СНАИ2

СНАИ2
Идентификаторы
Псевдонимы	SNAI2 , SLUG, SLUGH1, SNAIL2, WS2D, репрессор транскрипции 2 семейства улиток, SLUGH
Внешние идентификаторы	Опустить : 602150 ; МГИ : 1096393 ; Гомологен : 31127 ; Генные карты : SNAI2 ; ОМА : SNAI2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	48,921,740 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 16 (mouse)
End	14,527,249 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tibia; ; cartilage tissue; ; stromal cell of endometrium; ; skin of thigh; ; skin of arm; ; skin of hip; ; periodontal fiber; ; mucosa of paranasal sinus; ; tail of epididymis; ; seminal vesicula;
	Top expressed in
	condyle; ; fossa; ; migratory enteric neural crest cell; ; conjunctival fornix; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; hair follicle; ; vas deferens; ; calvaria; ; maxillary prominence; ; body of femur;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	sequence-specific DNA binding; DNA binding; metal ion binding; protein binding; nucleic acid binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; chromatin binding; DNA-binding transcription factor activity; transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; E-box binding;
Cellular component	cytoplasm; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	Notch signaling pathway; negative regulation of vitamin D receptor signaling pathway; regulation of transcription, DNA-templated; neural crest cell development; negative regulation of keratinocyte proliferation; regulation of bicellular tight junction assembly; positive regulation of cell migration; negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; transcription, DNA-templated; cellular response to epidermal growth factor stimulus; negative regulation of vitamin D biosynthetic process; regulation of chemokine production; multicellular organism development; negative regulation of chondrocyte differentiation; negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; regulation of osteoblast differentiation; osteoblast differentiation; canonical Wnt signaling pathway; negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; negative regulation of cell adhesion mediated by integrin; negative regulation of anoikis; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; epithelial to mesenchymal transition; epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation; cell migration involved in endocardial cushion formation; hearing; desmosome disassembly; pigmentation; epithelium development; negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; aortic valve morphogenesis; negative regulation of cell adhesion involved in substrate-bound cell migration; response to radiation; cell migration; positive regulation of histone acetylation; negative regulation of apoptotic process; positive regulation of fat cell differentiation; white fat cell differentiation; roof of mouth development; cartilage morphogenesis; regulation of branching involved in salivary gland morphogenesis; cellular response to ionizing radiation; negative regulation of stem cell proliferation; Notch signaling involved in heart development;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6591
	20583
	ENSG00000019549
	ENSMUSG00000022676
	О43623
	P97469
	НМ_003068
	НМ_011415
	НП_003059
	НП_035545
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок цинковых пальцев SNAI2 представляет собой фактор транскрипции , который у человека кодируется SNAI2 геном . Он способствует дифференцировке и миграции определенных клеток и играет роль в инициации гаструляции . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Этот ген кодирует члена суперсемейства улиток цинковых пальцев факторов транскрипции типа C2H2 . Кодируемый белок действует как репрессор транскрипции , который связывается с мотивами E-box , а также, вероятно, подавляет транскрипцию E-кадгерина при карциноме молочной железы. Этот белок участвует в эпителиально-мезенхимальных переходах и обладает антиапоптотической активностью. Он регулирует дифференцировку и миграцию клеток нервного гребня вместе с другими генами (например, FOXD3 , SOX9 и SOX10 , BMPs ) в эмбриональной жизни. Мутации в этом гене могут быть связаны со спорадическими случаями нервной трубки дефектов . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

SNAI2 подавляет экспрессию E-кадгерина в премигрирующих клетках нервного гребня; таким образом, SNAI2 индуцирует прочносвязанные эпителиальные клетки разрываться на рыхлый мезенхимальный фенотип, обеспечивая гаструляцию мезодермы у развивающегося эмбриона. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} Структурно сходный с антиапоптотическим Ces-1 у C. elegans , SLUG является негативным регулятором гибели продуктивных клеток у развивающихся эмбрионов и взрослых особей. ^{[ 9 ]}^{[ 11 ]}

