Jump to content

DDX3X

DDX3X
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы DDX3X , DBX, DDX14, DDX3, HLP2, CAP-Rf, MRX102, геликаза 3 DEAD-бокса, Х-связанная, геликаза 3 DEAD-бокса, MRXSSB
Внешние идентификаторы Опустить : 300160 ; МГИ : 103064 ; Гомологен : 3425 ; Генные карты : DDX3X ; ОМА : DDX3X — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_001193416
НМ_001193417
НМ_001356
НМ_024005
НМ_001363819

НМ_010028
НМ_008015

RefSeq (белок)

НП_001180345
НП_001180346
НП_001347
НП_001350748

НП_034158

Местоположение (UCSC) Chr X: 41,33 – 41,36 Мб Chr X: 13,15 – 13,16 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX3X фермент , который у человека кодируется DDX3X геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

Белки DEAD-бокса , характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), представляют собой предполагаемые РНК- хеликазы . Они участвуют в ряде клеточных процессов, включающих изменение вторичной структуры РНК, таких как инициация трансляции , ядерный и митохондриальный сплайсинг , а также сборка рибосом и сплайсосом . Судя по характеру их распространения, считается, что некоторые члены этого семейства участвуют в эмбриогенезе, сперматогенезе, а также росте и делении клеток. Этот ген кодирует белок DEAD-бокса, который специфически взаимодействует с коровым белком вируса гепатита С, что приводит к изменению его внутриклеточного расположения. Этот ген имеет гомолог, расположенный в нерекомбинирующей области Y-хромосомы. Белковая последовательность этого гена и Y-связанного гомолога идентична на 91%. [ 7 ]

Субклеточный трафик

[ редактировать ]

клетки DDX3X выполняет свои функции в ядре и цитоплазме , выходя из ядра по пути ядерного экспорта экспортина-1/CRM1 . Первоначально сообщалось, что для этого взаимодействия необходим хеликазный домен DDX3X, тогда как канонические особенности пути транспортировки, а именно наличие сигнала ядерного экспорта (NES) на DDX3X и Ran-GTP с экспортином-1, были необязательными. связывание [ 8 ] С тех пор было показано, что связывание DDX3X с экспортином-1 и его транспортировка не требуют геликазного домена DDX3X и явно зависят от NES- и Ran-GTP. [ 9 ]

Роль в раке

[ редактировать ]

DDX3X участвует во многих различных типах рака. Например, он аномально экспрессируется в клетках эпителиального рака молочной железы, в которых его экспрессия активируется с помощью HIF1A во время гипоксии . [ 10 ] Повышенная экспрессия DDX3X с помощью HIF1A при гипоксии инициируется прямым связыванием HIF1A с ответным элементом HIF1A . [ 10 ] что подтверждено иммунопреципитацией хроматина и репортерным анализом люциферазы . Поскольку на экспрессию DDX3X влияет активность HIF1A, совместная локализация этих белков также была продемонстрирована в MDA-MB-231 образцах опухоли ксенотрансплантата . [ 10 ]

Сообщается, что в клетках HeLa DDX3X контролирует развитие клеточного цикла посредством циклина E1 . [ 11 ] Более конкретно, было показано, что DDX3X напрямую связывается с 5'-UTR циклина E1 и тем самым облегчает трансляцию белка. Было продемонстрировано, что повышенные уровни белка циклина E1 опосредуют переход входа в S-фазу . [ 11 ]

На выживаемость, миграцию и пролиферацию меланомы влияет активность DDX3X. [ 12 ] Клетки меланомы с низкой экспрессией DDX3X обладают высокой миграционной способностью, низкой скоростью пролиферации и сниженной к вемурафенибу чувствительностью . Хотя клетки с высоким уровнем экспрессии DDX3X чувствительны к лекарствам, они более пролиферативны и менее мигрируют. Эти фенотипы можно объяснить трансляционными эффектами на транскрипционный фактор меланомы MITF . [ 12 ] 5'-UTR мРНК MITF содержит сложный РНК-регулон ( IRES ), который связывается и активируется DDX3X. Активация IRES приводит к трансляции мРНК MITF. У мышей, которым инъецировали клетки меланомы с удаленным IRES, наблюдается более агрессивное прогрессирование опухоли, включая увеличение метастазирования в легкие . [ 12 ] Интересно, что вемурафениб влияет на DDX3X при меланоме по неоткрытому механизму . Неизвестно, каким образом DDX3X подавляется присутствием вемурафениба. Однако снижение уровня DDX3X во время лечения препаратом объясняет развитие резистентных к лекарству клеток, часто обнаруживаемых при низкой экспрессии MITF . [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ]

Клиническое значение

[ редактировать ]

Мутации гена DDX3X связаны с медуллобластомой . [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] При меланоме низкая экспрессия гена связана с плохой выживаемостью без отдаленных метастазов . [ 12 ] Кроме того, уровень мРНК DDX3X ниже в биоптатах пострецидивной меланомы у пациентов, получающих вемурафениб , и при прогрессирующих опухолях.

Мутации гена DDX3X также вызывают синдром DDX3X , который поражает преимущественно женщин и проявляется задержкой развития или инвалидностью, аутизмом , СДВГ и низким мышечным тонусом .

