ПНКД

ПНКД
Идентификаторы
Псевдонимы	PNKD , BRP17, DYT8, FPD1, KIPP1184, MR-1, MR1, PDC, PKND1, TAHCCP2, FKSG19, пароксизмальная некинезигенная дискинезия, PNKD1, домен MBL, содержащий, MR-1S, PNKD, содержащий домен металло-бета-лактамазы, R1
Внешние идентификаторы	Опустить : 609023 ; МГИ : 1930773 ; Гомологен : 75045 ; GeneCards : ПНКД ; ОМА : ПНКД - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	218,346,793 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	74,392,853 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right uterine tube; ; right lobe of liver; ; mucosa of transverse colon; ; right lobe of thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; Brodmann area 9; ; right frontal lobe; ; prefrontal cortex; ; cingulate gyrus; ; anterior cingulate cortex;
	Top expressed in
	pontine nuclei; ; superior colliculus; ; yolk sac; ; CA3 field; ; right kidney; ; perirhinal cortex; ; medulla oblongata; ; central gray substance of midbrain; ; primary visual cortex; ; entorhinal cortex;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	hydroxyacylglutathione hydrolase activity; protein binding; hydrolase activity; metal ion binding;
Cellular component	cytoplasm; membrane; mitochondrion; nucleus;
Biological process	regulation of synaptic transmission, dopaminergic; methylglyoxal catabolic process to D-lactate via S-lactoyl-glutathione; negative regulation of neurotransmitter secretion; neuromuscular process controlling posture; regulation of dopamine metabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	25953
	56695
	ENSG00000127838
	ENSMUSG00000026179
	Q8N490
	Q69ZP3
	НМ_022572 ; НМ_001077399 ; НМ_015488
	НМ_001039509 ; НМ_019999 ; НМ_025580
	НП_001070867 ; НП_056303 ; НП_072094
	НП_001034598 ; НП_064383 ; НП_079856
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

ПНКД — это аббревиатура пароксизмальной некинезиогенной дискинезии, неврологического двигательного расстройства человека . Как и многие другие генетические нарушения человека, PNKD также относится к заболеванию, гену заболевания и кодируемому белку. (PNKD) — белок , который у человека кодируется PNKD геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Альтернативный сплайсинг приводит к транскрипции трех изоформ . Мышиный ортолог называется мозговым белком 17 (Brp17).

Структура

Этот ген расположен на хромосоме 2 в участке 2q35 и содержит 12 экзонов . ^{[ 6 ]} По крайней мере три изоформы различной длины (длинная, средняя и короткая) могут быть получены путем альтернативного сплайсинга этого гена. В то время как генные продукты длинной (PNKD-L) и средней (PNKD-M) изоформ содержат С-концевой домен β-лактамазы , короткая изоформа (PNKD-S), обычно называемая регулятором миофибриллогенеза-1 (MR- 1), содержит всего три экзона и не имеет гомологии ни с одним известным белком. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Эти изоформы также различаются по тканеспецифической экспрессии и субклеточной локализации . В частности, PNKD-L экспрессируется только в центральной нервной системе , тогда как PNKD-M и PNKD-S экспрессируются повсеместно в тканях. ^{[ 7 ]} При этом PNKD-L локализуется в клеточной мембране , PNKD-S — в цитоплазме и ядре , а PNKD-M — в митохондриях . ^{[ 9 ]}

Функция

Функция белков PNKD неизвестна, но длинные и средние изоформы PNKD содержат консервативный домен β-лактамазы , что позволяет предположить, что они могут функционировать как фермент . Ближайшим гомологом PNKD у млекопитающих является HAGH , фермент, участвующий в двухэтапной реакции гидролиза SLG и образования D-молочной кислоты и восстановления GSH. Однако гидролитическая активность ПНКД минимальна. ^{[ 7 ]}

Длинная форма PNKD нейронально-специфична и кодирует синаптический белок, который преимущественно локализуется на пресинаптической мембране. Постсинаптическая область и везикулярная структура также иногда имеют длинную форму ПНКД. Длинная форма PNKD взаимодействует с пресинаптическим белком RIM и ингибирует синаптический экзоцитоз. ПНКД с болезненными мутациями менее эффективна в ингибировании, поэтому высвобождение синапсов увеличивается. Это может вызвать чрезмерное высвобождение нейромедиаторов в мозге и, возможно, стать основной причиной развития эпилепсии у пациентов с ПНКД. ^{[ 10 ]}

