Фактор трилистника 1

ТФФ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1HI7, 1PS2
Идентификаторы
Псевдонимы	TFF1 , BCEI, D21S21, HP1.A, HPS2, pNR-2, pS2, фактор трилистника 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 113710 ; МГИ : 88135 ; Гомологен : 2426 ; Генные карты : TFF1 ; ОМА : TFF1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 21 (human)
End	42,366,535 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	31,384,251 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	pancreatic ductal cell; ; gastric mucosa; ; palpebral conjunctiva; ; pylorus; ; mucosa of sigmoid colon; ; mucosa of ileum; ; gallbladder; ; cardia; ; rectum; ; jejunal mucosa;
	Top expressed in
	pyloric antrum; ; epithelium of stomach; ; mucous cell of stomach; ; tibiofemoral joint; ; perirhinal cortex; ; entorhinal cortex; ; right ventricle; ; CA3 field; ; Ileal epithelium; ; choroid plexus of fourth ventricle;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	growth factor activity; protein binding;
Cellular component	extracellular space; extracellular region;
Biological process	response to immobilization stress; cell differentiation; response to peptide hormone; maintenance of gastrointestinal epithelium; negative regulation of cell population proliferation; response to iron ion; wound healing; carbohydrate metabolic process; regulation of signaling receptor activity; digestion; signal transduction;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7031
	21784
	ENSG00000160182
	ENSMUSG00000024032
	P04155
	Q08423
	НМ_003225
	НМ_009362
	НП_003216
	НП_033388
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор трилистника 1 — это белок , который у человека кодируется TFF1 . геном ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} (также называемый pS2 геном ^{[ 7 ]}).

Функция

Члены семейства трилистников характеризуются наличием по крайней мере одной копии мотива трилистника , домена из 40 аминокислот, который содержит три консервативных дисульфида . Они представляют собой стабильные секреторные белки, экспрессирующиеся в желудочно-кишечного тракта слизистой оболочке . Их функции не определены, но они могут защищать слизистую оболочку от повреждений, стабилизировать слой слизи и влиять на заживление эпителия . Этот ген, экспрессирующийся в слизистой оболочке желудка, также изучался из-за его экспрессии в опухолях человека. Этот ген и два других родственных гена-члена семейства трилистниковых обнаружены в кластере на 21 хромосоме . ^{[ 6 ]}

Гликановое связывание

Все три фактора трилистника человека представляют собой лектины , специфически взаимодействующие с дисахаридом GlcNAc -α-1,4- Gal . ^{[ 8 ]} существует только в крупных, сильно гликозилированных Этот дисахарид представляет собой необычный гликотоп, который, как известно , муцинах слизистой оболочки. Путем перекрестного связывания муцинов посредством двухвалентного связывания этого гликотопа факторы трилистника затем способны обратимо модулировать толщину и вязкость слизи. ^{[ 8 ]}

При раке желудка

Экспрессия TFF1 часто теряется при карциноме желудка , вероятно, из-за механизма метилирования ДНК , и поэтому его рассматривают как ген-супрессор опухоли . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000160182 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024032 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Гётт П., Бек С., Мачадо Х.К., Карнейро Ф., Шмитт Х., Блин Н. (май 1997 г.). «Пептиды трилистника человека: геномная структура в 21q22.3 и скоординированная экспрессия». Eur J Hum Genet . 4 (6): 308–15. дои : 10.1159/000472224 . ПМИД 9043862 . S2CID 25235589 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: фактор трилистника TFF1 1» .
^ Шатаньон А., Баллестар Э., Эстеллер М., Данте Р. (2010). «Роль белка 2 связывающего домена метил-CpG в модуляции эстрогенового ответа гена pS2/TFF1» . ПЛОС ОДИН . 5 (3): е9665. Бибкод : 2010PLoSO...5.9665C . дои : 10.1371/journal.pone.0009665 . ПМЦ 2837351 . ПМИД 20300195 .
^ Jump up to: ^а ^б Ярво М.А., Лингфорд Дж.П., Джон А., Солер Н.М., Скотт Н.Е., Годдард-Боргер Э.Д. (май 2020 г.). «Факторы трилистника имеют общую лектиновую активность, которая определяет их роль в слизи» . Природные коммуникации . 11 (1): 2265. Бибкод : 2020NatCo..11.2265J . дои : 10.1038/s41467-020-16223-7 . ПМК 7221086 . ПМИД 32404934 .
^ Фэн Г, Чжан Ю, Юань Х, Бай Р, Чжэн Дж, Чжан Дж, Сун М (январь 2014 г.). «Метилирование ДНК фактора трилистника 1 (TFF1) связано с онкогенезом рака желудка» . Представитель Мол Мед . 9 (1): 109–117. дои : 10.3892/ммр.2013.1772 . ПМИД 24190027 .