Клиническое значение

Широко экспрессирующийся в тканях человека, SLUG наиболее заметно отсутствует в лейкоцитах периферической крови, печени взрослого человека, а также тканях мозга как плода, так и взрослого человека. ^{[ 11 ]} SLUG играет роль в карциноме молочной железы, а также в лейкемии путем подавления E-кадгерина, который поддерживает мезенхимальный фенотип путем смещения экспрессии с профиля кадгерина типа I на тип II. ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]} Сохранение мезенхимального фенотипа делает возможным метастазирование опухолевых клеток, хотя SLUG экспрессируется в карциномах независимо от инвазивности. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} Модель нокаута с использованием куриных эмбрионов также показала ингибирование расслоения мезодермы и нервного гребня; Куриный эмбрион. Увеличение функции слизняков, по-видимому, увеличивает продукцию нервного гребня. ^{[ 9 ]} Мутации Slug связаны с потерей беременности во время гаструляции у некоторых животных. ^{[ 9 ]}

Взаимодействия

Костные морфогенетические белки (BMP) предшествуют экспрессии SLUG и предположительно являются непосредственными индукторами экспрессии генов. ^{[ 10 ]}^{[ 13 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000019549 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022676 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Рим Х., Савагнер П., Тибодо Дж., Тьери Дж. П., Паван В. Дж. (январь 1998 г.). «Локализация фактора транскрипции нервного гребня, Slug, на хромосоме 16 мыши и хромосоме 8 человека» . Геном млекопитающих . 8 (11): 872–3. дои : 10.1007/s003359900601 . ПМИД 9337409 . S2CID 2177885 .
^ Коэн М.Е., Инь М., Пазнекас В.А., Шерцер М., Вуд С., Джабс Э.В. (август 1998 г.). «Организация, экспрессия и расположение гена SLUG человека на карте 8q» . Геномика . 51 (3): 468–71. дои : 10.1006/geno.1998.5367 . ПМИД 9721220 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: гомолог 2 улитки SNAI2 (дрозофила)» .
^ Стегманн, К.; Бекер, Дж.; Косан, К.; Эрмерт, А.; Кунц, Дж.; Кох, MC (август 1999 г.). «Человеческий транскрипционный фактор SLUG: анализ мутаций у пациентов с дефектами нервной трубки и идентификация миссенс-мутации (D119E) в области, определяющей подсемейство Slug». Мутационные исследования . 406 (2–4): 63–69. дои : 10.1016/s1383-5726(99)00002-3 . ISSN 0027-5107 . ПМИД 10479723 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Ньето М.А. (март 2002 г.). «Суперсемейство факторов транскрипции цинковых пальцев улитки». Nature Reviews Молекулярно-клеточная биология . 3 (3): 155–66. дои : 10.1038/nrm757 . ПМИД 11994736 . S2CID 8330951 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Карлсон Б.М. (2013). Эмбриология человека и биология развития (5-е изд.). Филадельфия, Пенсильвания: Elsevier Health Sciences. стр. 101–102, 106, 313, 362, 382. ISBN. 978-1-4557-2794-0 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Инукай Т., Иноуэ А., Куросава Х., Гой К., Синдзё Т., Одзава К., Мао М., Инаба Т., Look AT (сентябрь 1999 г.). «SLUG, родственный ces-1 ген транскрипционного фактора цинковых пальцев с антиапоптотической активностью, является нижестоящей мишенью онкопротеина E2A-HLF» . Молекулярная клетка . 4 (3): 343–52. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80336-6 . ПМИД 10518215 .
^ Каллури Р., Вайнберг Р.А. (июнь 2009 г.). «Основы эпителиально-мезенхимального перехода» . Журнал клинических исследований . 119 (6): 1420–8. дои : 10.1172/jci39104 . ПМК 2689101 . ПМИД 19487818 .
^ Сакаи Д., Вакамацу Ю. (2005). «Регуляторные механизмы формирования нервного гребня». Клетки Ткани Органы . 179 (1–2): 24–35. дои : 10.1159/000084506 . ПМИД 15942190 . S2CID 1886380 .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Савангнер П., Ямада К.М., Тьери Дж.П. (июнь 1997 г.). «Белковый слизень с цинковыми пальцами вызывает диссоциацию десмосом, начальный и необходимый шаг для индуцированного фактором роста эпителиально-мезенхимального перехода» . Журнал клеточной биологии . 137 (6): 1403–19. дои : 10.1083/jcb.137.6.1403 . ПМК 2132541 . ПМИД 9182671 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Стегманн К., Бекер Дж., Косан С., Эрмерт А., Кунц Дж., Кох М.С. (август 1999 г.). «Человеческий транскрипционный фактор SLUG: анализ мутаций у пациентов с дефектами нервной трубки и идентификация миссенс-мутации (D119E) в области, определяющей подсемейство Slug». Мутационные исследования . 406 (2–4): 63–9. дои : 10.1016/S1383-5726(99)00002-3 . ПМИД 10479723 .
