Венделл Лим
Венделл Лим | |
---|---|
Национальность | Американский |
Альма-матер | Гарвардский университет , Массачусетский технологический институт |
Научная карьера | |
Поля | Биоинженерия |
Учреждения | Калифорнийский университет, Сан-Франциско |
Научные консультанты | Фред Ричардс [ 1 ] |
Венделл Лим Байера — американский биохимик, заслуженный профессор клеточной и молекулярной фармакологии в Калифорнийском университете в Сан-Франциско . [ 2 ] Он является директором Института проектирования ячеек UCSF. [ 3 ] Он получил степень бакалавра химии в Гарвардском университете, работая с Джереми Ноулзом над оптимизацией эволюции ферментов. Он получил докторскую степень. и Доктор биохимии биофизики Массачусетского технологического института под руководством Боба Зауэра, использующий генетические и биофизические подходы для понимания роли гидрофобных ядерных взаимодействий в сворачивании белков . [ 4 ] Затем он работал над докторской диссертацией вместе с Фредериком Ричардсом в Йельском университете над структурой доменов взаимодействия белков . [ 5 ] [ 6 ] Работа Лима была сосредоточена на передаче сигналов в клетках , синтетической биологии и клеточной инженерии , особенно в иммунных клетках . [ 7 ]
Исследовательская карьера
[ редактировать ]Модульные сигнальные белки
[ редактировать ]Исследования Лима были сосредоточены на механизмах клеточной сигнализации – как клетки воспринимают окружающую среду и обрабатывают эту информацию для принятия сложных функциональных решений. [ 6 ] Он начал свою карьеру с изучения структуры и функций модульных сигнальных доменов и каркасных белков , но все больше интересовался общим вопросом о том, как модульность играет роль в эволюции новых сигнальных цепей и сетей. [ 6 ]
Синтетическая и системная биология
[ редактировать ]Лим был пионером в области синтетической и системной биологии , задаваясь вопросом, как перепрограммирование клеточных регуляторных цепей можно использовать для понимания фундаментальных принципов проектирования биологических систем . Он показал, что сигнальные белки и пути могут быть функционально перепрограммированы в живых клетках с использованием измененных доменов взаимодействия белков, каркасных белков и модульных аллостерических взаимодействий . [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] Он помог пионером в использовании модулей оптогенетического ответа как способа осуществления контроля над внутриклеточной передачей сигналов и его использования в профилировании того, как клетки реагируют на временные закономерности стимуляции. [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] Он также работал над выявлением общих модулей регуляторной сети, которые выполняют фундаментальные клеточные функции, такие как усиление , адаптация , пространственная самоорганизация , поляризованное движение клеток и временное восприятие. [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] Он применял эти подходы для проектирования и понимания функций иммунных клеток, а также многоклеточной самоорганизации (синтетического развития). [ 18 ] [ 19 ]
Инженерные терапевтические иммунные клетки
[ редактировать ]Лим был лидером в применении подходов синтетической биологии к инженерии иммунных клеток и разработке клеточной терапии , пропагандируя подходы к прогнозной инженерии клеток с точными терапевтическими функциями для лечения рака и других сложных заболеваний . [ 20 ] [ 21 ] Его группа была первой, кто разработал низкомолекулярные химерные антигенные рецепторы (CAR). [ 22 ] а также очень гибкую синтетическую платформу рецепторов Notch (synNotch) для программирования новых схем контроля транскрипции . [ 23 ] [ 24 ] [ 25 ] Его группа показала, как эти компоненты можно использовать для разработки схем Т-клеток , которые обеспечивают точное комбинаторное обнаружение антигенов и уничтожение рака (схемы SynNotch для CAR). [ 24 ] [ 26 ] [ 27 ] Его группа также разработала Т-клетки, способные распознавать определенные ткани-мишени и доставлять генетически закодированные терапевтические нагрузки . в эти участки [ 25 ] Кроме того, группа Лима использовала эти синтетические рецепторы для разработки цепей положительной обратной связи для определения плотности антигена с нелинейными порогами. [ 28 ]
