Белок Polycomb EED

ЕФД
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3IIW, 3IIY, 3IJ0, 3IJ1, 3IJC, 3JPX, 3JZG, 3JZH, 3JZN, 3K26, 3K27, 4X3E, 5IJ7, 5IJ8, 5HYN
Идентификаторы
Псевдонимы	EED , HWAIT1, развитие эмбриональной эктодермы, COGIS
Внешние идентификаторы	Опустить : 605984 ; МГИ : 95286 ; Гомологен : 2814 ; GeneCards : EED ; ОМА : EED – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	86,278,813 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	89,630,191 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	lymph node; ; cerebellar vermis; ; cerebellar hemisphere; ; canal of the cervix; ; right uterine tube; ; epithelium of bronchus; ; mucosa of transverse colon; ; right hemisphere of cerebellum; ; left ovary; ; ventricular zone;
	Top expressed in
	zygote; ; primary oocyte; ; secondary oocyte; ; yolk sac; ; primitive streak; ; morula; ; morula; ; medullary collecting duct; ; Gonadal ridge; ; ureter;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	chromatin binding; protein binding; identical protein binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; histone methyltransferase activity; histone methyltransferase activity (H3-K27 specific); nucleosome binding;
Cellular component	sex chromatin; ESC/E(Z) complex; chromosome; pronucleus; nucleus; nucleoplasm; cytosol;
Biological process	regulation of gene expression by genetic imprinting; regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; negative regulation of gene expression, epigenetic; spinal cord development; positive regulation of histone H3-K27 methylation; histone methylation; negative regulation of transcription, DNA-templated; regulation of adaxial/abaxial pattern formation; histone H3-K27 methylation; cellular response to leukemia inhibitory factor; negative regulation of G0 to G1 transition; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8726
	13626
	ENSG00000074266
	ENSMUSG00000030619
	О75530
	Q921E6
	НМ_001308007 ; НМ_003797 ; НМ_152991 ; НМ_001330334
	НМ_021876
	НП_001294936 ; НП_001317263 ; НП_003788
	НП_068676
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок Polycomb EED — это белок , который у человека кодируется EED геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Белок Polycomb EED является членом семейства Polycomb -группы (PcG). Члены семейства PcG образуют мультимерные белковые комплексы, которые участвуют в поддержании транскрипционно-репрессивного состояния генов на протяжении последующих поколений клеток. Этот белок взаимодействует с энхансером zeste 2, цитоплазматическим хвостом интегрина β7 , белком MA вируса иммунодефицита типа 1 (ВИЧ-1) и гистондеацетилазы белками . Этот белок опосредует репрессию активности генов посредством деацетилирования гистонов и может действовать как специфический регулятор функции интегрина. Для этого гена были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 7 ]}

Клиническое значение

У людей de novo сообщалось о мутации EED у человека с симптомами, сходными с симптомами синдрома Уивера . ^{[ 8 ]}

Взаимодействия

Было показано, что EED взаимодействует с:

