Атаксин-2
| АТХН2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | ATXN2 , ASL13, ATX2, SCA2, TNRC13, атаксин 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 601517 ; МГИ : 1277223 ; Гомологен : 2234 ; Генные карты : ATXN2 ; OMA : ATXN2 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Атаксин-2 — это белок , который у человека кодируется ATXN2 геном . [ 5 ] [ 6 ] Мутации в ATXN2 вызывают спиноцеребеллярную атаксию 2 типа (SCA2).
Структура белка
[ редактировать ]Атаксин-2 содержит следующие белковые домены: [ 7 ]
- Два домена LSm , которые, вероятно, позволяют ему связывать РНК.
- Мотив PAM2, который, по прогнозам, будет ассоциироваться с поли(А)-связывающим белком.
- Полиглутаминовый тракт у некоторых видов (расположен вблизи аминоконца у приматов и между доменами LSm у насекомых) [ 8 ]
Был описан потенциальный вариант транскрипта, в котором отсутствует внутренний кодирующий экзон; однако его полноформатный характер не определен. [ 9 ]
Виды, ткани и субклеточное распределение
[ редактировать ]ATXN2 консервативен у эукариот . У большинства позвоночных есть два ортолога гена (у человека называемые ATXN2 и ATXN2L ), за исключением птиц, у которых есть только один. Виды растений имеют от двух до шести ATXN2 . ортологов [ 8 ]
ATXN2 повсеместно экспрессируется в различных тканях. Внутри отдельных клеток он локализуется в аппарате Гольджи и стрессовых гранулах . [ 10 ]
Функция
[ редактировать ]Атаксин-2 участвует в регуляции трансляции мРНК посредством взаимодействия с поли(А)-связывающим белком. Он также участвует в формировании стрессовых гранул и Р-тельц , которые также играют роль в регуляции РНК. [ 10 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Спиноцеребеллярная атаксия 2 типа (SCA2)
[ редактировать ]Полиглутаминовый тракт человеческого атаксина-2 нестабильен и может расширяться по мере передачи из поколения в поколение. Нормальные аллели обычно имеют 22 или 23 повтора, но могут содержать до 31 повтора. Более длинные расширения могут вызвать спиноцеребеллярную атаксию 2 типа (SCA2), фатальное прогрессирующее генетическое заболевание, при котором происходит дегенерация нейронов в мозжечке , нижней оливе , мосте и других областях. Симптомы SCA2 включают атаксию (потерю координации движений), паркинсонизм и в некоторых случаях деменцию. [ 11 ] Аллель заболевания обычно содержит 34–52 повтора CAG, но может содержать от 32 до более 100 и может увеличиваться в размерах при передаче последующим поколениям. Каким образом увеличение полиглутамина в атаксине-2 приводит к этим симптомам, неизвестно.
Боковой амиотрофический склероз (АЛС)
[ редактировать ]В 2010 году работа Аарона Гитлера и Нэнси Бонини из Пенсильванского университета обнаружила, что увеличение повторов CAG среднего размера в значительной степени связано с риском развития бокового амиотрофического склероза (болезни Лу Герига). [ 12 ]
Первичная открытоугольная глаукома (ПОУГ) и внутриглазное давление (ВГД)
[ редактировать ]Полногеномные исследования ассоциации выявили значительную связь вариантов ATXN2 с ПОУГ и ВГД. Дальнейшее исследование генетических и биологических механизмов, лежащих в основе связи между ATXN2 и ПОУГ, может дать ценную информацию о патогенезе и потенциальных терапевтических мишенях глаукомы. [ 13 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000204842 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042605 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Гисперт С., Твеллс Р., Ороско Г., Брайс А., Вебер Дж., Хередеро Л., Шойфлер К., Райли Б., Аллоти Р., Нозерс К. (июль 1993 г.). «Хромосомное присвоение второго локуса аутосомно-доминантной мозжечковой атаксии (SCA2) хромосоме 12q23-24.1». Природная генетика . 4 (3): 295–9. дои : 10.1038/ng0793-295 . ПМИД 8358438 . S2CID 7387082 .
- ^ Марголис Р.Л., Абрахам М.Р., Гатчелл С.Б., Ли Ш., Кидвай А.С., Брешель Т.С., Стайн О.К., Каллахан С., Макиннис М.Г., Росс К.А. (июль 1997 г.). «кДНК с длинными тринуклеотидными повторами CAG из мозга человека». Генетика человека . 100 (1): 114–22. дои : 10.1007/s004390050476 . ПМИД 9225980 . S2CID 25999127 .
- ^ Альбрехт М., Голатта М., Вюлльнер У., Ленгауэр Т. (август 2004 г.). «Структурный и функциональный анализ атаксина-2 и атаксина-3» . Европейский журнал биохимии . 271 (15): 3155–70. дои : 10.1111/j.1432-1033.2004.04245.x . ПМИД 15265035 .
