HLA-A1
| HLA-A1 | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ( MHC класса I , антиген клеточной поверхности) | ||||||||||
 | ||||||||||
| О | ||||||||||
| Белок | трансмембранный рецептор / лиганд | |||||||||
| Структура | αβ гетеродимер | |||||||||
| Субъединицы | HLA-A *01--, β 2 -микроглобулин | |||||||||
| Старые имена | HL-A1 | |||||||||
| Подтипы | ||||||||||
| ||||||||||
| Редкие аллели | ||||||||||
| ||||||||||
| Связь аллелей с базой данных IMGT/HLA в EBI | ||||||||||
HLA-A1 (A1) представляет собой человеческого лейкоцитарного антигена серотип в группе серотипов HLA-A «A». Серотип определяется антителом, распознающим α 1 подмножество α-цепей HLA-A. Для А1 альфа-цепь «А» кодируется HLA-A. Группа аллелей *01 и β-цепь кодируются B2M локусом . [ 1 ] В настоящее время в этой группе доминирует A*01:01. А1 и А *01 почти синонимы по смыслу. А1 более распространен в Европе, чем где-либо еще. Он является частью длинного гаплотипа , который, по-видимому, часто встречался у древних народов Северо-Западной Европы. А1 — частый компонент гаплотипа AH8.1 . Положительный результат серотипа А1 примерно связан с большим количеством воспалительных заболеваний и состояний, которые, как полагают, связаны с поражением иммунной системы. Из-за его связи внутри гаплотипа AH8.1 многие исследования показали связь с A1 или A1,B8 только позже, чтобы показать дрейф ассоциации в сторону аллелей генов региона класса II, DR3 и DQ2.5. Хотя неясно, какую роль А1 играет в инфекционных заболеваниях, некоторая связь с уровнем инфицирования ВИЧ по-прежнему связана с областью А1 гаплотипа.
Серотип
[ редактировать ]| А*01 | А1 | Образец |
| аллель | % | размер (Н) |
| *01:01 | 99 | 5612 |
| *01:02 | 95 | 129 |
| *01:03 | 78 | 9 |
До сих пор во всех случаях было обнаружено, что HLA-A1 связан с заболеванием путем ассоциации, но лишь немногие определяют, что HLA-A1 имеет преобладающий генетический риск по сравнению с другими генными аллелями вблизи гена A1 на более крупных объектах. гаплотип.
А1 и аутоиммунные заболевания
[ редактировать ]Серотип А1 был связан с рядом заболеваний, поскольку впервые были описаны антигены «HL-A» . Ассоциации быстро расширились и включили HLA-B8 «HL-A8» , поскольку было обнаружено, что HLA A1 и B8 обычно связаны. По мере того, как был охарактеризован DRw3, аутоиммунный риск сместился в сторону региона класса II.
Гаплотип A1-B58 (A1-B17, где B58 является доминантным) может оставаться связанным с цитоплазматическими антителами против нейтрофилов (ANCA). [ 3 ]
А1 при диабете
[ редактировать ]За исключением диабета 1 типа, большая часть доказательств прямой связи А1 с аутоиммунными заболеваниями испарилась, поскольку были охарактеризованы гены DR3 и DQ2. Хотя диабет 1 типа демонстрирует расширенную связь с гаплотипом HLA A1-B8-DR3-DQ2, эта ассоциация, по-видимому, не выходит за пределы локуса HLA-B. [ 4 ] Недавнее исследование фенотипа DR3-DQ2/DR4-DQ8 показало, что уровень A1-cw7-B8 на самом деле ниже, чем ожидалось, по сравнению с другими типами AB, что указывает на то, что гены, связанные с риском, расположены между B8 и DR3. Однако исследование, проведенное в другом месте, показало, что A*01:01, по-видимому, изменяет риск развития диабета 1 типа , но не Cw7-B8. [ 5 ] Пример диабета 1 типа показывает, что использование только анализа сцепления для определения риска является неотъемлемой трудностью.
