Апратаксин
(Перенаправлено с APTX )
| АПТХ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | APTX , AOA, AOA1, AXA1, EAOH, EOAHA, FHA-HIT, апратаксин | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 606350 ; МГИ : 1913658 ; Гомологен : 41634 ; Генные карты : APTX ; OMA : APTX – ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Апратаксин — белок , который у человека кодируется APTX геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
Этот ген кодирует члена суперсемейства гистидиновой триады (HIT), некоторые из которых обладают нуклеотидсвязывающей и диаденозинполифосфатгидролазной активностью. Кодируемый белок может играть роль в репарации одноцепочечной ДНК . Мутации в этом гене связаны с атаксией и апраксией глаз . Для этого гена было идентифицировано множество вариантов транскрипта, кодирующих разные изоформы, однако полноразмерная природа некоторых вариантов не определена. [ 7 ]
Функция
[ редактировать ]Апратаксин удаляет АМФ с концов ДНК после неудачных попыток лигирования ДНК-лигазой IV во время негомологичного соединения концов , тем самым делая возможным последующие попытки лигирования. [ 8 ] [ 9 ]
Нить ДНК рвется
[ редактировать ]Атаксия глазодвигательная апраксия-1 — неврологическое заболевание, вызванное мутациями в гене APTX, кодирующем апратаксин. [ 10 ] Неврологическое расстройство, по-видимому, вызвано постепенным накоплением невосстановленных разрывов цепей ДНК в результате неудачных событий лигирования ДНК. [ 10 ]
Преждевременное старение
[ редактировать ]aptx −/− Были созданы мутантные мыши, но у них отсутствует явный фенотип. [ 10 ] Была создана еще одна модель мыши, в которой мутация супероксиддисмутазы I (SOD1) экспрессируется в Aptx. −/− мышь. [ 11 ] Мутация SOD1 вызывает снижение восстановления транскрипции после окислительного стресса . У этих мышей наблюдалось ускоренное клеточное старение . Это исследование также продемонстрировало защитную роль Aptx in vivo и предположило, что потеря функции Aptx приводит к прогрессирующему накоплению разрывов ДНК в нервной системе, вызывая признаки системного преждевременного старения. [ 11 ] (см. теорию старения, связанную с повреждением ДНК ).
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что апратаксин взаимодействует с:
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000137074 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000028411 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Дате Х, Онодера О, Танака Х, Ивабути К, Уэкава К, Игараси С, Койке Р, Хирои Т, Юаса Т, Авайя Ю, Сакаи Т, Такахаси Т, Нагатомо Х, Секидзима Ю, Кавачи I, Такаяма Ю, Нисидзава М., Фукухара Н., Сайто К., Сугано С., Цудзи С. (октябрь 2001 г.). Ранняя атаксия с глазной моторной апраксией и гипоальбуминемией вызвана мутациями в новом гене суперсемейства HIT». ( 2 ) 184–8. : 10.1038 /ng1001-184 . « 29 Genet : doi Nat
- ^ Морейра MC , Барбот С , Тати Н , Кодзука Н , Учида Е , Гибсон Т , Мендонка П , Коста М , Баррос Дж , Янагисава Т , Ватанабэ М , Икеда Ю , Аоки М , Нагата Т , Коутиньо П , Секейрос Дж , Кениг М (октябрь 2001 г.). «Ген, мутировавший при атаксии-глазной апраксии 1, кодирует новый белок HIT/Zn-пальцевый апратаксин». Ночной Жене . 29 (2): 189–93. дои : 10.1038/ng1001-189 . ПМИД 11586300 . S2CID 23001321 .
- ^ Перейти обратно: а б «Ген Энтрез: Апратаксин APTX» .
- ^ Расс У, Ахель I, West SC (декабрь 2008 г.). «Молекулярный механизм деаденилирования ДНК белком апратаксином, вызывающим неврологические заболевания» . Ж. Биол. Хим . 283 (49): 33994–4001. дои : 10.1074/jbc.M807124200 . ПМЦ 2662222 . ПМИД 18836178 .