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000215301 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000787 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Лан Б.Т., Пейдж, округ Колумбия (октябрь 1997 г.). «Функциональная когерентность Y-хромосомы человека». Наука . 278 (5338): 675–80. Бибкод : 1997Sci...278..675L . дои : 10.1126/science.278.5338.675 . ПМИД   9381176 .
  6. ^ Пак С.Х., Ли С.Г., Ким Ю, Сон К. (октябрь 1998 г.). «Присвоение предполагаемого гена РНК-хеликазы человека, DDX3, полосам Х-хромосомы человека p11.3 → p11.23». Цитогенетика и клеточная генетика . 81 (3–4): 178–9. дои : 10.1159/000015022 . ПМИД   9730595 . S2CID   46774908 .
  7. ^ Jump up to: а б «Ген Энтреза: DDX3X DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) боксерский полипептид 3, Х-связанный» .
  8. ^ Йедавалли В.С., Новё С., Чи Ю.Х., Клейман Л., Жанг К.Т. (октябрь 2004 г.). «Требование РНК-хеликазы DDX3 DEAD box для функции экспорта ВИЧ-1 Rev-RRE» . Клетка . 119 (3): 381–92. дои : 10.1016/j.cell.2004.09.029 . ПМИД   15507209 .
  9. ^ Хитон С.М., Аткинсон С.С., Суини М.Н., Ян С.Н., Янс Д.А., Борг Н.А. (сентябрь 2019 г.). «Зависимый от экспортина-1 ядерный экспорт DEAD-бокс-хеликазы DDX3X играет центральную роль в ее роли в противовирусном иммунитете» . Клетки . 8 (10): 1181. doi : 10.3390/cells8101181 . ПМЦ   6848931 . ПМИД   31575075 .
  10. ^ Jump up to: а б с Ботлагунта М., Кришнамачари Б., Весуна Ф., Виннард П.Т., Бол Г.М., Патель А.Х. и др. (март 2011 г.). «Экспрессия DDX3 напрямую модулируется индуцируемым гипоксией фактором-1 альфа в эпителиальных клетках молочной железы» . ПЛОС ОДИН . 6 (3): e17563. Бибкод : 2011PLoSO...617563B . дои : 10.1371/journal.pone.0017563 . ПМК   3063174 . ПМИД   21448281 .
  11. ^ Jump up to: а б Лай MC, Чанг WC, Ши С.Ю., Тарн, Вайоминг (ноябрь 2010 г.). «DDX3 регулирует рост клеток посредством контроля трансляции циклина E1» . Молекулярная и клеточная биология . 30 (22): 5444–53. дои : 10.1128/MCB.00560-10 . ПМЦ   2976371 . ПМИД   20837705 .
  12. ^ Jump up to: а б с д и Фунг Б., Чесла М., Санна А., Гуцци Н., Беневенти Г., Као Тхи Нгок П. и др. (июнь 2019 г.). «Х-связанная РНК-геликаза DDX3X диктует перепрограммирование трансляции и метастазирование при меланоме» . Отчеты по ячейкам . 27 (12): 3573–3586.e7. дои : 10.1016/j.celrep.2019.05.069 . ПМИД   31216476 .
  13. ^ Мюллер Дж., Крийгсман О., Цой Дж., Роберт Л., Хьюго В., Сонг С. и др. (декабрь 2014 г.). «Низкое соотношение MITF/AXL предсказывает раннюю устойчивость меланомы к множественным таргетным препаратам» . Природные коммуникации . 5 (1): 5712. Бибкод : 2014NatCo...5.5712M . дои : 10.1038/ncomms6712 . ПМЦ   4428333 . ПМИД   25502142 .
  14. ^ Конечковски Д.Д., Йоханнессен К.М., Абудайе О., Ким Дж.В., Купер З.А., Пирис А. и др. (июль 2014 г.). «Различия в состоянии клеток меланомы влияют на чувствительность к ингибиторам пути MAPK» . Открытие рака . 4 (7): 816–27. дои : 10.1158/2159-8290.CD-13-0424 . ПМЦ   4154497 . ПМИД   24771846 .
  15. ^ Робинсон Г., Паркер М., Краненбург Т.А., Лу С., Чен Икс, Дин Л. и др. (август 2012 г.). «Новые мутации нацелены на отдельные подгруппы медуллобластомы» . Природа . 488 (7409): 43–8. Бибкод : 2012Natur.488...43R . дои : 10.1038/nature11213 . ПМК   3412905 . ПМИД   22722829 .
  16. ^ Джонс Д.Т., Ягер Н., Кул М., Зихнер Т., Хаттер Б., Султан М. и др. (август 2012 г.). «Анализ геномной сложности, лежащей в основе медуллобластомы» . Природа . 488 (7409): 100–5. Бибкод : 2012Natur.488..100J . дои : 10.1038/nature11284 . ПМК   3662966 . ПМИД   22832583 .
  17. ^ Пью Т.Дж., Вираратне С.Д., Арчер Т.К., Померанц Круммель Д.А., Оклер Д., Бокиккио Дж. и др. (август 2012 г.). «Секвенирование экзома медуллобластомы выявляет соматические мутации, специфичные для подтипа» . Природа . 488 (7409): 106–10. Бибкод : 2012Natur.488..106P . дои : 10.1038/nature11329 . ПМЦ   3413789 . ПМИД   22820256 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 1b86ed6d29d4aabd43f814ba3843fdf5__1713153300
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/1b/f5/1b86ed6d29d4aabd43f814ba3843fdf5.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
DDX3X - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)