Jump to content

HLA-A68

HLA-A68
( MHC класса I , антиген клеточной поверхности)
Рендеринг или 2hla , показывающий A*6801 (голубой) и микроглобулин бета-2 (розовый). На этом изображении нет связанного пептида.
О
Белок трансмембранный рецептор / лиганд
Структура αβ гетеродимер
Субъединицы HLA-A *68--, β 2 -микроглобулин
Старые имена А28
Подтипы
Подтип
аллель
Доступные структуры
Оу68.1 *6801 2 хла , 1 тмк , 1 хсб
Оу68.2 *6802
- *6803
{{{cNick4}}} *68{{{cAllele4}}}
Редкие аллели
Подтип
аллель
Доступные структуры
- *6805
{{{rnick2}}} *68{{{раллеле2}}}
{{{rnick3}}} *68{{{rallele3}}}
Связь аллелей с базой данных IMGT/HLA в EBI

HLA-A68 (A68) представляет собой человеческого лейкоцитарного антигена серотип в группе серотипов HLA-A . Серотип определяется антителом, распознающим α 68 подмножество α-цепей HLA-A. Для A68 альфа-цепь «A» кодируется HLA-A. *68 аллельная группа и β-цепь кодируются B2M локусом . [ 1 ] А68 и А *68 почти синонимы по смыслу. А68 представляет собой расщепленный антиген широкого антигена серотипа А28 . А68 является сестринским серотипом А69 .

A68 чаще встречается в Северной Америке.

Распознавание A68 некоторых продуктов гена HLA A*68 [ 2 ]
А*68 А68 А 28 А 69 Образец
аллель % % % размер (Н)
*6801 27 63 0 2736

А68 плохой, с низкой специфичностью обнаружения и высокой неспецифической идентификацией по А28.

Ассоциации заболеваний

[ редактировать ]

По аллелю

[ редактировать ]

А*68 связан с более высокой вирусной нагрузкой при ВИЧ . [ 3 ] [ 4 ] А68 может быть защитным против симптоматических заболеваний сердца при кардиомиопатии Чаги. [ 5 ]

Частоты аллелей

[ редактировать ]
Частоты HLA A*6801
Исследуемая популяция Частота.
 (в %) [ 6 ]
Бразилия Рельеф 25.0
Мексика Сонора Серия 19.7
США, коренные жители Аляски юпики 15.5
Мексика Микстек Оахака 13.7
Индия Хандеш Павра 12.0
Мексика Сапотек Оахака 11.2
Буркина-Фасо Мосси 9.4
Мексика Штат Чиуауа Та… 9.1
Эквадор Каяпа 9.0
Южная Африка Натал Тамильский 8.0
Пакистан Синдхи 7.7
Индия Мумбаи Маратхи 7.5
Пакистан Калаш 7.5
Индия Тамилнад Надар 7.4
Сенегал Ниоко Манденка 7.0
Грузия Тбилисские курды 6.7
Грузия Сванетия Сваны 6.3
Мексика Метисы 6.1
Индия Вест Бхилс 6.0
Португальский центр 6.0
Бельгия 5.7
Мексика Миксе Оахака 5.6
Саудовская Аравия Гураят и… 5.6
США, коренные жители Северной Америки… 5.6
Выходцы из Латинской Америки Южного Техаса США 5.2
Камерунский карликовый скот 5.0
Северо-Западный Кабо-Верде I… 4.8
Грузия Тбилиси Грузия… 4.8
Хорватия 4.7
Финляндия 4.5
Шотландия Оркнейские острова 4.4
Мой собственный 4.3
Марокко «бербер» Надор Ме… 4.2
Австралия Новый Южный Уэльс 4.1
США Африканская Америка 4.0
Китай Внутренняя Монголия 3.9
Гвадалахара-метисы (2) 3.9
Камерун Сава 3.8
Мали Бандиагара 3.6
Тунис 3.5
Индия Андхра-Прадеш Гол… 3.4
Ирландия Южная 3.4
Камерун Бети 3.2
Пакистанский белудж 3.2
Буркина-Фасо Фулани 3.1
Парсы западного побережья Индии 3.0
Израильские арабские друзы 3.0
Япония Айны Хоккайдо 3.0
Южноафриканский Натал Зулу 3.0
Суданский 3.0
США Кавказский 3.0
Индия Северные индусы 2.9
Пакистан Брахуи 2.9
Уганда Кампала 2.8
Иран Белудж 2.7
Ирландия Северная 2.7
румынский 2.6
США латиноамериканцы 2.6
Бразилия 2.5
Юго-Восток Франции 2.4
Гвинея-Бисау 2.3
Испания Каталония Жирона 2.3
Китай Пекин 2.2
Франция Корсика 2.0
Сингапур Яванский Индонезия 2.0
США Южная Дакота Лакота Сиу 2.0
Болгария 1.8
Mongolia Buryat 1.7
США Аризона Пима 1.7
Испания Восточная Андалусия 1.5
Кения 1.4
Камерун Бамилеке 1.3
Зимбабве Хараре Шона 1.3
Россия Тува (2) 1.1
частоты аллелей Представлены только

