Пролилэндопептидаза

показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

пролилолигопептидаза
пролилолигопептидаза
Идентификаторы
Номер ЕС.	3.4.21.26
Номер CAS.	72162-84-6
Базы данных
ИнтЭнк	вид IntEnz
БРЕНДА	БРЕНДА запись
Экспаси	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	КЕГГ запись
МетаЦик	метаболический путь
ПРЯМОЙ	профиль
PDB Структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология	АмиГО / QuickGO
PMC
показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

ПОДГОТОВКА
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3DDU
Идентификаторы
Псевдонимы	PREP , PE, PEP, пролилэндопептидаза
Внешние идентификаторы	Опустить : 600400 ; МГИ : 1270863 ; Гомологен : 2042 ; GeneCards : ПОДГОТОВКА ; ОМА : PREP – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	105,454,062 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; gastrocnemius muscle; ; mucosa of transverse colon; ; rectum; ; triceps brachii muscle; ; muscle of thigh; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; glutes; ; mucosa of sigmoid colon; ; biceps brachii;
	n/a
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	serine-type exopeptidase activity; peptidase activity; serine-type peptidase activity; serine-type endopeptidase activity; protein binding; hydrolase activity; endopeptidase activity; oligopeptidase activity;
Cellular component	membrane; nucleus; cytoplasm; cytosol;
Biological process	proteolysis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5550
	19072
	ENSG00000085377
	ENSMUSG00000019849
	P48147
	Q9BUILD6
	НМ_002726
	НМ_011156
	НП_002717
	НП_035286
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Пролилэндопептидаза (PE), также известная как пролилолигопептидаза или фермент, расщепляющий постпролин, представляет собой фермент , который у человека кодируется PREP геном . ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

Функция

Пролилэндопептидаза — крупный цитозольный фермент , принадлежащий к отдельному классу сериновых пептидаз. Впервые он был описан в цитозоле мозга кроликов как олигопептидаза , которая расщепляет нонапептид брадикинин по связи Pro-Phe. ^{[ 6 ]} Фермент участвует в созревании и деградации пептидных гормонов и нейропептидов , таких как альфа-меланоцитстимулирующий гормон , лютеинизирующий гормон-рилизинг-гормон (ЛГ-РГ), тиреотропин-рилизинг-гормон , ангиотензин , нейротензин , окситоцин , вещество Р и вазопрессин . PREP расщепляет пептидные связи на С-концевой стороне остатков пролина . Его активность ограничивается действием на олигопептиды массой менее 10 кДа, и он абсолютно необходим для трансконфигурации пептидной связи, предшествующей пролину.

Пролилэндопептидазы участвуют в созревании и деградации пептидных гормонов и нейропептидов . ^{[ 5 ]}

Структура

Пролилэндопептидаза представляет собой цитозольную пролилэндопептидазу, которая расщепляет пептидные связи на С-концевой стороне пролильных остатков внутри пептидов длиной примерно до 30 аминокислот . Только короткие белковые остатки могут проникать в активный центр пролилэндопептидазы благодаря отдельной области бета-пропеллера , которая действует как механизм воротного фильтра. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

также было обнаружено, что пролилэндопептидаза участвует в метаболизме VHL-PROTAC В исследованиях in vitro . ^{[ 9 ]}

Клиническое значение

Изменение активности PREP может быть связано с расстройствами аутистического спектра и различными психологическими заболеваниями, такими как шизофрения , мания и клиническая депрессия . ^{[ 10 ]}

Однако существует противоречивая информация относительно точной роли, которую пролилэндопептидаза играет в патофизиологии депрессии: более ранние исследования документировали снижение активности фермента у пациентов с депрессией, но более поздние исследования показали, что ингибирование того же фермента фактически приводит к облегчению симптомов. депрессивных симптомов. ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}

Некоторые типы пролилэндопептидазы использовались в исследованиях по снижению склонности глютен , содержащих продуктов из пшеницы , к обострению целиакии . ^{[ 13 ]} Однако перорально вводимые ферменты потенциально подвержены инактивации в желудочно-кишечном тракте. ^{[ 14 ]}

Ингибиторы

Известно несколько ингибиторов пролилэндопептидазы. ^{[ 15 ]}^{[ 16 ]} и были предложены в качестве возможных ноотропов и антидепрессантов . ^{[ 17 ]}^{[ 18 ]} Известные соединения включают:

