Вирус иммунодефицита обезьян

Вирус иммунодефицита обезьян
	Модель вириона SIV, полученная с помощью сканирования криоэлектронной микроскопии
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Паранавиры
Тип:	Артвервирикота
Сорт:	Ревтравирицеты
Заказ:	Ортервирусы
Семья:	Ретровирусиды
Род:	Лентивирус
Разновидность:	Вирус иммунодефицита обезьян

Вирус иммунодефицита обезьян ( SIV ) — это разновидность ретровируса , кроме человека , который вызывает стойкие инфекции по меньшей мере у 45 видов приматов . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} На основании анализа штаммов, обнаруженных у четырех видов обезьян с острова Биоко , который был изолирован от материка в результате повышения уровня моря около 11 000 лет назад, был сделан вывод, что SIV присутствует у обезьян и человекообразных обезьян в течение по крайней мере 32 000 лет. вероятно, намного дольше. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}

вируса Штаммы трех из этих видов приматов, SIVsmm у сажистых мангабеев , SIVgor у горилл и SIVcpz у шимпанзе , как полагают, преодолели видовой барьер и проникли в человека, что привело к появлению ВИЧ-2 и ВИЧ-1 соответственно, двух ВИЧ вирусов . Наиболее вероятный путь передачи ВИЧ-1 человеку предполагает контакт с кровью шимпанзе и горилл, на которых в Африке часто охотятся ради мяса диких животных . Четыре подтипа ВИЧ-1 (M, N, O и P), вероятно, возникли в результате четырех отдельных передач ВИО человеку, и полученный штамм ВИЧ-1 группы М чаще всего заражает людей во всем мире. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Таким образом, предполагается, что SIV, возможно, ранее пересекал видовой барьер и попадал в человека-хозяина несколько раз на протяжении всей истории, но только недавно, после появления современного транспорта и глобального пригородного движения , он наконец укрепился, распространившись за пределы локализованных уничтожений. несколько особей или отдельные небольшие племенные популяции.

В отличие от инфекций ВИЧ-1 и ВИЧ-2 у людей, инфекции SIV у естественных обезьян-хозяев, не являющихся людьми, во многих случаях оказываются непатогенными из-за эволюционной адаптации хозяев к вирусу. Обширные исследования на сажистых мангабеях установили, что инфекция SIVsmm не вызывает никаких заболеваний у этих приматов, несмотря на высокие уровни циркулирующего вируса. Регулирование активности корецептора CCR5 является одной из естественных стратегий предотвращения заболеваний у некоторых естественных видов-хозяев ВИО. ^{[ 7 ]}

В отличие от заражения SIVsmm у сажистых мангабеев, недавний ^{[ когда? ]} Исследование SIVcpz на диких шимпанзе предполагает, что инфицированные шимпанзе страдают от СПИД-подобного заболевания, сходного с таковым у людей, инфицированных ВИЧ-1. Более поздние стадии инфекции SIV перерастают в СПИД, подобно тому, как ВИЧ-инфекция развивается в СПИД.

Таксономия

Вирусы иммунодефицита обезьян (содержащиеся на обезьянах) представляют собой разновидность ретровирусов из группы приматов рода Lentivirus наряду с человеческими вирусами ВИЧ-1 и ВИЧ-2 , которые вызывают СПИД, а также некоторыми другими вирусами, которые заражают других приматов. Родственные вирусы других групп этого рода заражают других млекопитающих, таких как овцы и козы, лошади, крупный рогатый скот, кошки и некоторые другие. Род является одним из шести родов подсемейства orretrovirinae , которые вместе с родом Spumavirus образуют семейство ретровирусов всех РНК-ретровирусов (РНК-вирусов, использующих промежуточную ДНК). ^{[ 8 ]}

Код ICTVdB SIV — 61.0.6.5.003. ^{[ 9 ]} Хотя ВИЧ-1 и ВИЧ-2 кладистически относятся к ВИО, ^{[ 10 ]} ICTV считает их отличными от обычных, не заражающих человека SIV.

Штаммы

группа я

	ВИЧ-1

	cpzPtt

gor

cpzPts

	дрл

	mnd2

	ркм

	аги

группа II

	ВИЧ-2

	Мак

mne

стм

смм

группа III/AGM

	серый

	видеть

загар

сторона

группа IV

	ты знаешь

	солнце

прг

месяц 1

	ВКР

	плохой

	ТРК

	КРЦ

grp v

ГСН

mus2

(группа мы)

	столбец

	kcol1

kcol2

БЦ

Мой

mus1

рег

из

	по возрастанию

	БКМ

что

синий

	это

	больной

хотеть

Филогенетические связи между вирусами иммунодефицита обезьян (SIV) ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}

В то время как вирус иммунодефицита человека имеет ограниченное количество подтипов, сейчас известно, что SIV заражает несколько десятков видов приматов, кроме человека, и отдельные штаммы часто связаны с каждым видом или с набором близкородственных видов. На данный момент классифицировано около 40 штаммов, разделенных на пять отдельных групп и одну подгруппу: ^{[ 10 ]}

