КЛК6

КЛК6
Доступные структуры
ПДБ	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1GVL, 1L2E, 1LO6, 3VFE, 4D8N
Идентификаторы
Псевдонимы	KLK6 , Bssp, Klk7, PRSS18, PRSS9, SP59, hK6, калликреинродственная пептидаза 6
Внешние идентификаторы	Опустить : 602652 ; МГИ : 1343166 ; Гомологен : 68279 ; Генные карты : KLK6 ; ОМА : КЛК6 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	50,969,673 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	43,481,454 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	C1 segment; ; inferior ganglion of vagus nerve; ; inferior olivary nucleus; ; middle frontal gyrus; ; pons; ; corpus callosum; ; optic nerve; ; subthalamic nucleus; ; substantia nigra; ; pars reticulata;
	Top expressed in
	lip; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; deep cerebellar nuclei; ; anterior horn of spinal cord; ; pontine nuclei; ; cerebellar cortex; ; skin of external ear; ; motor neuron; ; white matter; ; medulla oblongata;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	peptidase activity; protein binding; serine-type peptidase activity; serine-type endopeptidase activity; hydrolase activity;
Cellular component	cytoplasm; intracellular membrane-bounded organelle; extracellular region; nucleolus; endoplasmic reticulum; mitochondrion; nucleus; extracellular space; secretory granule;
Biological process	neuron death; regulation of neuron projection development; tissue regeneration; amyloid precursor protein metabolic process; protein autoprocessing; proteolysis; central nervous system development; positive regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway; response to wounding; collagen catabolic process; regulation of cell differentiation; myelination; hormone metabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5653
	19144
	ENSG00000167755
	ENSMUSG00000050063
	Q92876
	н/д
	НМ_002774 ; НМ_001012964 ; НМ_001012965 ; НМ_001319948 ; НМ_001319949
	НМ_001164696 ; НМ_001164697 ; НМ_001164698 ; НМ_011177
	НП_001012982 ; НП_001012983 ; НП_001306877 ; НП_001306878 ; НП_002765
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Калликреин-6 — белок , который у человека кодируется KLK6 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Калликреин-6 также называют нейрозином, протеазой М, hK6 или зимом. Это последовательность из 223 аминокислот, полученная из исходной формы из 244 аминокислот, которая содержит пресигнальный пептид из 16 остатков и активационный пептид из 5 остатков . ^{[ 9 ]}

Функция

Калликреины представляют собой подгруппу сериновых протеаз, выполняющих разнообразные физиологические функции. Все больше данных свидетельствует о том, что многие калликреины участвуют в канцерогенезе , а некоторые из них потенциально могут выступать в качестве новых биомаркеров рака и других заболеваний . Этот ген является одним из пятнадцати членов подсемейства калликреинов, расположенных в кластере на хромосоме 19. Кодируемый фермент регулируется стероидными гормонами. В культуре тканей было обнаружено, что фермент генерирует амилоидогенные фрагменты из белка-предшественника амилоида , что указывает на его потенциальную роль в развитии болезни Альцгеймера . Для этого гена было идентифицировано множество вариантов альтернативно сплайсированных транскриптов, которые кодируют разные изоформы. ^{[ 8 ]}

Структура

Вторичная структура состоит из 13 бета-складчатых листов , 2 альфа-спиралей , 2 3 _10- спиралей и 8 петель. По аминокислотным последовательностям hK6 наиболее похож на миеленцефалон-специфическую протеазу (MSP) , которая происходит из семейства генов квлликреина крысы. MSP и hK6 нацелены на пептидную связь, за которой следует аргинин, и оба автоматически расщепляются в своих положениях Arg. ^{[ 10 ]}

Однако структурно hK6 больше всего напоминает трипсин, обнаруженный у коров/быков. Вокруг активного сайта имеются участки с короткими петлями, направленные в сторону от сайта связывания. В сайте связывания помимо остатков Asp, His и Ser обнаруживаются остатки 189–195, 214–220 и 224–228. ^{[ 11 ]}

Заболевание Патология

альфа-синуклеина Накопление обычно обнаруживается при деменции с тельцами Леви , болезни Паркинсона и у пациентов с множественной системной атрофией , что служит биомаркером инфекции. Таким образом, деградация этого белка необходима для предотвращения инфекции. В образцах мозга мышей ингибиторы протеазы использовались для идентификации белка, ответственного за деградацию альфа-синуклеина. Различные ингибиторы сериновых протеаз ( апротинин , фенилметилсульфонилфторид , лейпептин и 4-(2-аминоэтил)бензолсульфонилфторид ). существенно повлияло на путь деградации, что оправдывает необходимость использования сериновой протеазы для расщепления альфа-синуклеина.

