РАЛБ

РАЛБ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2KE5, 2KWI
Идентификаторы
Псевдонимы	RALB , RAS, подобные протоонкогену B
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 179551 ; МГИ : 1927244 ; Гомологен : 20632 ; GeneCards : RALB ; ОМА : RALB – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	120,294,710 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	119,432,524 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	monocyte; ; blood; ; rectum; ; gallbladder; ; cingulate gyrus; ; oral cavity; ; anterior cingulate cortex; ; visceral pleura; ; smooth muscle tissue; ; granulocyte;
	Top expressed in
	granulocyte; ; epithelium of stomach; ; endocardial cushion; ; left lung lobe; ; atrium; ; genital tubercle; ; yolk sac; ; cumulus cell; ; belly cord; ; placenta;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	nucleotide binding; GDP binding; ATPase binding; GTP binding; protein binding; GTPase activity; ubiquitin protein ligase binding;
Cellular component	membrane; plasma membrane; autophagosome; exocyst; extracellular exosome; intracellular anatomical structure; midbody;
Biological process	positive regulation of protein phosphorylation; positive regulation of autophagosome assembly; cellular response to starvation; negative regulation of protein binding; positive regulation of protein serine/threonine kinase activity; cell division; regulation of exocyst assembly; cellular response to exogenous dsRNA; cell cycle; positive regulation of protein binding; signal transduction; regulation of exocyst localization; apoptotic process; Ras protein signal transduction;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5899
	64143
	ENSG00000144118
	ENSMUSG00000004451
	P11234
	Q9JIW9
	НМ_002881 ; НМ_001369400
	НМ_022327
	НП_002872 ; НП_001356329
	НП_071722
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ras-родственный белок Ral-B ( RalB ) — это белок , который у человека кодируется RALB геном на хромосоме 2. ^{[ 5 ]} Этот белок является одним из двух паралогов белка Ral (второй — RalA) , и входит в семейство Ras GTPase . ^{[ 6 ]} RalA действует как молекулярный переключатель, активируя ряд биологических процессов, в основном деление и транспорт клеток, через сигнальные пути. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Таким образом, его биологическая роль предполагает его участие во многих видах рака . ^{[ 8 ]}

Структура

Изоформы Ral имеют общее совпадение аминокислотной последовательности на 80% и совпадение на 100% в области их эффекторного связывания. Две изоформы в основном различаются С-концевой гипервариабельной областью, которая содержит множество сайтов посттрансляционной модификации, что приводит к различию субклеточной локализации и биологических функций. Например, фосфорилирование серина 194 на RalA киназой Aurora A приводит к перемещению RalA на внутреннюю митохондриальную мембрану , где RalA помогает осуществлять деление митохондрий ; тогда как фосфорилирование серина 198 на RalB киназой PKC приводит к перемещению RalB на другие внутренние мембраны и активации его онкогенной функции. ^{[ 8 ]}

Функция

RalB — один из двух белков семейства Ral, которое само по себе является подсемейством малых ГТФаз семейства Ras. ^{[ 6 ]} Как Ras-GTPase, RalB действует как молекулярный переключатель, который становится активным при связывании с GTP и неактивным при связывании с GDP. RalB может активироваться RalGEF и, в свою очередь, активировать эффекторы в путях передачи сигнала, приводящие к биологическим результатам. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Например, RalB взаимодействует с двумя компонентами экзоцисты , Exo84 и Sec5 , способствуя сборке аутофагосом , транспортировке секреторных пузырьков и привязыванию. Другие последующие биологические функции включают экзоцитоз , рецептор-опосредованный эндоцитоз , биогенез плотных контактов , образование филоподий , деление митохондрий и цитокинез . ^{[ 6 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Хотя вышеуказанные функции, по-видимому, являются общими для двух изоформ Ral, их различная субклеточная локализация приводит к их различному участию в определенных биологических процессах. В частности, RalB более активно участвует в апоптозе и подвижности клеток. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Более того, RalB специфически взаимодействует с Exo84 для сборки комплекса инициации аутофагии beclin-1-VPS34 и с Sec5 для активации врожденного иммунного ответа через Tank-связывающую киназу 1 ( TBK1 ). ^{[ 6 ]}