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000085377 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ванхоф Г., Гуссенс Ф., Хендрикс Л., Де Мистер И., Хендрикс Д., Врайенд Г., Ван Броекховен С., Шарп С. (декабрь 1994 г.). «Клонирование и анализ последовательности гена, кодирующего пролилэндопептидазу лимфоцитов человека». Джин . 149 (2): 363–6. дои : 10.1016/0378-1119(94)90177-5 . ПМИД 7959018 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: пролилэндопептидаза PREP» .
^ Оливейра Э.Б., Мартинс А.Р., Камарго AC (май 1976 г.). «Выделение эндопептидаз головного мозга: влияние размера и последовательности субстратов, структурно связанных с брадикинином». Биохимия . 15 (9): 1967–74. дои : 10.1021/bi00654a026 . ПМИД 5120 .
^ Фюлоп В., Бёкскей З., Полгар Л. (июль 1998 г.). «Пролилолигопептидаза: необычный бета-пропеллерный домен регулирует протеолиз» . Клетка . 94 (2): 161–70. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81416-6 . ПМИД 9695945 . S2CID 17074611 .
^ Фюлёп В., Зельтнер З., Полгар Л. (сентябрь 2000 г.). «Катализ сериновых олигопептидаз контролируется механизмом воротного фильтра» . Представитель ЭМБО . 1 (3): 277–81. дои : 10.1093/embo-reports/kvd048 . ПМЦ 1083722 . ПМИД 11256612 .
^ Кастеллани Б., Элеутери М., Ди Бона С., Кручиани Дж., Десантис Дж., Гораччи Л. (сентябрь 2023 г.). «VHL-модифицированный ПРОтеолиз для борьбы с химерами (PROTAC) как стратегия предотвращения метаболической деградации в приложениях in vitro». Журнал медицинской химии . 66 (18): 13148–71. doi : 10.1021/acs.jmedchem.3c01144 . ПМИД 37699425 . S2CID 261704865 .
^ Момени Н., Нордстрем Б.М., Хорстманн В., Аварседжи Х., Сивберг Б.В. (2005). «Изменения активности пролилэндопептидазы в плазме детей с расстройствами аутистического спектра» . БМК Психиатрия . 5:27 . дои : 10.1186/1471-244X-5-27 . ПМК 1190193 . ПМИД 15932649 .
^ Маес М., Гуссенс Ф., Шарпе С., Калабрезе Дж., Деснидер Р., Мельцер Х.Ю. (1995). «Изменения активности пролилэндопептидазы в плазме при депрессии, мании и шизофрении: эффекты антидепрессантов, стабилизаторов настроения и антипсихотических препаратов». Психиатрия Рез . 58 (3): 217–25. дои : 10.1016/0165-1781(95)02698-В . ПМИД 8570777 . S2CID 42691937 .
^ Хлебникова Н.Н., Крупина Н.А., Кушнарева Е.Ю., Золотов Н.Н., Крыжановский Г.Н. (2012). «Влияние имипрамина и ингибитора пролилэндопептидазы бензилоксикарбонилметионил-2(S)-цианопирролидина на активность пролинспецифических пептидаз в головном мозге крыс с экспериментальным тревожно-депрессивным синдромом». Bull Exp Biol Med . 152 (4): 409–12. дои : 10.1007/s10517-012-1540-z . ПМИД 22803098 . S2CID 15088734 .
^ Степняк Д., Спэний-Деккинг Л., Митеа С. и др. (октябрь 2006 г.). «Высокоэффективная деградация глютена с помощью недавно идентифицированной пролилэндопротеазы: последствия целиакии». Am J Physiol Gastrointest Физиол печени . 291 (4): G621–9. дои : 10.1152/ajpgi.00034.2006 . ПМИД 16690904 .
