Серингидролаза
Серингидролазы — один из крупнейших известных классов ферментов , включающий примерно около 200 ферментов или 1% генов в протеоме человека. [ 1 ] наличие определенного серина в активном центре , который используется для гидролиза субстратов Определяющей характеристикой этих ферментов является . Гидролиз сложноэфирной или пептидной связи протекает в две стадии. Сначала ацильная часть субстрата (кислотная часть сложного эфира или часть пептида, оканчивающаяся карбоксильной группой) переносится на серин, образуя новую сложноэфирную или амидную связь и высвобождая другую часть субстрата ( спирт сложного эфира или часть пептида, оканчивающаяся аминогруппой ) . Позже, на более медленном этапе, связь между серином и ацильной группой гидролизуется водой или гидроксид-ионом, регенерируя свободный фермент. [ 2 ] В отличие от других, некаталитических серинов, реактивный серин этих гидролаз обычно активируется посредством протонной передачи, включающей каталитическую триаду, состоящую из серина, кислотного остатка (например, аспартата или глутамата ) и основного остатка (обычно гистидина ), хотя существуют вариации этого механизма.
Суперсемейство серингидролаз включает:
- Сериновые протеазы , включая трипсин , химотрипсин и субтилизин.
- Внеклеточные липазы , включая липазу поджелудочной железы , печеночную липазу , желудочную липазу , эндотелиальную липазу и липопротеинлипазу.
- Внутриклеточные липазы , включая гормончувствительную липазу , моноацилглицеринлипазу , жировую триглицеридлипазу и диацилглицеринлипазу.
- Холинэстеразы , включая ацетилхолинэстеразу и бутирилхолинэстеразу.
- Маломолекулярные тиоэстеразы , включая синтазу жирных кислот и тиоэстеразу ацил-КоА.
- Некоторые фосфолипазы , включая фосфолипазу А2 и ацетилгидролазу фактора активации тромбоцитов.
- Протеиновые и гликангидролазы , включая протеинфосфатметилэстеразу 1, ацилоксиацилгидролазу и ацетилэстеразу сиаловой кислоты.
- Некоторые амидазы , в том числе гидролаза амидов жирных кислот.
- Некоторые пептидазы, включая дипептидилпептидазу 4 , белок активации фибробластов и пролилендопептидазу.
См. также
[ редактировать ]- Протеомика, основанная на активности
- Альфа/бета-гидролазная складка
- Амид
- Фермент
- Эстер
- Список ферментов
- Тиоэфир
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Саймон ГМ, Краватт Б.Ф. (апрель 2010 г.). «Протеомика суперсемейств ферментов, основанная на активности: серингидролазы на примере тематического исследования» . Ж. Биол. Хим . 285 (15): 11051–5. дои : 10.1074/jbc.R109.097600 . ПМК 2856978 . ПМИД 20147750 .
- ^ Люберт Страйер (1981). Биохимия (2-е изд.). п. 162.