Клиническое значение

Белки Ral связаны с прогрессированием некоторых видов рака, включая рак мочевого пузыря и рак простаты. ^{[ 8 ]} Хотя точные механизмы остаются неясными, исследования показывают, что RalB способствует инвазии и метастазированию опухоли. В результате ингибирование RalB тормозит дальнейшее прогрессирование рака. ^{[ 8 ]} Кроме того, RalB регулирует уровни p53 K-Ras-независимым образом во время развития рака. ^{[ 7 ]} RalB также способствует выживанию клеток во время заражения вирусами с двухцепочечной ДНК, активируя TBK1 для осуществления иммунного ответа. ^{[ 6 ]}^{[ 8 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RalB взаимодействует с:

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000144118 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004451 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: гомолог B вирусного онкогена лейкемии обезьян RALB v-ral (родственный ras; GTP-связывающий белок)» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Симичек М., Ливенс С., Лага М., Гузенко Д., Аушев В.Н., Калев П., Баетти М.Ф., Стрелков С.В., Геварт К., Тавернье Дж., Саблина А.А. (октябрь 2013 г.). «Дубиквитилаза USP33 различает функции RALB при аутофагии и врожденном иммунном ответе». Природная клеточная биология . 15 (10): 1220–30. дои : 10.1038/ncb2847 . ПМИД 24056301 . S2CID 205287526 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Теклеаб А., Чжан Х, Себти С.М. (ноябрь 2014 г.). «Снижение уровня регуляции Ral GTPase стабилизирует и реактивирует р53, чтобы ингибировать злокачественную трансформацию» . Журнал биологической химии . 289 (45): 31296–309. дои : 10.1074/jbc.M114.565796 . ПМЦ 4223330 . ПМИД 25210032 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я Кашатус Д.Ф. (сентябрь 2013 г.). «Ral GTPases в онкогенезе: выход из тени» . Экспериментальные исследования клеток . 319 (15): 2337–42. doi : 10.1016/j.yexcr.2013.06.020 . ПМК 4270277 . ПМИД 23830877 .
^ Хазелетт CC, Шефф Д., Йеман С. (декабрь 2011 г.). «RalA и RalB по-разному регулируют развитие плотных эпителиальных контактов» . Молекулярная биология клетки . 22 (24): 4787–800. doi : 10.1091/mbc.E11-07-0657 . ПМК 3237622 . ПМИД 22013078 .
^ Jump up to: ^а ^б Москаленко С., Тонг С., Россе С., Мирей Г., Формстечер Е., Давиет Л., Камонис Дж., Уайт М.А. (декабрь 2003 г.). «Ral GTPases регулируют сборку экзоцист посредством двойных взаимодействий субъединиц» . Ж. Биол. Хим . 278 (51): 51743–8. дои : 10.1074/jbc.M308702200 . ПМИД 14525976 .
^ Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
^ Жюльен-Флорес В., Дорсей О., Ромеро Ф., Летурнер Ф., Сарагости С., Бергер Р., Тавитян А., Гакон Г., Камонис Дж. Х. (сентябрь 1995 г.). «Соединение Ral GTPase с путями Rho. RLIP76, эффектор Ral с активностью белка, активирующего CDC42 / Rac GTPase» . Ж. Биол. Химия 270 (38): 22473–7. дои : 10.1074/jbc.270.38.22473 . ПМИД 7673236 .

