Пацифастин
| Пацифастин_I | |||
|---|---|---|---|
 Структура раствора малого ингибитора сериновой протеазы sgci[l30r, k31m] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Пацифастин_I | ||
| Пфам | PF05375 | ||
| ИнтерПро | ИПР008037 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1кг / ОБЛАСТЬ / СУПФАМ | ||
| |||
Пацифастин представляет собой семейство сериновых ингибиторов протеиназ, обнаруженных у членистоногих . [ 1 ] [ 2 ] Пацифастин ингибирует сериновые пептидазы трипсин и химотрипсин . [ 3 ]
Все члены пацифастина, которые были охарактеризованы на молекулярном уровне, представляют собой -предшественники пептиды , состоящие из N-концевой сигнальной последовательности, за которой следует домен-предшественник и различное количество ингибиторов доменов- . Каждый из этих доменов-ингибиторов несет в себе мотив из шести цистеина – см. ниже.
Первыми идентифицированными членами семейства были выделены от Locusta migratoria migratoria ( перелетная саранча ), которыми были HI, LMCI-1 (PMP-D2) и LMCI-2 (PMP-C). [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] Еще пять членов, от SGPI-1 до 5, были затем выделены из Schistocerca gregaria ( пустынная саранча ). [ 7 ] [ 8 ] а гетеродимерный ингибитор сериновой протеазы был выделен из гемолимфы Pacifastacus leniusculus ( сигнальный рак ) и назван пацифастином. [ 9 ]
Функция
[ редактировать ]Ингибиторы пептидных протеиназ во многих случаях синтезируются как часть более крупного белка- предшественника , называемого пропептидом или зимогеном , который остается неактивным до тех пор, пока домен-предшественник не отщепляется в лизосоме , причем домен-предшественник предотвращает доступ субстрата к активному сайту. пока не понадобится. Ингибиторы протеиназ, предназначенные для секреции, имеют дополнительный N-концевой домен сигнального пептида, который будет расщепляться сигнальной пептидазой. Удаление этих одного или двух N-концевых ингибиторных доменов либо путем взаимодействия со второй пептидазой, либо путем автокаталитического расщепления активирует зимоген. [ 3 ]
Очень мало известно об эндогенной функции пацифастиноподобных ингибиторов, за исключением того, что они могут играть роль в иммунитете членистоногих и в регуляции физиологических процессов, участвующих в насекомых размножении . [ 10 ]
Структура
[ редактировать ]Ингибирующая единица пацифастина представляет собой консервативную структуру из шести остатков цистеина (Cys1 – Xaa9–12 – Cys2 – Asn – Xaa – Cys3 – Xaa – Cys4 – Xaa2–3 – Gly – Xaa3–6 – Cys5 – Thr – Xaa3 – Cys6). . Детальный анализ трехмерной структуры показывает, что эти шесть остатков образуют три дисульфидных мостика (Cys1–4, Cys2–6, Cys3–5), придавая членам семейства пацифастина типичную укладку и замечательную стабильность. [ 11 ]
155 кДа, Пацифастин представляет собой белок массой состоящий из двух ковалентно связанных субъединиц, которые кодируются отдельно. Тяжелая цепь пацифастина (105 кДа) связана с трансферринами, поскольку несет три доли трансферрина , две из которых, по-видимому, активны в железа связывании . [ 9 ] Ряд членов семейства трансферринов также являются сериновыми пептидазами и принадлежат к семейству пептидаз MEROPS S60 ( INTERPRO ). Легкая цепь пацифастина (44 кДа) представляет собой субъединицу, ингибирующую протеиназу, и состоит из девяти богатых цистеином ингибирующих доменов , гомологичных друг другу. Ингибиторы саранчи имеют общий консервативный набор из шести остатков с легкой цепью пацифастина. Структура членов этого семейства показывает , что они состоят из трехцепочечного антипараллельного бета-листа, соединенного тремя дисульфидными мостиками. [ 9 ]
Это семейство ингибиторов сериновых протеаз принадлежит к семейству ингибиторов MEROPS I19, клану IW. Они ингибируют химотрипсин , пептидазу, принадлежащую к семейству S1 ( ИНТЕРПРО ). [ 1 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Роулингс Н.Д., Толле Д.П., Барретт А.Дж. (2004). «Эволюционные семейства ингибиторов пептидаз» . Биохим Дж . 378 (Часть 3): 705–16. дои : 10.1042/BJ20031825 . ПМК 1224039 . ПМИД 14705960 .
