетц Г. и др. (2012). «Картирование признаков аденокарциномы легких с помощью массового параллельного секвенирования» . Клетка . 150 (6): 1107–1120. дои : 10.1016/j.cell.2012.08.029 . ПМЦ   3557932 . ПМИД   22980975 .
  8. ^ Исфахани М.С., Ли Л.Дж., Чон Й.Дж., Флинн Р.А., Штер Х., Хуэй А.Б. и др. (декабрь 2019 г.). «Функциональное значение мутаций U2AF1 S34F при аденокарциномах легких» . Природные коммуникации . 10 (1): 5712. Бибкод : 2019NatCo..10.5712E . дои : 10.1038/s41467-019-13392-y . ПМК   6911043 . ПМИД   31836708 .
  9. ^ Сяо С.Х., Мэнли Дж.Л. (ноябрь 1998 г.). «Фосфорилирование-дефосфорилирование по-разному влияет на активность фактора сплайсинга ASF/SF2» . ЭМБО Дж . 17 (21): 6359–67. дои : 10.1093/emboj/17.21.6359 . ПМК   1170960 . ПМИД   9799243 .
  10. ^ Чжан WJ, Ву JY (октябрь 1996 г.). «Функциональные свойства p54, нового белка SR, активного в конститутивном и альтернативном сплайсинге» . Мол. Клетка. Биол . 16 (10): 5400–8. дои : 10.1128/MCB.16.10.5400 . ПМК   231539 . ПМИД   8816452 .
  11. ^ Золотухин А.С., Тан В., Беар Дж., Смулевич С., Фельбер Б.К. (февраль 2002 г.). «U2AF участвует в связывании TAP (NXF1) с мРНК» . Ж. Биол. Хим . 277 (6): 3935–42. дои : 10.1074/jbc.M107598200 . ПМИД   11724776 .
  12. ^ Майта Х, Китаура Х, Кин Т.Дж., Инглхерн К.Ф., Арига Х., Игучи-Арига С.М. (ноябрь 2004 г.). «PAP-1, мутированный ген, лежащий в основе формы RP9 доминантного пигментного ретинита, является фактором сплайсинга». Эксп. Сотовый Res . 300 (2): 283–96. дои : 10.1016/j.yexcr.2004.07.029 . ПМИД   15474994 .
  13. ^ Литтл Дж.Т., Юрица М.С. (март 2008 г.). «Фактор сплайсинга SPF30 соединяет взаимодействие между белком пресплайсосомы U2AF35 и белком трехмалого ядерного рибонуклеопротеина hPrp3» . Ж. Биол. Хим . 283 (13): 8145–52. дои : 10.1074/jbc.M707984200 . ПМИД   18211889 .
  14. ^ Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД   16189514 . S2CID   4427026 .
  15. ^ Чжан М., Замор П.Д., Кармо-Фонсека М., Ламонд А.И., Грин М.Р. (сентябрь 1992 г.). «Клонирование и внутриклеточная локализация малой субъединицы вспомогательного фактора малого ядерного рибонуклеопротеина U2» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 89 (18): 8769–73. Бибкод : 1992PNAS...89.8769Z . дои : 10.1073/pnas.89.18.8769 . ПМК   50002 . ПМИД   1388271 .
  16. ^ Адамс DJ, ван дер Вейден Л., Майеда А., Стамм С., Моррис Б.Дж., Раско Дж.Э. (июль 2001 г.). «ZNF265 — новый сплайсосомный белок, способный индуцировать альтернативный сплайсинг» . Дж. Клеточная Биол . 154 (1): 25–32. дои : 10.1083/jcb.200010059 . ПМК   2196870 . ПМИД   11448987 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q01081 (субъединица фактора сплайсинга U2AF 35 кДа) на PDBe-KB .
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: e64271f447d9dd4fe142421cff970da0__1703339220
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/e6/a0/e64271f447d9dd4fe142421cff970da0.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
U2 small nuclear RNA auxiliary factor 1 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)