Вырез 2

ВЫРЕЗКА2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2OO4
Идентификаторы
Псевдонимы	NOTCH2 , AGS2, HJCYS, hN2, Notch-2, Notch 2, Notch-рецептор 2
Внешние идентификаторы	Опустить : 600275 ; МГИ : 97364 ; Гомологен : 7865 ; GeneCards : NOTCH2 ; OMA : NOTCH2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	120,100,779 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	98,057,677 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	retinal pigment epithelium; ; skin of hip; ; skin of thigh; ; ventricular zone; ; synovial joint; ; caput epididymis; ; vulva; ; lactiferous duct; ; tail of epididymis; ; skin of arm;
	Top expressed in
	ciliary body; ; retinal pigment epithelium; ; aortic valve; ; ascending aorta; ; vas deferens; ; vestibular sensory epithelium; ; cumulus cell; ; conjunctival fornix; ; epithelium of lens; ; molar;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	calcium ion binding; protein binding; signaling receptor activity;
Cellular component	cytoplasm; integral component of membrane; endoplasmic reticulum membrane; membrane; Golgi membrane; receptor complex; plasma membrane; integral component of plasma membrane; nucleoplasm; extracellular region; cell surface; nucleus;
Biological process	Notch signaling pathway; cell differentiation; hemopoiesis; pulmonary valve morphogenesis; regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of Ras protein signal transduction; negative regulation of apoptotic process; marginal zone B cell differentiation; transcription, DNA-templated; nervous system development; stem cell population maintenance; multicellular organism development; atrial septum morphogenesis; regulation of developmental process; bone remodeling; animal organ morphogenesis; transcription initiation from RNA polymerase II promoter; Notch signaling involved in heart development; apoptotic process; cell fate determination; intracellular receptor signaling pathway; negative regulation of gene expression; negative regulation of growth rate; positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; regulation of osteoclast development; positive regulation of keratinocyte proliferation; regulation of actin cytoskeleton reorganization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4853
	18129
	ENSG00000134250
	ENSMUSG00000027878
	Q04721
	О35516
	НМ_001200001 ; НМ_024408
	НМ_010928
	НП_001186930 ; НП_077719
	НП_035058
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок-гомолог нейрогенного локуса notch 2 ( Notch 2 ) представляет собой белок , который у человека кодируется NOTCH2 геном . ^{[ 5 ]}

NOTCH2 связан с синдромом Алажилля ^{[ 6 ]} и синдром Хайду-Чейни . ^{[ 7 ]}

Функция

Notch 2 является членом семейства Notch . Члены этого семейства трансмембранных белков типа 1 имеют общие структурные характеристики, включая внеклеточный домен, состоящий из множества повторов, подобных эпидермальному фактору роста ( EGF ), и внутриклеточный домен, состоящий из множества различных типов доменов. Члены семейства Notch играют роль во множестве процессов развития, контролируя решения о судьбе клеток. Сигнальная сеть Notch представляет собой эволюционно консервативный межклеточный сигнальный путь, который регулирует взаимодействия между физически соседними клетками. У дрозофилы взаимодействие notch с его связанными с клеткой лигандами (дельта, зубчатым) устанавливает межклеточный сигнальный путь, который играет ключевую роль в развитии. Гомологи Notch-лигандов также были идентифицированы у человека, но точные взаимодействия между этими лигандами и человеческими гомологами Notch еще предстоит определить. Этот белок расщепляется в транс-сети Гольджи и представлен на поверхности клетки в виде гетеродимера. Этот белок действует как рецептор для мембраносвязанных лигандов и может играть роль в развитии сосудов, почек и печени. ^{[ 8 ]}

мутации в последнем кодирующем экзоне Notch2 , которые удаляют домен PEST и избегают нонсенс-опосредованного распада мРНК, Было показано, что являются основной причиной синдрома Хайду-Чейни . ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Взаимодействия

Было показано, что NOTCH2 взаимодействует с:

Дельта-подобный 1 ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}
ГСК3Б , ^{[ 15 ]}
Я 1 , ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 16 ]} и
МЕ2 . ^{[ 13 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000134250 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027878 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ларссон С., Ларделли М., Уайт И., Лендал У. (май 1995 г.). «Гены NOTCH1, 2 и 3 человека расположены в положениях хромосом 9q34, 1p13-p11 и 19p13.2-p13.1 в областях транслокации, связанной с неоплазией». Геномика . 24 (2): 253–8. дои : 10.1006/geno.1994.1613 . ПМИД 7698746 .
^ Самеджима Х., Тории К., Косаки Р., Куросава К., Ёшихаси Х., Муроя К., Окамото Н., Ватанабе Ю., Кошо Т., Кубота М., Мацуда О., Гото М., Изуми К., Такахаси Т., Косаки К. (2007). «Скрининг мутаций синдрома Алажилля в генах JAG1 и NOTCH2 с использованием денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии». Жене. Тест . 11 (3): 216–27. дои : 10.1089/gte.2006.0519 . ПМИД 17949281 .
^ Симпсон М.А., Ирвинг М.Д., Асилмаз Э., Грей М.Дж., Дафу Д., Элмсли Ф.В., Мансур С., Холдер С.Е., Брэйн К.Э., Бертон Б.К., Ким К.Х., Паули Р.М., Афтимос С., Стюарт Х., Ким К.А., Холдер-Эспинасс М., Робертсон С.П., Дрейк В.М., Трембат RC (6 марта 2011 г.). «Мутации в NOTCH2 вызывают синдром Хайду-Чейни, заболевание, характеризующееся тяжелой и прогрессирующей потерей костной массы». Природная генетика . 43 (4): 303–5. дои : 10.1038/ng.779 . ПМИД 21378985 . S2CID 205357391 .
^ «Ген Энтреза: гомолог 2 NOTCH2 Notch (дрозофила)» .
^ Симпсон М.А., Ирвинг М.Д., Асилмаз Э., Грей М.Дж., Дафу Д., Элмсли Ф.В., Мансур С., Холдер С.Е. и др. (2011). «Мутации в NOTCH2 вызывают синдром Хайду-Чейни, заболевание, характеризующееся тяжелой и прогрессирующей потерей костной массы». Природная генетика . 43 (4): 303–305. дои : 10.1038/ng.779 . ПМИД 21378985 . S2CID 205357391 .
^ Исидор Б, Линденбаум П, Пишон О, Безье С, Дина С, Жакмон С, Мартен-Куаньяр Д, Товен-Робине С, Ле Меррер М, Мандель ЖЛ, Давид А, Фавр Л, Кормье-Дэр В, Редон Р, Ле Канек С (2011). «Укороченные мутации в последнем экзоне NOTCH2 вызывают редкое заболевание скелета, связанное с остеопорозом». Природная генетика . 43 (4): 306–8. дои : 10.1038/ng.778 . ПМИД 21378989 . S2CID 205357384 .
^ Маевски Дж., Шварцентрубер Дж.А., Какере А., Патри Л., Маркадье Дж., Фринс Дж.П., Бойкот К.М., Сте-Мари Л.Г., Маккирнан Ф.Е., Марик И., Ван Эш Х., Мишо Дж.Л., Сэмюэлс М.Э. (2011). «Мутации в NOTCH2 в семьях с синдромом Хайду-Чейни» . Хум Мутат . 32 (10): 1114–7. дои : 10.1002/humu.21546 . ПМИД 21681853 . S2CID 39342783 .
^ Jump up to: ^а ^б Симидзу К., Тиба С., Сайто Т., Кумано К., Такахаси Т., Хираи Х. (июль 2001 г.). «Маниакальная граница и безумная граница модифицируют разные участки внеклеточной области Notch2, что приводит к разной модуляции передачи сигналов» . Ж. Биол. Хим . 276 (28): 25753–8. дои : 10.1074/jbc.M103473200 . ПМИД 11346656 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Симидзу К., Тиба С., Хосоя Н., Кумано К., Сайто Т., Курокава М., Канда Ю., Хамада Ю., Хираи Х. (сентябрь 2000 г.). «Связывание Delta1, Jagged1 и Jagged2 с Notch2 быстро индуцирует расщепление, ядерную транслокацию и гиперфосфорилирование Notch2» . Мол. Клетка. Биол . 20 (18): 6913–22. дои : 10.1128/mcb.20.18.6913-6922.2000 . ПМЦ 88767 . ПМИД 10958687 .
^ Блаумюллер СМ, Ци Х, Загурас П, Артаванис-Цаконас С (июль 1997 г.). «Внутриклеточное расщепление Notch приводит к образованию гетеродимерного рецептора на плазматической мембране» . Клетка . 90 (2): 281–91. дои : 10.1016/s0092-8674(00)80336-0 . ПМИД 9244302 . S2CID 16544864 .
^ Эспиноза Л., Инглес-Эстев Дж., Агилера С., Бигас А. (август 2003 г.). «Фосфорилирование киназой гликогенсинтазы-3 бета снижает активность Notch, что является связующим звеном между путями Notch и Wnt» . Ж. Биол. Хим . 278 (34): 32227–35. дои : 10.1074/jbc.M304001200 . ПМИД 12794074 .
^ Симидзу К., Тиба С., Кумано К., Хосоя Н., Такахаси Т., Канда Ю., Хамада Ю., Язаки Ю., Хираи Х. (ноябрь 1999 г.). «Мышь jagged1 физически взаимодействует с notch2 и другими рецепторами notch. Оценка количественными методами» . Ж. Биол. Хим . 274 (46): 32961–9. дои : 10.1074/jbc.274.46.32961 . ПМИД 10551863 .