^ Фурманн Г., Леру Ж.К. (май 2011 г.). «Флуоресцентная визуализация активности экзогенных ферментов в желудочно-кишечном тракте in vivo» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 108 (22): 9032–7. Бибкод : 2011PNAS..108.9032F . дои : 10.1073/pnas.1100285108 . ПМК 3107327 . ПМИД 21576491 .
^ Ярхо Э.М., Веняляйнен Дж.И., Путиайнен С. и др. (март 2007 г.). «2(S)-(Циклоалк-1-енкарбонил)-1-(4-фенилбутаноил)пирролидины и 2(S)-(ароил)-1-(4-фенилбутаноил)пирролидины как ингибиторы пролилолигопептидазы». Биоорг. Мед. Хим . 15 (5): 2024–31. дои : 10.1016/j.bmc.2006.12.036 . ПМИД 17215128 .
^ Канай К., Араньи П., Бёкскей З. и др. (декабрь 2008 г.). «Ингибирование пролилолигопептидазы молекулами типа N-ацил-пропирролидина». Дж. Мед. Хим . 51 (23): 7514–22. дои : 10.1021/jm800944x . ПМИД 19006380 .
^ Морен П., Боэйджинга П.Х., Демазьер А., Де Нантей Г., Лутринджер Р. (2007). «Психотропный профиль S 17092, ингибитора пролилэндопептидазы, с использованием количественной ЭЭГ у молодых здоровых добровольцев». Нейропсихобиология . 55 (3–4): 176–83. дои : 10.1159/000107070 . ПМИД 17700042 . S2CID 27856130 .
^ Хлебникова Н.Н., Крупина Н.А., Богданова Н.Г., Золотов Н.Н., Крыжановский Г.Н. (январь 2009 г.). «Влияние ингибитора пролилендопептидазы бензилоксикарбонилметионил-2(S)-цианопирролидина на развитие экспериментального депрессивного синдрома у крыс». Бык. Эксп. Биол. Мед . 147 (1): 26–30. дои : 10.1007/s10517-009-0458-6 . ПМИД 19526123 . S2CID 25448235 .
^ Ёсимото Т., Кадо К., Мацубара Ф., Корияма Н., Кането Х., Цура Д. (декабрь 1987 г.). «Специфические ингибиторы пролилэндопептидазы и их антиамнестический эффект» . Дж. Фармакобио-Дин . 10 (12): 730–5 дои : 10.1248/bpb1978.10.730 . ПМИД 3330562 .
^ Тарраго Т., Кичик Н., Клаасен Б., Прадес Р., Тейшидо М., Хиральт Э. (август 2008 г.). «Байкалин, пролекарство, способное достигать ЦНС, является ингибитором пролилолигопептидазы». Биоорг. Мед . 16 (15): 7516–24. дои : 10.1016/j.bmc.2008.04.067 . ПМИД 18650094 .
^ Тоидэ К., Шинода М., Миядзаки А. (1998). «Новый ингибитор пролилэндопептидазы, JTP-4819 - его поведенческие и нейрохимические свойства для лечения болезни Альцгеймера». Преподобный Нейроски . 9 (1): 17–29. дои : 10.1515/revneuro.1998.9.1.17 . ПМИД 9683325 . S2CID 24450362 .
^ Ялканен А.Ю., Путтонен К.А., Веналайнен Дж.И., Синерва В., Маннила А., Руотсалайнен С., Ярхо Э.М., Валлин Э.А., Маннистё П.Т. (февраль 2007 г.). «Положительное влияние ингибирования пролилолигопептидазы на пространственную память у молодых, но не у старых крыс, получавших скополамин» . Базовая и клиническая фармакология и токсикология . 100 (2): 132–8. дои : 10.1111/j.1742-7843.2006.00021.x . ПМИД 17244263 .
^ Морен П., Лестаж П., Де Нантей Г., Йохемсен Р., Робин Дж.Л., Гез Д., Бойер П.А. (2002). «S 17092: ингибитор пролилэндопептидазы как потенциальное терапевтическое средство при нарушениях памяти. Доклинические и клинические исследования» . Препарат для ЦНС Rev. 8 (1): 31–52. дои : 10.1111/j.1527-3458.2002.tb00214.x . ПМК 6741683 . ПМИД 12070525 .