Инукай Т., Иноуэ А., Куросава Х., Гой К., Синдзё Т., Одзава К., Мао М., Инаба Т., Look AT (сентябрь 1999 г.). «SLUG, родственный ces-1 ген транскрипционного фактора цинковых пальцев с антиапоптотической активностью, является нижестоящей мишенью онкопротеина E2A-HLF» . Молекулярная клетка . 4 (3): 343–52. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80336-6 . ПМИД 10518215 .
Хемавати К., Гуру С.С., Харрис Дж., Чен Дж.Д., Ип Ю.Т. (июль 2000 г.). «Человеческий слизень — это репрессор, который локализуется в сайтах активной транскрипции» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (14): 5087–95. дои : 10.1128/MCB.20.14.5087-5095.2000 . ПМК 85958 . ПМИД 10866665 .
Хаджра К.М., Чен Д.Ю., Фирон Э.Р. (март 2002 г.). «Белок цинковых пальцев SLUG подавляет E-кадгерин при раке молочной железы». Исследования рака . 62 (6): 1613–8. ПМИД 11912130 .
Санчес-Мартин М., Родригес-Гарсиа А., Перес-Лосада Х., Сагрера А., Рид АП, Санчес-Гарсия I (декабрь 2002 г.). «Делеции SLUG (SNAI2) у пациентов с болезнью Ваарденбурга» . Молекулярная генетика человека . 11 (25): 3231–6. дои : 10.1093/hmg/11.25.3231 . ПМИД 12444107 .
Каджита М., Макклиник К.Н., Уэйд П.А. (сентябрь 2004 г.). «Аберрантная экспрессия факторов транскрипции улитки и слизняка изменяет реакцию на генотоксический стресс» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (17): 7559–66. дои : 10.1128/MCB.24.17.7559-7566.2004 . ПМК 506998 . ПМИД 15314165 .
Каталано А., Родилосси С., Риппо М.Р., Капрари П., Прокопио А. (ноябрь 2004 г.). «Индукция передачи сигнала фактора стволовых клеток/c-Kit/слизняка в клетках злокачественной мезотелиомы с множественной лекарственной устойчивостью» . Журнал биологической химии . 279 (45): 46706–14. дои : 10.1074/jbc.M406696200 . ПМИД 15337769 .
Утикадо Ю, Нацугоэ С, Окумура Х, Сетояма Т, Мацумото М, Исигами С, Айко Т (февраль 2005 г.). «Экспрессия слизней в опухолях, сохранивших E-кадгерин, связана с прогнозом у пациентов с плоскоклеточным раком пищевода» . Клинические исследования рака . 11 (3): 1174–80. дои : 10.1158/1078-0432.1174.11.3 . ПМИД 15709186 .
Трипати М.К., Мисра С., Хедкар С.В., Гамильтон Н., Ирвин-Уилсон С., Шаран С., Сили Л., Чаудхури Дж. (апрель 2005 г.). «Регуляция экспрессии гена BRCA2 с помощью белка-репрессора SLUG в клетках молочной железы человека» . Журнал биологической химии . 280 (17): 17163–71. дои : 10.1074/jbc.M501375200 . ПМК 3092429 . ПМИД 15734731 .
Трипати М.К., Мисра С., Чаудхури Г. (апрель 2005 г.). «Негативная регуляция экспрессии цитокератинов 8 и 19 с помощью белка-репрессора SLUG в клетках молочной железы человека» . Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 329 (2): 508–15. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.02.006 . ПМК 3086003 . ПМИД 15737616 .
Муди С.Э., Перес Д., Пан Т.К., Саркисян С.Дж., Портокарреро С.П., Стернер С.Дж., Ноторфранческо К.Л., Кардифф Р.Д., Ходош Л.А. (сентябрь 2005 г.). «Репрессор транскрипции Улитка способствует рецидиву опухоли молочной железы» . Раковая клетка . 8 (3): 197–209. дои : 10.1016/j.ccr.2005.07.009 . ПМИД 16169465 .
Чен М., Чен Л.М., Чай К.С. (июнь 2006 г.). «Андрогенная регуляция экспрессии гена простазина опосредована белками, связывающими стерол-регуляторные элементы, и SLUG» . Простата . 66 (9): 911–20. дои : 10.1002/pros.20325 . ПМИД 16541421 . S2CID 23036264 .
Тернер Ф.Е., Броуд С., Ханим Ф.Л., Джинс А., Талма С., Хьюз С., Целепис С., Хотчин Н.А. (июль 2006 г.). «Слизняк регулирует экспрессию интегрина и пролиферацию клеток в эпидермальных кератиноцитах человека» . Журнал биологической химии . 281 (30): 21321–31. дои : 10.1074/jbc.M509731200 . ПМИД 16707493 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000019549 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022676 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9337409-5] Рим Х., Савагнер П., Тибодо Дж., Тьери Дж. П., Паван В. Дж. (январь 1998 г.). «Локализация фактора транскрипции нервного гребня, Slug, на хромосоме 16 мыши и хромосоме 8 человека» . Геном млекопитающих . 8 (11): 872–3. дои : 10.1007/s003359900601 . ПМИД 9337409 . S2CID 2177885 .