и) ВИЧ-1, SIVcpz ( шимпанзе ), SIVgor ( горилла ), SIVrcm ( красношапочный мангабей ), SIVagi ( проворный мангабей ), SIVmnd 2 ( мандрил ), SIVdrl ( буровая обезьяна )
ii) ВИЧ-2, SIVsmm ( сажевый мангабей ), SIVmac ( макака-резус ), SIVmne ( кошачья макака ), SIVstm ( пеньхвостая макака )
iii) SIVagm [генерик] ( африканские зеленые обезьяны ): SIVsab, SIVver, SIVgri ( гривет-обезьяна ), SIVtan ( танталовая обезьяна )
iv) SIVmnd 1 ( мандрил ), SIVlho ( обезьяна Л'хоэста ), SIVsun ( солнечнохвостая обезьяна ), SIVprg ( генон Прейсса ), SIVwrc ( западный красный колобус ), SIVolc ( оливковый колобус ), SIVkrc ( красный колобус Кибале ), SIVtrc ( Красный колобус
v) SIVsyk ( обезьяна Сайкса ), SIVdeb ( обезьяна Де Браззы ), SIVden ( мона-обезьяна Дента ), SIVwol ( мона-обезьяна Волка ), SIVgsn/SIVmon/SIVmus 1/SIVmus 2 клада, SIVtal ( северный талапоин ), SIVasc ( красный) -хвостый генон ), SIVbkm ( черный мангабей ), SIVreg[ранее SIVery] ( красноухая мартышка ), SIVblu (голубая обезьяна)
- vi) SIVcol ( колобус гереза ), SIVkcol 1 ( колобус черно-белый ), SIVkcol 2, SIVbc (ранее SIVbcm) ( колобус черный ),

В дополнение к подгруппам, определенным для степени SIV, у прозимианских лемуров обнаружены два эндогенных SIV. Эти палео-SIV образуют базальную ветвь по отношению к современным SIV. ^{[ 15 ]}

История

Начиная с 1983 года, у содержащихся в неволе обезьян в США сообщалось об иммунодефиците, напоминающем СПИД человека. ^{[ 16 ]}^{[ 17 ]}^{[ 18 ]} SIV был выделен в 1985 году от некоторых из этих животных, содержащихся в неволе макак-резус , страдающих от обезьяньего СПИДа (SAIDS). ^{[ 17 ]} Открытие ВИО было сделано вскоре после того, как ВИЧ-1 был выделен как причина СПИДа, и привело к открытию штаммов ВИЧ-2 в Западной Африке. ВИЧ-2 был больше похож на известные тогда штаммы ВИО, чем на ВИЧ-1, что впервые позволило предположить обезьянье происхождение ВИЧ. Дальнейшие исследования показали, что ВИЧ-2 происходит от штамма SIVsmm, обнаруженного у сажистых мангабеев, тогда как ВИЧ-1, преобладающий вирус, обнаруженный у людей, происходит от штаммов SIV, инфицирующих шимпанзе (SIVcpz). ^{[ нужна ссылка ]}

Не считается, что шимпанзе являются первоначальными хозяевами независимой линии SIV, а скорее что SIVcpz является относительно недавним приобретением, возникшим в результате рекомбинации SIVgsn ( большие пятносые обезьяны ) и SIVrcm ( красношапочные мангабеи ) внутри хозяина. шимпанзе. Известно, что шимпанзе охотятся и потребляют этих обезьян в пищу. ^{[ 19 ]} В 2010 году исследователи сообщили, что SIV заражал обезьян в Биоко на протяжении как минимум 32 000 лет. На основе анализа последовательностей молекулярных часов ранее многие считали, что заражение SIV у обезьян произошло в течение последних нескольких сотен лет. ^{[ 3 ]} По оценкам ученых, пройдет столько же времени, прежде чем люди естественным образом адаптируются к ВИЧ-инфекции, как обезьяны в Африке адаптировались к ВИО, и не понесут никакого вреда от инфекции. ^{[ 20 ]}

В 2008 году открытие эндогенного лентивируса у полуобезьян (протообезьян), серого мышиного лемура, обитающего на Мадагаскаре, отодвинуло возникновение SIV-подобных лентивирусных инфекций у приматов назад, по крайней мере, на 14 млн лет назад, когда в последний раз происходило смешение млекопитающих между островом Мадагаскар и материковой частью Африки, если заражение связано с горизонтальной передачей между гомологичными хозяевами. Если вирус развивался совместно с хозяином, а не приобретался, это потенциально отодвигает дату эндогенного события примерно на 100 лет назад. 85 млн лет назад, раскол между линиями лемуроподобных и обезьяноподобных приматов. Эта дата едва ли предшествует появлению приматов (87,7 млн лет назад). ^{[ 21 ]}

Вирусология

Структура и геном

Вирион SIV представляет собой гликопротеиновую оболочку от сферической до плеоморфной размером 110–120 нм в поперечнике, включающую усеченный конус или клиновидный (иногда палочковидный) капсид размером 110x50 нм, содержащий димерную пару геномов одноцепочечной РНК с положительным смыслом . ^{[ нужна ссылка ]}

Геном

кодирующие регионы

Протеом

genes: env , gag , pol , tat , rev , nef , vpr , vif , vpu/vpx
Структурные белки (оболочка): SU, TM(gag): MA, CA, NC
Ферменты: РТ, ПР, ИН
Генные регуляторы: Tat, Rev.
Акцессорные белки: Nef, Vpr, Vpx, Vif.