Ингибитор калликреина был введен в образцы мышей, и он успешно ингибировал функцию калликреина. Исследования in vitro с использованием очищенного калликреина также были проведены с альфа-синуклеином, и он оказался эффективным в разложении альфа-синуклеина. Как ингибирование, так и успешная ферментативная активность in vitro демонстрируют, что калликреин является ферментом деградации. ^{[ 12 ]}

Хотя hK6 способствует профилактике заболеваний, он также может способствовать распространению злокачественных опухолевых клеток. Как фермент деградации, он способен разрушать белки внеклеточного матрикса как нормальных, так и злокачественных клеток, что повышает их способность мигрировать и отправлять сигналы. Например, фибронектин взаимодействует с целостными молекулами, когда злокачественные клетки пытаются мигрировать; разрушая его, злокачественные клетки могут мигрировать, прикрепляться и посылать сигнал другим злокачественным клеткам. ^{[ 13 ]}

Нейросиновый механизм

Asp-102 , His-57 и Ser-195 образуют каталитическую триаду для специфического гидролиза пептидной связи, где Arg находится по направлению к N-концу, а обычная аминокислота - по направлению к C-концу. ^{[ 14 ]} Считается, что он действует по тому же пути, что и другие протеазы серинового типа . ^{[ 15 ]}

Гистидин депротонирует серин
Заменители серина по амидной связи
Протонированный гистидин делает амин лучшей уходящей группой, а оксианион разрушается с образованием сложного эфира.
Вода входит в триаду и разрывает сложноэфирную связь, высвобождая серин.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000167755 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000050063 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ямасиро К., Цуруока Н., Кодама С., Цудзимото М., Ямамура Ю., Танака Т. и др. (январь 1997 г.). «Молекулярное клонирование новой трипсиноподобной сериновой протеазы (нейрозина), преимущественно экспрессируемой в мозге». Биохимия и биофизика Acta (BBA) - Структура и экспрессия генов . 1350 (1): 11–1 дои : 10.1016/s0167-4781(96)00187-x . ПМИД 9003450 .
^ Лундуолл А., Банд V, Блабер М., Клементс Дж.А., Корти Ю., Диамандис Э.П. и др. (июнь 2006 г.). «Полная номенклатура сериновых протеаз, гомологичных тканевым калликреинам» (PDF) . Биологическая химия . 387 (6): 637–641. дои : 10.1515/BC.2006.082 . ПМИД 16800724 . S2CID 436200 .
^ «Материалы 1-го Международного симпозиума по калликреинам, Лозанна, Швейцария, 1–3 сентября 2005 г.». Биологическая химия . 387 (6): 635–824. Июнь 2006 г. doi : 10.1515/BC.2006.081 . ПМИД 16800723 . S2CID 83910246 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: KLK6-калликреин-родственная пептидаза 6» .
^ Гомис-Рют Ф.Х., Байес А., Сотиропулу Г., Пампалакис Г., Цеценис Т., Виллегас В. и др. (июль 2002 г.). «Структура человеческого прокалликреина 6 раскрывает новый механизм активации семейства калликреинов» . Журнал биологической химии . 277 (30): 27273–27281. дои : 10.1074/jbc.M201534200 . ПМИД 12016211 .
^ Бернетт М.Дж., Блабер С.И., Скарисбрик И.А., Дханараджан П., Томпсон С.М., Блабер М. (июль 2002 г.). «Кристаллическая структура и биохимические характеристики человеческого калликреина 6 показывают, что трипсиноподобный калликреин экспрессируется в центральной нервной системе» . Журнал биологической химии . 277 (27): 24562–24570. дои : 10.1074/jbc.M202392200 . ПМИД 11983703 .
^ Бернетт М.Дж., Блабер С.И., Скарисбрик И.А., Дханараджан П., Томпсон С.М., Блабер М. (июль 2002 г.). «Кристаллическая структура и биохимические характеристики человеческого калликреина 6 показывают, что трипсиноподобный калликреин экспрессируется в центральной нервной системе» . Журнал биологической химии . 277 (27): 24562–24570. дои : 10.1074/jbc.M202392200 . ПМИД 11983703 .
^ Ивата А., Маруяма М., Акаги Т., Хашикава Т., Канадзава И., Цудзи С., Нукина Н. (октябрь 2003 г.). «Деградация альфа-синуклеина сериновой протеазой нейрозин: значение для патогенеза синуклеинопатий» . Молекулярная генетика человека . 12 (20): 2625–2635. дои : 10.1093/hmg/ddg283 . ПМИД 12928483 .
^ Гош М.К., Грасс Л., Соосаипиллай А., Сотиропулу Г., Диамандис Э.П. (2004). «Человеческий калликреин 6 разрушает белки внеклеточного матрикса и может усиливать метастатический потенциал опухолевых клеток». Биология опухолей . 25 (4): 193–199. дои : 10.1159/000081102 . ПМИД 15557757 . S2CID 14391147 .
^ Блабер С.И., Юн Х., Скарисбрик И.А., Джулиано М.А., Блабер М. (май 2007 г.). «Аутолитическая регуляция человеческой калликреин-родственной пептидазы 6» . Биохимия . 46 (17): 5209–5217. дои : 10.1021/bi6025006 . ПМК 2517904 . ПМИД 17417874 .
^ Хедстрем Л. (декабрь 2002 г.). «Механизм и специфичность сериновой протеазы». Химические обзоры . 102 (12): 4501–4524. дои : 10.1021/cr000033x . ПМИД 12475199 .