А1 и аллергические заболевания, чувствительность
[ редактировать ]На ранних этапах изучения HLA была обнаружена связь между HL A1,B8 при аллергических заболеваниях; обнаружено, что они связаны с расширенной областью HLA A1-B8.
Как ни странно, А1 также был связан с метотрексатом , вызванным циррозом печени . [ 6 ] В то время как было обнаружено, что А1 отрицательно связан с другими заболеваниями, такими как пневмокониоз рабочих угольной промышленности и проказа. [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
А1 и инфекционные заболевания
[ редактировать ]В ходе ранних исследований было обнаружено, что А1 связан с некоторыми инфекционными заболеваниями или защищает от них. [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] Примерами могут служить некоторые заболевания, связанные с A1, на самом деле связанные с расширенным гаплотипом A1-B8, вирусным гепатитом и ускоренным прогрессированием ВИЧ.
A1 с B8 показали повышенный риск заражения корью , [ 13 ] однако значимость не была постоянной. [ 14 ] Более поздняя статья показала связь A*01:01 с ответами на вакцину против кори ниже среднего . [ 15 ] При краснухе А1-В8 чаще обнаруживали у лиц, заразившихся в результате переноса матери. [ 16 ] Также было обнаружено, что А1 связан с околоротовым герпесом . [ 10 ] Также была описана связь между А1 и герпесом . [ 17 ] Впоследствии была также показана связь с простым герпесом . [ 18 ]
А1 при лимфоме
[ редактировать ]При лимфоме Ходжкина HLA-A1 [ 19 ] но DR3 не был обнаружен выше. [ 20 ] Гаплотип A1-B8-DR3-DQ2 имеет известную связь с Т-клеточной лимфомой, связанной с энтеропатией , примерно 70% пациентов являются гомозиготами по DQ2 по крайней мере с одной копией DR3-DQ2.
Аллели
[ редактировать ]| Исследуемая популяция | Частота. (в %) [ 21 ] |
|---|---|
| Ирландия Южная | 25.0 |
| Англия Ланкастер | 21.5 |
| Уэльс | 21.1 |
| Ирландия Северная | 20.2 |
| Англия Шеффилд | 19.7 |
| Англия Ливерпуль | 19.4 |
| Англия Ньюкасл | 19.3 |
| Испания Баскы Арратия Валь… | 19.2 |
| Англия Лидс | 19.1 |
| Англия Манчестер | 18.9 |
| Австралия Новый Южный Уэльс | 18.7 |
| Запад Австралии | 18.5 |
| Шотландия Оркнейские острова | 17.0 |
| Южная Африка Натал Тамильский | 17.0 |
| Бельгия | 15.5 |
| Север Италии (1) | 15.4 |
| Израильские евреи | 15.2 |
| Юго-Восток Франции | 15.0 |
| немецкая еда | 14.4 |
| Russia Arkhangelsk Pomors | 14.0 |
| Надор Металса (берберский) | 13.7 |
| Швеция Стокгольм | 13.6 |
| Испания Баскский Гипускоа Про… | 13.5 |
| Буркина-Фасо Фулани | 13.3 |
| Пакистан Синдхи | 13.3 |
| Сербия | 13.2 |
| Португальский центр | 13.0 |
| Швеция Лен Уппсала | 13.0 |
| Чешская Республика | 12.7 |
| Индия Андхра-Прадеш Гол… | 12.5 |
| Израиль Газа Палестинцы | 12.4 |
| Индия Мумбаи Маратхи | 12.3 |
| Тунис | 12.3 |
| Алжир1 | 12.3 |
| румынский | 12.2 |
| Италия | 12.1 |
| Северо-Запад России | 11.9 |