Тропизм

Различия в видовой специфичности SIV и родственных ретровирусов могут быть частично объяснены вариантами белка TRIM5α у человека и видов приматов, не относящихся к человеку. Этот внутриклеточный белок распознает капсид различных ретровирусов и блокирует их размножение. Другие белки, такие как APOBEC3G / 3F , который оказывает антиретровирусную иммунную активность, также могут играть важную роль в ограничении межвидовой передачи. ^{[ 22 ]}

Репликация

Вложение
Проникновение
Удаление покрытия
Репликация
- обратная транскрипция

 +ssRNA → -ssDNA → dsDNA → +ssRNA (viral genome)
                         → +ssmRNA → viral protein

интеграция
задержка
расщепление
синтез белка
Сборка

зарождающийся
Созревание

Квазивиды

Скорость и неточности транскрипции РНК-вирусов приводят к появлению антигенно различных разновидностей у одного животного-хозяина. Эти квазивиды не обязательно дают начало новым организмам всей популяции. Скорость распространения квазивидов имеет важное значение для иммунного контроля хозяина и, следовательно, для вирулентности организма. ^{[ нужна ссылка ]}

Патогенез

Патогенез SIV включает как патогенные, так и непатогенные SIV-инфекции. Инфекция SIV у приматов (NHP) неизменно приводит к стойкой инфекции, но редко к острому заболеванию. Типичным представителем патогенной инфекции являются макаки-резусы, зараженные штаммами SIV, полученными от сажистых мангабеев. Прогрессирование заболевания до СПИДа происходит в течение периода от месяцев до лет, в зависимости от используемого штамма SIV. Непатогенная инфекция типична для африканских НЧЧ, естественно инфицированных ВИО. У этих животных редко развивается СПИД, несмотря на сохранение вирусной нагрузки, эквивалентной вирусной нагрузке SIV при патогенных инфекциях. Предполагается, что СПИД-подобное заболевание у африканских НЧЧ представляет собой горизонтальную передачу вируса от одного или нескольких гомологичных видов в недавнем эволюционном прошлом, до того, как наступило равновесие коадаптации. ^{[ нужна ссылка ]}

Сходства и различия инфекций SIV/ВИЧ

Сходства двух типов вирусных инфекций: ^{[ 23 ]}

высокий уровень репликации вируса при первичном заражении (0–180 дней)
высокий уровень потери CD4+ Т-клеток (0–180 дней)
ограниченная роль гуморального иммунного ответа

Различия (что происходит у нечеловекообразных приматов):

более низкий уровень CCR5+ Т-клеток
стабильный уровень репликации вируса (180 дней-лет)
восстановление CD4+ Т-клеток
раннее производство цитокинов (0–10 дней после заражения)
нормальный уровень иммунной активации
высокий уровень функциональных иммунных клеток
создание противовоспалительной среды

Эпидемиология

напряжение	родословная	хозяин	биномиальный	болезнь
ВИЧ-1	СИВкпз	люди	Х. мудрый	СПИД
ВИЧ-2	СИВсмм	люди	Х. мудрый	СПИД
СИВкпз	СИВркм/СИВгсн	Шимпанзе	П. Троглодиты	СПИД
СИВгор	СИВкпз	Горилла	Г. горилла	( - )
СИВсмм		Закопченный мангабей		( - )

Беатрис Хан из Пенсильванского университета и группа исследователей в 2009 году обнаружили, что шимпанзе действительно умирают от обезьяньего СПИДа в дикой природе и что вспышка СПИДа в Африке способствовала сокращению популяций шимпанзе. Тестируя диких шимпанзе, исследователи обнаружили повреждение органов и тканей, подобное поздней стадии СПИДа у человека. У инфицированных шимпанзе риск смерти был в 10–16 раз выше, чем у неинфицированных; инфицированные женщины с меньшей вероятностью рожали, могли передать вирус своим младенцам и имели более высокий уровень детской смертности, чем неинфицированные женщины. ^{[ 24 ]}^{[ 25 ]} Бонобо , по-видимому, избегают вируса иммунодефицита обезьян (SIV) и его последствий, хотя неизвестно, почему. ^{[ 19 ]}

Африканские зеленые мартышки (также называемые верветками, род Chlorocebus) в африканских популяциях сильно заражены SIVagm, ^{[ 26 ]}^{[ 27 ]} в то время как вирус отсутствует в популяциях верветок-основателей в Карибском бассейне. ^{[ 28 ]} Распространенность инфекции SIV в африканском населении колеблется 78-90% у взрослых женщин и 36-57% у взрослых мужчин, тогда как инфекция SIV редко встречается у неполовозрелых людей. ^{[ 27 ]}^{[ 26 ]} У верветок, инфицированных SIV, в дикой природе не развивается хроническая иммунная активация или микробная транслокация (оценивается с помощью sCD14 в качестве суррогатного биомаркера). Во время естественной инфекции SIV в микробиоме кишечника наблюдалось значительное увеличение микробного разнообразия, уменьшение количества Proteobacteria/Succinivibrio и увеличение количества Veillonella, уменьшение количества генов, участвующих в путях микробной инвазии, а также частичная обратимость острых инфекционных сдвигов в микробной среде. избыток. ^{[ 29 ]} Характер естественного отбора в геноме обезьян в генах, участвующих в ответе на ВИЧ и регулируемых в ответ на экспериментальную инфекцию SIV у обезьян, но не у макак, предполагает естественную адаптацию к SIV у обезьян Chlorocebus в Африке. ^{[ 30 ]}

