Платиновый ствол
| Orf2-подобная пренилтрансфераза | |||
|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура белка PT-бочонка. | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | PTase_Orf2 | ||
| Пфам | ПФ11468 | ||
| ИнтерПро | ИПР020965 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1зб6 / СКОПе / СУПФАМ | ||
| |||
PT -бочонок представляет собой новую белковую складку, обнаруженную в кристаллической структуре пренилтрансферазы Orf2 из Streptomyces sp. штамм CL190. [ 1 ]
Структура
[ редактировать ]PT-цилиндр состоит из закрытого β-листа, содержащего десять антипараллельных β-нитей, расположенных вокруг центрального ядра β-цилиндра, окруженного кольцом α-спиралей, образующих внешнюю, открытую для растворителя поверхность цилиндра.
Вторичная связность почти соответствует классификации (ααββ) 5 , но более конкретно описывается с использованием номенклатуры (ααββ) 4 -(αββ)-α, где спирали 6 и 8, обе участвующие в межбелковых контактах в кристаллической решетке, отобразить спиральный «излом». Наиболее гидрофобным участком ПТ-цилиндра является область, расположенная между внешней поверхностью цилиндрического β-цилиндра и поясом окружающих α-спиралей. Кроме того, ряд гидрофобных остатков, расположенных внутри цилиндра, размещает пренильный хвост молекул геранил-дифосфата (GPP) и GSPP, в то время как дифосфатные или тиодифосфатные головные группы субстрата и аналогов субстрата соответственно указывают на «верхнюю часть» молекул. », более полярный конец ствола, где находится Mg 2+ ион координирован. Наконец, нижняя часть ствола увенчана короткой С-концевой спиралью (α11).
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Кузуяма Т., Ноэль Дж.П., Ричард С.Б. (июнь 2005 г.). «Структурная основа беспорядочного биосинтетического пренилирования ароматических натуральных продуктов» . Природа . 435 (7044): 983–7. Бибкод : 2005Natur.435..983K . дои : 10.1038/nature03668 . ПМЦ 2874460 . ПМИД 15959519 .
- Кёль П. (июль 2005 г.). «Слабая специфичность ароматических пренилтрансфераз». Нат. хим. Биол . 1 (2): 71–2. дои : 10.1038/nchembio0705-71 . ПМИД 16408001 . S2CID 10831640 .
- Ботта Б., Делле Монаш Дж., Менендес П., Боффи А. (декабрь 2005 г.). «Новые ферменты пренилтрансферазы как инструмент пренилирования флавоноидов». Тренды Фармакол. Наука . 26 (12): 606–8. дои : 10.1016/j.tips.2005.09.012 . ПМИД 16229901 .
Пресс-релизы
[ редактировать ]Беспорядочная каталитическая активность, которой обладает новая структура фермента, 15 июня 2005 г.
Научный обзор SSRL, июль 2005 г.
Номер пресс-релиза LightSource.org: PR-SSRL-05-3