Дальнейшее чтение

Се CL, Сваруп А, Франк У (1990). «Хромосомная локализация и последовательность кДНК человеческого ralB, белка, связывающего GTP». Сомат. Клетка Мол. Жене . 16 (4): 407–10. дои : 10.1007/BF01232469 . ПМИД 2120779 . S2CID 46005717 .
Шарден П., Тавитян А (1989). «Кодирующие последовательности кДНК ralA и ralB человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 17 (11): 4380. doi : 10.1093/nar/17.11.4380 . ПМК 317954 . ПМИД 2662142 .
Жюльен-Флорес В., Дорсей О., Ромеро Ф., Летурнер Ф., Сарагости С., Бергер Р., Тавитян А., Гакон Г., Камонис Дж.Х. (1995). «Соединение Ral GTPase с путями Rho. RLIP76, эффектор Ral с активностью белка, активирующего CDC42 / Rac GTPase» . Ж. Биол. Химия 270 (38): 22473–7. дои : 10.1074/jbc.270.38.22473 . ПМИД 7673236 .
Джилкина О, Бхуллар Р.П. (1997). «Получение антител, специфичных к ГТФ-связывающим белкам RalA и RalB, и определение их концентрации и распределения в тромбоцитах человека». Биохим. Биофиз. Акта . 1314 (1–2): 157–66. дои : 10.1016/s0167-4889(96)00073-0 . ПМИД 8972729 .
Икеда М., Исида О., Хиной Т., Кишида С., Кикучи А. (1998). «Идентификация и характеристика нового белка, взаимодействующего с Ral-связывающим белком 1, предполагаемым эффекторным белком Ral» . Ж. Биол. Хим . 273 (2): 814–21. дои : 10.1074/jbc.273.2.814 . ПМИД 9422736 .
Сугихара К., Асано С., Танака К., Ивамацу А., Окава К., Ота Ю. (2002). «Комплекс экзоцист связывает небольшую ГТФазу RalA, опосредуя образование филоподий». Нат. Клеточная Биол . 4 (1): 73–8. дои : 10.1038/ncb720 . ПМИД 11744922 . S2CID 9528945 .
Клаф Р.Р., Сидху Р.С., Бхуллар Р.П. (2002). «Кальмодулин связывает RalA и RalB и необходим для индуцированной тромбином активации Ral в тромбоцитах человека» . Ж. Биол. Хим . 277 (32): 28972–80. дои : 10.1074/jbc.M201504200 . ПМИД 12034722 .
Чиен Ю, Уайт, Массачусетс (2004). «RAL GTPases являются важнейшими модуляторами пролиферации и выживания опухолевых клеток человека» . Представитель ЭМБО . 4 (8): 800–6. дои : 10.1038/sj.embor.embor899 . ПМЦ 1326339 . ПМИД 12856001 .
Эрнандес-Муньос И., Бенет М., Калеро М., Хименес М., Диас Р., Пельисер А. (2003). «Онкоген rgr: активация путем устранения контроля трансляции и неправильной локализации». Рак Рез . 63 (14): 4188–95. ПМИД 12874025 .
Москаленко С., Тонг С., Россе С., Мирей Г., Формстечер Е., Давиет Л., Камонис Дж., Уайт М.А. (2004). «Ral GTPases регулируют сборку экзоцист посредством двойных взаимодействий субъединиц» . Ж. Биол. Хим . 278 (51): 51743–8. дои : 10.1074/jbc.M308702200 . ПМИД 14525976 .
Сидху Р.С., Клаф Р.Р., Бхуллар Р.П. (2005). «Регуляция фосфолипазы C-дельта1 посредством прямого взаимодействия с малой ГТФазой Ral и кальмодулином» . Ж. Биол. Хим . 280 (23): 21933–41. дои : 10.1074/jbc.M412966200 . ПМИД 15817490 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( 2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Чиен Ю., Ким С., Бумейстер Р., Лу Ю.М., Квон С.В., Джонсон С.Л., Балакирева М.Г., Ромео Ю., Копелович Л., Гейл М., Йеман С., Камонис Дж.Х., Чжао Ю., Уайт М.А. (2006). «Опосредованная RalB GTPase активация киназы TBK1 семейства IkappaB сочетает врожденную иммунную передачу сигналов с выживанием опухолевых клеток» . Клетка . 127 (1): 157–70. дои : 10.1016/j.cell.2006.08.034 . ПМИД 17018283 . S2CID 9878037 .
Лим К.Х., О'Хэйер К., Адам С.Дж., Кендалл С.Д., Кэмпбелл П.М., Дер СиДжей, Counter CM (2007). «Различные роли RalA и RalB в злокачественном росте клеток карциномы поджелудочной железы человека» . Курс. Биол . 16 (24): 2385–94. дои : 10.1016/j.cub.2006.10.023 . ПМИД 17174914 .
Смит С.К., Оксфорд Г., Барас А.С., Оуэнс С., Хавалешко Д., Бротиган Д.Л., Сафо М.К., Теодореску Д. (2007). «Экспрессия ral GTPases, их эффекторов и активаторов при раке мочевого пузыря человека» . Клин. Рак Рез . 13 (13): 3803–13. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-06-2419 . ПМИД 17606711 .
Инь Дж., Поллок С., Трейси К., Чок М., Мартин П., Оберст М., Келли К. (2007). «Активация пути RalGEF/Ral способствует метастазированию рака простаты в кости» . Мол. Клетка. Биол . 27 (21): 7538–50. дои : 10.1128/MCB.00955-07 . ПМК 2169046 . ПМИД 17709381 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000144118 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004451 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтрез: гомолог B вирусного онкогена лейкемии обезьян RALB v-ral (родственный ras; GTP-связывающий белок)» .