Клиническое значение

Точечные мутации в экзоне 1 PNKD вызывают у людей наследственное неврологическое двигательное расстройство, называемое пароксизмальной некинезигенной дискинезией . ^{[ 6 ]} Сверхэкспрессия PNKD также связана с множественными видами рака, включая аденокарциному протоков поджелудочной железы . ^{[ 11 ]} рак желудка , ^{[ 12 ]} рак яичников , ^{[ 13 ]} и рак молочной железы ^{[ 8 ]} и может служить терапевтической мишенью для лечения этих видов рака или биомаркером для оценки результатов лечения пациентов. Задействованные сигнальные пути могут различаться в зависимости от рака. Например, в клетках рака молочной железы человека (MCF7) PNKD может способствовать пролиферации опухолевых клеток путем активации сигнального пути MEK/ERK , тогда как в клетках гепатомы человека (HepG2) PNKD может действовать через путь MLC2/FAK/AKT . ^{[ 8 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PNKD взаимодействует с:

Молекула, взаимодействующая с Rab3 (RIM)1 ^{[ 10 ]}
РИМ2 ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000127838 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026179 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Финк Дж.К., Райнер С., Вилковски Дж., Джонс С.М., Куме А., Хедера П., Альбин Р., Мэтай Дж., Гирбах Л., Варвиль Т., Оттеруд Б., Лепперт М. (июль 1996 г.). «Пароксизмально-дистонический хореоатетоз: тесная связь с хромосомой 2q» . Американский журнал генетики человека . 59 (1): 140–5. ЧВК 1915128 . ПМИД 8659518 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: пароксизмальная некинезиогенная дискинезия ПНКД» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Шен Ю., Ли Х.И., Роусон Дж., Оджа С., Бэббит П., Фу Ю.Х., Птачек Л.Дж. (июнь 2011 г.). «Мутации в PNKD, вызывающие пароксизмальную дискинезию, изменяют расщепление и стабильность белка» . Молекулярная генетика человека . 20 (12): 2322–32. дои : 10.1093/hmg/ddr125 . ПМК 3098736 . ПМИД 21487022 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Гун Ю, Хэ Х, Лю Х, Чжан С, Чжао В, Шао Р.Г. (август 2014 г.). «Фосфорилирование регулятора миофибриллогенеза-1 активирует сигнальный путь MAPK и индуцирует пролиферацию и миграцию в клетках рака молочной железы человека MCF7» . Письма ФЭБС . 588 (17): 2903–10. дои : 10.1016/j.febslet.2014.07.018 . ПМИД 25066297 . S2CID 38906043 .
^ «PNKD - Вероятная гидролаза PNKD - Homo sapiens (Человек) - Ген и белок PNKD» . www.uniprot.org . Проверено 25 июля 2016 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Шен Ю, Ге В.П., Ли Ю, Хирано А., Ли Х.И., Рольманн А., Мисслер М., Цянь Р.В., Ян Л.И., Фу Ю.Х., Птачек Л.Дж. (март 2015 г.). «Белок, мутировавший при пароксизмальной дискинезии, взаимодействует с белком активной зоны RIM и подавляет экзоцитоз синаптических везикул» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (10): 2935–41. Бибкод : 2015PNAS..112.2935S . дои : 10.1073/pnas.1501364112 . ПМК 4364199 . ПМИД 25730884 .
^ Чжао С.И., Го З.Дж., Дай С.М., Чжан Ю, Чжоу Дж.Дж. (октябрь 2013 г.). «Клинико-патологическое и прогностическое значение экспрессии белка-регулятора миофибриллогенеза-1 при аденокарциноме протоков поджелудочной железы». Биология опухолей . 34 (5): 2983–7. дои : 10.1007/s13277-013-0862-4 . ПМИД 23696030 . S2CID 6019528 .
^ Го Дж, Донг Б, Цзи Дж. Ф., Ву А. В. (октябрь 2012 г.). «Сверхэкспрессия регулятора миофибриллогенеза-1 связана с плохим прогнозом для пациентов с раком желудка» . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 18 (38): 5434–41. дои : 10.3748/wjg.v18.i38.5434 . ПМЦ 3471113 . ПМИД 23082061 .
^ Лу РК, Сунь М, Гао X, Го Л (март 2012 г.). «[Экспрессия нового биомаркера MR-1S при раке яичников и его биологическое значение]». Чжунхуа Чжун Лю За Чжи [Китайский онкологический журнал] . 34 (3): 176–81. doi : 10.3760/cma.j.issn.0253-3766.2012.03.004 . ПМИД 22780969 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000127838 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026179 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8659518-5] Финк Дж.К., Райнер С., Вилковски Дж., Джонс С.М., Куме А., Хедера П., Альбин Р., Мэтай Дж., Гирбах Л., Варвиль Т., Оттеруд Б., Лепперт М. (июль 1996 г.). «Пароксизмально-дистонический хореоатетоз: тесная связь с хромосомой 2q» . Американский журнал генетики человека . 59 (1): 140–5. ЧВК 1915128 . ПМИД 8659518 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: пароксизмальная некинезиогенная дискинезия ПНКД» .