Исследования вакцин

В 2012 году исследователи сообщили, что первоначальное заражение макак-резус устойчивыми к нейтрализации штаммами SIV. ^{[ 31 ]} можно частично предотвратить путем использования вакцины против SIV _SME543 , обязательно содержащей белковые антигены Env . ^{[ 32 ]}

В 2013 году исследование группы авторов сообщило об успешных испытаниях вакцины, содержащей вектор резус-цитомегаловируса, экспрессирующий белок SIV. Примерно у 50% вакцинированных макак-резус наблюдался стойкий авиремический контроль инфекции высокопатогенным штаммом SIVmac239. ^{[ 33 ]}

См. также

ВИЧ , человеческая версия ВИО, вызывающая СПИД.
Вирус с одноцепочечной РНК с положительным смыслом , классификация, включающая SIV.
Зооноз и происхождение СПИДа , передача от других приматов человеку
Список зоонозных вирусов приматов
Другие экзогенные ретровирусы обезьян: Т-лимфотропный вирус обезьян , ретровирус обезьян типа D, вирус лейкоза гиббонов и обезьян , пенистый вирус обезьян , вирус саркомы обезьян.
Родственные вирусы вызывают заболевания и у других млекопитающих: овец , коз , кошек , крупного рогатого скота , лошадей.
SV40 — еще один вирус, который попал от обезьян в популяцию человека в середине двадцатого века.