- ^ Рейнольдс Дж. Дж., Эль-Хамиси С.Ф., Катьял С., Клементс П., Маккиннон П.Дж., Калдекотт К.В. (март 2009 г.). «Дефектное лигирование ДНК во время восстановления короткоцепочечного разрыва при атаксии глазодвигательной апраксии 1» . Мол. Клетка. Биол . 29 (5): 1354–62. дои : 10.1128/MCB.01471-08 . ПМЦ 2643831 . ПМИД 19103743 .
- ^ Перейти обратно: а б с Ахель И., Расс У., Эль-Хамиси С.Ф., Катьял С., Клементс П.М., Маккиннон П.Дж., Калдекотт К.В., West SC (2006). «Белок нейродегенеративных заболеваний апратаксин устраняет абортивные промежуточные соединения лигирования ДНК». Природа . 443 (7112): 713–6. Бибкод : 2006Natur.443..713A . дои : 10.1038/nature05164 . ПМИД 16964241 . S2CID 4431045 .
- ^ Перейти обратно: а б Кэрролл Дж., Пейдж ТК, Чианг С.К., Кальмар Б., Боде Д., Гринсмит Л., Маккиннон П.Дж., Торп Дж.Р., Хафезпараст М., Эль-Хамиси С.Ф. (2015). «Экспрессия патогенной мутации SOD1 повышает чувствительность клеток и мышей с дефицитом апратаксина к окислительному стрессу и вызывает признаки преждевременного старения» . Хм. Мол. Жене . 24 (3): 828–40. дои : 10.1093/hmg/ddu500 . ПМК 4291253 . ПМИД 25274775 .
- ^ Перейти обратно: а б Дате Х, Игараси С., Сано Ю., Такахаси Т., Такахаси Т., Такано Х., Цудзи С., Нисидзава М., Онодера О (декабрь 2004 г.). «Домен FHA апратаксина взаимодействует с С-концевой областью XRCC1». Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 325 (4): 1279–85. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.10.162 . ПМИД 15555565 .
- ^ Перейти обратно: а б с Гювен Н., Бешерель О.Дж., Киджас А.В., Чен П., Хоу О., Рудольф Дж.Х., Гатти Р., Дате Х., Онодера О., Таучер-Шольц Г., Лавин М.Ф. (май 2004 г.). «Апратаксин, новый белок, защищающий от генотоксического стресса» . Хм. Мол. Жене 13 (10): 1081–9 дои : 10.1093/hmg/ddh122 . ПМИД 15044383 .
- ^ Клементс П.М., Бреслин С., Дикс Э.Д., Берд П.Дж., Джу Л., Бигановски П., Бреннер С., Морейра М.К., Тейлор А.М., Калдекотт К.В. (ноябрь 2004 г.). «Продукт гена атаксии-глазомоторной апраксии 1 играет роль, отличную от ATM, и взаимодействует с белками восстановления разрыва цепи ДНК XRCC1 и XRCC4». Восстановление ДНК (Амст.) . 3 (11): 1493–502. дои : 10.1016/j.dnarep.2004.06.017 . ПМИД 15380105 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Айкарди Дж., Барбоза С., Андерманн Е. и др. (1989). «Атаксия-глазно-моторная апраксия: синдром, имитирующий атаксию-телеангиэктазию». Энн. Нейрол . 24 (4): 497–502. дои : 10.1002/ana.410240404 . ПМИД 3239952 . S2CID 45836910 .
- Гаскон Г.Г., Абдо Н., Сигут Д. и др. (1995). «Синдром атаксии-глазодвигательной апраксии». Дж. Детский Нейрол . 10 (2): 118–22. дои : 10.1177/088307389501000210 . ПМИД 7782601 . S2CID 26080242 .
- Ханнан М.А., Сигут Д., Вагрей М., Гаскон Г.Г. (1995). «Синдром атаксии-глазно-моторной апраксии: исследование клеточной радиочувствительности пациентов и членов их семей» . Дж. Мед. Жене . 31 (12): 953–6. дои : 10.1136/jmg.31.12.953 . ПМК 1016697 . ПМИД 7891378 .
- Морейра М.С., Барбот С., Тачи Н. и др. (2001). «Картирование гомозиготности португальской и японской форм атаксии-глазодвигательной апраксии по 9p13 и доказательства генетической гетерогенности» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 68 (2): 501–8. дои : 10.1086/318191 . ПМЦ 1235299 . ПМИД 11170899 .
