Jump to content

НДУФА13

НДУФА13
Идентификаторы
Псевдонимы NDUFA13 , B16.6, CDA016, GRIM-19, GRIM19, CGI-39, субъединица A13 НАДН:убихиноноксидоредуктазы, MC1DN28
Внешние идентификаторы Опустить : 609435 ; МГИ : 1914434 ; Гомологен : 41083 ; Генные карты : NDUFA13 ; OMA : NDUFA13 — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_015965

НМ_023312
НМ_001382215

RefSeq (белок)

НП_057049

НП_075801.1
НП_075801

Местоположение (UCSC) Чр 19: 19,52 – 19,53 Мб Chr 8: 70,35 – 70,36 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Субъединица 13 подкомплекса НАДН-дегидрогеназы [убихинон] 1 альфа представляет собой фермент , который у человека кодируется NDUFA13 геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] Белок NDUFA13 представляет собой субъединицу НАДН-дегидрогеназы (убихинона) , которая расположена во внутренней мембране митохондрий и является крупнейшим из пяти комплексов цепи переноса электронов . [ 9 ] [ 10 ]

Структура

[ редактировать ]

Ген NDUFA13 расположен на плече хромосомы 19 в положении 13,2 и охватывает 11 995 пар оснований. [ 8 ] Ген производит белок массой 17 кДа, состоящий из 144 аминокислот . [ 11 ] [ 12 ] NDUFA13 — субъединица фермента НАДН-дегидрогеназы (убихинона) , крупнейшего из дыхательных комплексов. Структура имеет L-образную форму с длинным гидрофобным трансмембранным доменом и гидрофильным доменом периферического плеча, который включает все известные окислительно-восстановительные центры и сайт связывания НАДН. [ 9 ] Было отмечено, что N-концевой гидрофобный домен может сворачиваться в альфа-спираль, охватывающую внутреннюю мембрану митохондрий , с C-концевым гидрофильным доменом, взаимодействующим с глобулярными субъединицами Комплекса I. Высококонсервативная двухдоменная структура предполагает, что эта особенность имеет решающее значение для функции белка и то, что гидрофобный домен действует как якорь для комплекса НАДН-дегидрогеназы (убихинон) на внутренней стороне. митохондриальная мембрана. NDUFA13 является одной из примерно 31 гидрофобной субъединицы, образующей трансмембранную область Комплекса I, но это вспомогательная субъединица, которая, как полагают, не участвует в катализе. [ 13 ] Предсказанная вторичная структура представляет собой в основном альфа-спираль, но карбокси-концевая половина белка имеет высокий потенциал принять форму спиральной спирали. Аминоконцевая часть содержит предполагаемый бета-лист, богатый гидрофобными аминокислотами, которые могут служить сигналом импорта в митохондрии. [ 8 ] [ 10 ] [ 14 ]

Ген NDUFA13 человека кодирует субъединицу комплекса I дыхательной цепи , которая переносит электроны от НАДН к убихинону . [ 8 ] НАДН связывается с Комплексом I и переносит два электрона на изоаллоксазиновое кольцо протезного плеча флавинмононуклеотида (FMN) с образованием FMNH 2 . Электроны передаются через серию железо-серных кластеров (Fe-S) в протезной руке и, наконец, к коферменту Q10 (CoQ), который восстанавливается до убихинола (CoQH 2 ). Поток электронов изменяет окислительно-восстановительное состояние белка, что приводит к конформационному изменению и сдвигу p K ионизируемой боковой цепи, которая выкачивает четыре иона водорода из митохондриального матрикса. [ 9 ]

NDUFA13 имеет гомологичный белок, известный как GRIM-19 , белок, регулирующий гибель клеток. Он участвует в гибели клеток, индуцированной интерфероном /полностью-транс-ретиноевой кислотой (IFN/RA). Эта форма апоптотической активности ингибируется взаимодействием с вирусным IRF1 . GRIM-19 предотвращает трансактивацию генов -мишеней преобразователя сигнала и активатора транскрипции 3 (STAT3), но не других членов семейства STAT. [ 13 ]

Клиническое значение

[ редактировать ]