| Кения Нанди | 11.8 |
| Испания Восточная Андалусия | 11.4 |
| Македония (4) | 11.3 |
| Тунис | 11.2 |
| Турция (я) | 10.9 |
| Испания Северная Кантабрия | 10.8 |
| Греция Север | 10.0 |
| Хорватия | 9.7 |
| Италия Южная Кампания | 9.7 |
| Греция (3) | 9.2 |
| Бразилия | 9.1 |
| Финляндия | 8.9 |
| Саудовская Аравия | 8.7 |
| Испания Каталония Жирона | 8.6 |
| Пакистан Карачи Парси | 8.3 |
| Уганда Кампала | 8.3 |
| Монгольская Халха | 8.0 |
| Джордан Амман | 7.9 |
| Испания Северное Кабуэрниго | 7.6 |
| Кения Луо | 7.4 |
| Болгария | 7.3 |
| Russia Chuvash | 7.3 |
| Мой собственный | 7.2 |
| Сингапурский яванский индонезийский… | 7.0 |
| Грузия Тбилисские курды | 6.7 |
| Франция Корсика | 6.5 |
| Грузия Тбилиси Грузия… | 5.7 |
| Грузия Сванетия Сваны | 5.6 |
| Китай Цинхай Хуэй | 5.5 |
| Накидка австралийских аборигенов… | 5.3 |
| Суданский | 5.0 |
| Италия Сардиния(3) | 4.5 |
| Россия Мурманск Саоми | 4.0 |
| Испания Пас-Вэлли | 3.8 |
| Лусака, Замбия | 3.5 |
| Буркина-Фасо Римайбе | 3.2 |
| Сингапур Риау Малайский | 3.2 |
| Кения | 3.1 |
| Россия Ненецкий | 3.1 |
| Камерунский пигмей Бакола | 3.0 |
| Таиланд | 2.8 |
| Австралийский абориген Гру… | 2.7 |
| Сенегал Ниохоло Манденка | 2.7 |
| Камерун Бамилеке | 2.6 |
| Индия Джалпайгури Тото | 2.5 |
| Китай Шанхай | 2.4 |
| Северо-восток Таиланда | 2.4 |
| частоты аллелей Представлены только | |
| Исследуемая популяция | Частота. (в %) [ 21 ] |
|---|---|
| Индия Север Дели | 3.3 |
| Кения Нанди | 2.7 |
| Юго-восточная часть Кабо-Верде… | 1.6 |
| Сенегал Ниохоло Манденка | 1.6 |
| Мали Бандиагара | 1.1 |
| Тунис | 1.0 |
| Гвинея-Бисау | 0.8 |
| Древесина | 0.8 |
| США Афроамериканцы (3) | 0.7 |
| Аргентина Тоба Росарио | 0.6 |
| США латиноамериканцы | 0.6 |
| Кения Луо | 0.4 |
| Камерун Бети | 0.3 |
| Россия Тува (2) | 0.3 |
| Уганда Кампала | 0.3 |
| частоты аллелей Представлены только | |
| Исследуемая популяция | Частота. (в %) [ 21 ] |
|---|---|
| Израиль Ашкенази и не… | 2.1 |
| Кения Нанди | 1.7 |
| Суданский | 1.5 |
| Кения | 0.7 |
| Саудовская Аравия Гурайат и… | 0.7 |
| Иран Белудж | 0.6 |
| Ч. Гуандун Мэйчжоу Хан | 0.5 |
| Китай Пекин Шицзячжуань… | 0.2 |
| частоты аллелей Представлены только | |
Большая часть риска заболевания, обусловленного A*01:01, представлена либо рисками серотипа A1, либо риском серотипа A1-B8 (в Европе A1-B8 почти всегда состоит из A*01:01 и B*08:01). Другие аллели, A*01:02 и A*01:03, могут представлять специфический риск. Например, было обнаружено, что A*01:02 связан с типом инсульта, который часто наблюдается у детей с серповидноклеточной анемией. [ 22 ]
Есть сообщение, что в сомалийских общинах в США 2/3 носителей А1 имеют изоформу А*01:03.
Гаплотипы A1-B
[ редактировать ]- A1-B8 Западная Ирландия, Северная Ирландия, Шотландия, Уэльс, Северо-Западная Англия, Скандинавия, Югославия, Россия,....