[pmid21487022-7] Jump up to: ^а ^б ^с Шен Ю., Ли Х.И., Роусон Дж., Оджа С., Бэббит П., Фу Ю.Х., Птачек Л.Дж. (июнь 2011 г.). «Мутации в PNKD, вызывающие пароксизмальную дискинезию, изменяют расщепление и стабильность белка» . Молекулярная генетика человека . 20 (12): 2322–32. дои : 10.1093/hmg/ddr125 . ПМК 3098736 . ПМИД 21487022 .

[Gong_2014-8] Jump up to: ^а ^б ^с Гун Ю, Хэ Х, Лю Х, Чжан С, Чжао В, Шао Р.Г. (август 2014 г.). «Фосфорилирование регулятора миофибриллогенеза-1 активирует сигнальный путь MAPK и индуцирует пролиферацию и миграцию в клетках рака молочной железы человека MCF7» . Письма ФЭБС . 588 (17): 2903–10. дои : 10.1016/j.febslet.2014.07.018 . ПМИД 25066297 . S2CID 38906043 .

[9] «PNKD - Вероятная гидролаза PNKD - Homo sapiens (Человек) - Ген и белок PNKD» . www.uniprot.org . Проверено 25 июля 2016 г.

[Shen_2015-10] Jump up to: ^а ^б ^с Шен Ю, Ге В.П., Ли Ю, Хирано А., Ли Х.И., Рольманн А., Мисслер М., Цянь Р.В., Ян Л.И., Фу Ю.Х., Птачек Л.Дж. (март 2015 г.). «Белок, мутировавший при пароксизмальной дискинезии, взаимодействует с белком активной зоны RIM и подавляет экзоцитоз синаптических везикул» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (10): 2935–41. Бибкод : 2015PNAS..112.2935S . дои : 10.1073/pnas.1501364112 . ПМК 4364199 . ПМИД 25730884 .

[11] Чжао С.И., Го З.Дж., Дай С.М., Чжан Ю, Чжоу Дж.Дж. (октябрь 2013 г.). «Клинико-патологическое и прогностическое значение экспрессии белка-регулятора миофибриллогенеза-1 при аденокарциноме протоков поджелудочной железы». Биология опухолей . 34 (5): 2983–7. дои : 10.1007/s13277-013-0862-4 . ПМИД 23696030 . S2CID 6019528 .

[12] Го Дж, Донг Б, Цзи Дж. Ф., Ву А. В. (октябрь 2012 г.). «Сверхэкспрессия регулятора миофибриллогенеза-1 связана с плохим прогнозом для пациентов с раком желудка» . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 18 (38): 5434–41. дои : 10.3748/wjg.v18.i38.5434 . ПМЦ 3471113 . ПМИД 23082061 .

[13] Лу РК, Сунь М, Гао X, Го Л (март 2012 г.). «[Экспрессия нового биомаркера MR-1S при раке яичников и его биологическое значение]». Чжунхуа Чжун Лю За Чжи [Китайский онкологический журнал] . 34 (3): 176–81. doi : 10.3760/cma.j.issn.0253-3766.2012.03.004 . ПМИД 22780969 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]