Дальнейшее чтение

Юсеф Г.М., Киши Т., Диамандис Э.П. (март 2003 г.). «Роль ферментов калликреина в центральной нервной системе». Клиника Химика Акта; Международный журнал клинической химии . 329 (1–2): 1–8. дои : 10.1016/S0009-8981(03)00004-4 . ПМИД 12589961 .
Менендес-Гонсалес М., Кастро-Сантос П., Суарес А., Калатаюд М.Т., Перес-Пинера П., Мартинес М. и др. (май 2008 г.). «Значение измерения плазменных уровней нейрозина в диагностике болезни Альцгеймера». Журнал болезни Альцгеймера . 14 (1): 59–67. дои : 10.3233/JAD-2008-14106 . ПМИД 18525128 .
Менендес-Гонсалес М., Кастро-Сантос П., Калатаюд М.Т., Перес-Пиньера П., Рибакоба Р., Мартинес-Ривера М. и др. (июль 2008 г.). «Уровень нейрозина в плазме предсказывает исход легких когнитивных нарушений» . Международный архив медицины . 1 (1): 11. дои : 10.1186/1755-7682-1-11 . ПМЦ 2475518 . ПМИД 18620574 .
Анисович А., Сотиропулу Г., Стенман Г., Мок С.К., Сагер Р. (сентябрь 1996 г.). «Новый гомолог протеазы, дифференциально экспрессирующийся при раке молочной железы и яичников» . Молекулярная медицина . 2 (5): 624–636. дои : 10.1007/BF03401646 . ПМК 2230195 . ПМИД 8898378 .
Литтл С.П., Диксон Э.П., Норрис Ф., Бакли В., Беккер Г.В., Джонсон М. и др. (октябрь 1997 г.). «Займ, новый и потенциально амилоидогенный фермент кДНК, выделенный из мозга при болезни Альцгеймера» . Журнал биологической химии . 272 (40): 25135–25142. дои : 10.1074/jbc.272.40.25135 . ПМИД 9312124 .
Юсеф Г.М., Луо Л.Ю., Шерер С.В., Сотиропулу Г., Диамандис Е.П. (декабрь 1999 г.). «Молекулярная характеристика фермента / протеазы M / нейрозина (PRSS9), гормонально регулируемой калликреинподобной сериновой протеазы». Геномика . 62 (2): 251–259. дои : 10.1006/geno.1999.6012 . ПМИД 10610719 .
Ган Л., Ли И., Смит Р., Аргонза-Барретт Р., Лей Х., Маккуэйг Дж. и др. (октябрь 2000 г.). «Секвенирование и анализ экспрессии кластера генов сериновой протеазы, расположенного в области хромосомы 19q13». Джин . 257 (1): 119–130. дои : 10.1016/S0378-1119(00)00382-6 . ПМИД 11054574 .
Петраки CD, Каравана В.Н., Скуфояннис П.Т., Литтл С.П., Howarth DJ, Юсеф Г.М., Диамандис EP (ноябрь 2001 г.). «Спектр экспрессии человеческого калликреина 6 (зима/протеазы М/нейрозина) в тканях человека по данным иммуногистохимии» . Журнал гистохимии и цитохимии . 49 (11): 1431–1441. дои : 10.1177/002215540104901111 . ПМИД 11668196 .
Бернетт М.Дж., Блабер С.И., Скарисбрик И.А., Дханараджан П., Томпсон С.М., Блабер М. (июль 2002 г.). «Кристаллическая структура и биохимические характеристики человеческого калликреина 6 показывают, что трипсиноподобный калликреин экспрессируется в центральной нервной системе» . Журнал биологической химии . 277 (27): 24562–24570. дои : 10.1074/jbc.M202392200 . ПМИД 11983703 .
Гомис-Рют Ф.Х., Байес А., Сотиропулу Г., Пампалакис Г., Цеценис Т., Виллегас В. и др. (июль 2002 г.). «Структура человеческого прокалликреина 6 раскрывает новый механизм активации семейства калликреинов» . Журнал биологической химии . 277 (30): 27273–27281. дои : 10.1074/jbc.M201534200 . ПМИД 12016211 .