- A1-B7 Армения, Австрия, Северо-Западная Европа (региональный рекомбинант между A1-B8 и A2/A3-B7)
- А1-Б13 Уральский
- A1-B35 (Албания, Бельгия, Италия, Греция, Франция - происхождение Восточного Средиземноморья)
- A1-B37 Якуты, племена-Индия, Айерс-Индия, монголы, индейцы, орохон, румыны, югославы, корейцы, албанцы, французы, немцы, маньчжуры
- A1-B51 Югославия, Германия, Иберия, Италия
- A1-B52 Бхаргавы-Индия, Племенная Индия, Италия, Иберия, Франция
- A1-B57 (см. таблицы на странице обсуждения)
- A1-B58 (см. таблицы на странице обсуждения)
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Арсе-Гомес Б., Джонс Э.А., Барнстейбл С.Дж., Соломон Э., Бодмер В.Ф. (февраль 1978 г.). «Генетический контроль антигенов HLA-A и B в гибридах соматических клеток: потребность в бета2-микроглобулине». Тканевые антигены . 11 (2): 96–112. дои : 10.1111/j.1399-0039.1978.tb01233.x . ПМИД 77067 .
- ^ Форма запроса аллелей IMGT/HLA - Европейский институт биоинформатики
- ^ Шанкаркумар У., Гош К., Прадхан В., Бадакере С., Моханти Д. (2005). «Иммуногенетическая ассоциация у пациентов с антинейтрофильными цитоплазматическими антителами (ANCA) из Мумбаи, Махараштра, Индия». Дж. Аутоиммун . 24 (3): 227–33. дои : 10.1016/j.jaut.2005.01.009 . ПМИД 15848045 .
- ^ Ноубл Дж.А., Мартин А., Вальдес А.М. и др. (2008). «Риск диабета 1 типа для гаплотипов HLA-DR3 зависит от генотипического контекста: ассоциация локусов DPB1 и HLA класса I среди соответствующих DR3 и DR4 итальянских пациентов и контрольной группы» . Хм. Иммунол . 69 (4–5): 291–300. дои : 10.1016/j.humimm.2008.02.003 . ПМК 2505335 . ПМИД 18486765 .
- ^ Ноубл Дж., Вальдес А., Бугаван Т., Эппл Р., Томсон Г., Эрлих Х. (2002). «Локус HLA класса IA влияет на предрасположенность к диабету 1 типа» . Хум Иммунол . 63 (8): 657–64. дои : 10.1016/S0198-8859(02)00421-4 . ПМК 4049513 . ПМИД 12121673 .
- ^ Захария Х, Крагбалле К, Теструп-Педерсен К, Киссмейер-Нильсен Ф (1980). «HLA-антигены при циррозе печени, вызванном метотрексатом» . Акта Дерм. Венереол . 60 (2): 165–66. дои : 10.2340/0001555560165166 . ПМИД 6155028 . S2CID 25032022 .
- ^ Вагнер М.М., Дарк К. (август 1979 г.). «Частота антигенов HLA-A и B у валлийских угольщиков с пневмокониозом и синдромом Каплана». Тканевые антигены . 14 (2): 165–8. дои : 10.1111/j.1399-0039.1979.tb00834.x . ПМИД 91226 .
- ^ Хейзе Э.Р., Ментнех М.С., Оленчок С.А. и др. (июнь 1979 г.). «HLA-A1 и пневмокониоз угольщиков». Являюсь. Преподобный Респир. Дис . 119 (6): 903–8. ПМИД 453710 .
- ^ Шанкаркумар У., Гош К., Бадакере С., Моханти Д. (2003). «Новые аллели HLA класса I, связанные с больными индийской проказой» . Дж. Биомед. Биотехнология . 2003 (3): 208–211. дои : 10.1155/S1110724303210019 . ПМК 400212 . ПМИД 12975536 .
- ^ Jump up to: а б Рассел А.С., Шлаут Дж. (октябрь 1975 г.). «Трансплантационные антигены HL-A у субъектов, восприимчивых к рецидиву лабиального герпеса». Тканевые антигены . 6 (4): 257–61. дои : 10.1111/j.1399-0039.1975.tb00640.x . ПМИД 1198581 .
