БПИФБ2

БПИФБ2
Идентификаторы
Псевдонимы	BPIFB2 , BPIL1, C20orf184, LPLUNC2, RYSR, dJ726C3.2, складка BPI, содержащая члена семейства B 2
Внешние идентификаторы	Опустить : 614108 ; МГИ : 1913807 ; Гомологен : 11884 ; GeneCards : BPIFB2 ; OMA : BPIFB2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	33,023,703 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	153,737,190 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	trachea; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; minor salivary glands; ; mucosa of pharynx; ; urethra; ; oral cavity; ; tongue; ; parotid gland; ; superior surface of tongue; ; body of tongue;
	Top expressed in
	trachea; ; seminiferous tubule; ; spermatid; ; nucleus of brain; ; telencephalic nucleus; ; basal forebrain; ; cerebral hemisphere; ; septal nuclei; ; nucleus of stria terminalis;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	lipid binding;
Cellular component	extracellular exosome; extracellular region; extracellular space; endoplasmic reticulum lumen;
Biological process	antimicrobial humoral response; post-translational protein modification;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	80341
	66557
	ENSG00000078898
	ENSMUSG00000027481
	Q8N4F0
	Q8C1E1
	НМ_025227
	НМ_025631
	НП_079503
	НП_079907
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Семейство B, содержащее складку BPI, член 2 (BPIFB2), также известное как бактерицидный/повышающий проницаемость белок-подобный 1 (BPI-подобный 1), представляет собой белок , который у людей кодируется BPIFB2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Суперсемья

BPIFB2 является членом суперсемейства белков складки BPI , определяемого наличием складки белка, оказывающей бактерицидное действие/повышение проницаемости (складки BPI), которая образована двумя сходными доменами в форме «бумеранга». ^{[ 7 ]} Это суперсемейство также известно как семейство BPI/LBP/PLUNC или семейство BPI / LPB / CETP . ^{[ 8 ]} Складка BPI создает аполярные связывающие карманы, которые могут взаимодействовать с гидрофобными и амфипатическими молекулами, такими как ацильные углеродные цепи липополисахарида, обнаруженные на грамотрицательных бактериях , но члены этого семейства могут выполнять множество других функций.

BPIFB2 является членом семейства генов BPI-fold и суперсемейства белков BPI/LBP/PLUNC.

Гены суперсемейства BPI/LBP/PLUNC обнаружены у всех видов позвоночных, включая отдаленные гомологи у видов беспозвоночных, таких как насекомые, моллюски и круглые черви. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} В эту широкую группу входит семейство генов BPIF, члены которого кодируют структурный мотив складки BPI и обнаруживаются сгруппированными на одной хромосоме, например, хромосома 20 у человека, хромосома 2 у мыши, хромосома 3 у крысы, хромосома 17 у свиньи, хромосома 13. у коровы. Семейство генов BPIF разделено на две группы: BPIFA и BPIFB. У человека BIPFA состоит из 3 белков, кодирующих гены BPIFA1 , BPIFA2 , BPIFA3 , и 1 псевдогена BPIFA4P ; тогда как BPIFB состоит из 5 белков, кодирующих гены BPIFB1 , BPIFB2 , BPIFB3 , BPIFB4 , BPIFB6 и 2 псевдогенов BPIFB5P , BPIFB9P . То, что у людей выглядит как псевдогены, у других видов может выглядеть как полностью функциональные гены.

У человека ген BPIFB2 был впервые идентифицирован как BPIL3 . ген ^{[ 5 ]} кодируемый белок которого был назван LPLUNC2 (клон 2 эпителия легких и носа длинного неба), ^{[ 11 ]} но впоследствии белки PLUNC были классифицированы как подсемейство суперсемейства складок BPI. ^{[ 10 ]} У людей ген BPIFB2 обнаружен вместе с другими членами суперсемейства BPI/LBP/PLUNC в кластере на хромосоме 20.