А68 можно разделить на 3 аллеля: *6801, *6802, *6803. *6801 также можно разделить на *680101 и *680102 (ранее называвшиеся *68011 и *68012).

Уровень A*6801 выше у некоторых групп коренных американцев , народов Южной Азии и Африки, однако уровень *6801 находится на низком уровне в большинстве стран Юго-Восточной Азии, особенно у коренного населения. Об этом также свидетельствуют низкие уровни в западной части Тихоокеанского региона, включая Японию. Перерыв *6801 прерывается в Северной Японии с 3%-ной частотой, обнаруженной у айнов , которая продолжает увеличиваться у арктических народов и снижается у коренных американцев. Тогда как в северных регионах Западной Евразии А*6801 падает. И в Африке, и в Новом Свете можно найти как A*680101, так и A*680102. [ 7 ] Хотя в Новом Свете более распространен А*680102.

Частоты HLA A*6802
частота
исх. Население (%)
[ 8 ] Юкпа (Венесуэла) 37.2
[ 9 ] Нанди (Кения) 11.6
[ 10 ] Кения 10.5
[ 11 ] Хараре Шона (Зимбабве) 9.8
[ 12 ] Натал Зулу (Южная Африка) 9.5
[ 9 ] Луо (Кения) 7.6
[ 9 ] Мали Бандиагара 6.2
[ 7 ] Суданский 5.5
[ 9 ] Уганда 5.2
[ 13 ] Карликовый скот (Камерун) 5.0
[ 14 ] Метисы (Гвадалахара, Мексика) 4.9
[ 15 ] Северо-восточный остров (Кабо-Верде) 4.8
[ 16 ] Надор Металса (Марокко) 4.8
[ 7 ] Чиригуанос (Аргентина) 4.7
[ 17 ] Мосси (Буркина-Фасо) 4.7
[ 9 ] Лусака (Замбия) 4.7
[ 13 ] Бамилеке (Камерун) 4.5
[ 7 ] Сава (Камерун) 3.8
[ 7 ] Калаш (Пакистан) 3.3
[ 7 ] Бети (Камерун) 3.2
[ 7 ] Юго-Восточная Франция 3.1
[ 7 ] Сери (Сонора, Мексика) 3.0
[ 7 ] Яунде (Камерун) 2.8
[ 7 ] Тунис 2.5
[ 7 ] Гвинея-Бисау 2.3
[ 7 ] Фулани (Буркина-Фасо) 2.0
[ 7 ] Южная Португалия 2.0
[ 7 ] Оман (Восточная Аравия) 1.7
[ 7 ] Корсика (Франция) 1.6
[ 7 ] Белудж (Пакистан) 1.6
[ 7 ] Ниоколо Манденка (Сенегал) 1.6
[ 7 ] Восточная Андалусия (Испания) 1.5
[ 7 ] Оркнейские острова (Шотландия) 1.4
[ 7 ] Метисы (Мексика) 1.2
[ 7 ] Белудж (Иран) 1.1
[ 7 ] Бергамо (Италия) 1.1
[ 7 ] Северная Хань (Китай) 1.0
[ 7 ] Центральная Португалия 1.0
[ 7 ] Чешская Республика 0.9
[ 7 ] Северная Ирландия 0.9
[ 7 ] Евреи (Израиль) 0.9
[ 7 ] Миксе (Оахака, Мексика) 0.9
[ 7 ] Мадейра (Испания) 0.8
[ 7 ] Каяпа (Эквадор) 0.6
[ 7 ] Хвост (Грузия) 0.6
[ 7 ] Майорка/Менорка (Испания) 0.6
[ 7 ] Бельгия 0.5
[ 7 ] Лакота (Сиу) 0.5