Дальнейшее чтение

Лангер Г., Ягла В., Беренс-Бауманн В., Вальтер С., Хоффманн В. (2003). «Глазные TFF-пептиды: новые секреторные продукты, связанные со слизью, бокаловидных клеток конъюнктивы». Слезная железа, слезная пленка и синдром сухого глаза 3 . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 506. стр. 313–6. дои : 10.1007/978-1-4615-0717-8_44 . ISBN 978-1-4613-5208-2 . ПМИД 12613926 .
Пигготт Н.Х., Генри Дж.А., Мэй Ф.Е., Уэстли Б.Р. (1991). «Антипептидные антитела против эстроген-регулируемого белка pNR-2 клеток рака молочной железы человека и обнаружение экспрессии pNR-2 в нормальных тканях с помощью иммуногистохимии». Дж. Патол . 163 (2): 95–104. дои : 10.1002/путь.1711630204 . ПМИД 1707960 . S2CID 2120939 .
Мори К., Фуджи Р., Кида Н., Такахаси Х., Окубо С., Фуджино М., Ота М., Хаяси К. (1990). «Полная первичная структура продукта человеческого эстроген-чувствительного гена (pS2)». Дж. Биохим . 107 (1): 73–6. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a123014 . ПМИД 2185238 .
Томасетто С, Рио МС, Готье С, Вольф С, Хареувени М, Шамбон П, Лате Р (1990). «hSP, гомолог белка pS2 с дуплицированным доменом, экспрессируется совместно с pS2 в желудке, но не в карциноме молочной железы» . ЭМБО Дж . 9 (2): 407–14. дои : 10.1002/j.1460-2075.1990.tb08125.x . ПМК 551681 . ПМИД 2303034 .
Такахаши Х., Кида Н., Фуджи Р., Танака К., Охта М., Мори К., Хаяши К. (1990). «Экспрессия гена pS2 в клетках рака желудка человека, происходящих из низкодифференцированной аденокарциномы» . ФЭБС Летт . 261 (2): 283–6. дои : 10.1016/0014-5793(90)80572-Z . ПМИД 2311759 . S2CID 37115994 .
Рио МС, Беллок Дж.П., Дэниел Дж.Ю., Томасетто С., Лате Р., Шенар М.П., Батценшлагер А., Шамбон П. (1988). «Белок pS2, связанный с раком молочной железы: синтез и секреция нормальной слизистой оболочкой желудка». Наука . 241 (4866): 705–8. Бибкод : 1988Sci...241..705R . дои : 10.1126/science.3041593 . ПМИД 3041593 .
Рио МК, Лепаж П., Димунш П., Ройч К., Шамбон П. (1989). «[Первичная структура человеческого белка pS2]». Доклады Академии наук, серия III . 307 (19): 825–31. ПМИД 3146413 .
Мори К., Фуджи Р., Кида Н., Ота М., Хаяши К. (1988). «Идентификация полипептида, секретируемого клетками рака молочной железы человека (MCF-7), как продукта человеческого эстроген-чувствительного гена (pS2)». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 155 (1): 366–72. дои : 10.1016/S0006-291X(88)81094-5 . ПМИД 3261981 .
Джельч Дж.М., Робертс М., Шац С., Гарнье Дж.М., Браун А.М., Шамбон П. (1987). «Структура человеческого эстроген-чувствительного гена pS2» . Нуклеиновые кислоты Рез . 15 (4): 1401–14. дои : 10.1093/нар/15.4.1401 . ПМЦ 340557 . ПМИД 3822834 .
Прюдом Ж.Ф., Фридлански Ф., Ле Канф М., Атгер М., Мерсье-Бодар С., Пишон М.Ф., Милгром Э. (1985). «Клонирование гена, экспрессируемого при раке молочной железы человека и регулируемого эстрогеном в клетках MCF-7». ДНК . 4 (1): 11–21. дои : 10.1089/dna.1985.4.11 . ПМИД 3838275 .
Яковлев С.Б., Бренак Р., Елч Дж.М., Масиаковский П., Шамбон П. (1984). «Последовательность мРНК pS2, индуцируемая эстрогеном в линии клеток рака молочной железы человека MCF-7» . Нуклеиновые кислоты Рез . 12 (6): 2861–78. дои : 10.1093/нар/12.6.2861 . ПМК 318711 . ПМИД 6324130 .
Хэнби А.М., Поулсом Р., Сингх С., Элиа Г., Джеффри Р.Э., Райт Н.А. (1993). «Спазмолитический полипептид является основным антральным пептидом: распределение пептидов трилистника, человеческого спазмолитического полипептида и pS2 в желудке» . Гастроэнтерология . 105 (4): 1110–6. дои : 10.1016/0016-5085(93)90956-д . ПМИД 8405856 .
Польшаков В.И., Френкил Т.А., Уэстли Б., Чедвик М., Мэй Ф., Карр М.Д., Фини Дж. (1996). «Структурные исследования однодоменного пептида трилистника pNR-2/pS2 на основе ЯМР. Сходство со спазмолитическим пептидом свиньи и доказательства мономерной структуры». Евро. Дж. Биохим . 233 (3): 847–55. дои : 10.1111/j.1432-1033.1995.847_3.x . ПМИД 8521850 .
Сейб Т., Блин Н., Хильгерт К., Зейферт М., Тайзингер Б., Энгель М., Дули С., Занг К.Д., Велтер С. (1997). «Три гена трилистника человека TFF1, TFF2 и TFF3 расположены в области размером 55 т.п.н. на хромосоме 21q22.3». Геномика . 40 (1): 200–2. дои : 10.1006/geno.1996.4511 . ПМИД 9070946 .
Польшаков В.И., Уильямс М.А., Гаргаро А.Р., Френкил Т.А., Уэстли Б.Р., Чедвик М.П., Мэй Ф.Е., Фини Дж. (1997). «Структура раствора pNR-2 / pS2 человека с высоким разрешением: один белок с мотивом трилистника». Дж. Мол. Биол . 267 (2): 418–32. дои : 10.1006/jmbi.1997.0896 . ПМИД 9096235 .
Член парламента от Чедвика, Уэстли Б.Р., Мэй Ф.Э. (1997). «Гомодимеризация и гетероолигомеризация однодоменного белка трилистника pNR-2/pS2 через цистеин 58» . Биохим. Дж . 327 (1): 117–23. дои : 10.1042/bj3270117 . ПМЦ 1218770 . ПМИД 9355742 .
Чен Х., Линь Р.Дж., Се В., Вильпитц Д., Эванс Р.М. (1999). «Регуляция гормон-индуцированного гиперацетилирования гистонов и активации генов посредством ацетилирования ацетилазы» . Клетка . 98 (5): 675–86. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80054-9 . ПМИД 10490106 . S2CID 14697597 .
Ньютон Дж.Л., Аллен А., Уэстли Б.Р., Мэй Ф.Е. (2000). «Пептид трилистника человека, TFF1, присутствует в различных молекулярных формах, которые тесно связаны со слизью в нормальном желудке» . Гут . 46 (3): 312–20. дои : 10.1136/gut.46.3.312 . ПМЦ 1727855 . ПМИД 10673290 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 21 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000160182 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024032 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9043862-5] Гётт П., Бек С., Мачадо Х.К., Карнейро Ф., Шмитт Х., Блин Н. (май 1997 г.). «Пептиды трилистника человека: геномная структура в 21q22.3 и скоординированная экспрессия». Eur J Hum Genet . 4 (6): 308–15. дои : 10.1159/000472224 . ПМИД 9043862 . S2CID 25235589 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: фактор трилистника TFF1 1» .