Лим был частью команды, которая изобрела систему CRISPRi, которая использовала модульное нацеливание ДНК на неактивный Cas9 для контроля транскрипции определенных эндогенных генов. [ 29 ] Он также занимался разработкой многоклеточных сетей, которые управляют специфическим формированием сложных самоорганизующихся тканеподобных структур. [ 18 ] Лим и его коллеги выступают за применение подходов клеточной инженерии ко многим другим сложным заболеваниям, помимо рака, а также к использованию сконструированных клеток в качестве исследовательских инструментов для исследования и нарушения регуляторных сетей клеток и тканей. [ 28 ]
Биотехнологическая промышленность
[ редактировать ]Работа Лима в области инженерии иммунных клеток привела к основанию в 2015 году компании Cell Design Labs, занимающейся разработкой ранней клеточной терапии, которая была приобретена Gilead Sciences в 2017 году. [ 30 ]
Научное образование и информационно-пропагандистская деятельность
[ редактировать ]является соавтором учебника Cell Signaling . Лим вместе с коллегами Брюсом Майером и Тони Поусоном [ 31 ] Его группа также участвовала в информационно-просветительской программе по синтетической биологии iGEM среди района залива Сан-Франциско . старшеклассников и учителей [ 32 ] [ 33 ] Он также вел творческие проекты по дизайн-мышлению . [ 34 ] а также наука и кулинария . [ 35 ]
Личная жизнь
[ редактировать ]Лим — американец китайского происхождения , вырос в Чикаго , где окончил лабораторные школы Чикагского университета . [ 36 ] В настоящее время он живет в Сан-Франциско с женой и детьми. Лим — заядлый баскетболист, серфер и художник. [ 6 ]
Награды и услуги
[ редактировать ]- Венский центр молекулярной медицины, лекция Ландштайнера (2021 г.) [ 37 ]
- Университет Орегона , лекция Штрайзингера (2020 г.) [ 38 ]
- Немецкое биохимическое общество, Премия Федора Линдена (2019) [ 39 ]
- NIH Transformative R01 («Перепроектирование Т-клетки») (2014) [ 40 ]
- Журнал Wired , 50 человек, которые изменят мир (2012) [ 41 ]
- Медицинского института Говарда Хьюза (2008–2020 гг.) Следователь [ 42 ]
- Премия Белкового общества Ханса Нейрата (2010) [ 43 ]
- поиска талантов Westinghouse в области науки (1982) Финалист [ 44 ]
- Редакционный совет журнала «Наука» [ 45 ]
- Редакционный совет, Ячейка [ 46 ]
- Фонд Burroughs Wellcome , Совет директоров [ 47 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Фред Ричардс на академическом дереве» .
- ^ «Профили UCSF» .
- ^ «Институт клеточного дизайна UCSF» . Институт проектирования ячеек UCSF . Проверено 28 июля 2022 г.
- ^ «Венделл Лим» . Проверено 1 ноября 2012 г.
- ^ «Венделл А. Лим, доктор философии». ХХМИ . Проверено 1 ноября 2012 г.
- ^ Jump up to: а б с д Седвик, К. (17 сентября 2012 г.). «Венделл Лим: Исследование неизбранного пути» . Журнал клеточной биологии . 198 (6): 956–957. дои : 10.1083/jcb.1986pi . ПМЦ 3444780 . ПМИД 22986491 .
- ^ «Исследования | Лим Лаборатория» . limlab.ucsf.edu . Проверено 29 июля 2022 г.
- ^ Пак Сан Хён; Зарринпар, Али; Лим, Венделл А. (14 февраля 2003 г.). «Перестройка путей MAP-киназы с использованием альтернативных механизмов сборки каркаса» . Наука . 299 (5609): 1061–1064. Бибкод : 2003Sci...299.1061P . дои : 10.1126/science.1076979 . ISSN 1095-9203 . ПМИД 12511654 . S2CID 1643040 .
- ^ Дубер, Джон Э.; Мирский, Итан А.; Лим, Венделл А. (июнь 2007 г.). «Разработка синтетических сигнальных белков со сверхчувствительным контролем ввода/вывода» . Природная биотехнология . 25 (6): 660–662. дои : 10.1038/nbt1308 . ISSN 1087-0156 . ПМИД 17515908 . S2CID 10465894 .
- ^ Да, Брайан Дж.; Рутильяно, Роберт Дж.; Деб, Анрика; Бар-Саги, Дафна; Лим, Венделл А. (31 мая 2007 г.). «Перестройка путей клеточной морфологии с помощью синтетических факторов обмена гуаниновых нуклеотидов» . Природа . 447 (7144): 596–600. Бибкод : 2007Natur.447..596Y . дои : 10.1038/nature05851 . ISSN 1476-4687 . ПМИД 17515921 . S2CID 4393136 .