Белок, гомологичный NDUFA13, GRIM-19, может играть роль в болезни Крона (БК), воспалительном заболевании кишечника (ВЗК), характеризующемся хроническим воспалением кишечного эпителия. Его экспрессия снижена в воспаленной слизистой оболочке больных этими заболеваниями. Белок 2, содержащий домен нуклеотидсвязывающей олигомеризации (NOD2), также известный как белок 15, содержащий домен рекрутирования каспаз (CARD15) или белок 1 воспалительных заболеваний кишечника (IBD1), действует как молекула распознавания цитозольных патогенов млекопитающих и играет антибактериальную функцию. роль, ограничивая выживаемость внутриклеточных инвазивных бактерий. GRIM-19 действует как нижестоящий антибактериальный эффектор в CARD15-опосредованных врожденных реакциях слизистой оболочки, регулируя реакцию эпителиальных клеток кишечника на микробы. После NOD2-опосредованного распознавания бактериального мурамилдипептида GRIM-19 необходим для активации NF-κB , ключевого компонента регуляции иммунного ответа на инфекцию. [ 13 ] [ 15 ]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что NDUFA13 взаимодействует со STAT3 . [ 16 ]

  1. ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000186010 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036199 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Херст Дж., Кэрролл Дж., Фернли И.М., Шеннон Р.Дж., Уокер Дж.Э. (июль 2003 г.). «Ядерно-кодируемые субъединицы комплекса I из митохондрий бычьего сердца» . Биохим Биофиз Акта . 1604 (3): 135–50. дои : 10.1016/S0005-2728(03)00059-8 . ПМИД   12837546 .
  6. ^ Энджелл Дж.Э., Линднер Д.Д., Шапиро П.С., Хофманн Э.Р., Калваколану Д.В. (ноябрь 2000 г.). «Идентификация GRIM-19, нового гена, регулирующего гибель клеток, индуцируемого комбинацией интерферона-бета и ретиноевой кислоты, с использованием генетического подхода» . J Биол Хим . 275 (43): 33416–26. дои : 10.1074/jbc.M003929200 . ПМИД   10924506 .
  7. ^ Хуан Г, Лу Х, Хао А, Нг ДК, Понния С, Го К, Луфэй С, Цзэн Ц, Цао X (сентябрь 2004 г.). «GRIM-19, белок, регулирующий клеточную смерть, необходим для сборки и функционирования митохондриального комплекса I» . Мол Клеточная Биол . 24 (19): 8447–56. дои : 10.1128/MCB.24.19.8447-8456.2004 . ПМК   516758 . ПМИД   15367666 .
  8. ^ Перейти обратно: а б с д «Ген Энтреза: NDUFA13 НАДН-дегидрогеназа (убихинон) 1 альфа-субкомплекс, 13» .
  9. ^ Перейти обратно: а б с Пратт, Дональд Воэт, Джудит Г. Воэт, Шарлотта В. (2013). "18" Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. стр. 100-1 581–620. ISBN  9780470547847 . {{cite book}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  10. ^ Перейти обратно: а б Эмахазион Т., Бесков А., Гилленстен У., Брукс А.Дж. (ноябрь 1998 г.). «Радиационное гибридное картирование на основе интронов 15 генов комплекса I цепи переноса электронов человека». Цитогенетический клеточный генетик . 82 (1–2): 115–9. дои : 10.1159/000015082 . ПМИД   9763677 . S2CID   46818955 .
  11. ^ Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК   4076475 . ПМИД   23965338 .
  12. ^ «NDUFA13-НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа-подкомплекс, субъединица 13» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) .
  13. ^ Перейти обратно: а б с «НДУФА13» . UniProt.org . Консорциум UniProt.
  14. ^ Тон С., Хван Д.М., Демпси А.А., Лью CC (январь 1998 г.). «Идентификация и первичная структура пяти субъединиц НАДН-убихинон оксидоредуктазы человека». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 241 (2): 589–94. дои : 10.1006/bbrc.1997.7707 . ПМИД   9425316 .
  15. ^ Барнич, Н; Хисамацу, Т; Агирре, Дж. Э.; Ксавье, Р; Райнекер, ХК; Подольский, ДК (13 мая 2005 г.). «GRIM-19 взаимодействует с доменом олигомеризации нуклеотидов 2 и служит нижестоящим эффектором антибактериальной функции в эпителиальных клетках кишечника» . Журнал биологической химии . 280 (19): 19021–6. дои : 10.1074/jbc.m413776200 . ПМИД   15753091 .
  16. ^ Чжан Дж., Ян Дж., Рой С.К., Тининини С., Ху Дж., Бромберг Дж.Ф., Поли В., Старк Г.Р., Калваколану Д.В. (август 2003 г.). «Регулятор клеточной гибели GRIM-19 является ингибитором преобразователя сигнала и активатором транскрипции 3» . Учеб. Натл. акад. наук. США 100 (16): 9342–7. Бибкод : 2003PNAS..100.9342Z . дои : 10.1073/pnas.1633516100 . ПМК   170920 . ПМИД   12867595 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: c6e6b51c4ba46fe843e4c69abd63e4a3__1704500940
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/c6/a3/c6e6b51c4ba46fe843e4c69abd63e4a3.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
NDUFA13 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)