HLA-A3
 | Эта статья может быть слишком технической для понимания большинства читателей . ( Май 2017 г. ) |
| HLA-A3 | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ( MHC класса I , антиген клеточной поверхности) | ||||||||||
 HLA-A3 | ||||||||||
| О | ||||||||||
| Белок | трансмембранный рецептор / лиганд | |||||||||
| Структура | αβ гетеродимер | |||||||||
| Субъединицы | HLA-A *03--, β 2 -микроглобулин | |||||||||
| Старые имена | HL-A3 | |||||||||
| Подтипы | ||||||||||
| ||||||||||
| Редкие аллели | ||||||||||
| ||||||||||
| Связь аллелей с базой данных IMGT/HLA в EBI | ||||||||||
HLA-A3 (A3) представляет собой человеческого лейкоцитарного антигена серотип в группе серотипов HLA-A . Серотип определяется антителом, распознающим α 3 подмножество α-цепей HLA-A. Для A3 альфа-цепочка «A» кодируется HLA-A. Группа аллелей *03 и β-цепь кодируются B2M локусом . [ 1 ] В настоящее время в этой группе доминирует A*03:01. А3 и А *03 почти синонимы по смыслу. A3 более распространен в Европе, он является частью самого длинного известного мультигенного гаплотипа A3~B7~DR15~DQ6. [ 2 ]
Серотип
[ редактировать ]| А*03 | А3 | Образец |
| аллель | % | размер (Н) |
| *03:01 | 99 | 3504 |
| *03:02 | 78 | 342 |
| *03:05 | 20 | 5 |
A3 в основном состоит из A*03:01 и *03:02, которые хорошо серотипируются антителами против A3. Существует 26 несинонимичных вариантов A*03, 4 нулевых варианта и 22 варианта белка.
Сопутствующие заболевания
[ редактировать ]Серотип А3 является вторичным фактором риска развития миастении гравис. [ 4 ] и ниже CD8 + уровни у пациентов с гемохроматозом . [ 5 ] [ 6 ] Локус HFE (гемохроматоз) расположен между A3 и B7 в супергаплотипе A3 ~ DQ6. [ 7 ]
ВИЧ
[ редактировать ]HLA-A3 выбирает эволюцию ВИЧ для мутации эпитопа Gag KK9 и приводит к быстрому снижению ответа Т-клеток CD8. Т-клетки CD8 ответственны за быстрое уничтожение ВИЧ-инфицированных клеток CD4+. [ 8 ] Этот тип развитого ответа может быть неспецифичен для HLA-A3, поскольку ВИЧ способен быстро адаптироваться in situ к селективным факторам.
Аллели
[ редактировать ]| Исследуемая популяция | Частота. (в %) [ 9 ] |
|---|---|
| Финляндия | 25.0 |
| Индия Тамилнад Надар | 20.5 |
| Чешская Республика | 18.9 |
| Бельгия | 17.1 |
| Ирландия Северная | 14.3 |
| Австралия Новый Южный Уэльс | 13.8 |
| Грузия Сванетия Сваны | 13.8 |
| Грузия Тбилиси Грузия… | 13.8 |
| Пакистанская кисть | 13.0 |
| Северо-Западный Кабо-Верде I… | 12.0 |
| Ирландия Южная | 11.6 |
| румынский | 11.6 |
| Хорватия | 11.0 |
| США кавказцы (3) | 10.8 |
| Италия Север (1) | 9.7 |
| США Афроамериканцы (2) | 9.4 |
| Индия Мумбаи Маратхи | 9.3 |
| Индия Вест Бхилс | 9.0 |
| Португальский центр | 9.0 |
| Пакистан Патан | 8.7 |
| Камерун Бети | 8.6 |
| Камерун Бамилеке | 7.8 |
| Пакистан Калаш | 7.5 |
| Саудовская Аравия Гурайат и… | 7.5 |