- ^ Башор, Калеб Дж.; Хелман, Ной К.; Ян, Шуде; Лим, Венделл А. (14 марта 2008 г.). «Использование сконструированных каркасных взаимодействий для изменения динамики передачи сигналов пути MAP-киназы» . Наука . 319 (5869): 1539–1543. Бибкод : 2008Sci...319.1539B . дои : 10.1126/science.1151153 . ISSN 1095-9203 . ПМИД 18339942 . S2CID 365578 .
- ^ Левская, Ансельм; Вайнер, Орион Д.; Лим, Венделл А.; Фойгт, Кристофер А. (15 октября 2009 г.). «Пространственно-временной контроль клеточной передачи сигналов с использованием светопереключаемого взаимодействия белков» . Природа . 461 (7266): 997–1001. Бибкод : 2009Natur.461..997L . дои : 10.1038/nature08446 . ISSN 1476-4687 . ПМЦ 2989900 . ПМИД 19749742 .
- ^ Тетчер, Джаред Э.; Вайнер, Орион Д.; Лим, Венделл А. (5 декабря 2013 г.). «Использование оптогенетики для исследования динамического контроля передачи сигналов модулем Ras/Erk» . Клетка . 155 (6): 1422–1434. дои : 10.1016/j.cell.2013.11.004 . ISSN 1097-4172 . ПМЦ 3925772 . ПМИД 24315106 .
- ^ Бугай, Лукаш Дж.; О'Донохью, Джефф П.; Лим, Венделл А. (2 января 2017 г.). «Опрос клеточного восприятия и принятия решений с помощью оптогенетических инструментов» . Журнал клеточной биологии . 216 (1): 25–28. дои : 10.1083/jcb.201612094 . ISSN 1540-8140 . ПМЦ 5223619 . ПМИД 28003330 .
- ^ Ма, Вэньчжэ; Трусина, Ала; Эль-Самад, Хана; Лим, Венделл А.; Тан, Чао (21 августа 2009 г.). «Определение сетевых топологий, позволяющих добиться биохимической адаптации» . Клетка . 138 (4): 760–773. дои : 10.1016/j.cell.2009.06.013 . ISSN 1097-4172 . ПМК 3068210 . ПМИД 19703401 .
- ^ Жерарден, Жалин; Редди, Нишит Р.; Лим, Венделл А. (25 сентября 2019 г.). «Принципы проектирования биохимических таймеров: схемы, различающие временную и устойчивую стимуляцию» . Клеточные системы . 9 (3): 297–308.e2. дои : 10.1016/j.cels.2019.07.008 . ISSN 2405-4720 . ПМЦ 6763348 . ПМИД 31521602 .
- ^ Чау, Анджела Х.; Уолтер, Джессика М.; Жерарден, Жалин; Тан, Чао; Лим, Венделл А. (12 октября 2012 г.). «Разработка синтетических регуляторных сетей, способных к самоорганизации клеточной поляризации» . Клетка . 151 (2): 320–332. дои : 10.1016/j.cell.2012.08.040 . ISSN 1097-4172 . ПМЦ 3498761 . ПМИД 23039994 .
- ^ Jump up to: а б с Тода, Сатоши; Блаух, Лукас Р.; Тан, Синди Кентукки; Морсут, Леонардо; Лим, Венделл А. (13 июля 2018 г.). «Программирование самоорганизующихся многоклеточных структур с помощью синтетической межклеточной передачи сигналов» . Наука . 361 (6398): 156–162. Бибкод : 2018Sci...361..156T . дои : 10.1126/science.aat0271 . ISSN 1095-9203 . ПМК 6492944 . ПМИД 29853554 .
- ^ Тода, Сатоши; Маккейтан, Уэсли Л.; Хаккинен, Теему Дж.; Лопес, Пилар; Кляйн, Офир Д.; Лим, Венделл А. (16 октября 2020 г.). «Разработка синтетических морфогенных систем, которые могут программировать формирование многоклеточного паттерна» . Наука . 370 (6514): 327–331. Бибкод : 2020Sci...370..327T . дои : 10.1126/science.abc0033 . ISSN 1095-9203 . ПМЦ 7986291 . ПМИД 33060357 .
