Интегрин бета 7

Itgb7
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2BRQ, 3V4P, 3V4V
Идентификаторы
Псевдонимы	Itgb7 , интегрин субъединица бета 7
Внешние идентификаторы	Омим : 147559 ; MGI : 96616 ; Гомологен : 20247 ; GeneCards : ITGB7 ; OMA : ITGB7 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	53,207,282 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	102,140,379 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	granulocyte; ; lymph node; ; bone marrow cells; ; blood; ; spleen; ; cecum; ; appendix; ; mononuclear cell; ; monocyte; ; trachea;
	Top expressed in
	blood; ; mesenteric lymph nodes; ; granulocyte; ; spleen; ; thymus; ; morula; ; morula; ; corneal stroma; ; bone marrow; ; subcutaneous adipose tissue;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	virus receptor activity; metal ion binding; protein binding; cell adhesion molecule binding; integrin binding; signaling receptor activity;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; receptor complex; plasma membrane; cell surface; integrin complex; extracellular exosome; integrin alpha4-beta7 complex; focal adhesion;
Biological process	T cell migration; heterotypic cell-cell adhesion; cell-matrix adhesion involved in ameboidal cell migration; extracellular matrix organization; receptor clustering; cell adhesion; regulation of immune response; leukocyte tethering or rolling; integrin-mediated signaling pathway; viral entry into host cell; substrate adhesion-dependent cell spreading; cell-matrix adhesion; leukocyte migration; cell migration; cell adhesion mediated by integrin;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3695
	16421
	ENSG00000139626
	Ensmusg00000001281
	P26010
	P26011
	NM_000889
	NM_013566
	NP_000880
	NP_038594
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Integrin Beta-7 -это интегрина белок , который у людей кодируется ITGB7 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Он может сочетаться с ITGA4 (CD49D), чтобы сформировать гетеродимерный интегрина рецептор α ₄ β ₇ или с ITGAE (CD103) для образования α _E β ₇ . ^{[ 7 ]}

Структура

Как и все субъединицы интегрина, β ₇ представляет собой очень гибкий, связанный с мембраной внеклеточный белок, который должен сочетаться с α-субъединицей для стабильности. Гибкость молекулы позволяет ему динамически регулировать свою сродство к лиганду посредством конформационных изменений. ^{[ 8 ]} Начиная с апикального конца белка, самого дальнего от клеточной мембраны, β ₇ состоит из головы и верхних ног, совокупно известных как головной убор, нижние ножки, трансмембранное домен и цитоплазматический хвост. Верхняя часть головы-это I-подобный домен, иногда называемый βi-домен, который в сочетании с α-субъединицей связывает лиганд. Чуть ниже этого находится гибридный домен, часть которого является N-концевой для I-подобного домена. Под гибридным доменом находится домен PSI, который завершает головной убор. Нижние ноги состоят из доменов EGF 1-4 и β-хвостового домена. Наконец, есть трансмембранная домен и С-концевой цитоплазматический хвост. ^{[ 9 ]}

Взаимодействия

Было показано, что ITGB7 взаимодействует с EED . ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000139626 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000001281 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Erle DJ, Rüegg C, Sheppard D, Pytela R (Jun 1991). «Полная аминокислотная последовательность интегрин -бета -субъединицы (бета 7), идентифицированная в лейкоцитах» . Журнал биологической химии . 266 (17): 11009–16. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 99120-9 . PMID 2040616 .
^ "Entrez Gene: Itgb7 Integrin, Beta 7" .
^ Байрон А., Хамфрис Д.Д., Аскари Дж.А., Крейг С.Е., Молд А.П., Хамфрис М.Дж. (ноябрь 2009 г.). «Противоинтегриновые моноклональные антитела» . Журнал сотовой науки . 122 (Pt 22): 4009–11. doi : 10.1242/jcs.056770 . PMC 3329622 . PMID 19910492 .
^ Carman CV, Springer TA (октябрь 2003 г.). «Регуляция авидности интегрина: недооценны ли изменения в аффинности и конформации?». Современное мнение в клеточной биологии . 15 (5): 547–56. doi : 10.1016/j.ceb.2003.08.003 . PMID 14519389 .
^ Yu Y, Zhu J, Mi LZ, Walz T, Sun H, Chen J, Springer TA (январь 2012 г.). «Структурные специализации α (4) β (7), интегрина, который опосредует катание на адгезии» . Журнал клеточной биологии . 196 (1): 131–46. doi : 10.1083/jcb.201110023 . PMC 3255974 . PMID 22232704 .
^ Rietzler M, Bittner M, Kolanus W, Schuster A, Holzmann B (октябрь 1998). «Человеческий wd-повторный белок wait-1 специфически взаимодействует с цитоплазматическими хвостами бета7-интегринов» . Журнал биологической химии . 273 (42): 27459–66. doi : 10.1074/jbc.273.42.27459 . PMID 9765275 .