A*6802 имеет глобальный узел у некоторых коренных народов Южной Америки (37%). Вторичный узел можно найти в Африке. Как и *6801, в коренном населении Юго-Восточной Азии имеется перерыв в *6802, что указывает на то, что эта популяция не является вероятным источником среди коренных народов Нового Света. Уровни, как правило, низкие (<1%) в Европе, за исключением побережья Средиземного моря. В Африке более высокие уровни можно обнаружить в Кении, Западной Африке и на островах Зеленого Мыса. [ 7 ] Примечание о чистоте: представление о том, что A*6802 имеет коренное индейское происхождение, может быть оспорено на основании возможности интрогрессии со стороны европейцев и африканцев. В случае с Юкпа это несостоятельно. У юкпа частота HLA-DQ8 составляет ~ 80%, это самая высокая частота аллеля DQ в мире. Это племя демонстрирует мало свидетельств европейской генетической интрогрессии, кроме того, самая близкая частота DQ8 с точки зрения Африки - изолированный !кунг из Намибии . Существует два возможных источника A*6802: напрямую из Африки и через Азию. Соответствующие аллели B (B*48, B*61) указывают на азиатское происхождение или на африканский источник очень древнего происхождения, поскольку для рекомбинации типичных азиатских аллелей B с A68 потребуется время. В испанском языке уровни A28 составляют 3,1% от этих ~0,5% — это A*6901, A*6802 — около 2,0%, что означает, что чистый уровень от A*6802 до A*6805 в испанском языке составляет ~0,5%. Из 11 опрошенных групп АН 9 имеют показатель выше и 2 — ниже 0,5%. Из двух испанских групп одна (Андалусия - 1,5%) находится выше, а другая (Каталония - 0,0%) ниже. В модели примеси испанская интрогрессия не объясняет A*6802 в Новом Свете. Азиатская модель миграции не показывает ни одного народа к северо-востоку от Пакистана, имеющего A*6802.

Частоты HLA A*6803
частота
исх. Население (%)
[ 18 ] Майя (Гватемала) 7.6
[ 19 ] Карликовая лошадь (Камерун) 6.0
[ 14 ] Метисы (Гвадалахара, Мексика) 3.9
[ 20 ] Метисы (Мексика) 3.7
[ 19 ] Мбензеле Пигмей (Центральноафриканский) 1.5
[ 21 ] Лакота (Сиу) 1.2
[ 22 ] Юпик (Эскимосско-Аляска) 1.0
[ 11 ] Бурят (Монголия) 0.4
[ 11 ] Северная Ирландия, Румыния, Чехия, 0.0

А*6803 можно встретить у коренных народов Нового Света и Центральной Азии, в Африке он, по-видимому, ограничен жителями Западной и Центральной Африки. Это распределение вместе с информацией о 6801 и 6802 предполагает вероятное перераспределение аллелей *68 из Африки после первоначальной миграции из Восточной Африки, колонизировавшей Юго-Восточную Азию. Он также обеспечивает поддержку двух волн миграции из Азии в Новый Свет или, как минимум, в неизвестную зону смешения гаплотипов Западно-Тихоокеанского региона и гаплотипов, происходящих из Западной Африки и Ближнего Востока, в Восточной Азии до первой миграции. В настоящее время вторжение народов Западной Евразии в Восточную Азию следует за свидетельствами повторного использования Забайкалья спустя 18 300 лет и коррелирует с зарождающимся периодом Дзёмон в Японии несколько тысяч лет спустя. Определенные аллели и гаплотипы HLA у жителей Южной Америки нацелены на предполагаемый состав Японии до Яёй, но другие народы, например, в западной Мексике, наиболее похожи на айнов и народы бассейна Амура.

A*6805 встречается в гватемальском и центральноафриканском мбензеле на низких уровнях.

Гаплотипы A68

[ редактировать ]

Генетическая дистанция между коренными американцами и евразийцами слишком велика для сохранения общих гаплотипов, особенно в свете более низких уровней на большей части Сибири. Связь гаплотипов с Западной Африкой может быть значительной и может указывать на быструю миграцию и смешение на восток в период позднего палеолита.

Гаплотипы коренных американцев

[ редактировать ]

Гаплотипы A*680102-B35

  • А*680102 Cw*0304 B*3506 (A68-Cw10-B35)
  • A68-Cw4-B35 (Терена, серия (Мексика))
    • A*680102 Cw*0401 B3521 (A68-Cw4-B35) (Терена)

А*6802-B35

  • A*6802-B3501 Гвадалахара
  • A*6802-B3502 Гвадалахара

A68-B35 Майя (A*6803).