| США латиноамериканцы | 7.3 |
| Индия Север Дели | 7.2 |
| Древесина | 7.0 |
| Россия Тува (2) | 6.9 |
| Тунис | 6.7 |
| США, коренные жители Северной Америки… | 6.7 |
| Юго-восточная часть Кабо-Верде… | 6.5 |
| Азорские острова Санта-Мария и Са… | 6.4 |
| Пакистанский белудж | 6.3 |
| Гвинея-Бисау | 6.2 |
| Израильские арабские друзы | 6.0 |
| Южноафриканский Натал Зулу | 6.0 |
| Выходцы из Латинской Америки Южного Техаса США | 6.0 |
| Индия Северные индусы | 5.8 |
| Лусака, Замбия | 5.8 |
| Иран Белудж | 5.6 |
| Уганда Кампала | 5.5 |
| Джордан Амман | 5.2 |
| Кения | 5.2 |
| Бразилия | 5.1 |
| Мой собственный | 5.1 |
| Камерунский карликовый скот | 5.0 |
| Грузия Тбилисские курды | 5.0 |
| Суданский | 4.8 |
| Болгария | 4.6 |
| Пакистан Брахуи | 4.6 |
| Китай Пекин | 4.5 |
| Австралийский индиг. Возьми Йора… | 4.4 |
| Китай Внутренняя Монголия | 4.4 |
| Мали Бандиагара | 4.4 |
| Пакистан Синдхи | 4.4 |
| Китай Цинхай Хуэй | 4.1 |
| Зимбабве Хараре Шона | 4.0 |
| Камерун Сава | 3.8 |
| Сенегал Ниохоло Манденка | 3.8 |
| Кения Луо | 3.6 |
| Марокко Nador Metalsa Cla… | 3.4 |
| Кения Нанди | 3.1 |
| Мексика. Гвадалахарские метисы… | 3.1 |
| Китай Гуанчжоу | 2.9 |
| Китай Северная Хань | 2.9 |
| Монголия Бурят | 2.9 |
| Китайские тибетцы | 2.5 |
| Китай Юньнань Ну | 2.5 |
| Мексика Метисы | 2.4 |
| Американское Самоа | 2.0 |
| Сингапурский яванский индонезийский… | 2.0 |
| частоты аллелей Представлены только | |
| Исследуемая популяция | Частота. (в %) [ 9 ] |
|---|---|
| Грузия Тбилисские курды | 8.3 |
| Марокко Nador Metalsa Cla… | 4.1 |
| Пакистан Карачи Парси | 2.8 |
| Израильские арабские друзы | 2.5 |
| Индия Нью-Дели | 2.3 |
| Суданский | 2.3 |
| Индия Север Дели | 2.2 |
| Парсы западного побережья Индии | 2.0 |
| Португальский центр | 2.0 |
| Индия Андхра-Прадеш Гол… | 1.7 |
| Пакистан Калаш | 1.7 |
| Пакистанский белудж | 1.6 |
| Грузия Тбилиси Грузия… | 1.4 |
| Саудовская Аравия Гурайат и… | 1.4 |
| Мой собственный | 1.3 |
| Пакистан Синдхи | 1.3 |
| Индия Северные индусы | 1.0 |
| Пакистан Патан | 1.0 |
| Южная Африка Натал Тамильский | 1.0 |
| Выходцы из Латинской Америки Южного Техаса США | 0.8 |
| частоты аллелей Представлены только | |
Сопутствующие заболевания
[ редактировать ]A*03:01 модулирует повышенный риск рассеянного склероза [ 10 ]
Гаплотипы A3 ~ B
[ редактировать ]A3-B7 является частью супергаплотипа A3 ~ DQ2.
А3-В8 (Румыния, СванС)
A3~B35 (Болгария, Хорватия, Восточная часть Черного моря)
A3~B55 (Восточная часть Черного моря)
А3~Cw7~B7
[ редактировать ]A3~B7 является бимодальным по частоте в Европе: один узел находится в Ирландии, а другой в Швейцарии, условно говоря, в Швейцарии частота выше. A3~Cw7~B7 — один из наиболее распространенных мультигенных гаплотипов в западном мире, особенно в Центральной и Восточной Европе.