Ссылки

^ Петерс М., Курно В., Абела Б. (2001). «Генетическое разнообразие лентивирусов у приматов, кроме человека» (PDF) . Обзоры по СПИДу . 3 :3–10 . Проверено 11 июля 2020 г.
^ Петерс М., Курно В. (2002). Куикен С., Фоли Б., Фрид Э., Хан Б., Корбер Б., Маркс П.А., Маккатчан Ф.Е., Меллорс Дж.В., Волински С. (ред.). Обзор лентивирусов приматов и их эволюции у приматов, не являющихся человеком, в Африке (PDF) . Сборник последовательностей ВИЧ. Лос-Аламос, Нью-Мексико: Группа теоретической биологии и биофизики, Национальная лаборатория Лос-Аламоса. стр. 2–23 . Проверено 19 сентября 2010 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б Макнил Дональд Дж. младший (16 сентября 2010 г.). «Предшественник ВИЧ был у обезьян на протяжении тысячелетий» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 17 сентября 2010 г.
^ Воробей М., Телфер П., Сукьер С., Хантер М., Коулман К.А., Мецгер М.Дж. и др. (сентябрь 2010 г.). «Биогеография острова раскрывает глубокую историю SIV». Наука . 329 (5998): 1487. Бибкод : 2010Sci...329.1487W . дои : 10.1126/science.1193550 . ПМИД 20847261 . S2CID 37803712 . .
^ Sharp PM, Хан Б.Х. (август 2010 г.). «Эволюция ВИЧ-1 и происхождение СПИДа» . Философские труды Лондонского королевского общества. Серия Б, Биологические науки . 365 (1552): 2487–2494. дои : 10.1098/rstb.2010.0031 . ПМК 2935100 . ПМИД 20643738 .
^ Питерс М., Д'Арк М., Делапорт Э. (2014). «Происхождение и разнообразие ретровирусов человека» . Обзоры по СПИДу . 16 (1): 23–34. ПМК 4289907 . ПМИД 24584106 .
^ Ясинска А.Дж., Пандреа И., Апетрей С. (27 января 2022 г.). «CCR5 как корецептор вируса иммунодефицита человека и вирусов иммунодефицита обезьян: прототип романа любви и ненависти» . Границы в иммунологии . 13 : 835994. дои : 10.3389/fimmu.2022.835994 . ISSN 1664-3224 . ПМЦ 8829453 . ПМИД 35154162 .
^ «Подробности о таксонах | ICTV» . ictv.global .
^ Запись в базе данных ICTV: 61.0.6.5.003.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Sharp PM, Хан Б.Х. (сентябрь 2011 г.). «Истоки ВИЧ и пандемии СПИДа» . Перспективы Колд-Спринг-Харбора в медицине . 1 (1): а006841. doi : 10.1101/cshperspect.a006841 . ПМК 3234451 . ПМИД 22229120 .
^ Ахука-Мундеке С., Аюба А., Мбала-Кингебени П., Льежуа Ф., Эстебан А., Лунгуя-Метила О. и др. (декабрь 2011 г.). «Новый мультиплексный анализ обнаружения антител к ВИЧ/вирусу иммунодефицита обезьян» . Новые инфекционные заболевания . 17 (12): 2277–2286. дои : 10.3201/eid1712.110783 . ПМК 3311211 . ПМИД 22172157 .
^ Панчино Дж., Сильвестри Дж., Фаук К.Р. (2012). Модели защиты от ВИЧ/ВИО: предотвращение СПИДа у людей и обезьян . Эльзевир. п. 6. ISBN 978-0-12-387715-4 .
^ Петерс М., Курно В., Абела Б., Озель П., Пуррю Х, Биболле-Рюш Ф. и др. (май 2002 г.). «Риск для здоровья человека из-за множества вирусов иммунодефицита обезьян в мясе диких приматов» . Новые инфекционные заболевания . 8 (5): 451–457. дои : 10.3201/eid0805.010522 . ПМЦ 2732488 . ПМИД 11996677 .
^ Лаук М., Свитцер В.М., Сибли С.Д., Хероба Д., Тумукунде А., Вени Г. и др. (октябрь 2013 г.). «Обнаружение и полная характеристика генома двух сильно различающихся вирусов иммунодефицита обезьян, заражающих черно-белых обезьян-колобусов (Colobus guereza) в национальном парке Кибале, Уганда» . Ретровирусология . 10 :107. дои : 10.1186/1742-4690-10-107 . ПМК 4016034 . ПМИД 24139306 .
^ Гилберт, К; Максфилд, генеральный директор; Гудман, С.М.; Фешотт, К. (март 2009 г.). «Параллельная зародышевая инфильтрация лентивируса у двух малагасийских лемуров» . ПЛОС Генетика . 5 (3): e1000425. дои : 10.1371/journal.pgen.1000425 . ПМК 2651035 . ПМИД 19300488 .
^ Летвин Н.Л., Итон К.А., Олдрич В.Р., Сегал П.К., Блейк Б.Дж., Шлоссман С.Ф. и др. (май 1983 г.). «Синдром приобретенного иммунодефицита в колонии макак» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 80 (9): 2718–2722. Бибкод : 1983PNAS...80.2718L . дои : 10.1073/pnas.80.9.2718 . ПМЦ 393899 . ПМИД 6221343 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Дэниел М.Д., Летвин Н.Л., Кинг Н.В., Каннаги М., Сегал П.К., Хант Р.Д. и др. (июнь 1985 г.). «Выделение Т-клеточного тропного HTLV-III-подобного ретровируса от макак». Наука . 228 (4704): 1201–1204. Бибкод : 1985Sci...228.1201D . дои : 10.1126/science.3159089 . ПМИД 3159089 .
^ Кинг Н.В., Хант Р.Д., Летвин Н.Л. (декабрь 1983 г.). «Гистопатологические изменения у макак с синдромом приобретенного иммунодефицита (СПИД)» . Американский журнал патологии . 113 (3): 382–388. ЧВК 1916356 . ПМИД 6316791 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Sharp PM, Shaw GM, Hahn BH (апрель 2005 г.). «Инфекция шимпанзе вирусом обезьяньего иммунодефицита» . Журнал вирусологии . 79 (7): 3891–3902. doi : 10.1128/JVI.79.7.3891-3902.2005 . ПМЦ 1061584 . ПМИД 15767392 .
^ «Предшественник ВИЧ у древних обезьян: исследование» . Новости Си-Би-Си. 17 сентября 2010 года. Архивировано из оригинала 25 марта 2013 года . Проверено 17 сентября 2010 г.
^ Гиффорд, Р.Дж.; Кацуракис, А; Тристем, М; Пибус, Огайо; Уинтерс, М; Шафер, RW (23 декабря 2008 г.). «Переходный эндогенный лентивирус из генома базального примата и последствия для эволюции лентивируса» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (51): 20362–7. дои : 10.1073/pnas.0807873105 . ПМК 2603253 . ПМИД 19075221 .
^ Хини Дж.Л., Далглиш АГ, Вайс Р.А. (июль 2006 г.). «Происхождение ВИЧ и эволюция устойчивости к СПИДу». Наука . 313 (5786): 462–466. Бибкод : 2006Sci...313..462H . дои : 10.1126/science.1123016 . ПМИД 16873637 . S2CID 27673160 .
^ Пандреа, Ивона; Содора, Дональд Л.; Сильвестри, Гвидо; Апетрей, Кристиан (сентябрь 2008 г.). «В дикой природе: инфекция обезьяньего вируса иммунодефицита (SIV) у естественных хозяев» . Тенденции в иммунологии . 29 (9): 419–428. дои : 10.1016/j.it.2008.05.004 . ISSN 1471-4906 . ПМК 2840226 . ПМИД 18676179 .
^ Шимпанзе действительно умирают от обезьяньего СПИДа, результаты исследования Лоуренса К. Альтмана Шимпанзе действительно умирают от обезьяньего СПИДа, результаты исследования
^ Кил Б.Ф., Джонс Дж.Х., Терио К.А., Эстес Дж.Д., Рудиселл Р.С., Уилсон М.Л. и др. (июль 2009 г.). «Повышенная смертность и СПИД-подобная иммунопатология у диких шимпанзе, инфицированных SIVcpz» . Природа . 460 (7254): 515–519. Бибкод : 2009Natur.460..515K . дои : 10.1038/nature08200 . ПМЦ 2872475 . ПМИД 19626114 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Ма Д., Ясинска А., Кристофф Дж., Гроблер Дж.П., Тернер Т., Юнг Ю. и др. (январь 2013 г.). «Инфекция SIVagm у диких африканских зеленых мартышек из Южной Африки: эпидемиология, естественная история и эволюционные соображения» . ПЛОС Патогены . 9 (1): e1003011. дои : 10.1371/journal.ppat.1003011 . ПМЦ 3547836 . ПМИД 23349627 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Ма Д., Ясинска А.Дж., Фейертаг Ф., Виджевардана В., Кристофф Дж., Хе Т. и др. (май 2014 г.). «Факторы, связанные с передачей вируса иммунодефицита симана у естественного африканского примата-хозяина, не являющегося человеком, в дикой природе» . Журнал вирусологии . 88 (10): 5687–5705. дои : 10.1128/JVI.03606-13 . ПМК 4019088 . ПМИД 24623416 .
^ Капусински Б., Малвани У., Ясинска А.Дж., Дэн Х, Фреймер Н., Делварт Э. (август 2015 г.). «Локальное исчезновение вирусов из-за узкого места в популяции хозяев» . Журнал вирусологии . 89 (16): 8152–8161. дои : 10.1128/jvi.00671-15 . ПМЦ 4524239 . ПМИД 26018153 .
^ Ясинска А.Дж., Донг Т.С., Лагишетти В., Кацка В., Джейкобс Дж.П., Шмитт К.А. и др. (ноябрь 2020 г.). «Изменения в микробном разнообразии, составе и функциональности кишечного и генитального микробиома во время естественной инфекции SIV у верветок» . Микробиом . 8 (1): 154. дои : 10.1186/s40168-020-00928-4 . ПМЦ 7648414 . ПМИД 33158452 .
^ Свардал Х., Ясинска А.Дж., Апетрей С., Коппола Г., Хуанг Ю., Шмитт К.А. и др. (декабрь 2017 г.). «Древняя гибридизация и сильная адаптация к вирусам в популяциях африканских верветок» . Природная генетика . 49 (12): 1705–1713. дои : 10.1038/ng.3980 . ПМК 5709169 . ПМИД 29083404 .
^ «Устойчивый к нейтрализации» относится к штаммам, которые не могут быть нейтрализованы нативным иммунным ответом из-за компенсирующей мутации; см. информацию, связанную с ВИЧ-1 .
^
Баруш Д.Х., Лю Дж., Ли Х., Максфилд Л.Ф., Аббинк П., Линч Д.М. и др. (январь 2012 г.). «Вакцинальная защита от заражения устойчивыми к нейтрализации вирусами SIV у макак-резус» . Природа . 482 (7383): 89–93. Бибкод : 2012Natur.482...89B . дои : 10.1038/nature10766 . ПМК 3271177 . ПМИД 22217938 .
- Симеон Беннетт (4 января 2012 г.). «Вакцина от СПИДа J&J помогает защитить обезьян от вируса» . Блумберг .
^ Хансен С.Г., Пиатак М., Вентура А.Б., Хьюз К.М., Гилбрайд Р.М., Форд Дж.К. и др. (октябрь 2013 г.). «Иммунный клиренс высокопатогенной SIV-инфекции» . Природа . 502 (7469): 100–104. Бибкод : 2013Natur.502..100H . дои : 10.1038/nature12519 . ПМЦ 3849456 . ПМИД 24025770 .

