Фактор трилистника 2

ТФФ2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2DYZ, 2DZ0, 2DZ1
Идентификаторы
Псевдонимы	TFF2 , SML1, SP, фактор трилистника 2
Внешние идентификаторы	Опустить : 182590 ; МГИ : 1306805 ; Гомологен : 3956 ; Генные карты : TFF2 ; ОМА : TFF2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 21 (human)
End	42,350,997 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	31,363,256 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	pancreatic ductal cell; ; gastric mucosa; ; pylorus; ; gallbladder; ; body of stomach; ; gonad; ; duodenum; ; fundus; ; islet of Langerhans; ; cardia;
	Top expressed in
	mucous cell of stomach; ; epithelium of stomach; ; pyloric antrum; ; duodenum; ; islet of Langerhans; ; trachea; ; gallbladder; ; respiratory epithelium; ; olfactory epithelium; ; embryo;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; CXCR4 chemokine receptor binding;
Cellular component	extracellular region; extracellular space;
Biological process	wound healing; maintenance of gastrointestinal epithelium; negative regulation of gastric acid secretion; chemokine-mediated signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7032
	21785
	ENSG00000160181
	ENSMUSG00000024028
	Q03403
	Q03404 ; Q9QX97
	НМ_005423
	НМ_009363
	НП_005414
	НП_033389
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор трилистника 2 — это белок , который у человека кодируется TFF2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Члены семейства трилистников характеризуются наличием по крайней мере одной копии мотива трилистника , домена из 40 аминокислот, который содержит три консервативных дисульфида . Они представляют собой стабильные секреторные белки, экспрессирующиеся в желудочно-кишечного тракта слизистой оболочке . Их функции не определены, но они могут защищать слизистую оболочку от повреждений, стабилизировать слой слизи и влиять на заживление эпителия . Кодируемый белок ингибирует секрецию желудочной кислоты . Этот ген и два других родственных гена-члена семейства трилистниковых обнаружены в кластере на хромосоме 21 . ^{[ 7 ]}

Гликановое связывание

Все факторы трилистника человека представляют собой лектины , специфически взаимодействующие с дисахаридом GlcNAc -α-1,4- Gal . ^{[ 8 ]} существует только в крупных, сильно гликозилированных Этот дисахарид представляет собой необычный гликотоп, который, как известно , муцинах слизистой оболочки. Путем перекрестного связывания муцинов посредством двухвалентного связывания этого гликотопа факторы трилистника затем способны обратимо модулировать толщину и вязкость слизи. ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000160181 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024028 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Томасетто С., Рокель Н., Маттеи М.Г., Фудзита Р., Рио МС (сентябрь 1992 г.). «Ген, кодирующий спазмолитический белок человека (SML1/hSP), находится в 21q 22.3 и физически связан с гомологичным маркерным геном рака молочной железы BCEI/pS2». Геномика . 13 (4): 1328–30. дои : 10.1016/0888-7543(92)90059-2 . ПМИД 1505966 .
^ Готт П., Бек С., Мачадо Х.К., Карнейро Ф., Шмитт Х., Блин Н. (май 1997 г.). «Пептиды трилистника человека: геномная структура в 21q22.3 и скоординированная экспрессия». Eur J Hum Genet . 4 (6): 308–15. дои : 10.1159/000472224 . ПМИД 9043862 . S2CID 25235589 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: фактор трилистника TFF2 2 (спазмолитический белок 1)» .
^ Перейти обратно: ^а ^б Ярво М.А., Лингфорд Дж.П., Джон А., Солер Н.М., Скотт Н.Е., Годдард-Боргер Э.Д. (май 2020 г.). «Факторы трилистника имеют общую лектиновую активность, которая определяет их роль в слизи» . Природные коммуникации . 11 (1): 2265. Бибкод : 2020NatCo..11.2265J . дои : 10.1038/s41467-020-16223-7 . ПМК 7221086 . ПМИД 32404934 .

