DDX3X
DDX3X | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | DDX3X , DBX, DDX14, DDX3, HLP2, CAP-Rf, MRX102, геликаза 3 DEAD-бокса, Х-связанная, геликаза 3 DEAD-бокса, MRXSSB | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Опустить : 300160 ; МГИ : 103064 ; Гомологен : 3425 ; Генные карты : DDX3X ; ОМА : DDX3X — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX3X — фермент , который у человека кодируется DDX3X геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
Функция
[ редактировать ]Белки DEAD-бокса , характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), представляют собой предполагаемые РНК- хеликазы . Они участвуют в ряде клеточных процессов, включающих изменение вторичной структуры РНК, таких как инициация трансляции , ядерный и митохондриальный сплайсинг , а также сборка рибосом и сплайсосом . Судя по характеру их распространения, считается, что некоторые члены этого семейства участвуют в эмбриогенезе, сперматогенезе, а также росте и делении клеток. Этот ген кодирует белок DEAD-бокса, который специфически взаимодействует с коровым белком вируса гепатита С, что приводит к изменению его внутриклеточного расположения. Этот ген имеет гомолог, расположенный в нерекомбинирующей области Y-хромосомы. Белковая последовательность этого гена и Y-связанного гомолога идентична на 91%. [ 7 ]
Субклеточный трафик
[ редактировать ]клетки DDX3X выполняет свои функции в ядре и цитоплазме , выходя из ядра по пути ядерного экспорта экспортина-1/CRM1 . Первоначально сообщалось, что для этого взаимодействия необходим хеликазный домен DDX3X, тогда как канонические особенности пути транспортировки, а именно наличие сигнала ядерного экспорта (NES) на DDX3X и Ran-GTP с экспортином-1, были необязательными. связывание [ 8 ] С тех пор было показано, что связывание DDX3X с экспортином-1 и его транспортировка не требуют геликазного домена DDX3X и явно зависят от NES- и Ran-GTP. [ 9 ]
Роль в раке
[ редактировать ]DDX3X участвует во многих различных типах рака. Например, он аномально экспрессируется в клетках эпителиального рака молочной железы, в которых его экспрессия активируется с помощью HIF1A во время гипоксии . [ 10 ] Повышенная экспрессия DDX3X с помощью HIF1A при гипоксии инициируется прямым связыванием HIF1A с ответным элементом HIF1A . [ 10 ] что подтверждено иммунопреципитацией хроматина и репортерным анализом люциферазы . Поскольку на экспрессию DDX3X влияет активность HIF1A, совместная локализация этих белков также была продемонстрирована в MDA-MB-231 образцах опухоли ксенотрансплантата . [ 10 ]
Сообщается, что в клетках HeLa DDX3X контролирует развитие клеточного цикла посредством циклина E1 . [ 11 ] Более конкретно, было показано, что DDX3X напрямую связывается с 5'-UTR циклина E1 и тем самым облегчает трансляцию белка. Было продемонстрировано, что повышенные уровни белка циклина E1 опосредуют переход входа в S-фазу . [ 11 ]
На выживаемость, миграцию и пролиферацию меланомы влияет активность DDX3X. [ 12 ] Клетки меланомы с низкой экспрессией DDX3X обладают высокой миграционной способностью, низкой скоростью пролиферации и сниженной к вемурафенибу чувствительностью . Хотя клетки с высоким уровнем экспрессии DDX3X чувствительны к лекарствам, они более пролиферативны и менее мигрируют. Эти фенотипы можно объяснить трансляционными эффектами на транскрипционный фактор меланомы MITF . [ 12 ] 5'-UTR мРНК MITF содержит сложный РНК-регулон ( IRES ), который связывается и активируется DDX3X. Активация IRES приводит к трансляции мРНК MITF. У мышей, которым инъецировали клетки меланомы с удаленным IRES, наблюдается более агрессивное прогрессирование опухоли, включая увеличение метастазирования в легкие . [ 12 ] Интересно, что вемурафениб влияет на DDX3X при меланоме по неоткрытому механизму . Неизвестно, каким образом DDX3X подавляется присутствием вемурафениба. Однако снижение уровня DDX3X во время лечения препаратом объясняет развитие резистентных к лекарству клеток, часто обнаруживаемых при низкой экспрессии MITF . [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Мутации гена DDX3X связаны с медуллобластомой . [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] При меланоме низкая экспрессия гена связана с плохой выживаемостью без отдаленных метастазов . [ 12 ] Кроме того, уровень мРНК DDX3X ниже в биоптатах пострецидивной меланомы у пациентов, получающих вемурафениб , и при прогрессирующих опухолях.
Мутации гена DDX3X также вызывают синдром DDX3X , который поражает преимущественно женщин и проявляется задержкой развития или инвалидностью, аутизмом , СДВГ и низким мышечным тонусом .
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000215301 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000787 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Лан Б.Т., Пейдж, округ Колумбия (октябрь 1997 г.). «Функциональная когерентность Y-хромосомы человека». Наука . 278 (5338): 675–80. Бибкод : 1997Sci...278..675L . дои : 10.1126/science.278.5338.675 . ПМИД 9381176 .