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000074266 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030619 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Ритцлер М., Биттнер М., Коланус В., Шустер А., Хольцманн Б. (ноябрь 1998 г.). «Человеческий белок-повтор WD WAIT-1 специфически взаимодействует с цитоплазматическими хвостами бета7-интегринов» . Ж. Биол. Хим . 273 (42): 27459–66. дои : 10.1074/jbc.273.42.27459 . ПМИД 9765275 .
^ Шумахер А., Лихтардж О., Шварц С., Магнусон Т. (январь 1999 г.). «Мышиный ген eed группы Polycomb и его человеческий ортолог: функциональные последствия эволюционного сохранения». Геномика . 54 (1): 79–88. дои : 10.1006/geno.1998.5509 . ПМИД 9806832 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: развитие эмбриональной эктодермы EED» .
^ Коэн А.С., Туйсуз Б., Шен Ю., Бхалла С.К., Джонс С.Дж., Гибсон В.Т. (март 2015 г.). «Новая мутация EED, связанная с чрезмерным ростом» . Журнал генетики человека . 60 (6): 339–342. дои : 10.1038/jhg.2015.26 . ПМИД 25787343 . S2CID 22055237 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ван дер Влаг Дж., Отте AP (декабрь 1999 г.). «Репрессия транскрипции, опосредованная белком EED группы полисот человека, включает деацетилирование гистонов». Нат. Жене . 23 (4): 474–8. дои : 10.1038/70602 . ПМИД 10581039 . S2CID 6748531 .
^ ван Лохейзен М., Таймс М., Вонкен Дж.В., Шумахер А., Магнусон Т., Вьентйенс Э. (июнь 1998 г.). «Взаимодействие белков мышиной поликомб-группы (Pc-G) Enx1 и Enx2 с Eed: указание на отдельные комплексы Pc-G» . Мол. Клетка. Биол . 18 (6): 3572–9. дои : 10.1128/MCB.18.6.3572 . ПМЦ 108938 . ПМИД 9584197 .
^ Денисенко О., Шнырева М., Сузуки Х., Бомштык К. (октябрь 1998 г.). «Точечные мутации в домене WD40 Eed блокируют его взаимодействие с Ezh2» . Мол. Клетка. Биол . 18 (10): 5634–42. дои : 10.1128/MCB.18.10.5634 . ПМК 109149 . ПМИД 9742080 .
^ Джин К., ван Эйнде А., Бёлленс М., Рой Н., Тиль Г., Сталманс В., Боллен М. (август 2003 г.). «Регулятор протеинфосфатазы-1 (PP1), ядерный ингибитор PP1 (NIPP1), взаимодействует с белком группы поликомб, развитием эмбриональной эктодермы (EED), и действует как репрессор транскрипции» . Ж. Биол. Хим . 278 (33): 30677–85. дои : 10.1074/jbc.M302273200 . ПМИД 12788942 .
^ Энюнлю I, Папай Г, Церпан I, Удварди А, Жанг К.Т., Борос I (сентябрь 2003 г.). «Различные изоформы PRIP-взаимодействующего белка с доменом метилтрансферазы/триметилгуанозинсинтазы локализуются в цитоплазме и ядре». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 309 (1): 44–51. дои : 10.1016/s0006-291x(03)01514-6 . ПМИД 12943661 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O75530 (белок Polycomb EED) в PDBe-KB .