- ^ Лим, Венделл А. (июнь 2010 г.). «Проектирование индивидуальных схем сотовой сигнализации» . Обзоры природы. Молекулярно-клеточная биология . 11 (6): 393–403. дои : 10.1038/nrm2904 . ISSN 1471-0080 . ПМЦ 2975372 . ПМИД 20485291 .
- ^ Фишбах, Майкл А.; Блюстоун, Джеффри А.; Лим, Венделл А. (3 апреля 2013 г.). «Клеточная терапия: следующий столп медицины» . Наука трансляционной медицины . 5 (179): 179пс7. doi : 10.1126/scitranslmed.3005568 . ISSN 1946-6234 . ПМЦ 3772767 . ПМИД 23552369 .
- ^ Ву, Цзя-Юнг; Ройбал, Коле Т.; Пухнер, Элиас М.; Онуффер, Джеймс; Лим, Венделл А. (16 октября 2015 г.). «Дистанционное управление терапевтическими Т-клетками через небольшой управляемый молекулой химерный рецептор» . Наука . 350 (6258): ааб4077. Бибкод : 2015Sci...350.4077W . дои : 10.1126/science.aab4077 . ISSN 1095-9203 . ПМЦ 4721629 . ПМИД 26405231 .
- ^ Морсут, Леонардо; Ройбал, Коле Т.; Сюн, Синь; Гордли, Рассел М.; Койл, Скотт М.; Томсон, Мэтью; Лим, Венделл А. (11 февраля 2016 г.). «Разработка индивидуального поведения клеток и реагирования на них с использованием синтетических Notch-рецепторов» . Клетка . 164 (4): 780–791. дои : 10.1016/j.cell.2016.01.012 . ISSN 1097-4172 . ПМЦ 4752866 . ПМИД 26830878 .
- ^ Jump up to: а б Ройбал, Коле Т.; Рупп, Леви Дж.; Морсут, Леонардо; Уокер, Уитни Дж.; МакНелли, Криста А.; Парк, Джейсон С.; Лим, Венделл А. (11 февраля 2016 г.). «Точное распознавание опухолей Т-клетками с помощью комбинаторных антиген-чувствительных цепей» . Клетка . 164 (4): 770–779. дои : 10.1016/j.cell.2016.01.011 . ISSN 1097-4172 . ПМЦ 4752902 . ПМИД 26830879 .
- ^ Jump up to: а б Ройбал, Коле Т.; Уильямс, Джаспер З.; Морсут, Леонардо; Рупп, Леви Дж.; Колинько, Изабель; Чоу, Джозеф Х.; Уокер, Уитни Дж.; МакНелли, Криста А.; Лим, Венделл А. (06 октября 2016 г.). «Инженерия Т-клеток с индивидуальными программами терапевтического ответа с использованием синтетических рецепторов Notch» . Клетка . 167 (2): 419–432.e16. дои : 10.1016/j.cell.2016.09.011 . ISSN 1097-4172 . ПМК 5072533 . ПМИД 27693353 .
- ^ Уильямс, Джаспер З.; Аллен, Грег М.; Шах, Деван; Стерин, Игал С.; Ким, Ки Х.; Гарсия, Вивиан П.; Шави, Гэвин Э.; Ю, Вэй; Пуч-Саус, Кристина; Цой, Дженнифер; Рибас, Антони (27 ноября 2020 г.). «Программы точного распознавания Т-клеток, разработанные путем транскрипционного связывания нескольких рецепторов» . Наука . 370 (6520): 1099–1104. Бибкод : 2020Sci...370.1099W . дои : 10.1126/science.abc6270 . ISSN 1095-9203 . ПМК 8054651 . ПМИД 33243890 .
- ^ Чоу, Джозеф Х.; Часовщик Паял Б.; Симич, Милош С.; Гилберт, Райан Д.; Ли, Эйлин В.; Краснов, Нира А.; Дауни, Кира М.; Ю, Вэй; Каррера, Диего А.; Челли, Анна; Чо, Джухён (28 апреля 2021 г.). «Т-клетки SynNotch-CAR преодолевают проблемы специфичности, гетерогенности и устойчивости при лечении глиобластомы» . Наука трансляционной медицины . 13 (591): eabe7378. doi : 10.1126/scitranslmed.abe7378 . ISSN 1946-6242 . ПМЦ 8362330 . ПМИД 33910979 .