Функция

Белок BPIFB2 участвует во врожденном иммунном ответе на бактериальное воздействие в слизистой оболочке рта, носовой полости и легких, как и другие близкородственные белки BPIFB. В частности, он высоко экспрессируется в нормальных слюнных железах и пищеводе, а также в гипертрофированных миндалинах человека. ^{[ 6 ]} При хроническом риносинусите уровни BPIFB2/LPLUNC2 резко снижаются, что интерпретируется как дефект высвобождения врожденных защитных молекул желез. ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000078898 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027481 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Мулеро Дж.Дж., Бойл Б.Дж., Брэдли С., Брайт Дж.М., Нелкен С.Т., Хо Т.Т. и др. (август 2002 г.). «Три новых человеческих члена семейства белков-переносчиков липидов/липополисахарид-связывающих белков (LT/LBP)». Иммуногенетика . 54 (5): 293–300. дои : 10.1007/s00251-002-0467-3 . ПМИД 12185532 . S2CID 11886572 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: бактерицидный/белок-подобный 1, повышающий проницаемость BPIL1» .
^ Бимер Л.Дж., Кэрролл С.Ф., Айзенберг Д. (апрель 1998 г.). «Семейство белков BPI/LBP: структурный анализ консервативных областей» . Белковая наука . 7 (4): 906–914. дои : 10.1002/pro.5560070408 . ПМК 2143972 . ПМИД 9568897 .
^ «Семейство консервативных белковых доменов CDD: BPI» . www.ncbi.nlm.nih.gov .
^ Бимер Л.Дж., Фишер Д., Айзенберг Д. (июль 1998 г.). «Обнаружение дальних родственников ЛПС-связывающих и липидтранспортных белков млекопитающих» . Белковая наука . 7 (7): 1643–1646. дои : 10.1002/pro.5560070721 . ПМК 2144061 . ПМИД 9684900 .
^ Jump up to: ^а ^б Компакт-диск Bingle, Сил Р.Л., Крэйвен СиДжей (август 2011 г.). «Систематическая номенклатура белков PLUNC/PSP/BSP30/SMGB как подсемейства суперсемейства, содержащего складки BPI» . Труды Биохимического общества . 39 (4): 977–983. дои : 10.1042/BST0390977 . ПМК 3196848 . ПМИД 21787333 .
^ Касадо Б., Паннелл Л.К., Ядарола П., Баранюк Дж.Н. (июль 2005 г.). «Идентификация белков слизистой оболочки носа человека с использованием протеомики». Протеомика . 5 (11): 2949–2959. дои : 10.1002/pmic.200401172 . ПМИД 15996010 . S2CID 22281622 .
^ Сешадри С., Лин Д.К., Розати М., Картер Р.Г., Нортон Дж.Э., Су Л. и др. (июль 2012 г.). «Снижение экспрессии антимикробных белков PLUNC в тканях носовых полипов пациентов с хроническим риносинуситом» . Аллергия . 67 (7): 920–928. дои : 10.1111/j.1398-9995.2012.02848.x . ПМЦ 3375597 . ПМИД 22676062 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома BPIFB2 и BPIFB2 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Компакт-диск Bingle, Bingle L (октябрь 2000 г.). «Характеристика гена pplnc человека, генного продукта с ограниченным паттерном экспрессии в верхних дыхательных путях и носоглотке». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1493 (3): 363–367. дои : 10.1016/S0167-4781(00)00196-2 . ПМИД 11018263 .
Компакт-диск Bingle, Craven CJ (апрель 2002 г.). «PLUNC: новое семейство защитных белков-кандидатов-хозяев, экспрессируемых в верхних дыхательных путях и носоглотке» . Молекулярная генетика человека . 11 (8): 937–943. дои : 10.1093/hmg/11.8.937 . ПМИД 11971875 .
Чжан Z, Henzel WJ (октябрь 2004 г.). «Прогнозирование сигнальных пептидов на основе анализа экспериментально подтвержденных сайтов расщепления» . Белковая наука . 13 (10): 2819–2824. дои : 10.1110/ps.04682504 . ПМК 2286551 . ПМИД 15340161 .
Рамачандран П., Бунтеунг П., Се Ю, Сондей М., Вонг Д.Т., Лу Дж.А. (июнь 2006 г.). «Идентификация N-связанных гликопротеинов в слюне человека методом захвата гликопротеинов и масс-спектрометрии». Журнал исследований протеома . 5 (6): 1493–1503. дои : 10.1021/pr050492k . ПМИД 16740002 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000078898 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027481 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid12185532-5] Jump up to: ^а ^б Мулеро Дж.Дж., Бойл Б.Дж., Брэдли С., Брайт Дж.М., Нелкен С.Т., Хо Т.Т. и др. (август 2002 г.). «Три новых человеческих члена семейства белков-переносчиков липидов/липополисахарид-связывающих белков (LT/LBP)». Иммуногенетика . 54 (5): 293–300. дои : 10.1007/s00251-002-0467-3 . ПМИД 12185532 . S2CID 11886572 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: бактерицидный/белок-подобный 1, повышающий проницаемость BPIL1» .

[Beamer-1998-A-7] Бимер Л.Дж., Кэрролл С.Ф., Айзенберг Д. (апрель 1998 г.). «Семейство белков BPI/LBP: структурный анализ консервативных областей» . Белковая наука . 7 (4): 906–914. дои : 10.1002/pro.5560070408 . ПМК 2143972 . ПМИД 9568897 .

[8] «Семейство консервативных белковых доменов CDD: BPI» . www.ncbi.nlm.nih.gov .

[Beamer-1998-B-9] Бимер Л.Дж., Фишер Д., Айзенберг Д. (июль 1998 г.). «Обнаружение дальних родственников ЛПС-связывающих и липидтранспортных белков млекопитающих» . Белковая наука . 7 (7): 1643–1646. дои : 10.1002/pro.5560070721 . ПМК 2144061 . ПМИД 9684900 .

[Bingle-2011-10] Jump up to: ^а ^б Компакт-диск Bingle, Сил Р.Л., Крэйвен СиДжей (август 2011 г.). «Систематическая номенклатура белков PLUNC/PSP/BSP30/SMGB как подсемейства суперсемейства, содержащего складки BPI» . Труды Биохимического общества . 39 (4): 977–983. дои : 10.1042/BST0390977 . ПМК 3196848 . ПМИД 21787333 .

[Casado-2005-11] Касадо Б., Паннелл Л.К., Ядарола П., Баранюк Дж.Н. (июль 2005 г.). «Идентификация белков слизистой оболочки носа человека с использованием протеомики». Протеомика . 5 (11): 2949–2959. дои : 10.1002/pmic.200401172 . ПМИД 15996010 . S2CID 22281622 .

[12] Сешадри С., Лин Д.К., Розати М., Картер Р.Г., Нортон Дж.Э., Су Л. и др. (июль 2012 г.). «Снижение экспрессии антимикробных белков PLUNC в тканях носовых полипов пациентов с хроническим риносинуситом» . Аллергия . 67 (7): 920–928. дои : 10.1111/j.1398-9995.2012.02848.x . ПМЦ 3375597 . ПМИД 22676062 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]