Rab2b
| Rab2b | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | Rab2b , семейство ras oncogene, белок, связывающий белок GTP-GTP, белок | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Омим : 607466 ; MGI : 1923588 ; Гомологен : 23789 ; Genecards : Rab2b ; OMA : Rab2b - ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викидид | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Связанный с RAS белок Rab-2b является белком , который у людей кодируется Rab2b геном .
RAB2B необходим для транспорта белка от эндоплазматической ретикулумы в комплекс Гольджи . Он принадлежит к небольшому суперсемейству GTPase , в частности, к семейству Rab Protein. [ 5 ] Небольшие GTPases - это тип ферментов гидролазы, которые могут прикрепляться к GTP с образованием ВВП. Этот процесс делает небольшие GTPases активными при связывании с GTP и неактивным при связи с ВВП. В этом небольшом суперсемействе GTPase мы можем найти подсемейство RAS. Эта семья разделена на 5 групп: Ras, Rho, Ran, Rab и ARF GTPases. Основной функцией Rab2B является регулирование транспорта пузырьков и слияние мембраны.
Структура
[ редактировать ]RAB2B - это белок человека, чей ген расположен в четырнадцатой хромосоме. Он имеет ядро, сделанное из основных элементов, таких как кислород, углерод, азот и фосфор. Его вторичная структура содержит восемь альфа -спираль и шесть бета -пряди. Более того, он прикрепил ион магния и ВВП. [ 6 ]
Зрелый Rab2b содержит три посттрансляционных модификации , фосфосерин обнаружен в месте 202 вместо нормального серина, и две липидации в местах 215-216 можно найти . Он имеет мотив домен между аминокислотами 35 и 43.
Из -за альтернативного сплайсинга существуют две изоформы этого же белка. Изоформа 1 является канонической последовательности, что означает, что она наиболее распространена, имеющая молекулярную массу 24 214 Да. [ 7 ] Изоформа 2 состоит только из 151 аминокислоты, имея массу 16 667 DA.
Функция
[ редактировать ]Небольшие GTPases суперсемейства RAB признаны ключевыми игроками белкового механизма, участвующего в везикулярном транспорте [ 8 ] и динамика органелл в эукариотических клетках. RAB2B следует в основном экзоцитарными путями, от эндоплазматической ретикулумы до комплекса Гольджи. Белки Rab участвуют в стыковке и слиянии транспортных везикул с их целевыми мембранами. Эти белки связываются с эффекторными белками (Garil4 и Garil5) с созданием комплексов.
Чтобы выполнить свою биологическую функцию, RAB2B должен переключиться от формы ВВП на форму GTP, и это возможно благодаря катализации белков GEF, которые являются факторами обмена гуанином. С другой стороны, когда Rab2b неактивны в цитозоле, форма GDP поддерживается из -за взаимодействия с белками GDI, которые являются белками диссоциации GDP. [ 9 ]
Исследования также показали, что Rab2b влияет на антивирусный ответ IFN , который индуцируется цитозольной ДНК. Из -за этого дефицит Rab2b позволяет вирус вакцинии воспроизводить . После стимуляции ДНК RAB2B прикрепляется к аппарату Гольджи, наряду со стимулятором генов интерферонов (укус) , нисходящего сигнального медиатора CGA. Чтобы Rab2b придерживался аппарата Гольджи, требуется GTP-активность Rab2B, а также для набора Garil5, чтобы образовался комплекс Rab2b-Garil5. Также показано, что дефицит Garil5 влияет на противовирусную реакцию IFN, что указывает на то, что весь комплекс Rab2B-Garil5 регулирует ось сигнальной нажима CGAS , что способствует реакциям IFN против цитозольной ДНК ( ДНК-вирусы ). [ 10 ]
Нокдаун изоформы RAB2B влияет на морфологию комплекса Гольджи у млекопитающих, что вызывает его фрагментацию. [ 11 ] Несмотря на то, что эти белки семейства RAB очень гомологичны друг другу ( Rab2a и Rab2b имеют 85,8% аминокислотной идентичности), нокдаун любого из них (от Rab1a до Rab8a) заставляет комплекс Гольджи рассеиваться через цитоплазму клетки. Из-за этого комплекс Rab2b-Garil5 прекращает функционировать должным образом, влияя на IFN реакцию [ 10 ] и усиление репликации многих вирусов, как видно ранее.
Распределение тканей
[ редактировать ]Паттерн экспрессии гена Rab2b человека выявляет транскрипт в почках, простате, легких, тимусе и толстой кишке, а также более низкий уровень экспрессии в плаценте, поджелудочной железе и скелетных мышцах. Более того, показано, что транскрипт чрезмерной экспрессируется при аденокарциноме толстой кишки , а также рак поджелудочной железы. [ 12 ] Это наблюдение влечет за собой, что этот белок может иметь тесную связь с опухолями толстой кишки. [ 13 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000129472 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000022159 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ «RAB2B - RAS -связанный белок Rab -2b - Homo sapiens (Human) - Gene & Protein» . www.uniprot.org . Получено 2019-10-18 .
- ^ «ICN3D: веб-3D-структура просмотра» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 2019-10-26 .
- ^ "Rab2b (человек)" . www.phosphosite.org . Получено 2019-10-26 .
- ^ Мартинес О, Гауд Б (август 1998 г.). "Rab Proteins" . Biochemica et Biophysica Acta (BBA) - исследования молекулярных клеток . 1404 (1–2): 101–12. Doi : 10.1016/s0167-489 (98) 00050-0 . PMID 9714762 .
- ^ Мартинес, Оливье; Goud, Bruno (1998-08-14). "Rab Proteins " Клеточные исследования 1404 (1): 101–112. два 10.1016/S0167-4889(98)00050-0: ISSN 0167-4 9714762PMID
- ^ Jump up to: а беременный Такахама М., Фукуда М., Обаяши Н., Козаки Т., Мисава Т., Окамото Т. и др. (Сентябрь 2017). «Комплекс Rab2b-Garil5 способствует цитозольной ДНК-индуцированной врожденной иммунной реакции» . Сотовые отчеты . 20 (12): 2944–2954. doi : 10.1016/j.celrep.2017.08.085 . PMC 5614515 . PMID 28930687 .
- ^ Aizawa M, Fukuda M (сентябрь 2015 г.). «Small GTPase RAB2B и его специфический связывающий белок, ассоциированное на GOLG-ассоциированном RAB2B, регулируют морфологию Гольджи» . Журнал биологической химии . 290 (36): 22250–61. doi : 10.1074/jbc.m115.669242 . PMC 4571976 . PMID 26209634 .
- ^ Jin J, Wu Y, Zhou D, Sun Q, Wang W (сентябрь 2018 г.). «Мир -448 мишеней RAB2B и имеет ключевое значение в подавлении рака поджелудочной железы» . Онкологические отчеты . 40 (3): 1379–1389. doi : 10.3892/или.2018.6562 . PMC 6072403 . PMID 30015954 .
- ^ X, Ma Y, Cheng H, Jiang M, Guo L, Ji C, et al. (2002). «Мекулярное клонирование и характеристика нового гена Rab (Rab2b (Rab2b) человека » Журнал генетики человека 47 (10): 548–5 Doi : 10.1007/s100380200083 . PMID 12376746