- ^ Jump up to: а б Хименес-Лопес Д., Гусман П. (июль 2014 г.). «Понимание эволюции и доменной структуры белков атаксина-2 у эукариот» . Исследовательские заметки BMC . 7 : 453. doi : 10.1186/1756-0500-7-453 . ПМК 4105795 . ПМИД 25027299 .
- ^ «Ген Энтреза: атаксин 2 ATXN2» .
- ^ Jump up to: а б Орр HT (апрель 2012 г.). «Клеточная биология спиноцеребеллярной атаксии» . Журнал клеточной биологии . 197 (2): 167–77. дои : 10.1083/jcb.201105092 . ПМЦ 3328388 . ПМИД 22508507 .
- ^ Справочник, Дом генетики. «СКА2» . Домашний справочник по генетике . Проверено 11 января 2018 г.
- ^ Элден А.С., Ким Х.Дж., Харт М.П., Чен-Плоткин А.С., Джонсон Б.С., Фанг Х, Армакола М., Гесер Ф, Грин Р., Лу М.М., Падманабхан А., Клэй-Фальконе Д., МакКласки Л., Элман Л., Джур Д., Грубер П.Дж., Руб У., Аубургер Дж., Трояновски Дж.К., Ли В.М., Ван Дирлин В.М., Бонини Н.М., Гитлер А.Д. (август 2010 г.). «Увеличение полиглутамина средней длины атаксина-2 связано с повышенным риском развития БАС» . Природа . 466 (7310): 1069–75. Бибкод : 2010Natur.466.1069E . дои : 10.1038/nature09320 . ПМЦ 2965417 . ПМИД 20740007 .
- ^ Цукерман Р., Харрис А., Верселлин А.В., Сиски Б., Паскуале Л.Р., Чулла Т.А. (декабрь 2020 г.). «Молекулярная генетика глаукомы: соображения подтипа и этнической принадлежности» . Гены . 12 (1): 55. doi : 10.3390/genes12010055 . ПМЦ 7823611 . ПМИД 33396423 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Стеванин Г., Дюрр А., Брайс А. (январь 2000 г.). «Клинические и молекулярные достижения в области аутосомно-доминантных мозжечковых атаксий: от генотипа к фенотипу и физиопатологии» . Европейский журнал генетики человека . 8 (1): 4–18. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200403 . ПМИД 10713882 .
- Пульст С.М., Нечипорук А., Нечипорук Т., Гисперт С., Чен Х.Н., Лопес-Сендес И., Перлман С., Старкман С., Ороско-Диас Г., Лункес А., ДеДжонг П., Руло Г.А., Обургер Дж., Коренберг Дж.Р., Фигероа К., Сахба. С (ноябрь 1996 г.). «Умеренное расширение обычно двуаллельного тринуклеотидного повтора при спиноцеребеллярной атаксии 2 типа». Природная генетика . 14 (3): 269–76. дои : 10.1038/ng1196-269 . ПМИД 8896555 . S2CID 12365475 .
- Санпей К, Такано Х, Игараси С, Сато Т, Ояке М, Сасаки Х, Вакисака А, Таширо К, Исида Ю, Икеучи Т, Койде Р, Сайто М, Сато А, Танака Т, Ханю С, Такаяма Ю, Нисидзава М , Симидзу Н., Номура Ю., Сегава М., Ивабути К., Эгучи И., Танака Х., Такахаси Х., Цудзи С. (ноябрь 1996 г.). «Идентификация гена спиноцеребеллярной атаксии типа 2 с использованием метода прямой идентификации, расширения повторов и клонирования, DIRECT». Природная генетика . 14 (3): 277–84. дои : 10.1038/ng1196-277 . ПМИД 8896556 . S2CID 24971010 .
- Имберт Дж., Сауду Ф., Ивер Г., Девис Д., Тротье Ю., Гарнье Ж.М., Вебер С., Мандель Дж.Л., Кансел Г., Аббас Н., Дюрр А., Дидьежан О., Стеванин Г., Агид Ю., Брайс А. (ноябрь 1996 г.). «Клонирование гена спиноцеребеллярной атаксии 2 обнаруживает локус с высокой чувствительностью к расширенным повторам CAG/глутамина». Природная генетика . 14 (3): 285–91. дои : 10.1038/ng1196-285 . ПМИД 8896557 . S2CID 9304975 .
- Сахба С., Нечипорук А., Фигероа К.П., Нечипорук Т., Пульст С.М. (февраль 1998 г.). «Геномная структура человеческого гена спиноцеребеллярной атаксии типа 2 (SCA2) на хромосоме 12q24.1». Геномика . 47 (3): 359–64. дои : 10.1006/geno.1997.5131 . ПМИД 9480749 .
