SSX4 (ген)

ССХ4
Идентификаторы
Псевдонимы	SSX4 , CT5.4, синовиальная саркома, точка разрыва X 4, член семейства SSX 4
Внешние идентификаторы	Опустить : 300326 ; МГИ : 2446771 ; Гомологен : 133052 ; Генные карты : SSX4 ; OMA : SSX4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. X chromosome (human) Band Xp11.23 Start 48,383,516 bp End 48,393,347 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. X chromosome (mouse) Band X A1.1|X Start 8,320,584 bp End 8,327,965 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in testicle gonad right testis left testis olfactory zone of nasal mucosa thoracic aorta ascending aorta tibial arteries spleen uterine tube Top expressed in spermatid testicle embryo spermatocyte superior frontal gyrus ovary cerebellar cortex primary visual cortex lens More reference expression data BioGPS n/a
showГенная онтология Molecular function transcription corepressor activity nucleic acid binding Cellular component intracellular anatomical structure nucleus Biological process negative regulation of nucleic acid-templated transcription regulation of transcription, DNA-templated transcription, DNA-templated Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 6759 387132 Вместе ENSG00000268009 ENSMUSG00000023165 ЮниПрот О60224 н/д RefSeq (мРНК) НМ_175729 НМ_005636 НМ_001001450 НМ_001134226 RefSeq (белок) НП_005627 НП_783856 н/д Местоположение (UCSC) Chr X: 48,38 – 48,39 Мб Chr X: 8,32 – 8,33 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Белок SSX4 — это белок , который у человека кодируется SSX4 геном .

Продукт этого гена принадлежит к семейству высоко гомологичных белков синовиальной саркомы X (SSX) . Эти белки могут действовать как репрессоры транскрипции . Они также способны вызывать спонтанные гуморальные и клеточные иммунные реакции у больных раком и являются потенциально полезными мишенями в иммунотерапии на основе противораковых вакцин . Гены SSX1 , SSX2 и SSX4 участвуют в хромосомной транслокации t(X;18), характерной для всех синовиальных сарком . Эта транслокация приводит к слиянию гена транслокации синовиальной саркомы на хромосоме 18 с одним из генов SSX на хромосоме X. Хромосома Xp11 содержит сегментную дупликацию, приводящую к образованию двух идентичных копий синовиальной саркомы, точка разрыва X 4, SSX4 и SSX4B, в ориентации хвост к хвосту. Этот ген, SSX4, представляет собой более теломерную копию. два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы . Для этого гена были идентифицированы

Дальнейшее чтение

• дос Сантос Н.Р., де Брёйн Д.Р., ван Кессель АГ (2001). «Молекулярные механизмы, лежащие в основе развития синовиальной саркомы человека». Гены Хромосомы Рак . 30 (1): 1–14. doi : 10.1002/1098-2264(2000)9999:9999<::AID-GCC1056>3.0.CO;2-G . ПМИД   11107170 . S2CID   24403558 .
• Гуре А.О., Туречи О., Шахин У. и др. (1997). «SSX: мультигенное семейство, несколько членов которого транскрибируются при нормальном яичке и раке человека». Межд. Дж. Рак . 72 (6): 965–71. doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(19970917)72:6<965::AID-IJC8>3.0.CO;2-N . ПМИД   9378559 . S2CID   21203036 .
• Скайттинг Б., Нильссон Г., Бродин Б. и др. (1999). «Новый слитый ген SYT-SSX4 при синовиальной саркоме» . Дж. Натл. Онкологический институт . 91 (11): 974–5. дои : 10.1093/jnci/91.11.974 . ПМИД   10359553 .
• Чен Ч., Чен Г.Дж., Ли Х.С. и др. (2001). «Экспрессия антигенов рака яичка при гепатоцеллюлярной карциноме человека». Рак Летт . 164 (2): 189–95. дои : 10.1016/S0304-3835(01)00379-2 . ПМИД   11179834 .
• Бродин Б., Хаслам К., Ян К. и др. (2001). «Клонирование и характеристика сплайсированных вариантов слитых транскриптов синовиальной саркомы: SYT/SSX4, SYT/SSX4v и SYT/SSX2v. Возможная регуляторная роль продукта слитого гена в экспрессии SYT дикого типа». Джин . 268 (1–2): 173–82. дои : 10.1016/S0378-1119(01)00412-7 . ПМИД   11368913 .
• Панагопулос И., Мертенс Ф., Исакссон М. и др. (2001). «Клиническое влияние молекулярных и цитогенетических данных на синовиальную саркому». Гены Хромосомы Рак . 31 (4): 362–72. дои : 10.1002/gcc.1155 . ПМИД   11433527 . S2CID   41111894 .
• де Брёйн Д.Р., Дос Сантос Н.Р., Катер-Баатс Э. и др. (2002). «Связанный с раком белок SSX2 взаимодействует с человеческим гомологом Ras-подобного взаимодействия GTPase, RAB3IP, и новым ядерным белком, SSX2IP». Гены Хромосомы Рак . 34 (3): 285–98. дои : 10.1002/gcc.10073 . ПМИД   12007189 . S2CID   11734893 .
• Ян К., Луи В.О., Се Ю. и др. (2002). «Сосуществование слияний SYT-SSX1 и SYT-SSX2 при синовиальных саркомах» . Онкоген . 21 (26): 4181–90. дои : 10.1038/sj.onc.1205569 . ПМИД   12037676 .
• Гюре А.О., Вэй И.Дж., Олд Л.Дж., Чен Ю.Т. (2002). «Семейство генов SSX: характеристика 9 полных генов» . Межд. Дж. Рак . 101 (5): 448–53. дои : 10.1002/ijc.10634 . ПМИД   12216073 . S2CID   21174312 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Росс М.Т., Графэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека» . Природа . 434 (7031): 325–37. Бибкод : 2005Natur.434..325R . дои : 10.1038/nature03440 . ПМЦ   2665286 . ПМИД   15772651 .
• Айюб М., Мерло А., Хесдорфер К.С. и др. (2005). «Ответы CD4+ Т-клеток на SSX-4 у пациентов с меланомой» . Дж. Иммунол . 174 (8): 5092–9. дои : 10.4049/jimmunol.174.8.5092 . ПМИД   15814740 .
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД   16189514 . S2CID   4427026 .