Внешние ссылки

пролил+эндопептидаза,+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
Запись о пролилэндопептидазе в Национальном центре биотехнологической информации
PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для пролилэндопептидазы человека.

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000085377 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7959018-4] Ванхоф Г., Гуссенс Ф., Хендрикс Л., Де Мистер И., Хендрикс Д., Врайенд Г., Ван Броекховен С., Шарп С. (декабрь 1994 г.). «Клонирование и анализ последовательности гена, кодирующего пролилэндопептидазу лимфоцитов человека». Джин . 149 (2): 363–6. дои : 10.1016/0378-1119(94)90177-5 . ПМИД 7959018 .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: пролилэндопептидаза PREP» .

[6] Оливейра Э.Б., Мартинс А.Р., Камарго AC (май 1976 г.). «Выделение эндопептидаз головного мозга: влияние размера и последовательности субстратов, структурно связанных с брадикинином». Биохимия . 15 (9): 1967–74. дои : 10.1021/bi00654a026 . ПМИД 5120 .

[Fülöp_1998-7] Фюлоп В., Бёкскей З., Полгар Л. (июль 1998 г.). «Пролилолигопептидаза: необычный бета-пропеллерный домен регулирует протеолиз» . Клетка . 94 (2): 161–70. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81416-6 . ПМИД 9695945 . S2CID 17074611 .

[Fülöp_2002-8] Фюлёп В., Зельтнер З., Полгар Л. (сентябрь 2000 г.). «Катализ сериновых олигопептидаз контролируется механизмом воротного фильтра» . Представитель ЭМБО . 1 (3): 277–81. дои : 10.1093/embo-reports/kvd048 . ПМЦ 1083722 . ПМИД 11256612 .

[Castellani_2023-9] Кастеллани Б., Элеутери М., Ди Бона С., Кручиани Дж., Десантис Дж., Гораччи Л. (сентябрь 2023 г.). «VHL-модифицированный ПРОтеолиз для борьбы с химерами (PROTAC) как стратегия предотвращения метаболической деградации в приложениях in vitro». Журнал медицинской химии . 66 (18): 13148–71. doi : 10.1021/acs.jmedchem.3c01144 . ПМИД 37699425 . S2CID 261704865 .

[10] Момени Н., Нордстрем Б.М., Хорстманн В., Аварседжи Х., Сивберг Б.В. (2005). «Изменения активности пролилэндопептидазы в плазме детей с расстройствами аутистического спектра» . БМК Психиатрия . 5:27 . дои : 10.1186/1471-244X-5-27 . ПМК 1190193 . ПМИД 15932649 .

[11] Маес М., Гуссенс Ф., Шарпе С., Калабрезе Дж., Деснидер Р., Мельцер Х.Ю. (1995). «Изменения активности пролилэндопептидазы в плазме при депрессии, мании и шизофрении: эффекты антидепрессантов, стабилизаторов настроения и антипсихотических препаратов». Психиатрия Рез . 58 (3): 217–25. дои : 10.1016/0165-1781(95)02698-В . ПМИД 8570777 . S2CID 42691937 .

[12] Хлебникова Н.Н., Крупина Н.А., Кушнарева Е.Ю., Золотов Н.Н., Крыжановский Г.Н. (2012). «Влияние имипрамина и ингибитора пролилэндопептидазы бензилоксикарбонилметионил-2(S)-цианопирролидина на активность пролинспецифических пептидаз в головном мозге крыс с экспериментальным тревожно-депрессивным синдромом». Bull Exp Biol Med . 152 (4): 409–12. дои : 10.1007/s10517-012-1540-z . ПМИД 22803098 . S2CID 15088734 .

[13] Степняк Д., Спэний-Деккинг Л., Митеа С. и др. (октябрь 2006 г.). «Высокоэффективная деградация глютена с помощью недавно идентифицированной пролилэндопротеазы: последствия целиакии». Am J Physiol Gastrointest Физиол печени . 291 (4): G621–9. дои : 10.1152/ajpgi.00034.2006 . ПМИД 16690904 .

[pmid21576491-14] Фурманн Г., Леру Ж.К. (май 2011 г.). «Флуоресцентная визуализация активности экзогенных ферментов в желудочно-кишечном тракте in vivo» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 108 (22): 9032–7. Бибкод : 2011PNAS..108.9032F . дои : 10.1073/pnas.1100285108 . ПМК 3107327 . ПМИД 21576491 .

[15] Ярхо Э.М., Веняляйнен Дж.И., Путиайнен С. и др. (март 2007 г.). «2(S)-(Циклоалк-1-енкарбонил)-1-(4-фенилбутаноил)пирролидины и 2(S)-(ароил)-1-(4-фенилбутаноил)пирролидины как ингибиторы пролилолигопептидазы». Биоорг. Мед. Хим . 15 (5): 2024–31. дои : 10.1016/j.bmc.2006.12.036 . ПМИД 17215128 .

[16] Канай К., Араньи П., Бёкскей З. и др. (декабрь 2008 г.). «Ингибирование пролилолигопептидазы молекулами типа N-ацил-пропирролидина». Дж. Мед. Хим . 51 (23): 7514–22. дои : 10.1021/jm800944x . ПМИД 19006380 .