- ^ Пак С.Х., Ли С.Г., Ким Ю, Сон К. (октябрь 1998 г.). «Присвоение предполагаемого гена РНК-хеликазы человека, DDX3, полосам Х-хромосомы человека p11.3 → p11.23». Цитогенетика и клеточная генетика . 81 (3–4): 178–9. дои : 10.1159/000015022 . ПМИД 9730595 . S2CID 46774908 .
- ^ Jump up to: а б «Ген Энтреза: DDX3X DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) боксерский полипептид 3, Х-связанный» .
- ^ Йедавалли В.С., Новё С., Чи Ю.Х., Клейман Л., Жанг К.Т. (октябрь 2004 г.). «Требование РНК-хеликазы DDX3 DEAD box для функции экспорта ВИЧ-1 Rev-RRE» . Клетка . 119 (3): 381–92. дои : 10.1016/j.cell.2004.09.029 . ПМИД 15507209 .
- ^ Хитон С.М., Аткинсон С.С., Суини М.Н., Ян С.Н., Янс Д.А., Борг Н.А. (сентябрь 2019 г.). «Зависимый от экспортина-1 ядерный экспорт DEAD-бокс-хеликазы DDX3X играет центральную роль в ее роли в противовирусном иммунитете» . Клетки . 8 (10): 1181. doi : 10.3390/cells8101181 . ПМЦ 6848931 . ПМИД 31575075 .
- ^ Jump up to: а б с Ботлагунта М., Кришнамачари Б., Весуна Ф., Виннард П.Т., Бол Г.М., Патель А.Х. и др. (март 2011 г.). «Экспрессия DDX3 напрямую модулируется индуцируемым гипоксией фактором-1 альфа в эпителиальных клетках молочной железы» . ПЛОС ОДИН . 6 (3): e17563. Бибкод : 2011PLoSO...617563B . дои : 10.1371/journal.pone.0017563 . ПМК 3063174 . ПМИД 21448281 .
- ^ Jump up to: а б Лай MC, Чанг WC, Ши С.Ю., Тарн, Вайоминг (ноябрь 2010 г.). «DDX3 регулирует рост клеток посредством контроля трансляции циклина E1» . Молекулярная и клеточная биология . 30 (22): 5444–53. дои : 10.1128/MCB.00560-10 . ПМЦ 2976371 . ПМИД 20837705 .
- ^ Jump up to: а б с д и Фунг Б., Чесла М., Санна А., Гуцци Н., Беневенти Г., Као Тхи Нгок П. и др. (июнь 2019 г.). «Х-связанная РНК-геликаза DDX3X диктует перепрограммирование трансляции и метастазирование при меланоме» . Отчеты по ячейкам . 27 (12): 3573–3586.e7. дои : 10.1016/j.celrep.2019.05.069 . ПМИД 31216476 .
- ^ Мюллер Дж., Крийгсман О., Цой Дж., Роберт Л., Хьюго В., Сонг С. и др. (декабрь 2014 г.). «Низкое соотношение MITF/AXL предсказывает раннюю устойчивость меланомы к множественным таргетным препаратам» . Природные коммуникации . 5 (1): 5712. Бибкод : 2014NatCo...5.5712M . дои : 10.1038/ncomms6712 . ПМЦ 4428333 . ПМИД 25502142 .
- ^ Конечковски Д.Д., Йоханнессен К.М., Абудайе О., Ким Дж.В., Купер З.А., Пирис А. и др. (июль 2014 г.). «Различия в состоянии клеток меланомы влияют на чувствительность к ингибиторам пути MAPK» . Открытие рака . 4 (7): 816–27. дои : 10.1158/2159-8290.CD-13-0424 . ПМЦ 4154497 . ПМИД 24771846 .
- ^ Робинсон Г., Паркер М., Краненбург Т.А., Лу С., Чен Икс, Дин Л. и др. (август 2012 г.). «Новые мутации нацелены на отдельные подгруппы медуллобластомы» . Природа . 488 (7409): 43–8. Бибкод : 2012Natur.488...43R . дои : 10.1038/nature11213 . ПМК 3412905 . ПМИД 22722829 .
- ^ Джонс Д.Т., Ягер Н., Кул М., Зихнер Т., Хаттер Б., Султан М. и др. (август 2012 г.). «Анализ геномной сложности, лежащей в основе медуллобластомы» . Природа . 488 (7409): 100–5. Бибкод : 2012Natur.488..100J . дои : 10.1038/nature11284 . ПМК 3662966 . ПМИД 22832583 .
- ^ Пью Т.Дж., Вираратне С.Д., Арчер Т.К., Померанц Круммель Д.А., Оклер Д., Бокиккио Дж. и др. (август 2012 г.). «Секвенирование экзома медуллобластомы выявляет соматические мутации, специфичные для подтипа» . Природа . 488 (7409): 106–10. Бибкод : 2012Natur.488..106P . дои : 10.1038/nature11329 . ПМЦ 3413789 . ПМИД 22820256 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Ли Л, Ли Х.С., Пауза К.Д., Букринский М., Чжао Р.Ю. (2006). «Роль вспомогательных белков ВИЧ-1 в вирусном патогенезе и взаимодействии хозяин-патоген» . Клеточные исследования . 15 (11–12): 923–34. дои : 10.1038/sj.cr.7290370 . ПМИД 16354571 .