Дальнейшее чтение

«Происхождение ВИЧ обнаружено у диких шимпанзе» Статья BBC News
Петерс и др. : «Риск для здоровья человека из-за множества вирусов иммунодефицита обезьян в мясе диких животных приматов» , Emerging Infectious Diseases , Том 8, № 5, май 2002 г. Содержит картину взаимосвязи между различными штаммами SIV/HIV.

Внешние ссылки

Описание SIV , включая ссылки на подвиды и данные о последовательностях, предоставлено Международным комитетом по таксономии вирусов.

[Peeters_2001-1] Петерс М., Курно В., Абела Б. (2001). «Генетическое разнообразие лентивирусов у приматов, кроме человека» (PDF) . Обзоры по СПИДу . 3 :3–10 . Проверено 11 июля 2020 г.

[Peeters-2] Петерс М., Курно В. (2002). Куикен С., Фоли Б., Фрид Э., Хан Б., Корбер Б., Маркс П.А., Маккатчан Ф.Е., Меллорс Дж.В., Волински С. (ред.). Обзор лентивирусов приматов и их эволюции у приматов, не являющихся человеком, в Африке (PDF) . Сборник последовательностей ВИЧ. Лос-Аламос, Нью-Мексико: Группа теоретической биологии и биофизики, Национальная лаборатория Лос-Аламоса. стр. 2–23 . Проверено 19 сентября 2010 г.

[millennia-3] Перейти обратно: ^а ^б Макнил Дональд Дж. младший (16 сентября 2010 г.). «Предшественник ВИЧ был у обезьян на протяжении тысячелетий» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 17 сентября 2010 г.

[4] Воробей М., Телфер П., Сукьер С., Хантер М., Коулман К.А., Мецгер М.Дж. и др. (сентябрь 2010 г.). «Биогеография острова раскрывает глубокую историю SIV». Наука . 329 (5998): 1487. Бибкод : 2010Sci...329.1487W . дои : 10.1126/science.1193550 . ПМИД 20847261 . S2CID 37803712 . .

[5] Sharp PM, Хан Б.Х. (август 2010 г.). «Эволюция ВИЧ-1 и происхождение СПИДа» . Философские труды Лондонского королевского общества. Серия Б, Биологические науки . 365 (1552): 2487–2494. дои : 10.1098/rstb.2010.0031 . ПМК 2935100 . ПМИД 20643738 .