Дальнейшее чтение

Джозеф А.М., Кумар М., Митра Д. (2005). «Нэф: «необходимый и принудительный фактор» при ВИЧ-инфекции». Курс. ВИЧ Рез . 3 (1): 87–94. дои : 10.2174/1570162052773013 . ПМИД 15638726 .
Ван Маеле Б., Дебизер З. (2005). «Интеграция ВИЧ-1: взаимодействие между интегразой ВИЧ-1, клеточными и вирусными белками». СПИД преп . 7 (1): 26–43. ПМИД 15875659 .
Джонс Калифорния, Нг Дж, Петерсон А.Дж., Морган К., Саймон Дж., Джонс Р.С. (1998). «Белки esc и E(z) дрозофилы являются прямыми партнерами в репрессии, опосредованной полисотовой группой» . Мол. Клетка. Биол . 18 (5): 2825–34. дои : 10.1128/mcb.18.5.2825 . ПМЦ 110661 . ПМИД 9566901 .
ван Лохуизен М., Таймс М., Вонкен Дж.В., Шумахер А., Магнусон Т., Вьентйенс Э. (1998). «Взаимодействие белков мышиной поликомб-группы (Pc-G) Enx1 и Enx2 с Eed: указание на отдельные комплексы Pc-G» . Мол. Клетка. Биол . 18 (6): 3572–9. дои : 10.1128/MCB.18.6.3572 . ПМЦ 108938 . ПМИД 9584197 .
Севальт Р.Г., ван дер Влаг Дж., Гюнстер М.Дж., Хамер К.М., ден Блаувен Дж.Л., Сатин Д.П., Хендрикс Т., ван Дрил Р., Отте А.П. (1998). «Характеристика взаимодействий между белками группы полисот млекопитающих Enx1 / EZH2 и EED предполагает существование различных белковых комплексов группы полисот млекопитающих» . Мол. Клетка. Биол . 18 (6): 3586–95. дои : 10.1128/mcb.18.6.3586 . ПМК 108940 . ПМИД 9584199 .
Денисенко О, Шнырева М, Сузуки Х, Бомштык К (1998). «Точечные мутации в домене WD40 Eed блокируют его взаимодействие с Ezh2» . Мол. Клетка. Биол . 18 (10): 5634–42. дои : 10.1128/MCB.18.10.5634 . ПМК 109149 . ПМИД 9742080 .
Пейтави Р., Хонг С.С., Гей Б., д'Анжак А.Д., Селиг Л., Бенишу С., Бенарус Р., Буланже П. (1999). «HEED, продукт человеческого гомолога мышиного гена eed, связывается с матричным белком ВИЧ-1» . Ж. Биол. Хим . 274 (3): 1635–45. дои : 10.1074/jbc.274.3.1635 . ПМИД 9880543 .
ван дер Влаг Дж., Отте А.П. (1999). «Транкрипционная репрессия, опосредованная белком EED группы полисот человека, включает деацетилирование гистонов». Нат. Жене . 23 (4): 474–8. дои : 10.1038/70602 . ПМИД 10581039 . S2CID 6748531 .
Сатин Д.П., Хамер К.М., ден Блаувен Дж., Отте А.П. (2001). «Белок группы полисот EED взаимодействует с YY1, и оба белка индуцируют нервную ткань у эмбрионов Xenopus» . Мол. Клетка. Биол . 21 (4): 1360–9. дои : 10.1128/MCB.21.4.1360-1369.2001 . ПМК 99588 . ПМИД 11158321 .
Кузьмичев А, Нишиока К, Эрджюмент-Бромаж Х, Темпст П, Рейнберг Д (2002). «Активность гистон-метилтрансферазы, связанная с мультибелковым комплексом человека, содержащим усилитель белка Zeste» . Генс Дев . 16 (22): 2893–905. дои : 10.1101/gad.1035902 . ЧВК 187479 . ПМИД 12435631 .
Джин К., ван Эйнде А., Бёлленс М., Рой Н., Тиль Г., Сталманс В., Боллен М. (2003). «Регулятор протеинфосфатазы-1 (PP1), ядерный ингибитор PP1 (NIPP1), взаимодействует с белком группы поликомб, развитием эмбриональной эктодермы (EED), и действует как репрессор транскрипции» . Ж. Биол. Хим . 278 (33): 30677–85. дои : 10.1074/jbc.M302273200 . ПМИД 12788942 .
Энюнлю I, Папай Г, Церпан I, Удварди А, Жанг К.Т., Борос I (2003). «Различные изоформы PRIP-взаимодействующего белка с доменом метилтрансферазы/триметилгуанозинсинтазы локализуются в цитоплазме и ядре». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 309 (1): 44–51. дои : 10.1016/S0006-291X(03)01514-6 . ПМИД 12943661 .
Виоло С., Хонг СС, Ракотобе Д., Пети С., Гей Б., Моро К., Бийо Дж., Приет С., Сир Дж., Шварц О., Мусаде Дж. Ф., Буланже П. (2003). «Белок EED группы полисот человека взаимодействует с интегразой вируса иммунодефицита человека типа 1» . Дж. Вирол . 77 (23): 12507–22. doi : 10.1128/JVI.77.23.12507-12522.2003 . ПМК 262565 . ПМИД 14610174 .
Витте В., Лафферт Б., Розориус О, Лишка П., Блюм К., Галлер Г., Стилпер А., Уиллболд Д., Д'Алоха П., Сикст М., Коланус Дж., Отт М., Коланус В., Шулер Г., Баур А.С. (2004). «ВИЧ-1 Nef имитирует сигнал рецептора интегрина, который рекрутирует белок Eed группы поликомбов на плазматическую мембрану» . Мол. Клетка . 13 (2): 179–90. дои : 10.1016/S1097-2765(04)00004-8 . ПМИД 14759364 .
Цао Р, Чжан Ю (2004). «SUZ12 необходим как для активности гистон-метилтрансферазы, так и для функции молчания комплекса EED-EZH2» . Мол. Клетка . 15 (1): 57–67. doi : 10.1016/j.molcel.2004.06.020 . ПМИД 15225548 .
Пасини Д., Бракен А.П., Дженсен М.Р., Лаззерини Денчи Э., Хелин К. (2004). «Suz12 необходим для развития мышей и для активности гистон-метилтрансферазы EZH2» . ЭМБО Дж . 23 (20): 4061–71. дои : 10.1038/sj.emboj.7600402 . ПМК 524339 . ПМИД 15385962 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000074266 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030619 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9765275-5] Jump up to: ^а ^б Ритцлер М., Биттнер М., Коланус В., Шустер А., Хольцманн Б. (ноябрь 1998 г.). «Человеческий белок-повтор WD WAIT-1 специфически взаимодействует с цитоплазматическими хвостами бета7-интегринов» . Ж. Биол. Хим . 273 (42): 27459–66. дои : 10.1074/jbc.273.42.27459 . ПМИД 9765275 .