Дальнейшее чтение

Rüegg C, Postigo AA, Sikorski EE, Butcher EC, Pytela R, Erle DJ (апрель 1992). «Роль интегрина альфа 4 бета 7/альфа 4 бета P в прилипке лимфоцитов к фибронектину и VCAM-1 и в гомотипической кластеризации клеток» . Журнал клеточной биологии . 117 (1): 179–89. doi : 10.1083/jcb.117.1.179 . PMC 2289398 . PMID 1372909 .
Chan BM, Elices MJ, Murphy E, Hemler ME (апрель 1992 г.). «Адгезия с молекулой адгезии сосудистых клеток 1 и фибронектин. Сравнение альфа 4 бета 1 (VLA-4) и альфа 4 бета 7 на линии B-клеток человека JY» . Журнал биологической химии . 267 (12): 8366–70. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 42453-2 . PMID 1373725 .
Цзян В.М., Дженкинс Д., Юань К., Леунг Е., Чу Х.Х., Уотсон Дж.Д., Криссансен Г.В. (сентябрь 1992). «Генная организация субъединицы бета-7 человека, общая бета-субъединица лейкоцитов Integrins HML-1 и LPAM-1». Международная иммунология . 4 (9): 1031–40. doi : 10.1093/intimm/4.9.1031 . PMID 1382574 .
Бейкер Э., Сазерленд Г.Р. , Цзян В.М., Юань К., Леунг Е., Уотсон Д.Д., Криссансен Г.В. (1992). «Картирование гена Integrin Integrin Beta 7 (ITG Beta 7) по 12q13.13 с помощью неизотопической гибридизации in situ». Геном млекопитающих . 2 (4): 272–3. doi : 10.1007/bf003555438 . PMID 1543919 . S2CID 30346801 .
Юань Ка, Цзян В.М., Криссансен Г.В., Уотсон Дж.Д. (декабрь 1991). «Клонирование и анализ последовательности нового бета-2-связанного транскрипта интегрина из Т-лимфоцитов: гомология репев, богатых цистеином интегрина, в домен III цепей ламинина В». Международная иммунология . 3 (12): 1373–4. doi : 10.1093/intimm/3.12.1373 . PMID 1777426 .
Юань Ка, Цзян В.М., Криссансен Г.В., Уотсон Д.Д. (1991). «Клонирование и анализ последовательности нового бета-2-связанного транскрипта интегрина из Т-лимфоцитов: гомология репев, богатых цистеином интегрина, в домен III цепей ламинина В». Международная иммунология . 2 (11): 1097–108. doi : 10.1093/intimm/2.11.1097 . PMID 2083230 .
Erle DJ, Brown T, Christian D, Aris R (Mar 1994). «Подмножества Т -клеток легких в эпителиальной жидкой жидкости определяются различными паттернами экспрессии бета 7 и бета 1 интегрина». Американский журнал респираторных клеток и молекулярной биологии . 10 (3): 237–44. doi : 10.1165/ajrcmb.10.3.7509610 . PMID 7509610 .
Sánchez-Medrid F, Sánchez-Madrid F, De Landázuri Mo (сентябрь 1993). Альфа " Журнал иммунологии 151 (5): 2471–8 doi : 10.4049/jimmunol . PMID 7689608 .
Shaw SK, Cepek KL, Murphy EA, Russell GJ, Brenner MB, Parker CM (февраль 1994 г.). «Молекулярное клонирование лимфоцитарной лимфоцитарной лимфоцитов человека альфа -субъединицы. Необычная структура и ограниченное распределение РНК» . Журнал биологической химии . 269 (8): 6016–25. doi : 10.1016/s0021-9258 (17) 37563-4 . PMID 8119947 .
Tidswell M, Pachynski R, Wu SW, Qiu SQ, Dunham E, Cochran N, Briskin MJ, Kilshaw PJ, Lazarovits AI, Эндрю Д.П., Мясник Е.С., Йеднок Т.А., Эрле Джа (август 1997). «Структурно-функциональный анализ субъединицы интегрина бета 7: идентификация доменов, участвующих в адгезии к MADCAM-1» . Журнал иммунологии . 159 (3): 1497–505. doi : 10.4049/jimmunol.159.3.1497 . PMID 9233649 .
Тан К, Касасновас Дж. М., Лю Дж.Х., Брискин М.Дж., Спрингер Т.А., Ван Дж. Х. (июнь 1998 г.). «Структура доменов суперсемейства иммуноглобулина 1 и 2 MADCAM-1 показывает новые особенности, важные для распознавания интегрина» . Структура 6 (6): 793–801. doi : 10.1016/s0969-2126 (98) 00080-x . PMID 9655832 .
Rietzler M, Bittner M, Kolanus W, Schuster A, Holzmann B (октябрь 1998). «Человеческий wd-повторный белок wait-1 специфически взаимодействует с цитоплазматическими хвостами бета7-интегринов» . Журнал биологической химии . 273 (42): 27459–66. doi : 10.1074/jbc.273.42.27459 . PMID 9765275 .
Тарашка К.С., Хиггинс Дж. М., Тан К., Мандельброт Д.А., Ван Дж. Х., Бреннер М.Б. (май 2000). «Молекулярная основа для лейкоцитов интегрина альфа (E) бета (7) адгезии к эпителиальному (E) -кадгерину» . Журнал экспериментальной медицины . 191 (9): 1555–67. doi : 10.1084/jem.191.9.1555 . PMC 2213439 . PMID 10790430 .
Хиггинс JM, Cernadas M, Tan K, Irie A, Wang J, Takada Y, Brenner MB (август 2000 г.). «Роль альфа и бета -цепей в распознавании лигандов Beta 7 Integrins» . Журнал биологической химии . 275 (33): 25652–64. doi : 10.1074/jbc.m001228200 . PMID 10837471 .
Бутылка L, Weave J, Bernabeu C, Corbi AL (октябрь 2000). CD49D Integrin . Журнал иммунологии 165 (8): 4338–45. два 10.4049/jimmunol.165.8.4338: 11035069PMID
Guilliano MJ, Foxx-Orenstein AE, Lebman DA (февраль 2001 г.). «Микросреда пятен Пейера человека ингибирует увеличение экспрессии CD38, связанного с реакцией зародышевого центра». Журнал иммунологии . 166 (4): 2179–85. doi : 10.4049/jimmunol.166.4.2179 . PMID 11160270 . S2CID 36075610 .
Calderwood DA, Huttenlocher A, Kiosses WB, Rose DM, Woodside DG, Schwartz MA, Ginsberg MH (Dec 2001). «Повышенное связывание филамина с бета-интегриновыми цитоплазматическими доменами ингибирует миграцию клеток». Природная клеточная биология . 3 (12): 1060–8. doi : 10.1038/ncb1201-1060 . PMID 11781567 . S2CID 6459957 .
Calderwood DA, Fujioka Y, De Pereda JM, García-Alvarez B, Nakamoto T, Margolis B, McGlade CJ, Liddington RC, Ginsberg MH (март 2003 г.). «Интегриновые бета-цитоплазматические взаимодействия с доменами фосфотирозин-связывающих: структурный прототип для разнообразия в передаче сигналов интегрина» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (5): 2272–7. Bibcode : 2003pnas..100.2272c . doi : 10.1073/pnas.262791999 . PMC 151330 . PMID 12606711 .

