Суперсемейство альфа/бета-гидролаз
 Бактериальная липаза , один из членов этого семейства. | |||
| Идентификаторы | |||
|---|---|---|---|
| Символ | Абгидролаза_1 | ||
| Пфам | PF00561 | ||
| Пфам Клан | CL0028 | ||
| ЭКОД | 7579.1.1 | ||
| ИнтерПро | ИПР029058 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1еде / СКОПе / СУПФАМ | ||
| Суперсемейство OPM | 127 | ||
| белок OPM | 1qge | ||
| CDD | cl21494 | ||
| Мембраном | 300 | ||
| |||
Суперсемейство альфа/бета-гидролаз представляет собой суперсемейство гидролитических ферментов широко различающегося филогенетического происхождения и каталитической функции, имеющих общую структуру . [ 1 ] Ядро каждого фермента представляет собой альфа/бета-лист (а не ствол ), содержащий 8 бета-цепей, соединенных 6 альфа-спиралями . [ 1 ] [ 2 ] Считается, что ферменты произошли от общего предка, сохранив мало очевидного сходства последовательностей , но сохранив расположение каталитических остатков. Все они имеют каталитическую триаду , элементы которой несут петли, являющиеся наиболее сохранившимися структурными особенностями складки.
Альфа/бета-гидролазная складка включает протеазы , липазы , пероксидазы , эстеразы , эпоксидгидролазы и дегалогеназы . [ 3 ]
База данных
[ редактировать ]База данных ESTHER содержит большую коллекцию информации об этом суперсемействе белков. [ 4 ]
Подсемейства
[ редактировать ]Белки человека, содержащие этот домен
[ редактировать ]АБХД10 ; АБХД11 ; АБХД12 ; АБХД12Б ; АБХД13 ; АБХД2 ; АБХД3 ; АБХД4 ; АБХД5 ; АБХД6 ; АБХД7 ; АБХД8 ; АБХД9 ; БАТ5 ; БПХЛ C20или135 ; ЭПХ1 ; ЭПХ2 ; ФАМ108Б1 ; ЛИПА ; ЛИПФ ЛИПЖ ЛИПК ЛИПМ ЛИПН ЛИПЛАЛ1 ; МЭСТ МГЛЛ ППМЕ1 ; СЕРХЛ СЕРХЛ2 ; СПГ21 ; КЕС1 ; КЕС2 ; C4orf29
См. также
[ редактировать ]- Экдистероид-фосфатфосфатаза - структура стероидфосфатфосфотазы
- Серингидролаза - семейство ферментов, состоящее в основном из белков со складками альфа-бета-гидролазы.
Внешние ссылки
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Оллис, Д.Л.; Чеа, Э.; Сиглер, М.; Дейкстра, Б.; Фролоу, Ф.; Франкен, С.М.; Харель, М.; Ремингтон, SJ; Силман, И.; Шраг, Дж.; Сассман, Дж.Л.; Вершуерен, КХГ и Голдман, А. (1992). «Складка альфа/бета-гидролазы» (PDF) . Белок англ . 5 (3): 197–211. дои : 10.1093/протеин/5.3.197 . hdl : 11370/2d4c057d-1a67-437d-ad10-701f7a60f1e6 . ПМИД 1409539 .
- ^ Карр П.Д., Оллис Д.Л. (2009). «Альфа-бета-гидролазная складка: обновление». Белковый пепт. Летт . 16 (10): 1137–48. дои : 10.2174/092986609789071298 . ПМИД 19508187 .
- ^ Нардини М., Дейкстра Б.В. (декабрь 1999 г.). «Ферменты альфа-/бета-гидролазы: семья продолжает расти». Курс. Мнение. Структура. Биол . 9 (6): 732–7. дои : 10.1016/S0959-440X(99)00037-8 . ПМИД 10607665 .
- ^ Рено Л., Негре В., Отельер Т., Кузен Х., Маршо П., Шатонне А. (декабрь 2005 г.). «Новые удобные инструменты для пользователей ESTHER, базы данных суперсемейства белков с альфа-/бета-гидролазными складками». хим. Биол. Взаимодействуйте . 157–158: 339–43. дои : 10.1016/j.cbi.2005.10.100 . ПМИД 16297901 .