- ^ Jump up to: а б Еловиц, Майкл; Лим, Венделл А. (декабрь 2010 г.). «Постройте жизнь, чтобы понять ее» . Природа . 468 (7326): 889–890. Бибкод : 2010Natur.468..889E . дои : 10.1038/468889а . ISSN 1476-4687 . ПМК 3068207 . ПМИД 21164460 .
- ^ Ци, Лей С.; Ларсон, Мэтью Х.; Гилберт, Люк А.; Дудна, Дженнифер А.; Вайсман, Джонатан С.; Аркин, Адам П.; Лим, Венделл А. (04 февраля 2021 г.). «Перепрофилирование CRISPR в качестве РНК-ориентированной платформы для последовательно-специфического контроля экспрессии генов» . Клетка . 184 (3): 844. doi : 10.1016/j.cell.2021.01.019 . ISSN 1097-4172 . ПМИД 33545038 . S2CID 231809613 .
- ^ «Наука о стартапах | Журнал UCSF» . журнал.ucsf.edu . Проверено 29 июля 2022 г.
- ^ Торнер, Джереми (01 марта 2017 г.). «Передача клеточных сигналов: принципы и механизмы Венделла Лима, Брюса Майера и Тони Поусона» . Ежеквартальный обзор биологии . 92 (1): 105–106. дои : 10.1086/690882 . ISSN 0033-5770 .
- ^ Тэнси, Бернадетт (17 ноября 2007 г.). «Школьные биоволшебники открывают новые возможности в победе в соревнованиях» . СФГЕЙТ . Проверено 29 июля 2022 г.
- ^ Закари, Дж. Паскаль (18 ноября 2007 г.). «Английский язык, алгебра, физика… и биотехнологии» . Нью-Йорк Таймс . ISSN 0362-4331 . Проверено 29 июля 2022 г.
- ^ Бернштейн, Рэйчел (28 октября 2011 г.). «Бросьте эту пипетку: наука по замыслу» . Клетка . 147 (3): 496–497. дои : 10.1016/j.cell.2011.10.010 . ISSN 0092-8674 . ПМИД 22036559 . S2CID 13248964 .
- ^ «Лекция UCSF посвящена науке о еде | Калифорнийский университет в Сан-Франциско» . www.ucsf.edu . Проверено 29 июля 2022 г.
- ^ «Лабораторные школы Чикагского университета: выпускники » Выходные для выпускников » Премия «Восходящая звезда» за профессиональные достижения» . 11 ноября 2014 г. Архивировано из оригинала 11 ноября 2014 г. Проверено 29 июля 2022 г.
- ^ «15-я лекция Ландштайнера CeMM Венделла Лима и церемония вручения премии Дениз П. Барлоу 2021 года» . CeMM - Наука – наше лекарство! . Проверено 29 июля 2022 г.
- ^ «Венделл Лим выбран для участия в 34-й лекции памяти Джорджа Штрайзингера | Центр клеточного строительства» . ccc.ucsf.edu . Проверено 29 июля 2022 г.
- ^ «Лекция и медаль Федора Линена — домашняя страница Общества биохимии и молекулярной биологии eV» gbm-online.de . Проверено 29 июля 2022 г.
- ^ «Программа премий директора НИЗ за трансформационные исследования - финансируемые исследования» . commonfund.nih.gov . 27 июня 2013 г. Проверено 29 июля 2022 г.
- ^ «Умный список 2012: 50 человек, которые изменят мир» . Проводная Великобритания . ISSN 1357-0978 . Проверено 29 июля 2022 г.
- ^ «Венделл А. Лим» . ХХМИ . Проверено 29 июля 2022 г.
- ^ «Протеиновое общество: Награды Протеинового общества» . www.proteinsociety.org . Проверено 29 июля 2022 г.
- ^ «Научный поиск талантов 1982» . Общество науки . Проверено 29 июля 2022 г.
- ^ «Венделл Лим, доктор философии». www.science.org . Проверено 29 июля 2022 г.
- ^ «Редакция: Ячейка» . www.cell.com . Проверено 29 июля 2022 г.
- ^ «Совет БВФ» . Благотворительный фонд Берроуза . Проверено 29 июля 2022 г.