Скарисбрик И.А., Блабер С.И., Луккинетти С.Ф., Генайн С.П., Блабер М., Родригес М. (июнь 2002 г.). «Активность недавно идентифицированной сериновой протеазы при демиелинизации ЦНС» . Мозг . 125 (Часть 6): 1283–1296. дои : 10.1093/brain/awf142 . ПМИД 12023317 .
Заргхуни М., Соосаипиллай А., Грасс Л., Скорилас А., Миразими Н., Диамандис Э.П. (май 2002 г.). «Снижение концентрации человеческого калликреина 6 в экстрактах головного мозга пациентов с болезнью Альцгеймера». Клиническая биохимия . 35 (3): 225–231. дои : 10.1016/S0009-9120(02)00292-8 . ПМИД 12074831 .
Хоффман Б.Р., Катсарос Д., Скорилас А., Диамандис П., Фрачкиоли С., Риго де ла Лонгре И.А. и др. (сентябрь 2002 г.). «Иммунофлуориметрическое количественное определение и гистохимическая локализация белка калликреина 6 в ткани рака яичников: новый независимый неблагоприятный прогностический биомаркер» . Британский журнал рака . 87 (7): 763–771. дои : 10.1038/sj.bjc.6600533 . ПМК 2364256 . ПМИД 12232761 .
Мицуи С., Окуи А., Уэмура Х., Мизуно Т., Ямада Т., Ямамура Ю., Ямагути Н. (ноябрь 2002 г.). «Снижение уровня нейрозина (KLK6), связанной со старением протеазы, в спинномозговой жидкости как возможный новый фактор риска болезни Альцгеймера». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 977 (1): 216–223. Бибкод : 2002NYASA.977..216M . дои : 10.1111/j.1749-6632.2002.tb04818.x . ПМИД 12480753 . S2CID 40568196 .
Хатчинсон С., Луо Л.Ю., Юсеф Г.М., Соосаипиллай А., Диамандис Э.П. (май 2003 г.). «Очистка человеческого калликреина 6 из биологических жидкостей и идентификация его комплекса с альфа(1)-антихимотрипсином» . Клиническая химия . 49 (5): 746–751. дои : 10.1373/49.5.746 . ПМИД 12709365 .
Магклара А., Меллати А.А., Васни Г.А., Литтл С.П., Сотиропулу Г., Беккер Г.В., Диамандис Э.П. (август 2003 г.). «Характеристика ферментативной активности человеческого калликреина 6: аутоактивация, субстратная специфичность и регуляция ингибиторами». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 307 (4): 948–955. дои : 10.1016/S0006-291X(03)01271-3 . ПМИД 12878203 .
Ивата А., Маруяма М., Акаги Т., Хашикава Т., Канадзава И., Цудзи С., Нукина Н. (октябрь 2003 г.). «Деградация альфа-синуклеина сериновой протеазой нейрозин: значение для патогенеза синуклеинопатий» . Молекулярная генетика человека . 12 (20): 2625–2635. дои : 10.1093/hmg/ddg283 . ПМИД 12928483 .
Саутер Э.Р., Лайнингер Дж., Магклара А., Хьюитт Дж.Э., Диамандис Э.П. (февраль 2004 г.). «Связь экспрессии калликреина в жидкости аспирата сосков с риском рака молочной железы» . Международный журнал рака . 108 (4): 588–591. дои : 10.1002/ijc.11607 . ПМИД 14696124 . S2CID 29116787 .
Пампалакис Г., Курлендер Л., Диамандис Э.П., Сотиропулу Г. (июль 2004 г.). «Клонирование и характеристика новых изоформ гена калликреина 6 человека». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 320 (1): 54–61. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.04.205 . ПМИД 15207701 .