[7] Шатаньон А., Баллестар Э., Эстеллер М., Данте Р. (2010). «Роль белка 2 связывающего домена метил-CpG в модуляции эстрогенового ответа гена pS2/TFF1» . ПЛОС ОДИН . 5 (3): е9665. Бибкод : 2010PLoSO...5.9665C . дои : 10.1371/journal.pone.0009665 . ПМЦ 2837351 . ПМИД 20300195 .

[Järvå_2020-8] Jump up to: ^а ^б Ярво М.А., Лингфорд Дж.П., Джон А., Солер Н.М., Скотт Н.Е., Годдард-Боргер Э.Д. (май 2020 г.). «Факторы трилистника имеют общую лектиновую активность, которая определяет их роль в слизи» . Природные коммуникации . 11 (1): 2265. Бибкод : 2020NatCo..11.2265J . дои : 10.1038/s41467-020-16223-7 . ПМК 7221086 . ПМИД 32404934 .

[pmid_=_24190027-9] Фэн Г, Чжан Ю, Юань Х, Бай Р, Чжэн Дж, Чжан Дж, Сун М (январь 2014 г.). «Метилирование ДНК фактора трилистника 1 (TFF1) связано с онкогенезом рака желудка» . Представитель Мол Мед . 9 (1): 109–117. дои : 10.3892/ммр.2013.1772 . ПМИД 24190027 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]