Внешние ссылки

ITGB7 Информация со ссылками в шлюзе для миграции сотовой связи Архивировал 2014-12-11 на машине Wayback

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000139626 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000001281 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid2040616-5] Erle DJ, Rüegg C, Sheppard D, Pytela R (Jun 1991). «Полная аминокислотная последовательность интегрин -бета -субъединицы (бета 7), идентифицированная в лейкоцитах» . Журнал биологической химии . 266 (17): 11009–16. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 99120-9 . PMID 2040616 .

[entrez-6] "Entrez Gene: Itgb7 Integrin, Beta 7" .

[pmid19910492-7] Байрон А., Хамфрис Д.Д., Аскари Дж.А., Крейг С.Е., Молд А.П., Хамфрис М.Дж. (ноябрь 2009 г.). «Противоинтегриновые моноклональные антитела» . Журнал сотовой науки . 122 (Pt 22): 4009–11. doi : 10.1242/jcs.056770 . PMC 3329622 . PMID 19910492 .

[pmid14519389-8] Carman CV, Springer TA (октябрь 2003 г.). «Регуляция авидности интегрина: недооценны ли изменения в аффинности и конформации?». Современное мнение в клеточной биологии . 15 (5): 547–56. doi : 10.1016/j.ceb.2003.08.003 . PMID 14519389 .

[pmid22232704-9] Yu Y, Zhu J, Mi LZ, Walz T, Sun H, Chen J, Springer TA (январь 2012 г.). «Структурные специализации α (4) β (7), интегрина, который опосредует катание на адгезии» . Журнал клеточной биологии . 196 (1): 131–46. doi : 10.1083/jcb.201110023 . PMC 3255974 . PMID 22232704 .

[pmid9765275-10] Rietzler M, Bittner M, Kolanus W, Schuster A, Holzmann B (октябрь 1998). «Человеческий wd-повторный белок wait-1 специфически взаимодействует с цитоплазматическими хвостами бета7-интегринов» . Журнал биологической химии . 273 (42): 27459–66. doi : 10.1074/jbc.273.42.27459 . PMID 9765275 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]