Внешние ссылки

Онлайн-база данных MEROPS . по пептидазам и их ингибиторам: S01.236

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000167755 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000050063 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9003450-5] Ямасиро К., Цуруока Н., Кодама С., Цудзимото М., Ямамура Ю., Танака Т. и др. (январь 1997 г.). «Молекулярное клонирование новой трипсиноподобной сериновой протеазы (нейрозина), преимущественно экспрессируемой в мозге». Биохимия и биофизика Acta (BBA) - Структура и экспрессия генов . 1350 (1): 11–1 дои : 10.1016/s0167-4781(96)00187-x . ПМИД 9003450 .

[pmid16800724-6] Лундуолл А., Банд V, Блабер М., Клементс Дж.А., Корти Ю., Диамандис Э.П. и др. (июнь 2006 г.). «Полная номенклатура сериновых протеаз, гомологичных тканевым калликреинам» (PDF) . Биологическая химия . 387 (6): 637–641. дои : 10.1515/BC.2006.082 . ПМИД 16800724 . S2CID 436200 .

[pmid16800723-7] «Материалы 1-го Международного симпозиума по калликреинам, Лозанна, Швейцария, 1–3 сентября 2005 г.». Биологическая химия . 387 (6): 635–824. Июнь 2006 г. doi : 10.1515/BC.2006.081 . ПМИД 16800723 . S2CID 83910246 .

[entrez-8] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: KLK6-калликреин-родственная пептидаза 6» .

[9] Гомис-Рют Ф.Х., Байес А., Сотиропулу Г., Пампалакис Г., Цеценис Т., Виллегас В. и др. (июль 2002 г.). «Структура человеческого прокалликреина 6 раскрывает новый механизм активации семейства калликреинов» . Журнал биологической химии . 277 (30): 27273–27281. дои : 10.1074/jbc.M201534200 . ПМИД 12016211 .

[10] Бернетт М.Дж., Блабер С.И., Скарисбрик И.А., Дханараджан П., Томпсон С.М., Блабер М. (июль 2002 г.). «Кристаллическая структура и биохимические характеристики человеческого калликреина 6 показывают, что трипсиноподобный калликреин экспрессируется в центральной нервной системе» . Журнал биологической химии . 277 (27): 24562–24570. дои : 10.1074/jbc.M202392200 . ПМИД 11983703 .

[11] Бернетт М.Дж., Блабер С.И., Скарисбрик И.А., Дханараджан П., Томпсон С.М., Блабер М. (июль 2002 г.). «Кристаллическая структура и биохимические характеристики человеческого калликреина 6 показывают, что трипсиноподобный калликреин экспрессируется в центральной нервной системе» . Журнал биологической химии . 277 (27): 24562–24570. дои : 10.1074/jbc.M202392200 . ПМИД 11983703 .

[12] Ивата А., Маруяма М., Акаги Т., Хашикава Т., Канадзава И., Цудзи С., Нукина Н. (октябрь 2003 г.). «Деградация альфа-синуклеина сериновой протеазой нейрозин: значение для патогенеза синуклеинопатий» . Молекулярная генетика человека . 12 (20): 2625–2635. дои : 10.1093/hmg/ddg283 . ПМИД 12928483 .

[13] Гош М.К., Грасс Л., Соосаипиллай А., Сотиропулу Г., Диамандис Э.П. (2004). «Человеческий калликреин 6 разрушает белки внеклеточного матрикса и может усиливать метастатический потенциал опухолевых клеток». Биология опухолей . 25 (4): 193–199. дои : 10.1159/000081102 . ПМИД 15557757 . S2CID 14391147 .

[14] Блабер С.И., Юн Х., Скарисбрик И.А., Джулиано М.А., Блабер М. (май 2007 г.). «Аутолитическая регуляция человеческой калликреин-родственной пептидазы 6» . Биохимия . 46 (17): 5209–5217. дои : 10.1021/bi6025006 . ПМК 2517904 . ПМИД 17417874 .

[15] Хедстрем Л. (декабрь 2002 г.). «Механизм и специфичность сериновой протеазы». Химические обзоры . 102 (12): 4501–4524. дои : 10.1021/cr000033x . ПМИД 12475199 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]