Дальнейшее чтение

Артаванис-Цаконас С., Рэнд, доктор медицинских наук, Лейк Р.Дж. (1999). «Передача сигналов Notch: контроль судьбы клеток и интеграция сигналов в развитии». Наука . 284 (5415): 770–6. Бибкод : 1999Sci...284..770A . дои : 10.1126/science.284.5415.770 . ПМИД 10221902 . S2CID 16790253 .
Кодзика С., Гриффин Джей.Д. (2001). «Рецепторы Notch и кроветворение» . Эксп. Гематол . 29 (9): 1041–52. дои : 10.1016/S0301-472X(01)00676-2 . ПМИД 11532344 .
Шварцмайер Дж.Д., Хубманн Р., Дюхлер М., Ягер У., Шехата М. (2005). «Регуляция экспрессии CD23 с помощью Notch2 при В-клеточном хроническом лимфоцитарном лейкозе». Лейк. Лимфома . 46 (2): 157–65. дои : 10.1080/10428190400010742 . ПМИД 15621797 . S2CID 36863790 .
Стифани С., Блаумюллер С.М., Рыжий Нью-Джерси, Хилл Р.Э., Артаванис-Цаконас С. (1993). «Человеческие гомологи энхансера продукта расщепленного гена дрозофилы определяют новое семейство ядерных белков». Нат. Жене . 2 (2): 119–27. дои : 10.1038/ng1092-119 . ПМИД 1303260 . S2CID 32142845 .
Кацанис Н., Фитцгиббон Дж., Фишер Э.М. (1996). «Картирование паралогии: идентификация области в MHC человека, триплицированной на хромосомах 1 и 9 человека, позволяет прогнозировать и изолировать новые локусы PBX и NOTCH». Геномика . 35 (1): 101–8. дои : 10.1006/geno.1996.0328 . ПМИД 8661110 .
Се Дж.Дж., Нофцигер Д.Э., Вайнмастер Г., Хейворд С.Д. (1997). «Имортализация вируса Эпштейна-Барра: Notch2 взаимодействует с CBF1 и блокирует дифференцировку» . Дж. Вирол . 71 (3): 1938–45. дои : 10.1128/JVI.71.3.1938-1945.1997 . ЧВК 191274 . ПМИД 9032325 .
Блаумюллер СМ, Ци Х, Загурас П, Артаванис-Цаконас С (1997). «Внутриклеточное расщепление Notch приводит к образованию гетеродимерного рецептора на плазматической мембране» . Клетка . 90 (2): 281–91. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80336-0 . ПМИД 9244302 . S2CID 16544864 .
Бигас А., Мартин Д.И., Милнер Л.А. (1998). «Notch1 и Notch2 ингибируют миелоидную дифференцировку в ответ на различные цитокины» . Мол. Клетка. Биол . 18 (4): 2324–33. дои : 10.1128/mcb.18.4.2324 . ПМК 121486 . ПМИД 9528802 .
Березовская О., Ся М.К., Хайман Б.Т. (1998). «Notch экспрессируется в мозге взрослых, коэкспрессируется с пресенилином-1 и изменяется при болезни Альцгеймера». Дж. Нейропатол. Эксп. Нейрол . 57 (8): 738–45. дои : 10.1097/00005072-199808000-00003 . ПМИД 9720489 . S2CID 23509744 .
Грей Дж.Э., Манн Р.С., Мициадис Э., Энрике Д., Карканджиу М.Л., Бэнкс А., Лейман Дж., Уорд Д., Иш-Горовиц Д., Артаванис-Цаконас С. (1999). «Человеческие лиганды рецептора Notch» . Являюсь. Дж. Патол . 154 (3): 785–94. дои : 10.1016/S0002-9440(10)65325-4 . ПМК 1866435 . ПМИД 10079256 .
Симидзу К., Тиба С., Кумано К., Хосоя Н., Такахаши Т., Канда Ю., Хамада Ю., Язаки Ю., Хираи Х. (2000). «Мышь jagged1 физически взаимодействует с notch2 и другими рецепторами notch. Оценка количественными методами» . Ж. Биол. Хим . 274 (46): 32961–9. дои : 10.1074/jbc.274.46.32961 . ПМИД 10551863 .
Симидзу К., Тиба С., Хосоя Н., Кумано К., Сайто Т., Курокава М., Канда Ю., Хамада Ю., Хираи Х. (2000). «Связывание Delta1, Jagged1 и Jagged2 с Notch2 быстро индуцирует расщепление, ядерную транслокацию и гиперфосфорилирование Notch2» . Мол. Клетка. Биол . 20 (18): 6913–22. дои : 10.1128/MCB.20.18.6913-6922.2000 . ПМЦ 88767 . ПМИД 10958687 .
Ву Л, Астер Дж.К., Блэклоу С.С., Лейк Р., Артаванис-Цаконас С., Гриффин Дж.Д. (2001). «MAML1, человеческий гомолог вдохновителя дрозофилы, является коактиватором транскрипции рецепторов NOTCH». Нат. Жене . 26 (4): 484–9. дои : 10.1038/82644 . ПМИД 11101851 . S2CID 23335042 .
Шриуранпонг В., Борхес М.В., Рави Р.К., Арнольд Д.Р., Нелькин Б.Д., Бэйлин С.Б., Болл Д.В. (2001). «Передача сигналов Notch индуцирует остановку клеточного цикла в клетках мелкоклеточного рака легких». Рак Рез . 61 (7): 3200–5. ПМИД 11306509 .
Симидзу К., Чиба С., Сайто Т., Кумано К., Такахаси Т., Хираи Х. (2001). «Маниакальная граница и безумная граница модифицируют разные участки внеклеточной области Notch2, что приводит к разной модуляции передачи сигналов» . Ж. Биол. Хим . 276 (28): 25753–8. дои : 10.1074/jbc.M103473200 . ПМИД 11346656 .
Саксена М.Т., Шретер Э.Х., Мумм Дж.С., Копан Р. (2001). «Мышиные гомологи notch (N1-4) подвергаются пресенилин-зависимому протеолизу» . Ж. Биол. Хим . 276 (43): 40268–73. дои : 10.1074/jbc.M107234200 . ПМИД 11518718 .
Английский-Эстев Дж., Эспиноза Л., Милнер Л.А., Целлес С., Бигас А. (2002). «Фосфорилирование Ser2078 модулирует функцию Notch2 при дифференцировке клеток 32D» . Ж. Биол. Хим . 276 (48): 44873–80. дои : 10.1074/jbc.M104703200 . ПМИД 11577080 .