[pmid24056301-6] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Симичек М., Ливенс С., Лага М., Гузенко Д., Аушев В.Н., Калев П., Баетти М.Ф., Стрелков С.В., Геварт К., Тавернье Дж., Саблина А.А. (октябрь 2013 г.). «Дубиквитилаза USP33 различает функции RALB при аутофагии и врожденном иммунном ответе». Природная клеточная биология . 15 (10): 1220–30. дои : 10.1038/ncb2847 . ПМИД 24056301 . S2CID 205287526 .

[pmid25210032-7] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Теклеаб А., Чжан Х, Себти С.М. (ноябрь 2014 г.). «Снижение уровня регуляции Ral GTPase стабилизирует и реактивирует р53, чтобы ингибировать злокачественную трансформацию» . Журнал биологической химии . 289 (45): 31296–309. дои : 10.1074/jbc.M114.565796 . ПМЦ 4223330 . ПМИД 25210032 .

[pmid23830877-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я Кашатус Д.Ф. (сентябрь 2013 г.). «Ral GTPases в онкогенезе: выход из тени» . Экспериментальные исследования клеток . 319 (15): 2337–42. doi : 10.1016/j.yexcr.2013.06.020 . ПМК 4270277 . ПМИД 23830877 .

[pmid22013078-9] Хазелетт CC, Шефф Д., Йеман С. (декабрь 2011 г.). «RalA и RalB по-разному регулируют развитие плотных эпителиальных контактов» . Молекулярная биология клетки . 22 (24): 4787–800. doi : 10.1091/mbc.E11-07-0657 . ПМК 3237622 . ПМИД 22013078 .

[pmid14525976-10] Jump up to: ^а ^б Москаленко С., Тонг С., Россе С., Мирей Г., Формстечер Е., Давиет Л., Камонис Дж., Уайт М.А. (декабрь 2003 г.). «Ral GTPases регулируют сборку экзоцист посредством двойных взаимодействий субъединиц» . Ж. Биол. Хим . 278 (51): 51743–8. дои : 10.1074/jbc.M308702200 . ПМИД 14525976 .

[pmid16189514-11] Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

[pmid7673236-12] Жюльен-Флорес В., Дорсей О., Ромеро Ф., Летурнер Ф., Сарагости С., Бергер Р., Тавитян А., Гакон Г., Камонис Дж. Х. (сентябрь 1995 г.). «Соединение Ral GTPase с путями Rho. RLIP76, эффектор Ral с активностью белка, активирующего CDC42 / Rac GTPase» . Ж. Биол. Химия 270 (38): 22473–7. дои : 10.1074/jbc.270.38.22473 . ПМИД 7673236 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]