Дальнейшее чтение

Адвенье С., Ладженте В., Бойшо Э. (1997). «Роль антагонистов рецепторов тахикинина в предотвращении гиперреактивности бронхов, воспаления дыхательных путей и кашля» . Евро. Дыхание. Дж . 10 (8): 1892–906. дои : 10.1183/09031936.97.10081892 . ПМИД 9272936 .
Лангер Г., Ягла В., Беренс-Бауманн В. и др. (2002). «Глазные TFF-пептиды: новые секреторные продукты, связанные со слизью, бокаловидных клеток конъюнктивы». Слезная железа, слезная пленка и синдром сухого глаза 3 . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 506. стр. 313–6. дои : 10.1007/978-1-4615-0717-8_44 . ISBN 978-1-4613-5208-2 . ПМИД 12613926 .
Томасетто С., Рио МС, Готье С. и др. (1990). «hSP, гомолог белка pS2 с дуплицированным доменом, экспрессируется совместно с pS2 в желудке, но не в карциноме молочной железы» . ЭМБО Дж . 9 (2): 407–14. дои : 10.1002/j.1460-2075.1990.tb08125.x . ПМК 551681 . ПМИД 2303034 .
Бхогал Н., Доннелли Д., Финдли Дж.Б. (1994). «Сайт связывания лиганда рецептора нейрокинина 2. Сайт-направленный мутагенез и идентификация остатков связывания нейрокинина А в рецепторе нейрокинина 2 человека» . Ж. Биол. Хим . 269 (44): 27269–74. дои : 10.1016/S0021-9258(18)46979-7 . ПМИД 7961636 .
Хэнби А.М., Поулсом Р., Сингх С. и др. (1993). «Спазмолитический полипептид является основным антральным пептидом: распределение пептидов трилистника, человеческого спазмолитического полипептида и pS2 в желудке» . Гастроэнтерология . 105 (4): 1110–6. дои : 10.1016/0016-5085(93)90956-д . ПМИД 8405856 .
Ито Х., Томита М., Учино Х. и др. (1996). «Клонирование кДНК крысиного пептида pS2 и экспрессия пептидов трилистника при колите, индуцированном уксусной кислотой» . Биохим. Дж . 318 (3): 939–44. дои : 10.1042/bj3180939 . ПМК 1217708 . ПМИД 8836141 .
Мэй Ф.Е., Уэстли Б.Р. (1997). «Тесная физическая связь генов, кодирующих белок pNR-2/pS2 и спазмолитический белок человека (hSP)». Хм. Жене . 99 (3): 303–7. дои : 10.1007/s004390050362 . ПМИД 9050913 . S2CID 22603186 .
Сейб Т., Блин Н., Хильгерт К. и др. (1997). «Три гена трилистника человека TFF1, TFF2 и TFF3 расположены в области размером 55 т.п.н. на хромосоме 21q22.3». Геномика . 40 (1): 200–2. дои : 10.1006/geno.1996.4511 . ПМИД 9070946 .
Каядемир Т., Сильва Эдос С., Пуш С. и др. (1998). «Новый тандемный повтор длиной 25 п.н. в гене пептида трилистника человека TFF2 в 21q22.3: полиморфизм и эволюция млекопитающих» . Евро. Дж. Хум. Жене . 6 (2): 121–8. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200166 . ПМИД 9781055 .
Брунеллески С., Бордин Г., Коланджело Д., Виано I (1999). «Тахикининовые рецепторы на моноцитах человека: их участие в ревматоидном артрите». Нейропептиды . 32 (3): 215–23. дои : 10.1016/S0143-4179(98)90040-3 . ПМИД 10189055 . S2CID 40222022 .
Мэй Ф.Е., Семпл Дж.И., Ньютон Дж.Л., Уэстли Б.Р. (2000). «Человеческий двухдоменный белок трилистника, TFF2, гликозилируется in vivo в желудке» . Гут . 46 (4): 454–9. дои : 10.1136/gut.46.4.454 . ПМЦ 1727891 . ПМИД 10716671 .
Хаттори М., Фудзияма А., Тейлор Т.Д. и др. (2000). «Последовательность ДНК 21 хромосомы человека» . Природа . 405 (6784): 311–9. Бибкод : 2000Natur.405..311H . дои : 10.1038/35012518 . ПМИД 10830953 .
Берри А., Скотт Х.С., Кудо Дж. и др. (2001). «Уточненная локализация локуса DFNB10 аутосомно-рецессивной несиндромальной глухоты с использованием 34 новых микросателлитных маркеров, геномной структуры и исключения шести известных генов в этом регионе». Геномика . 68 (1): 22–9. дои : 10.1006/geno.2000.6253 . ПМИД 10950923 .
Булитта С.Дж., Флеминг Дж.В., Рэйчоудхури Р. и др. (2002). «Аутоиндукция промотора фактора трилистника 2 (TFF2) требует наличия вышестоящего цис-действующего элемента». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 293 (1): 366–74. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00199-7 . ПМИД 12054609 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ху Г.Ю., Ю Б.П., Донг В.Г. и др. (2003). «Экспрессия TFF2 и инфекции Helicobacter pylori в канцерогенезе слизистой оболочки желудка» . Мир Дж. Гастроэнтерол . 9 (5): 910–4. дои : 10.3748/wjg.v9.i5.910 . ПМЦ 4611396 . ПМИД 12717829 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 21 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000160181 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024028 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1505966-5] Томасетто С., Рокель Н., Маттеи М.Г., Фудзита Р., Рио МС (сентябрь 1992 г.). «Ген, кодирующий спазмолитический белок человека (SML1/hSP), находится в 21q 22.3 и физически связан с гомологичным маркерным геном рака молочной железы BCEI/pS2». Геномика . 13 (4): 1328–30. дои : 10.1016/0888-7543(92)90059-2 . ПМИД 1505966 .

[pmid9043862-6] Готт П., Бек С., Мачадо Х.К., Карнейро Ф., Шмитт Х., Блин Н. (май 1997 г.). «Пептиды трилистника человека: геномная структура в 21q22.3 и скоординированная экспрессия». Eur J Hum Genet . 4 (6): 308–15. дои : 10.1159/000472224 . ПМИД 9043862 . S2CID 25235589 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: фактор трилистника TFF2 2 (спазмолитический белок 1)» .

[Järvå_2020-8] Перейти обратно: ^а ^б Ярво М.А., Лингфорд Дж.П., Джон А., Солер Н.М., Скотт Н.Е., Годдард-Боргер Э.Д. (май 2020 г.). «Факторы трилистника имеют общую лектиновую активность, которая определяет их роль в слизи» . Природные коммуникации . 11 (1): 2265. Бибкод : 2020NatCo..11.2265J . дои : 10.1038/s41467-020-16223-7 . ПМК 7221086 . ПМИД 32404934 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]