Голодный1

Консервативная вторичная структура транскрипта 1 аденокарциномы легкого, связанного с метастазами.
Консервативная вторичная структура транскрипта 1 аденокарциномы легкого, связанного с метастазами.
	Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности MALAT1
Идентификаторы
Символ	Голодный1
Рфам	RF01871
Другие данные
РНК Тип	Джин ;
Домен(ы)	Эукариоты ;
ИДТИ	GO:2000147
ТАК	ТАК: 0001263
PDB Структуры	ПДБе

Голодный1
Идентификаторы
Псевдонимы	MALAT1 , HCN, LINC00047, MALAT-1, NCRNA00047, NEAT2, PRO2853, mascRNA, транскрипт 1 аденокарциномы легких, ассоциированный с метастазами (некодирующий белок), транскрипт 1 аденокарциномы легких, ассоциированный с метастазами
Внешние идентификаторы	Опустить : 607924 ; Генные карты : ILL1 ; ОМА : MALAT1 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	65,506,516 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	renal medulla; ; trigeminal ganglion; ; cardia; ; corpus callosum; ; pylorus; ; seminal vesicula; ; Achilles tendon; ; external globus pallidus; ; spinal ganglia; ; Pars compacta;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
hideОртологи
	378938
	н/д
	ENSG00000251562
	н/д
	н ; а
	н/д
	н/д
	н/д
	н/д
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека

MALAT 1 (транскрипт 1 аденокарциномы легких, связанный с метастазами), также известный как NEAT2 (обильный некодирующий ядерно-обогащенный транскрипт 2), представляет собой большую, редко сплайсируемую некодирующую РНК , которая высоко консервативна среди млекопитающих и высоко экспрессируется в ядре . ^{[ 3 ]} Он регулирует экспрессию генов метастазами связанных с , . ^{[ 4 ]} Он также положительно регулирует подвижность клеток посредством транскрипционной и/или посттранскрипционной регуляции генов, связанных с подвижностью. ^{[ 5 ]} MALAT1 может играть роль в температурно-зависимом определении пола у красноухой черепахи ( Trachemys scripta ). ^{[ 6 ]}

Экспрессия в мозгу алкоголика

Транскрипты MALAT1 значительно увеличиваются в мозжечке людей-алкоголиков, а также в аналогичных областях мозга крыс после выведения паров этанола. Эта вызванная алкоголем активация MALAT1 может быть ответственна за дифференциальную экспрессию ряда белков, которые способствуют толерантности и зависимости от этанола у людей. ^{[ 7 ]}

Прогностический потенциал при раке

Повышенная экспрессия MALAT1 коррелирует с плохой общей выживаемостью при различных типах рака, что позволяет предположить, что этот ген является прогностическим фактором для различных типов рака. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000251562 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Хатчинсон Дж.Н., Энсмингер А.В., Клемсон С.М., Линч С.Р., Лоуренс Дж.Б., Chess A (2007). «Скрининг ядерных транскриптов идентифицирует две связанные некодирующие РНК, связанные с доменами сплайсинга SC35» . БМК Геномика . 8:39 . дои : 10.1186/1471-2164-8-39 . ПМК 1800850 . ПМИД 17270048 .
^ Гучнер Т., Хаммерле М., Эйссманн М., Сюй Дж., Ким Ю., Хунг Г., Ревенко А., Арун Г., Стентруп М., Гросс М., Цёрниг М., Маклауд А.Р., Спектор Д.Л., Дидерихс С. (февраль 2013 г.). «Некодирующая РНК MALAT1 является критическим регулятором фенотипа метастазирования клеток рака легких» . Исследования рака . 73 (3): 1180–1189. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-12-2850 . ПМЦ 3589741 . ПМИД 23243023 .
^ Тано К., Мизуно Р., Окада Т., Раквал Р., Сибато Дж., Масуо Ю., Идзири К., Акимицу Н. (ноябрь 2010 г.). «MALAT-1 усиливает подвижность клеток аденокарциномы легких, влияя на экспрессию генов, связанных с подвижностью» . Письма ФЭБС . 584 (22): 4575–4580. дои : 10.1016/j.febslet.2010.10.008 . ПМИД 20937273 . S2CID 207575862 .
^ Хойновски Дж. Л., Браун Э. Л. (15 июля 2012 г.). «Непредвзятый подход к идентификации генов, участвующих в развитии черепахи, с определением пола в зависимости от температуры» . БМК Геномика . 13 :308. дои : 10.1186/1471-2164-13-308 . ПМЦ 3434017 . ПМИД 22793670 .
^ Крайгер Р., Фан Л., Вилсе П.А., Жаке В. (ноябрь 2012 г.). «MALAT-1, некодирующая белок РНК, активируется в мозжечке, гиппокампе и стволе мозга у людей-алкоголиков». Алкоголь . 46 (7): 629–634. дои : 10.1016/j.alcohol.2012.04.002 . ПМИД 22560368 .
^ Тянь Х, Сюй Г (2015). «Клиническая ценность днРНК MALAT1 как прогностического маркера рака человека: систематический обзор и метаанализ» . БМЖ Опен . 5 (9): e008653. doi : 10.1136/bmjopen-2015-008653 . ПМЦ 4593150 . ПМИД 26423854 .
^ Вэй Ю, Ню Б (2015). «Роль MALAT1 как прогностический фактор выживания при различных видах рака: систематический обзор литературы с мета-анализом» . Маркеры заболеваний . 2015 : 164635. дои : 10.1155/2015/164635 . ПМЦ 4572489 . ПМИД 26420912 . В эту статью включен текст из этого источника, доступного по лицензии CC BY 4.0 .