- Овсянка А.М., Патель А.Х. (май 1999 г.). «Коровой белок вируса гепатита С взаимодействует с белком DEAD-бокса человека DDX3» . Вирусология . 257 (2): 330–40. дои : 10.1006/виро.1999.9659 . ПМИД 10329544 .
- Мамия Н., Ворман HJ (май 1999 г.). «Коровой белок вируса гепатита С связывается с РНК-хеликазой DEAD box» . Журнал биологической химии . 274 (22): 15751–6. дои : 10.1074/jbc.274.22.15751 . ПМИД 10336476 .
- Ягуэ Х., Альварес И., Рогнан Д., Рамос М., Васкес Х., де Кастро Х.А. (июнь 2000 г.). «N-ацетилированный природный лиганд лейкоцитарного антигена гистосовместимости человека (HLA)-B39. Белки класса I классического главного комплекса гистосовместимости связывают пептиды с заблокированным NH (2)-концом in vivo» . Журнал экспериментальной медицины . 191 (12): 2083–92. дои : 10.1084/jem.191.12.2083 . ПМК 2193201 . ПМИД 10859333 .
- Ким Ю.С., Ли С.Г., Пак С.Х., Сон К. (октябрь 2001 г.). «Геновая структура человеческого DDX3 и картирование хромосом связанных с ним последовательностей» . Молекулы и клетки . 12 (2): 209–14. дои : 10.1016/S1016-8478(23)17085-3 . ПМИД 11710523 .
- Ли Дж., Хокинс И.С., Харви С.Д., Дженнингс Дж.Л., Линк Эй.Дж., Паттон Дж.Г. (ноябрь 2003 г.). «Регуляция альтернативного сплайсинга с помощью SRrp86 и взаимодействующих с ним белков» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (21): 7437–47. дои : 10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003 . ПМК 207616 . ПМИД 14559993 .
- Шу Х., Чен С., Би Кью, Мамби М., Бреккен Д.Л. (март 2004 г.). «Идентификация фосфопротеинов и сайтов их фосфорилирования в клеточной линии лимфомы WEHI-231 B» . Молекулярная и клеточная протеомика . 3 (3): 279–86. дои : 10.1074/mcp.D300003-MCP200 . ПМИД 14729942 .
- Баумистер Т., Баух А., Раффнер Х., Ангранд П.О., Бергамини Г., Кротон К. и др. (февраль 2004 г.). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Природная клеточная биология . 6 (2): 97–105. дои : 10.1038/ncb1086 . ПМИД 14743216 . S2CID 11683986 .
- Йедавалли В.С., Новё С., Чи Ю.Х., Клейман Л., Жанг К.Т. (октябрь 2004 г.). «Требование РНК-хеликазы DDX3 DEAD box для функции экспорта ВИЧ-1 Rev-RRE» . Клетка . 119 (3): 381–92. дои : 10.1016/j.cell.2004.09.029 . ПМИД 15507209 .
- Дейтон AI (октябрь 2004 г.). «Внутри тебя, без тебя: версия ВИЧ-1 и экспорт РНК» . Ретровирусология . 1:35 . дои : 10.1186/1742-4690-1-35 . ПМК 526764 . ПМИД 15516266 .
- Кришнан В., Зейхнер С.Л. (декабрь 2004 г.). «Изменения в экспрессии DEAD-бокса и других РНК-связывающих белков во время репликации ВИЧ-1» . Ретровирусология . 1 : 42. дои : 10.1186/1742-4690-1-42 . ПМЦ 543576 . ПМИД 15588285 .
- Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж. и др. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природная биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
- Тао В.А., Воллшайд Б., О'Брайен Р., Энг Дж.К., Ли XJ, Боденмиллер Б. и др. (август 2005 г.). «Количественный анализ фосфопротеома с использованием химии конъюгации дендримеров и тандемной масс-спектрометрии». Природные методы . 2 (8): 591–8. дои : 10.1038/nmeth776 . ПМИД 16094384 . S2CID 20475874 .
- Геварт К., Стас А., Ван Дамм Дж., Де Гроот С., Хьюгельер К., Демол Х. и др. (сентябрь 2005 г.). «Глобальный анализ фосфопротеома гепатоцитов человека HepG2 с использованием диагональной ЖХ с обращенной фазой» . Протеомика . 5 (14): 3589–99. дои : 10.1002/pmic.200401217 . ПМИД 16097034 . S2CID 895879 .
- Чанг ПК, Чи К.В., Чау Г.Ю., Ли Ф.Ю., Цай Ю.Х., Ву Дж.К. и др. (март 2006 г.). «DDX3, РНК-геликаза DEAD-бокса, дерегулируется при гепатоцеллюлярной карциноме, связанной с вирусом гепатита, и участвует в контроле роста клеток» . Онкоген . 25 (14): 1991–2003. дои : 10.1038/sj.onc.1209239 . ПМИД 16301996 .