Эти два гаплотипа соответствуют присутствию Cw4-B35 и A68 в Азии и на Ближнем Востоке, а A68-B35, возможно, является предковым гаплотипом A68. A28(A*6802)-B35 находится в Сенегале. [ 23 ]

A6801-B4002/4 - Терена, эскимосы, метисы, индейцы (Азия)

A*680102-B*520102 в популяции метисов Мексики. A28(A*6802)-B52 также встречается в Сенегале. [ 23 ]

Гаплотипы Старого Света A68

[ редактировать ]

A28(~A68)-B51 Армения, Сенегал, Эскимосский [ 23 ]
A28(~A68)-B70 Западная Африка, Заир, Зимбабве, Северная и Южная Африка (неевропейцы), Хой (готтентоты) [ 23 ]

  1. ^ Арсе-Гомес Б., Джонс Э.А., Барнстейбл С.Дж., Соломон Э., Бодмер В.Ф. (февраль 1978 г.). «Генетический контроль антигенов HLA-A и B в гибридах соматических клеток: потребность в бета2-микроглобулине». Тканевые антигены . 11 (2): 96–112. дои : 10.1111/j.1399-0039.1978.tb01233.x . ПМИД   77067 .
  2. ^ Форма запроса аллелей IMGT/HLA - Европейский институт биоинформатики
  3. ^ Тан Дж., Тан С., Лобашевский Э., Миракл А., Фидели У., Альдрованди Г., Аллен С., Мусонда Р., Каслоу Р. (2002). «Благоприятные и неблагоприятные аллели и гаплотипы HLA класса I у замбийцев, преимущественно инфицированных вирусом иммунодефицита человека типа 1 клады C» . Дж Вирол . 76 (16): 8276–84. doi : 10.1128/JVI.76.16.8276-8284.2002 . ПМК   155130 . ПМИД   12134033 .
  4. ^ Гостик Э., Коул Д.К., Хатчинсон С.Л. и др. (2007). «Функциональная и биофизическая характеристика HLA-A * 6801-рестриктированного ВИЧ-специфического Т-клеточного рецептора» . Евро. Дж. Иммунол . 37 (2): 479–86. дои : 10.1002/eji.200636243 . ПМК   2699040 . ПМИД   17273992 .
  5. ^ Крус-Роблес Д., Рейес П.А., Монтеон-Падилья В.М., Ортис-Муньис А.Р., Варгас-Аларкон Г. (2004). «Гены MHC класса I и II у мексиканских пациентов с болезнью Шагаса». Хм. Иммунол . 65 (1): 60–5. дои : 10.1016/j.humimm.2003.10.008 . ПМИД   14700597 .
  6. ^ Миддлтон, Д.; Менчака, Л.; Руд, Х.; Комерофски, Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allerefrequency.net». Тканевые антигены . 61 (5): 403–407. дои : 10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x . ПМИД   12753660 .
  7. ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р с т в v В х и С аа аб и объявление но из в ах есть Миддлтон Д., Менчака Л., Руд Х., Комерофски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей» . Тканевые антигены . 61 (5): 403–7. дои : 10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x . ПМИД   12753660 .
  8. ^ Лайрис З., Гедес И., Домингес Э. и др. (2001). «Расширенные гаплотипы HLA у индейцев Карибского бассейна: юкпа хребта Перия». Хм. Иммунол . 62 (9): 992–1000. дои : 10.1016/S0198-8859(01)00297-X . ПМИД   11543901 .
  9. ^ Перейти обратно: а б с д и Цао К., Мурманн А.М., Лайк К.Е. и др. (2004). «Дифференциация между африканскими популяциями подтверждается разнообразием аллелей и гаплотипов локусов HLA класса I». Тканевые антигены . 63 (4): 293–325. дои : 10.1111/j.0001-2815.2004.00192.x . ПМИД   15009803 .
  10. ^ Луо М., Эмбри Дж., Рамдахин С. и др. (2002). «HLA-A и HLA-B в Кении, Африка: частоты аллелей и идентификация HLA-B * 1567 и HLA-B * 4426». Тканевые антигены . 59 (5): 370–80. дои : 10.1034/j.1399-0039.2002.590503.x . ПМИД   12144620 .
  11. ^ Перейти обратно: а б с Материалы семинара IHW, Сиэтл, 2002 г., через http://www.allelefrequency.net через Миддлтон Д., Менчака Л., Руд Х., Комерофски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей» . Тканевые антигены . 61 (5): 403–7. дои : 10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x . ПМИД   12753660 .