Дальнейшее чтение

Го Ф, Ли Й, Лю Й, Ван Дж, Ли Й, Ли Г (март 2010 г.). «Ингибирование транскрипта 1 аденокарциномы легких, связанного с метастазами, в клетках рака шейки матки человека CaSki подавляет пролиферацию и инвазию клеток» . Acta Biochimica et Biophysica Sinica . 42 (3): 224–229. дои : 10.1093/abbs/gmq008 . ПМИД 20213048 .
Цзи Ц, Лю Х, Фу Х, Чжан Л, Суй Х, Чжоу Л, Сунь Дж, Цай Дж, Цинь Дж, Рен Дж, Ли Q (ноябрь 2013 г.). «Ресвератрол ингибирует инвазию и метастазирование клеток колоректального рака посредством MALAT1-опосредованного сигнального пути Wnt/β-катенин» . ПЛОС ОДИН . 8 (11): е78700. Бибкод : 2013PLoSO...878700J . дои : 10.1371/journal.pone.0078700 . ПМЦ 3823921 . ПМИД 24244343 .
Ценг Дж.Дж., Се Ю.Т., Сюй С.Л., Чжоу М.М. (ноябрь 2009 г.). «Транскрипт 1 аденокарциномы легких, связанный с метастазами, активируется при предлежании плаценты increta/percreta и тесно связан с инвазией трофобластоподобных клеток in vitro» . Молекулярная репродукция человека . 15 (11): 725–731. дои : 10.1093/моль/gap071 . ПМИД 19690017 .
ван Ассельдонк М., Шепенс М., де Брёйн Д., Янссен Б., Меркс Г., Гертс ван Кессель А. (май 2000 г.). «Создание готового космидного контига 11q13 размером 350 т.п.н., включающего маркеры D11S4933 и D11S546: картирование 11 генов и 3 точек разрыва опухолеассоциированной транслокации». Геномика . 66 (1): 35–42. дои : 10.1006/geno.2000.6194 . ПМИД 10843802 .
Кошимидзу Т.А., Фудзивара Ю., Сакаи Н., Сибата К., Цучия Х. (март 2010 г.). «Окситоцин стимулирует экспрессию некодирующего РНК-маркера опухоли в клеточной линии нейробластомы человека». Науки о жизни . 86 (11–12): 455–460. дои : 10.1016/j.lfs.2010.02.001 . ПМИД 20149803 .
Гуру С.К., Агарвал С.К., Маникам П., Олуфеми С.Е., Крэбтри Дж.С., Вейземанн Дж.М., Кестер М.Б., Ким Ю.С., Ван Ю., Эммерт-Бак М.Р., Лиотта Л.А., Шпигель А.М., Богуски М.С., Роу Б.А., Коллинз Ф.С., Маркс С.Дж., Бернс Л., Чандрасекхараппа SC (июль 1997 г.). «Карта транскриптов области размером 2,8 Мб, содержащей локус множественной эндокринной неоплазии типа 1» . Геномные исследования . 7 (7): 725–735. дои : 10.1101/гр.7.7.725 . ПМК 310681 . ПМИД 9253601 .
Трипати В., Эллис Дж.Д., Шен З., Сонг Д.И., Пан К., Ватт А.Т., Фрейер С.М., Беннетт К.Ф., Шарма А., Бубуля П.А., Бленкоу Б.Дж., Прасант С.Г., Прасант К.В. (сентябрь 2010 г.). «Сохраняющаяся в ядре некодирующая РНК MALAT1 регулирует альтернативный сплайсинг путем модуляции фосфорилирования фактора сплайсинга SR» . Молекулярная клетка . 39 (6): 925–938. doi : 10.1016/j.molcel.2010.08.011 . ПМК 4158944 . ПМИД 20797886 .
Койпер Р.П., Шепенс М., Тейссен Дж., ван Ассельдонк М., ван ден Берг Э., Бридж Дж., Шууринг Э., Шенмейкерс Э.Ф., ван Кессель АГ (июль 2003 г.). «Повышение регуляции транскрипционного фактора TFEB в t(6;11)(p21;q13)-позитивном почечно-клеточном раке вследствие замены промотора» . Молекулярная генетика человека . 12 (14): 1661–1669. дои : 10.1093/hmg/ddg178 . ПМИД 12837690 .
Ямада К., Кано Дж., Цунода Х., Ёсикава Х., Окубо С., Исияма Т., Ногучи М. (февраль 2006 г.). «Фенотипическая характеристика стромальной саркомы эндометрия матки» . Раковая наука . 97 (2): 106–112. дои : 10.1111/j.1349-7006.2006.00147.x . ПМЦ 11158577 . ПМИД 16441420 . S2CID 25815889 .
Вилуш Дж. Э., Фрейер С. М., Спектор Д. Л. (ноябрь 2008 г.). «Процессинг на 3'-конце длинной некодирующей РНК, удерживаемой в ядре, дает тРНК-подобную цитоплазматическую РНК» . Клетка . 135 (5): 919–932. дои : 10.1016/j.cell.2008.10.012 . ПМЦ 2722846 . ПМИД 19041754 .
Джи П., Дидерихс С., Ван В., Бёинг С., Мецгер Р., Шнайдер П.М., Тидоу Н., Брандт Б., Бюргер Х., Балк Э., Томас М., Бердель В.Е., Серве Х., Мюллер-Тидоу С. (сентябрь 2003 г.). «MALAT-1, новая некодирующая РНК, и тимозин бета4 предсказывают метастазирование и выживаемость при немелкоклеточном раке легких на ранней стадии». Онкоген . 22 (39): 8031–8041. дои : 10.1038/sj.onc.1206928 . ПМИД 12970751 . S2CID 34070842 .
Миягава Р., Тано К., Мизуно Р., Накамура Ю., Идзири К., Раквал Р., Сибато Дж., Масуо Ю., Маеда А., Хиросе Т., Акимицу Н. (апрель 2012 г.). «Идентификация цис- и транс-действующих факторов, участвующих в локализации некодирующей РНК MALAT-1 в ядерных спеклах» . РНК . 18 (4): 738–751. дои : 10.1261/rna.028639.111 . ПМЦ 3312561 . ПМИД 22355166 .