- Хюинь Д.П., Дель Биджио М.Р., Хо Д.Х., Пульст С.М. (февраль 1999 г.). «Экспрессия атаксина-2 в мозге нормальных людей и пациентов с болезнью Альцгеймера и спиноцеребеллярной атаксией 2». Анналы неврологии . 45 (2): 232–41. doi : 10.1002/1531-8249(199902)45:2<232::AID-ANA14>3.0.CO;2-7 . ПМИД 9989626 . S2CID 18022785 .
- Хюинь Д.П., Фигероа К., Хоанг Н., Пульст С.М. (сентябрь 2000 г.). «Ядерная локализация или образование телец включения атаксина-2 не являются необходимыми для патогенеза SCA2 у мышей или человека». Природная генетика . 26 (1): 44–50. дои : 10.1038/79162 . ПМИД 10973246 . S2CID 14489237 .
- Аффаитати А, де Кристофаро Т, Феличелло А, Варроне С (апрель 2001 г.). «Идентификация альтернативного сплайсинга гена спиноцеребеллярной атаксии 2 типа». Джин . 267 (1): 89–93. дои : 10.1016/S0378-1119(01)00402-4 . ПМИД 11311558 .
- Киль Т.Р., Шибата Х., Во Т., Хюнь Д.П., Пульст С.М. (август 2001 г.). «Идентификация и экспрессия мышиного ортолога A2BP1». Геном млекопитающих . 12 (8): 595–601. дои : 10.1007/s00335-001-2056-4 . ПМИД 11471052 . S2CID 7340712 .
- Чоудри С., Мукерджи М., Шривастава А.К., Джайн С., Брахмачари С.К. (октябрь 2001 г.). «Нестабильность повтора CAG в локусе SCA2: закрепление прерываний CAA и связанных однонуклеотидных полиморфизмов» . Молекулярная генетика человека . 10 (21): 2437–46. дои : 10.1093/hmg/10.21.2437 . ПМИД 11689490 .
- Панг Дж.Т., Джунти П., Чемберлен С., Ан С.Ф., Виталиани Р., Скаравилли Т., Мартиниан Л., Вуд Н.В., Скаравилли Ф., Ансорж О (март 2002 г.). «Нейрональные внутриядерные включения при SCA2: генетическое, морфологическое и иммуногистохимическое исследование двух случаев» . Мозг . 125 (Часть 3): 656–63. дои : 10.1093/brain/awf060 . ПМИД 11872620 .
- Саттерфилд Т.Ф., Джексон С.М., Палланк Л.Дж. (декабрь 2002 г.). «Гомолог гена полиглутаминовой болезни SCA2 у дрозофилы является дозозависимым регулятором образования актиновых нитей» . Генетика . 162 (4): 1687–702. дои : 10.1093/генетика/162.4.1687 . ПМЦ 1462369 . ПМИД 12524342 .
- Видемайер Р., Вестерманн Ф., Виттке И., Новок Дж., Шваб М. (январь 2003 г.). «Атаксин-2 способствует апоптозу клеток нейробластомы человека» . Онкоген . 22 (3): 401–11. дои : 10.1038/sj.onc.1206150 . ПМИД 12545161 .
- Пайами Х., Натт Дж., Ганчер С., Берд Т., МакНил М.Г., Зельцер В.К., Хасси Дж., Локхарт П., Гвинн-Харди К., Синглтон А.А., Синглтон А.Б., Харди Дж., Фаррер М. (апрель 2003 г.). «SCA2 может проявляться как паркинсонизм, чувствительный к леводопе». Двигательные расстройства . 18 (4): 425–9. дои : 10.1002/mds.10375 . ПМИД 12671950 . S2CID 35401117 .
- Светел М, Джармати А, Драгасевич Н, Савич Д, Цулкович Б, Ромак С, Костич ВС (сентябрь 2003 г.). «Мутации SCA2 и SCA3 при молодом паркинсонизме, реагирующем на дофа» . Европейский журнал неврологии . 10 (5): 597. doi : 10.1046/j.1468-1331.2003.00671.x . ПМИД 12940846 . S2CID 30076827 .
- Бреннейс С., Бёш С.М., Шокке М., Веннинг Г.К., Пове В. (октябрь 2003 г.). «Характер атрофии в SCA2, определенный с помощью воксельной морфометрии». НейроОтчёт . 14 (14): 1799–802. дои : 10.1097/00001756-200310060-00008 . ПМИД 14534423 . S2CID 26149005 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Запись GeneReviews/NIH/NCBI/UW о спиноцеребеллярной атаксии типа 2
- Расположение генома человека ATXN2 и страница сведений о гене ATXN2 в браузере генома UCSC .