А *03:01 ~ С *07:02 ~ Б *07:02 ~ ДРБ1 *15:01 ~ DQA1 *01:02 ~ DQB1 *06:02
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Арсе-Гомес Б., Джонс Э.А., Барнстейбл С.Дж., Соломон Э., Бодмер В.Ф. (февраль 1978 г.). «Генетический контроль антигенов HLA-A и B в гибридах соматических клеток: потребность в бета2-микроглобулине». Тканевые антигены . 11 (2): 96–112. дои : 10.1111/j.1399-0039.1978.tb01233.x . ПМИД 77067 .
- ^ Хортон Р., Гибсон Р., Коггилл П. и др. (январь 2008 г.). «Анализ вариаций и аннотация генов восьми гаплотипов MHC: Проект гаплотипов MHC» . Иммуногенетика . 60 (1): 1–18. дои : 10.1007/s00251-007-0262-2 . ПМК 2206249 . ПМИД 18193213 .
- ^ Форма запроса аллелей IMGT/HLA - Европейский институт биоинформатики
- ^ Махенс А., Лёлигер С., Пихльмайер У., Эмскёттер Т., Буш С., Избицкий Дж. (1999). «Корреляция патологии тимуса с HLA при миастении». Клиническая иммунология . 91 (3): 296–301. дои : 10.1006/clim.1999.4710 . ПМИД 10370374 .
- ^ Бартон Дж., Винер Х., Эктон Р., Го Р. (2005). «HLA-гаплотип A * 03-B * 07 у пробандов гемохроматоза с гомозиготностью HFE C282Y: несоответствие частот у мужчин и женщин и отсутствие связи с тяжестью перегрузки железом». Клетки крови Мол Дис . 34 (1): 38–47. дои : 10.1016/j.bcmd.2004.08.022 . ПМИД 15607698 .
- ^ Круз Э., Виейра Дж., Алмейда С., Ласерда Р., Гартнер А., Кардосо С., Алвес Х., Порту Дж. (2006). «Исследование 82 расширенных гаплотипов HLA у субъектов с гомозиготным гемохроматозом HFE-C282Y: взаимосвязь с генетическим контролем количества CD8 + Т-лимфоцитов и тяжести перегрузки железом» . БМК Мед Генет . 7:16 . дои : 10.1186/1471-2350-7-16 . ПМЦ 1413516 . ПМИД 16509978 .
- ^ Олссон К.С., Риттер Б., Ханссон Н., Чоудхури Р.Р. (июль 2008 г.). «Карта гаплотипов HLA популяций речных долин с гемохроматозом, прослеженная на протяжении пяти столетий в Центральной Швеции» . Евро. Дж. Гематол . 81 (1): 36–46. дои : 10.1111/j.1600-0609.2008.01078.x . ПМИД 18363869 . S2CID 30689398 .
- ^ Аллен Т.М., Альтфельд М., Ю.X.G. и др. (июль 2004 г.). «Отбор, передача и реверсия ускользающей мутации цитотоксических Т-лимфоцитов, процессирующих антиген, при инфекции вируса иммунодефицита человека типа 1» . Дж. Вирол . 78 (13): 7069–78. doi : 10.1128/JVI.78.13.7069-7078.2004 . ПМК 421658 . ПМИД 15194783 .
- ^ Jump up to: а б Миддлтон, Д.; Менчака, Л.; Руд, Х.; Комерофски, Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allerefrequency.net». Тканевые антигены . 61 (5): 403–407. дои : 10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x . ПМИД 12753660 .
- ^ Фогделл-Хан А., Лигерс А., Грённинг М., Хиллерт Дж., Олеруп О. (2000). «Рассеянный склероз: модифицирующее влияние генов HLA класса I на аутоиммунное заболевание, связанное с HLA класса II». Тканевые антигены . 55 (2): 140–8. дои : 10.1034/j.1399-0039.2000.550205.x . PMID 10746785 .