- Бреннер С. (2002). «Подсказка, Fhit и GalT: функция, структура, эволюция и механизм трех ветвей суперсемейства гистидиновой триады нуклеотидных гидролаз и трансфераз» . Биохимия . 41 (29): 9003–14. дои : 10.1021/bi025942q . ПМК 2571077 . ПМИД 12119013 .
- Симадзаки Х., Такаяма Ю., Сакоэ К. и др. (2002). «Атаксия с ранним началом с моторной апраксией глаз и гипоальбуминемией: мутации гена апратаксина». Неврология . 59 (4): 590–5. дои : 10.1212/wnl.59.4.590 . ПМИД 12196655 . S2CID 19576330 .
- Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
- Транчант С., Флёри М., Морейра М.С. и др. (2004). «Фенотипическая изменчивость мутаций гена апратаксина». Неврология . 60 (5): 868–70. дои : 10.1212/01.wnl.0000048562.88536.a4 . ПМИД 12629250 . S2CID 29358633 .
- Ле Бер И., Морейра М.К., Риво-Пешу С. и др. (2003). «Мозжечковая атаксия с глазодвигательной апраксией 1 типа: клинико-генетические исследования» . Мозг . 126 (Часть 12): 2761–72. дои : 10.1093/brain/awg283 . ПМИД 14506070 .
- Секидзима Ю., Хашимото Т., Онодера О. и др. (2004). «Тяжелая генерализованная дистония как проявление пациента с мутацией гена апратаксин». Мов. Разлад . 18 (10): 1198–200. дои : 10.1002/mds.10526 . ПМИД 14534929 . S2CID 28225863 .
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
- Сано Ю., Дате Х., Игараси С. и др. (2004). «Апратаксин, белок, вызывающий EAOH, представляет собой ядерный белок, который потенциально может играть роль белка восстановления ДНК». Энн. Нейрол . 55 (2): 241–9. дои : 10.1002/ана.10808 . ПМИД 14755728 . S2CID 25338143 .
- Гувен Н., Бешерель О.Дж., Киджас А.В. и др. (2004). «Апратаксин, новый белок, защищающий от генотоксического стресса» . Хм. Мол. Жене . 13 (10): 1081–93. дои : 10.1093/hmg/ddh122 . ПМИД 15044383 .
- Хамфри С.Дж., Оливер К., Хант А.Р. и др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ 9 хромосомы человека» . Природа . 429 (6990): 369–74. Бибкод : 2004Natur.429..369H . дои : 10.1038/nature02465 . ПМК 2734081 . ПМИД 15164053 .
- Хабек М., Зюльке С., Бентеле К.Х. и др. (2004). «Мутации апратаксина являются редкой причиной ранней атаксии в Германии». Дж. Нейрол . 251 (5): 591–4. дои : 10.1007/s00415-004-0374-7 . ПМИД 15164193 . S2CID 20280677 .
- Хирано М., Нишиваки Т., Кария С. и др. (2004). «Новые варианты сплайсинга увеличивают молекулярное разнообразие апраксина, гена, ответственного за раннюю атаксию с глазной моторной апраксией и гипоальбуминемией». Неврология. Летт . 366 (2): 120–5. дои : 10.1016/j.neulet.2004.05.034 . ПМИД 15276230 . S2CID 37647769 .
- Амури Р., Морейра М.К., Зуари М. и др. (2005). «Мутации гена апратаксина в тунисских семьях». Неврология . 63 (5): 928–9. дои : 10.1212/01.wnl.0000137044.06573.46 . ПМИД 15365154 . S2CID 41637052 .
- Клементс П.М., Бреслин С., Дикс Э.Д. и др. (2005). «Продукт гена атаксии-глазомоторной апраксии 1 играет роль, отличную от ATM, и взаимодействует с белками восстановления разрыва цепи ДНК XRCC1 и XRCC4». Восстановление ДНК (Амст.) . 3 (11): 1493–502. дои : 10.1016/j.dnarep.2004.06.017 . ПМИД 15380105 .