Внешние ссылки

Запись GeneReviews/NCBI/UW/NIH о синдроме Алажиля
Записи OMIM о синдроме Алажиля
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q04721 (белок-гомолог нейрогенного локуса notch 2) на PDBe-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000134250 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027878 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7698746-5] Ларссон С., Ларделли М., Уайт И., Лендал У. (май 1995 г.). «Гены NOTCH1, 2 и 3 человека расположены в положениях хромосом 9q34, 1p13-p11 и 19p13.2-p13.1 в областях транслокации, связанной с неоплазией». Геномика . 24 (2): 253–8. дои : 10.1006/geno.1994.1613 . ПМИД 7698746 .

[pmid17949281-6] Самеджима Х., Тории К., Косаки Р., Куросава К., Ёшихаси Х., Муроя К., Окамото Н., Ватанабе Ю., Кошо Т., Кубота М., Мацуда О., Гото М., Изуми К., Такахаси Т., Косаки К. (2007). «Скрининг мутаций синдрома Алажилля в генах JAG1 и NOTCH2 с использованием денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии». Жене. Тест . 11 (3): 216–27. дои : 10.1089/gte.2006.0519 . ПМИД 17949281 .

[pmid21378985-7] Симпсон М.А., Ирвинг М.Д., Асилмаз Э., Грей М.Дж., Дафу Д., Элмсли Ф.В., Мансур С., Холдер С.Е., Брэйн К.Э., Бертон Б.К., Ким К.Х., Паули Р.М., Афтимос С., Стюарт Х., Ким К.А., Холдер-Эспинасс М., Робертсон С.П., Дрейк В.М., Трембат RC (6 марта 2011 г.). «Мутации в NOTCH2 вызывают синдром Хайду-Чейни, заболевание, характеризующееся тяжелой и прогрессирующей потерей костной массы». Природная генетика . 43 (4): 303–5. дои : 10.1038/ng.779 . ПМИД 21378985 . S2CID 205357391 .