  12. ^ Миддлтон Д., Уильямс Ф., Мина А. и др. (2000). «Анализ распределения аллелей HLA-A в популяциях пяти континентов». Хм. Иммунол . 61 (10): 1048–52. дои : 10.1016/S0198-8859(00)00178-6 . ПМИД   11082518 .
  13. ^ Перейти обратно: а б Торимиро Дж.Н., Карр Дж.К., Вулф Н.Д. и др. (2006). «Разнообразие HLA класса I среди жителей сельских тропических лесов Камеруна: идентификация гаплотипа A*2612-B*4407». Тканевые антигены . 67 (1): 30–7. дои : 10.1111/j.1399-0039.2005.00527.x . ПМИД   16451198 .
  14. ^ Перейти обратно: а б Леал К.А., Мендоса-Каррера Ф., Ривас Ф., Родригес-Рейносо С., Портилья-де Буэн Э. (2005). «Частоты аллелей HLA-A и HLA-B в популяции метисов из Гвадалахары, Мексика, определены методом типирования на основе последовательностей». Тканевые антигены . 66 (6): 666–73. дои : 10.1111/j.1399-0039.2005.00495.x . ПМИД   16305683 .
  15. ^ Спинола Х., Брюгге-Армас Дж., Миддлтон Д., Брем А. (2005). «Полиморфизмы HLA в Кабо-Верде и Гвине-Бисау, выявленные на основе типирования на основе последовательностей». Хм. Иммунол . 66 (10): 1082–92. дои : 10.1016/j.humimm.2005.09.001 . ПМИД   16386651 .
  16. ^ Умхани К., Каносси А., Пианкателли Д. и др. (2002). «Секвенционный анализ полиморфизма HLA-DRB1 в арабоязычных группах Metalsa Berber и Chaouya из Марокко». Хм. Иммунол . 63 (2): 129–38. дои : 10.1016/S0198-8859(01)00370-6 . ПМИД   11821160 .
  17. ^ Модиано Д., Луони Дж., Петрарка В. и др. (2001). «Класс I HLA в трех этнических группах Западной Африки: генетические дистанции от популяций к югу от Сахары и европеоидов». Тканевые антигены . 57 (2): 128–37. дои : 10.1034/j.1399-0039.2001.057002128.x . ПМИД   11260507 .
  18. ^ Гомес-Касадо Э., Мартинес-Ласо Дж., Москосо Дж. и др. (2003). «Происхождение майя по генам HLA и уникальность индейцев». Тканевые антигены . 61 (6): 425–36. дои : 10.1034/j.1399-0039.2003.00040.x . ПМИД   12823766 .
  19. ^ Перейти обратно: а б Брюгге Армас Дж., Дестро-Бисоль Г., Лопес-Васкес А. и др. (2003). «Вариация HLA класса I у западноафриканских пигмеев и их генетическое родство с другими африканскими популяциями». Тканевые антигены . 62 (3): 233–42. дои : 10.1034/j.1399-0039.2003.00100.x . ПМИД   12956877 .
  20. ^ Уильямс Ф., Мина А., Дарк С. и др. (2001). «Анализ распределения аллелей HLA-B в популяциях пяти континентов». Хм. Иммунол . 62 (6): 645–50. дои : 10.1016/S0198-8859(01)00247-6 . ПМИД   11390040 .
  21. ^ Леффелл М.С., Фаллин М.Д., Хильдебранд В.Х., Каветт Дж.В., Иглхарт Б.А., Закари А.А. (2004). «Аллели и гаплотипы HLA среди сиу лакота: отчет о семинарах меньшинств ASHI, часть III». Хм. Иммунол . 65 (1): 78–89. дои : 10.1016/j.humimm.2003.10.001 . ПМИД   14700599 .
  22. ^ Леффелл М.С., Фаллин М.Д., Эрлих Х.А. и др. (2002). «Антигены, аллели и гаплотипы HLA среди юпиков, коренных жителей Аляски: отчет о семинарах меньшинств ASHI, Часть II». Хм. Иммунол . 63 (7): 614–25. дои : 10.1016/S0198-8859(02)00415-9 . ПМИД   12072196 .
  23. ^ Перейти обратно: а б с д [Примечание: поскольку freq(A28) = freq(A68) + freq(A69) и A69 не широко распространены в Африке (в основном Левант, острова Кабо-Верде, некоторые племена в Буркино-Фасо), частоты A28 обычно можно рассматривать как частоты A68. ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 38cf183073b51f2c519de6fb33e46906__1719401760
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/38/06/38cf183073b51f2c519de6fb33e46906.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
HLA-A68 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)