хлорофлексалес

хлорофлексалес
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Хлорофлексота
Сорт:	хлорофлексия
Заказ:	хлорофлексалес ; Гупта и др. 2013 год
Семьи
	хлорофлексинеа Хлорофлексовые ; Осциллохлоридные ; ; Розеифлексинеа Розеифлексовые ; ;

Chloroflexales — отряд бактерий класса Chloroflexia . ^{[ 1 ]} Клада также известна как нитчатые аноксигенные фототрофные бактерии (FAP). ^{[ 2 ]} так как отряд содержит фототрофы , не производящие кислород. Эти бактерии являются факультативными аэробами. ^{[ 3 ]} Обычно они используют хемотрофию , когда присутствует кислород, и переключаются на энергию, получаемую из света, в противном случае. Большинство видов — гетеротрофы , но некоторые способны к фотоавтотрофии . ^{[ 2 ]}

Отряд можно разделить на два подотряда. Chloroflexineae («Зеленый FAP», «зеленые несерные бактерии») является более известным. Этот подотряд использует хлоросомы — специализированный антенный комплекс — для передачи световой энергии в реакционный центр. Roseiflexineae («Red FAP»), с другой стороны, не обладает такой способностью. Названные цвета не являются абсолютными, поскольку в условиях роста, таких как концентрация кислорода, зеленый FAP будет казаться зеленым, коричневым или красновато-оранжевым, вызывая изменения в пигментном составе. ^{[ 2 ]}

Таксономия

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). ^{[ 4 ]} и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). ^{[ 5 ]}

Подотряд Roseiflexineae Gupta et al. 2013 год
- Семейство Roseiflexaceae Gupta et al. 2013 ["Kouleotrichaceae" Mehrshad et al. 2018 ]
  - Род « Kuleothrix » Kohno et al. 2002 г.
  - Род Heliothrix Pierson et al. 1986 год
  - Род Roseiflexus Hanada et al. 2002 г.
Подотряд Chloroflexineae Gupta et al. 2013 год
- Семейство Chloroflexaceae Gupta et al. 2013 год
  - Род Candida Chloranaerophilus Thiel et al. 2016 год
  - Род Chloroflexus Pierson & Castenholz 1974 [" Chlorocrinis "]
- Семейство Oscilloloridaceae Gupta et al. 2013 год
  - Род Candidatus Chloroploca Горленко и др. 2014 год
  - Род Chloronema ♪ Дубинина и Горленко 1975.
  - Род Oscilloloris Горленко и Пивоварова 1989.
  - Род Candida Viridilinea Grouzdev et al. 2018 год

Филогения

на основе 16S рРНК ДП _06_2022 ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

120 однокопийных маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Герпетосифоналы

Герпетосифоновые	Герпетосифон

хлорофлексалес

Розеифлексовые

Розеифлексус

Хлорофлексовые

Гелиотрикс

	Осциллохлорис

	хлорофлексус

хлорофлексалес

Герпетосифоновые	Герпетосифон

Розеифлексовые

	« Кулеотрикс »

	Розеифлексус

Хлорофлексовые

хлорофлексус

Осциллохлорис

	" Ка. Хлороплока "

	" Ка Виридилинея "

См. также

Список отрядов бактерий

Ссылки

^ Гаррити, Джордж М. (2001). Руководство Берджи по систематической бактериологии (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. стр. 427–446 . ISBN 978-0-387-21609-6 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Твитт, Дженнифер Л.; Каннифф, Дэниел П.; Брайант, Дональд А. (2019). «Биосинтез хлорофиллов и бактериохлорофиллов у зеленых бактерий». Достижения в ботанических исследованиях . 90 : 35–89. дои : 10.1016/bs.abr.2019.03.002 .
^ Гупта Р.С., Чандер П., Джордж С. (2013). «Филогенетическая основа и молекулярные признаки класса Chloroflexia и его различных клад; предложение о разделении класса Chloroflexia class. nov. [исправлено] на подотряд Chloroflexineae subord. nov., состоящий из исправленного семейства Oscilloloridaceae и семейства Chloroflexaceae fam. nov. и подотряд Roseiflexineae subord nov., содержащий семейство Roseiflexaceae fam. ноябрь». Антони ван Левенгук . 103 (1): 99–119. дои : 10.1007/s10482-012-9790-3 . ПМИД 22903492 .
^ Ж. П. Эзеби. «Хлорофлексалес» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 20 июля 2022 г.
^ Сэйерс; и др. «Хлорофлексалес» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 июля 2022 г.
^ «ЛТП» . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «Примечания к выпуску LTP_06_2022» (PDF) . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

Внешние ссылки

Эта бактериях статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Гаррити, Джордж М. (2001). Руководство Берджи по систематической бактериологии (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. стр. 427–446 . ISBN 978-0-387-21609-6 .

[Th19-2] Jump up to: ^а ^б ^с Твитт, Дженнифер Л.; Каннифф, Дэниел П.; Брайант, Дональд А. (2019). «Биосинтез хлорофиллов и бактериохлорофиллов у зеленых бактерий». Достижения в ботанических исследованиях . 90 : 35–89. дои : 10.1016/bs.abr.2019.03.002 .

[pmid22903492-3] Гупта Р.С., Чандер П., Джордж С. (2013). «Филогенетическая основа и молекулярные признаки класса Chloroflexia и его различных клад; предложение о разделении класса Chloroflexia class. nov. [исправлено] на подотряд Chloroflexineae subord. nov., состоящий из исправленного семейства Oscilloloridaceae и семейства Chloroflexaceae fam. nov. и подотряд Roseiflexineae subord nov., содержащий семейство Roseiflexaceae fam. ноябрь». Антони ван Левенгук . 103 (1): 99–119. дои : 10.1007/s10482-012-9790-3 . ПМИД 22903492 .

[4] Ж. П. Эзеби. «Хлорофлексалес» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 20 июля 2022 г.

[5] Сэйерс; и др. «Хлорофлексалес» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 июля 2022 г.

[6] «ЛТП» . Проверено 10 мая 2023 г.

[7] «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 10 мая 2023 г.

[8] «Примечания к выпуску LTP_06_2022» (PDF) . Проверено 10 мая 2023 г.

[about-9] «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[tree-10] "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[taxon_history-11] «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]