[6] Питерс М., Д'Арк М., Делапорт Э. (2014). «Происхождение и разнообразие ретровирусов человека» . Обзоры по СПИДу . 16 (1): 23–34. ПМК 4289907 . ПМИД 24584106 .

[7] Ясинска А.Дж., Пандреа И., Апетрей С. (27 января 2022 г.). «CCR5 как корецептор вируса иммунодефицита человека и вирусов иммунодефицита обезьян: прототип романа любви и ненависти» . Границы в иммунологии . 13 : 835994. дои : 10.3389/fimmu.2022.835994 . ISSN 1664-3224 . ПМЦ 8829453 . ПМИД 35154162 .

[8] «Подробности о таксонах | ICTV» . ictv.global .

[9] Запись в базе данных ICTV: 61.0.6.5.003.

[pmid22229120-10] Перейти обратно: ^а ^б ^с Sharp PM, Хан Б.Х. (сентябрь 2011 г.). «Истоки ВИЧ и пандемии СПИДа» . Перспективы Колд-Спринг-Харбора в медицине . 1 (1): а006841. doi : 10.1101/cshperspect.a006841 . ПМК 3234451 . ПМИД 22229120 .

[11] Ахука-Мундеке С., Аюба А., Мбала-Кингебени П., Льежуа Ф., Эстебан А., Лунгуя-Метила О. и др. (декабрь 2011 г.). «Новый мультиплексный анализ обнаружения антител к ВИЧ/вирусу иммунодефицита обезьян» . Новые инфекционные заболевания . 17 (12): 2277–2286. дои : 10.3201/eid1712.110783 . ПМК 3311211 . ПМИД 22172157 .

[12] Панчино Дж., Сильвестри Дж., Фаук К.Р. (2012). Модели защиты от ВИЧ/ВИО: предотвращение СПИДа у людей и обезьян . Эльзевир. п. 6. ISBN 978-0-12-387715-4 .

[13] Петерс М., Курно В., Абела Б., Озель П., Пуррю Х, Биболле-Рюш Ф. и др. (май 2002 г.). «Риск для здоровья человека из-за множества вирусов иммунодефицита обезьян в мясе диких приматов» . Новые инфекционные заболевания . 8 (5): 451–457. дои : 10.3201/eid0805.010522 . ПМЦ 2732488 . ПМИД 11996677 .

[14] Лаук М., Свитцер В.М., Сибли С.Д., Хероба Д., Тумукунде А., Вени Г. и др. (октябрь 2013 г.). «Обнаружение и полная характеристика генома двух сильно различающихся вирусов иммунодефицита обезьян, заражающих черно-белых обезьян-колобусов (Colobus guereza) в национальном парке Кибале, Уганда» . Ретровирусология . 10 :107. дои : 10.1186/1742-4690-10-107 . ПМК 4016034 . ПМИД 24139306 .

[pmid19300488-15] Гилберт, К; Максфилд, генеральный директор; Гудман, С.М.; Фешотт, К. (март 2009 г.). «Параллельная зародышевая инфильтрация лентивируса у двух малагасийских лемуров» . ПЛОС Генетика . 5 (3): e1000425. дои : 10.1371/journal.pgen.1000425 . ПМК 2651035 . ПМИД 19300488 .

[pmid6221343-16] Летвин Н.Л., Итон К.А., Олдрич В.Р., Сегал П.К., Блейк Б.Дж., Шлоссман С.Ф. и др. (май 1983 г.). «Синдром приобретенного иммунодефицита в колонии макак» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 80 (9): 2718–2722. Бибкод : 1983PNAS...80.2718L . дои : 10.1073/pnas.80.9.2718 . ПМЦ 393899 . ПМИД 6221343 .

[pmid3159089-17] Перейти обратно: ^а ^б Дэниел М.Д., Летвин Н.Л., Кинг Н.В., Каннаги М., Сегал П.К., Хант Р.Д. и др. (июнь 1985 г.). «Выделение Т-клеточного тропного HTLV-III-подобного ретровируса от макак». Наука . 228 (4704): 1201–1204. Бибкод : 1985Sci...228.1201D . дои : 10.1126/science.3159089 . ПМИД 3159089 .

[pmid6316791-18] Кинг Н.В., Хант Р.Д., Летвин Н.Л. (декабрь 1983 г.). «Гистопатологические изменения у макак с синдромом приобретенного иммунодефицита (СПИД)» . Американский журнал патологии . 113 (3): 382–388. ЧВК 1916356 . ПМИД 6316791 .

[Sharp_2005-19] Перейти обратно: ^а ^б Sharp PM, Shaw GM, Hahn BH (апрель 2005 г.). «Инфекция шимпанзе вирусом обезьяньего иммунодефицита» . Журнал вирусологии . 79 (7): 3891–3902. doi : 10.1128/JVI.79.7.3891-3902.2005 . ПМЦ 1061584 . ПМИД 15767392 .

[cbc20100917-20] «Предшественник ВИЧ у древних обезьян: исследование» . Новости Си-Би-Си. 17 сентября 2010 года. Архивировано из оригинала 25 марта 2013 года . Проверено 17 сентября 2010 г.

[21] Гиффорд, Р.Дж.; Кацуракис, А; Тристем, М; Пибус, Огайо; Уинтерс, М; Шафер, RW (23 декабря 2008 г.). «Переходный эндогенный лентивирус из генома базального примата и последствия для эволюции лентивируса» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (51): 20362–7. дои : 10.1073/pnas.0807873105 . ПМК 2603253 . ПМИД 19075221 .