[17] Морен П., Боэйджинга П.Х., Демазьер А., Де Нантей Г., Лутринджер Р. (2007). «Психотропный профиль S 17092, ингибитора пролилэндопептидазы, с использованием количественной ЭЭГ у молодых здоровых добровольцев». Нейропсихобиология . 55 (3–4): 176–83. дои : 10.1159/000107070 . ПМИД 17700042 . S2CID 27856130 .

[18] Хлебникова Н.Н., Крупина Н.А., Богданова Н.Г., Золотов Н.Н., Крыжановский Г.Н. (январь 2009 г.). «Влияние ингибитора пролилендопептидазы бензилоксикарбонилметионил-2(S)-цианопирролидина на развитие экспериментального депрессивного синдрома у крыс». Бык. Эксп. Биол. Мед . 147 (1): 26–30. дои : 10.1007/s10517-009-0458-6 . ПМИД 19526123 . S2CID 25448235 .

[pmid3330562-19] Ёсимото Т., Кадо К., Мацубара Ф., Корияма Н., Кането Х., Цура Д. (декабрь 1987 г.). «Специфические ингибиторы пролилэндопептидазы и их антиамнестический эффект» . Дж. Фармакобио-Дин . 10 (12): 730–5 дои : 10.1248/bpb1978.10.730 . ПМИД 3330562 .

[pmid18650094-20] Тарраго Т., Кичик Н., Клаасен Б., Прадес Р., Тейшидо М., Хиральт Э. (август 2008 г.). «Байкалин, пролекарство, способное достигать ЦНС, является ингибитором пролилолигопептидазы». Биоорг. Мед . 16 (15): 7516–24. дои : 10.1016/j.bmc.2008.04.067 . ПМИД 18650094 .

[pmid9683325-21] Тоидэ К., Шинода М., Миядзаки А. (1998). «Новый ингибитор пролилэндопептидазы, JTP-4819 - его поведенческие и нейрохимические свойства для лечения болезни Альцгеймера». Преподобный Нейроски . 9 (1): 17–29. дои : 10.1515/revneuro.1998.9.1.17 . ПМИД 9683325 . S2CID 24450362 .

[pmid17244263-22] Ялканен А.Ю., Путтонен К.А., Веналайнен Дж.И., Синерва В., Маннила А., Руотсалайнен С., Ярхо Э.М., Валлин Э.А., Маннистё П.Т. (февраль 2007 г.). «Положительное влияние ингибирования пролилолигопептидазы на пространственную память у молодых, но не у старых крыс, получавших скополамин» . Базовая и клиническая фармакология и токсикология . 100 (2): 132–8. дои : 10.1111/j.1742-7843.2006.00021.x . ПМИД 17244263 .

[pmid12070525-23] Морен П., Лестаж П., Де Нантей Г., Йохемсен Р., Робин Дж.Л., Гез Д., Бойер П.А. (2002). «S 17092: ингибитор пролилэндопептидазы как потенциальное терапевтическое средство при нарушениях памяти. Доклинические и клинические исследования» . Препарат для ЦНС Rev. 8 (1): 31–52. дои : 10.1111/j.1527-3458.2002.tb00214.x . ПМК 6741683 . ПМИД 12070525 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

v т и Эндопептидазы : сериновые протеазы/сериновые эндопептидазы ( EC 3.4.21 ).
Digestive enzymes	Enteropeptidase Trypsin Chymotrypsin Elastase Neutrophil Pancreatic
Coagulation	factors: Thrombin Factor VIIa Factor IXa Factor Xa Factor XIa Factor XIIa Kallikrein PSA KLK1 KLK2 KLK3 KLK4 KLK5 KLK6 KLK7 KLK8 KLK9 KLK10 KLK11 KLK12 KLK13 KLK14 KLK15 fibrinolysis: Plasmin Plasminogen activator Tissue plasminogen activator Urinary plasminogen activator
Complement system	Factor B Factor D Factor I MASP MASP1 MASP2 C3-convertase
Other immune system	Chymase Granzyme Tryptase Proteinase 3/Myeloblastin
Venombin	Ancrod Batroxobin
Other	Acrosin Prolyl endopeptidase Pronase Proprotein convertases 1 2 Prostasin Reelin Subtilisin/Furin/S1P4 Sedolisin/TPP1 Streptokinase Cathepsin A G

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)