Внешние ссылки

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000251562 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid17270048-3] Хатчинсон Дж.Н., Энсмингер А.В., Клемсон С.М., Линч С.Р., Лоуренс Дж.Б., Chess A (2007). «Скрининг ядерных транскриптов идентифицирует две связанные некодирующие РНК, связанные с доменами сплайсинга SC35» . БМК Геномика . 8:39 . дои : 10.1186/1471-2164-8-39 . ПМК 1800850 . ПМИД 17270048 .

[4] Гучнер Т., Хаммерле М., Эйссманн М., Сюй Дж., Ким Ю., Хунг Г., Ревенко А., Арун Г., Стентруп М., Гросс М., Цёрниг М., Маклауд А.Р., Спектор Д.Л., Дидерихс С. (февраль 2013 г.). «Некодирующая РНК MALAT1 является критическим регулятором фенотипа метастазирования клеток рака легких» . Исследования рака . 73 (3): 1180–1189. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-12-2850 . ПМЦ 3589741 . ПМИД 23243023 .

[pmid20937273-5] Тано К., Мизуно Р., Окада Т., Раквал Р., Сибато Дж., Масуо Ю., Идзири К., Акимицу Н. (ноябрь 2010 г.). «MALAT-1 усиливает подвижность клеток аденокарциномы легких, влияя на экспрессию генов, связанных с подвижностью» . Письма ФЭБС . 584 (22): 4575–4580. дои : 10.1016/j.febslet.2010.10.008 . ПМИД 20937273 . S2CID 207575862 .

[6] Хойновски Дж. Л., Браун Э. Л. (15 июля 2012 г.). «Непредвзятый подход к идентификации генов, участвующих в развитии черепахи, с определением пола в зависимости от температуры» . БМК Геномика . 13 :308. дои : 10.1186/1471-2164-13-308 . ПМЦ 3434017 . ПМИД 22793670 .

[7] Крайгер Р., Фан Л., Вилсе П.А., Жаке В. (ноябрь 2012 г.). «MALAT-1, некодирующая белок РНК, активируется в мозжечке, гиппокампе и стволе мозга у людей-алкоголиков». Алкоголь . 46 (7): 629–634. дои : 10.1016/j.alcohol.2012.04.002 . ПМИД 22560368 .

[8] Тянь Х, Сюй Г (2015). «Клиническая ценность днРНК MALAT1 как прогностического маркера рака человека: систематический обзор и метаанализ» . БМЖ Опен . 5 (9): e008653. doi : 10.1136/bmjopen-2015-008653 . ПМЦ 4593150 . ПМИД 26423854 .

[9] Вэй Ю, Ню Б (2015). «Роль MALAT1 как прогностический фактор выживания при различных видах рака: систематический обзор литературы с мета-анализом» . Маркеры заболеваний . 2015 : 164635. дои : 10.1155/2015/164635 . ПМЦ 4572489 . ПМИД 26420912 . В эту статью включен текст из этого источника, доступного по лицензии CC BY 4.0 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]