[22] Хини Дж.Л., Далглиш АГ, Вайс Р.А. (июль 2006 г.). «Происхождение ВИЧ и эволюция устойчивости к СПИДу». Наука . 313 (5786): 462–466. Бибкод : 2006Sci...313..462H . дои : 10.1126/science.1123016 . ПМИД 16873637 . S2CID 27673160 .

[23] Пандреа, Ивона; Содора, Дональд Л.; Сильвестри, Гвидо; Апетрей, Кристиан (сентябрь 2008 г.). «В дикой природе: инфекция обезьяньего вируса иммунодефицита (SIV) у естественных хозяев» . Тенденции в иммунологии . 29 (9): 419–428. дои : 10.1016/j.it.2008.05.004 . ISSN 1471-4906 . ПМК 2840226 . ПМИД 18676179 .

[24] Шимпанзе действительно умирают от обезьяньего СПИДа, результаты исследования Лоуренса К. Альтмана Шимпанзе действительно умирают от обезьяньего СПИДа, результаты исследования

[25] Кил Б.Ф., Джонс Дж.Х., Терио К.А., Эстес Дж.Д., Рудиселл Р.С., Уилсон М.Л. и др. (июль 2009 г.). «Повышенная смертность и СПИД-подобная иммунопатология у диких шимпанзе, инфицированных SIVcpz» . Природа . 460 (7254): 515–519. Бибкод : 2009Natur.460..515K . дои : 10.1038/nature08200 . ПМЦ 2872475 . ПМИД 19626114 .

[:0-26] Перейти обратно: ^а ^б Ма Д., Ясинска А., Кристофф Дж., Гроблер Дж.П., Тернер Т., Юнг Ю. и др. (январь 2013 г.). «Инфекция SIVagm у диких африканских зеленых мартышек из Южной Африки: эпидемиология, естественная история и эволюционные соображения» . ПЛОС Патогены . 9 (1): e1003011. дои : 10.1371/journal.ppat.1003011 . ПМЦ 3547836 . ПМИД 23349627 .

[:1-27] Перейти обратно: ^а ^б Ма Д., Ясинска А.Дж., Фейертаг Ф., Виджевардана В., Кристофф Дж., Хе Т. и др. (май 2014 г.). «Факторы, связанные с передачей вируса иммунодефицита симана у естественного африканского примата-хозяина, не являющегося человеком, в дикой природе» . Журнал вирусологии . 88 (10): 5687–5705. дои : 10.1128/JVI.03606-13 . ПМК 4019088 . ПМИД 24623416 .

[28] Капусински Б., Малвани У., Ясинска А.Дж., Дэн Х, Фреймер Н., Делварт Э. (август 2015 г.). «Локальное исчезновение вирусов из-за узкого места в популяции хозяев» . Журнал вирусологии . 89 (16): 8152–8161. дои : 10.1128/jvi.00671-15 . ПМЦ 4524239 . ПМИД 26018153 .

[29] Ясинска А.Дж., Донг Т.С., Лагишетти В., Кацка В., Джейкобс Дж.П., Шмитт К.А. и др. (ноябрь 2020 г.). «Изменения в микробном разнообразии, составе и функциональности кишечного и генитального микробиома во время естественной инфекции SIV у верветок» . Микробиом . 8 (1): 154. дои : 10.1186/s40168-020-00928-4 . ПМЦ 7648414 . ПМИД 33158452 .

[30] Свардал Х., Ясинска А.Дж., Апетрей С., Коппола Г., Хуанг Ю., Шмитт К.А. и др. (декабрь 2017 г.). «Древняя гибридизация и сильная адаптация к вирусам в популяциях африканских верветок» . Природная генетика . 49 (12): 1705–1713. дои : 10.1038/ng.3980 . ПМК 5709169 . ПМИД 29083404 .

[31] «Устойчивый к нейтрализации» относится к штаммам, которые не могут быть нейтрализованы нативным иммунным ответом из-за компенсирующей мутации; см. информацию, связанную с ВИЧ-1 .

[32] Баруш Д.Х., Лю Дж., Ли Х., Максфилд Л.Ф., Аббинк П., Линч Д.М. и др. (январь 2012 г.). «Вакцинальная защита от заражения устойчивыми к нейтрализации вирусами SIV у макак-резус» . Природа . 482 (7383): 89–93. Бибкод : 2012Natur.482...89B . дои : 10.1038/nature10766 . ПМК 3271177 . ПМИД 22217938 .
Симеон Беннетт (4 января 2012 г.). «Вакцина от СПИДа J&J помогает защитить обезьян от вируса» . Блумберг .

[33] Симеон Беннетт (4 января 2012 г.). «Вакцина от СПИДа J&J помогает защитить обезьян от вируса» . Блумберг .

[33] Хансен С.Г., Пиатак М., Вентура А.Б., Хьюз К.М., Гилбрайд Р.М., Форд Дж.К. и др. (октябрь 2013 г.). «Иммунный клиренс высокопатогенной SIV-инфекции» . Природа . 502 (7469): 100–104. Бибкод : 2013Natur.502..100H . дои : 10.1038/nature12519 . ПМЦ 3849456 . ПМИД 24025770 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]