[entrez-8] «Ген Энтреза: гомолог 2 NOTCH2 Notch (дрозофила)» .

[9] Симпсон М.А., Ирвинг М.Д., Асилмаз Э., Грей М.Дж., Дафу Д., Элмсли Ф.В., Мансур С., Холдер С.Е. и др. (2011). «Мутации в NOTCH2 вызывают синдром Хайду-Чейни, заболевание, характеризующееся тяжелой и прогрессирующей потерей костной массы». Природная генетика . 43 (4): 303–305. дои : 10.1038/ng.779 . ПМИД 21378985 . S2CID 205357391 .

[10] Исидор Б, Линденбаум П, Пишон О, Безье С, Дина С, Жакмон С, Мартен-Куаньяр Д, Товен-Робине С, Ле Меррер М, Мандель ЖЛ, Давид А, Фавр Л, Кормье-Дэр В, Редон Р, Ле Канек С (2011). «Укороченные мутации в последнем экзоне NOTCH2 вызывают редкое заболевание скелета, связанное с остеопорозом». Природная генетика . 43 (4): 306–8. дои : 10.1038/ng.778 . ПМИД 21378989 . S2CID 205357384 .

[pmid21681853-11] Маевски Дж., Шварцентрубер Дж.А., Какере А., Патри Л., Маркадье Дж., Фринс Дж.П., Бойкот К.М., Сте-Мари Л.Г., Маккирнан Ф.Е., Марик И., Ван Эш Х., Мишо Дж.Л., Сэмюэлс М.Э. (2011). «Мутации в NOTCH2 в семьях с синдромом Хайду-Чейни» . Хум Мутат . 32 (10): 1114–7. дои : 10.1002/humu.21546 . ПМИД 21681853 . S2CID 39342783 .

[pmid11346656-12] Jump up to: ^а ^б Симидзу К., Тиба С., Сайто Т., Кумано К., Такахаси Т., Хираи Х. (июль 2001 г.). «Маниакальная граница и безумная граница модифицируют разные участки внеклеточной области Notch2, что приводит к разной модуляции передачи сигналов» . Ж. Биол. Хим . 276 (28): 25753–8. дои : 10.1074/jbc.M103473200 . ПМИД 11346656 .

[pmid10958687-13] Jump up to: ^а ^б ^с Симидзу К., Тиба С., Хосоя Н., Кумано К., Сайто Т., Курокава М., Канда Ю., Хамада Ю., Хираи Х. (сентябрь 2000 г.). «Связывание Delta1, Jagged1 и Jagged2 с Notch2 быстро индуцирует расщепление, ядерную транслокацию и гиперфосфорилирование Notch2» . Мол. Клетка. Биол . 20 (18): 6913–22. дои : 10.1128/mcb.20.18.6913-6922.2000 . ПМЦ 88767 . ПМИД 10958687 .

[pmid9244302-14] Блаумюллер СМ, Ци Х, Загурас П, Артаванис-Цаконас С (июль 1997 г.). «Внутриклеточное расщепление Notch приводит к образованию гетеродимерного рецептора на плазматической мембране» . Клетка . 90 (2): 281–91. дои : 10.1016/s0092-8674(00)80336-0 . ПМИД 9244302 . S2CID 16544864 .

[pmid12794074-15] Эспиноза Л., Инглес-Эстев Дж., Агилера С., Бигас А. (август 2003 г.). «Фосфорилирование киназой гликогенсинтазы-3 бета снижает активность Notch, что является связующим звеном между путями Notch и Wnt» . Ж. Биол. Хим . 278 (34): 32227–35. дои : 10.1074/jbc.M304001200 . ПМИД 12794074 .

[pmid10551863-16] Симидзу К., Тиба С., Кумано К., Хосоя Н., Такахаси Т., Канда Ю., Хамада Ю., Язаки Ю., Хираи Х. (ноябрь 1999 г.). «Мышь jagged1 физически взаимодействует с notch2 и другими рецепторами notch. Оценка количественными методами» . Ж. Биол. Хим . 274 (46): 32961–9. дои : 10.1074/jbc.274.46.32961 . ПМИД 10551863 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

v т и Сигнальный путь : сигнальный путь Notch
Receptor on signaling cell	Delta DLL1 DLL3 DLL4
Ligand	Jagged JAG1 JAG2
Receptor on receiving cell	Notch 1 Notch 2 Notch 3 Notch 4