- ^ Брейгельманс Б., Симонет Г., ван Хоф В., Ван Соест С., Ванден Брук Дж. (2009). «Пептиды, родственные пацифастину: структурные и функциональные характеристики семейства ингибиторов сериновой пептидазы». Пептиды . 30 (3): 622–32. doi : 10.1016/j.peptides.2008.07.026 . ПМИД 18775459 . S2CID 8797134 .
- ^ Jump up to: а б Паркинсон Н.М., Коньерс С., Кин Дж., МакНиколл А., Смит И., Одсли Н. и др. (2004). «К всестороннему взгляду на первичную структуру белков яда паразитоидной осы Pimpla hypochondriaca». Насекомое Биохимия Мол Биол . 34 (6): 565–71. дои : 10.1016/j.ibmb.2004.03.003 . ПМИД 15147757 .
- ^ Бойгегрейн Р.А., Маттрас Х., Бреелен М., Паруто П., Колетти-Превьеро М.А. (декабрь 1992 г.). «Иммунитет насекомых: два ингибитора протеиназ из гемолимфы Locusta migratoria». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 189 (2): 790–3. дои : 10.1016/0006-291x(92)92271-x . ПМИД 1472051 .
- ^ Накакура Н., Хиттер Х., Ван Дорселер А., Луу Б. (февраль 1992 г.). «Выделение и структурное определение трех пептидов из насекомых Locusta migratoria. Идентификация дезоксигексозно-связанного пептида». Евро. Дж. Биохим . 204 (1): 147–53. дои : 10.1111/j.1432-1033.1992.tb16617.x . ПМИД 1740125 .
- ^ Бойгререн Р.А., Пуньер М., Паруто П., Кастро Б., Бреелин М. (февраль 2000 г.). «Низкомолекулярные ингибиторы сериновых протеаз насекомых представляют собой белки с высококонсервативными последовательностями». Биохимия насекомых. Мол. Биол . 30 (2): 145–52. дои : 10.1016/s0965-1748(99)00109-5 . ПМИД 10696590 .
- ^ Хамдауи А., Ваталеб С., Девриз Б., Чиу С.Дж., Ванден Брук Дж., Ван Беумен Дж., Де Луф А., Шуфс Л. (январь 1998 г.). «Очистка и характеристика группы из пяти новых пептидных ингибиторов сериновой протеазы из яичников пустынной саранчи Schistocerca gregaria». ФЭБС Летт . 422 (1): 74–8. дои : 10.1016/s0014-5793(97)01585-8 . ПМИД 9475173 . S2CID 35980008 .
- ^ Гаспари З., Пэтти А., Граф Л., Перцель А. (январь 2002 г.). «Сравнительный структурный анализ ингибиторов протеиназ пустынной саранчи Schistocerca gregaria» . Евро. Дж. Биохим . 269 (2): 527–37. дои : 10.1046/j.0014-2956.2001.02685.x . ПМИД 11856311 .
- ^ Jump up to: а б с Лян З., Соттруп-Йенсен Л., Аспан А., Холл М., Сёдерхалл К. (июнь 1997 г.). «Пацифастин, новый гетеродимерный ингибитор протеиназы 155 кДа, содержащий уникальную цепь трансферрина» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (13): 6682–7. Бибкод : 1997PNAS...94.6682L . дои : 10.1073/pnas.94.13.6682 . ПМК 21218 . ПМИД 9192625 .
- ^ Ван С, Цуй З, Лю Ю, Ли Ц, Сун С (2012). «Первый гомолог предшественника пацифастина у плавающего краба (Portunus trituberculatus): характеристика и потенциальная роль в иммунном ответе на бактерии и грибы». Рыба Моллюски Иммунол . 32 (2): 331–8. дои : 10.1016/j.fsi.2011.11.025 . ПМИД 22154999 .
- ^ Брейгельманс Б., Симонет Г., ван Хоф В., Ван Соест С., Смагге Г., Ванден Брук Дж. (2009). «Чешуекрылый пацифастин: клонирование, структура гена, рекомбинантное производство, профилирование транскриптов и активность in vitro». Насекомое Биохимия Мол Биол . 39 (7): 430–9. дои : 10.1016/j.ibmb.2009.03.005 . ПМИД 19364530 .