[pmid9806832-6] Шумахер А., Лихтардж О., Шварц С., Магнусон Т. (январь 1999 г.). «Мышиный ген eed группы Polycomb и его человеческий ортолог: функциональные последствия эволюционного сохранения». Геномика . 54 (1): 79–88. дои : 10.1006/geno.1998.5509 . ПМИД 9806832 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: развитие эмбриональной эктодермы EED» .

[8] Коэн А.С., Туйсуз Б., Шен Ю., Бхалла С.К., Джонс С.Дж., Гибсон В.Т. (март 2015 г.). «Новая мутация EED, связанная с чрезмерным ростом» . Журнал генетики человека . 60 (6): 339–342. дои : 10.1038/jhg.2015.26 . ПМИД 25787343 . S2CID 22055237 .

[pmid10581039-9] Jump up to: ^а ^б ^с ван дер Влаг Дж., Отте AP (декабрь 1999 г.). «Репрессия транскрипции, опосредованная белком EED группы полисот человека, включает деацетилирование гистонов». Нат. Жене . 23 (4): 474–8. дои : 10.1038/70602 . ПМИД 10581039 . S2CID 6748531 .

[pmid9584197-10] ван Лохейзен М., Таймс М., Вонкен Дж.В., Шумахер А., Магнусон Т., Вьентйенс Э. (июнь 1998 г.). «Взаимодействие белков мышиной поликомб-группы (Pc-G) Enx1 и Enx2 с Eed: указание на отдельные комплексы Pc-G» . Мол. Клетка. Биол . 18 (6): 3572–9. дои : 10.1128/MCB.18.6.3572 . ПМЦ 108938 . ПМИД 9584197 .

[pmid9742080-11] Денисенко О., Шнырева М., Сузуки Х., Бомштык К. (октябрь 1998 г.). «Точечные мутации в домене WD40 Eed блокируют его взаимодействие с Ezh2» . Мол. Клетка. Биол . 18 (10): 5634–42. дои : 10.1128/MCB.18.10.5634 . ПМК 109149 . ПМИД 9742080 .

[pmid12788942-12] Джин К., ван Эйнде А., Бёлленс М., Рой Н., Тиль Г., Сталманс В., Боллен М. (август 2003 г.). «Регулятор протеинфосфатазы-1 (PP1), ядерный ингибитор PP1 (NIPP1), взаимодействует с белком группы поликомб, развитием эмбриональной эктодермы (EED), и действует как репрессор транскрипции» . Ж. Биол. Хим . 278 (33): 30677–85. дои : 10.1074/jbc.M302273200 . ПМИД 12788942 .

[pmid12943661-13] Энюнлю I, Папай Г, Церпан I, Удварди А, Жанг К.Т., Борос I (сентябрь 2003 г.). «Различные изоформы PRIP-взаимодействующего белка с доменом метилтрансферазы/триметилгуанозинсинтазы локализуются в цитоплазме и ядре». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 309 (1): 44–51. дои : 10.1016/s0006-291x(03)01514-6 . ПМИД 12943661 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]