- ^ Хейз Э.Р., Майор ПК, Ментнек М.С., Пэрриш Э.Дж., Джордон А.Л., Морган В.К. (сентябрь 1975 г.). «Преобладание антигенов гистосовместимости W18 и HL-A1 у шахтеров, устойчивых к осложненному пневмокониозу угольщиков». Вдыхаемая часть . 4 Пт 2: 495–507. ПМИД 1236236 .
- ^ Обнимаю Джи (май 1976 г.). «Генетические факторы и аутоиммунитет при вирусном гепатите». Являюсь. Дж. Клин. Патол . 65 (5 дополнений): 870–5. ПМИД 218441 .
- ^ Ханиман MC, Дорман, округ Колумбия, Менсер М.А., Форрест Дж.М., Гинан Дж.Дж., Кларк П. (февраль 1975 г.). «Антигены HL-A при врожденной краснухе и роль антигенов 1 и 8 в эпидемиологии естественной краснухи». Тканевые антигены . 5 (1): 12–8. дои : 10.1111/j.1399-0039.1975.tb00520.x . ПМИД 1138435 .
- ^ Харкорт Г.К., Бест Дж.М., Банатвала Дж.Э., Кеннеди Л.А. (декабрь 1979 г.). «HLA-антигены и реакция на вакцинацию против краснухи» . Дж. Хиг (Лондон) . 83 (3): 405–12. дои : 10.1017/S0022172400026231 . ПМК 2130160 . ПМИД 512353 .
- ^ Овсянникова И.Г., Райан Дж.Э., Виркант Р.А., Панкратц В.С., Якобсон Р.М., Польша Г.А. (декабрь 2005 г.). «Иммунологическое значение генов HLA класса I в иммунных ответах на цитокины IFN-гамма и IL-4, специфичные для вируса кори». Иммуногенетика . 57 (11): 828–36. дои : 10.1007/s00251-005-0061-6 . ПМИД 16331510 . S2CID 25508939 .
- ^ Форрест Дж.М., Тернбулл Ф.М., Шоллер Г.Ф. и др. (2002). «Больные Грегга врожденной краснухой 60 лет спустя» . Мед. Дж. Ауст . 177 (11–12): 664–7. дои : 10.5694/j.1326-5377.2002.tb05003.x . ПМИД 12463994 . S2CID 36212779 .
- ^ Рассел А.С., Шлаут Дж (декабрь 1977 г.). «Ассоциация антигена HLA-A1 и восприимчивость к рецидивирующему герпесу». Арч Дерматол . 113 (12): 1721–2. дои : 10.1001/archderm.113.12.1721 . ПМИД 596908 .
- ^ Джаббар А.А., аль-Самараи AM, аль-Амар Н.С. (1991). «HLA-антигены, связанные с восприимчивостью к инфекции вируса простого герпеса». Дис. Маркеры . 9 (5): 281–7. ПМИД 1797451 .
- ^ Хорс Дж., Дауссе Дж. (1983). «HLA и восприимчивость к болезни Ходжкина». Иммунол. Преподобный . 70 : 167–92. дои : 10.1111/j.1600-065X.1983.tb00714.x . ПМИД 6403456 . S2CID 5400650 .
- ^ Хансен Дж.А., Янг К.В., Уитсетт С. и др. (1977). «Типирование HLA и MLC у пациентов с болезнью Ходжкина». Прог. Клин. Биол. Рез . 16 : 217–27. ПМИД 143667 .
- ^ Jump up to: а б с Миддлтон, Д.; Менчака, Л.; Руд, Х.; Комерофски, Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allerefrequency.net». Тканевые антигены . 61 (5): 403–407. дои : 10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x . ПМИД 12753660 .
- ^ Хоппе С., Клитц В., Ноубл Дж., Виджил Л., Вичинский Э., Стайлз Л. (апрель 2003 г.). «Отличные ассоциации HLA по подтипам инсульта у детей с серповидноклеточной анемией» . Кровь . 101 (7): 2865–9. дои : 10.1182/blood-2002-09-2791 . ПМИД 12517810 .