[pmid9721220-6] Коэн М.Е., Инь М., Пазнекас В.А., Шерцер М., Вуд С., Джабс Э.В. (август 1998 г.). «Организация, экспрессия и расположение гена SLUG человека на карте 8q» . Геномика . 51 (3): 468–71. дои : 10.1006/geno.1998.5367 . ПМИД 9721220 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: гомолог 2 улитки SNAI2 (дрозофила)» .

[8] Стегманн, К.; Бекер, Дж.; Косан, К.; Эрмерт, А.; Кунц, Дж.; Кох, MC (август 1999 г.). «Человеческий транскрипционный фактор SLUG: анализ мутаций у пациентов с дефектами нервной трубки и идентификация миссенс-мутации (D119E) в области, определяющей подсемейство Slug». Мутационные исследования . 406 (2–4): 63–69. дои : 10.1016/s1383-5726(99)00002-3 . ISSN 0027-5107 . ПМИД 10479723 .

[Nieto_2002-9] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Ньето М.А. (март 2002 г.). «Суперсемейство факторов транскрипции цинковых пальцев улитки». Nature Reviews Молекулярно-клеточная биология . 3 (3): 155–66. дои : 10.1038/nrm757 . ПМИД 11994736 . S2CID 8330951 .

[Carlson_2013-10] Jump up to: ^а ^б ^с Карлсон Б.М. (2013). Эмбриология человека и биология развития (5-е изд.). Филадельфия, Пенсильвания: Elsevier Health Sciences. стр. 101–102, 106, 313, 362, 382. ISBN. 978-1-4557-2794-0 .

[Inukai_1999-11] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Инукай Т., Иноуэ А., Куросава Х., Гой К., Синдзё Т., Одзава К., Мао М., Инаба Т., Look AT (сентябрь 1999 г.). «SLUG, родственный ces-1 ген транскрипционного фактора цинковых пальцев с антиапоптотической активностью, является нижестоящей мишенью онкопротеина E2A-HLF» . Молекулярная клетка . 4 (3): 343–52. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80336-6 . ПМИД 10518215 .

[12] Каллури Р., Вайнберг Р.А. (июнь 2009 г.). «Основы эпителиально-мезенхимального перехода» . Журнал клинических исследований . 119 (6): 1420–8. дои : 10.1172/jci39104 . ПМК 2689101 . ПМИД 19487818 .

[13] Сакаи Д., Вакамацу Ю. (2005). «Регуляторные механизмы формирования нервного гребня». Клетки Ткани Органы . 179 (1–2): 24–35. дои : 10.1159/000084506 . ПМИД 15942190 . S2CID 1886380 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]