Jump to content

ATRX

ATRX
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы ATRX , ATR2, JMS, MRXHF1, RAD54, RAD54L, SFM1, SHS, XH2, XNP, ZNF-HX, MRX52, альфа-талассемия/синдром умственной отсталости, сцепленный с Х-сцепленным, ремоделирование хроматина, ремоделирование хроматина ATRX
Внешние идентификаторы Опустить : 300032 ; МГИ : 103067 ; Гомологен : 416 ; Генные карты : ATRX ; OMA : ATRX — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_000489
НМ_138270
НМ_138271

НМ_009530

RefSeq (белок)

НП_000480
НП_612114

НП_033556

Местоположение (UCSC) Chr X: 77,5 – 77,79 Мб Chr X: 104,84 – 104,97 Мб
в PubMed Поиск [3] [4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Регулятор транскрипции ATRX, также известный как АТФ-зависимая хеликаза ATRX , Х-связанная геликаза II или Х-связанный ядерный белок (XNP), представляет собой белок , который у человека кодируется ATRX геном . [5] [6] [7]

Регулятор транскрипции ATRX содержит домен АТФазы / хеликазы и, таким образом, принадлежит к SWI/SNF семейству белков ремоделирования хроматина . ATRX необходим для отложения варианта гистона H3.3 на теломерах и других геномных повторах. [8] Эти взаимодействия важны для поддержания молчания на этих сайтах. [9] [10] [11]

Кроме того, ATRX подвергается зависимому от клеточного цикла фосфорилированию, которое регулирует ассоциацию его ядерного матрикса и хроматина и предполагает его участие в регуляции генов в интерфазе и хромосомной сегрегации в митозе. [7]

Клиническое значение

[ редактировать ]

Наследственные мутации

[ редактировать ]

Наследственные мутации гена ATRX связаны с Х-сцепленным синдромом умственной отсталости ( XLMR ), чаще всего сопровождающимся синдромом альфа-талассемии ( ATR-X ). Было показано, что эти мутации вызывают разнообразные изменения в характере метилирования ДНК , что может обеспечить связь между ремоделированием хроматина, метилированием ДНК и экспрессией генов в процессах развития. Сообщалось о множестве альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, кодирующих различные изоформы. Женщины-носители могут демонстрировать асимметричную инактивацию Х-хромосомы . [7]

Соматические мутации

[ редактировать ]

Приобретенные мутации в ATRX были зарегистрированы при ряде видов рака человека, включая нейроэндокринные опухоли поджелудочной железы . [12] глиомы , [13] [14] остеосаркомы , [15] саркомы мягких тканей , [16] и злокачественные феохромоцитомы . [17] Существует сильная корреляция между мутациями ATRX и фенотипом альтернативного удлинения теломер (АЛТ) при раке. [12]

Взаимодействия

[ редактировать ]

ATRX образует комплекс с DAXX , который является шапероном гистона H3.3. [18]

Также было показано, что ATRX взаимодействует с EZH2 . [19]

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000085224 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031229 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Стейтон С.Л., Дабович Б., Гулисано М., Геч Дж., Брокколи В., Джованацци С. и др. (ноябрь 1994 г.). «Клонирование и характеристика нового человеческого гена Xq13, кодирующего предполагаемую хеликазу». Молекулярная генетика человека . 3 (11): 1957–64. дои : 10.1093/hmg/3.11.1957 . ПМИД   7874112 .
  6. ^ Гиббонс Р.Дж., Сазерс Г.К., Уилки А.О., Бакл В.Дж., Хиггс Д.Р. (ноябрь 1992 г.). «Синдром Х-связанной альфа-талассемии/умственной отсталости (ATR-X): локализация на Xq12-q21.31 с помощью инактивации X и анализа сцепления» . Американский журнал генетики человека . 51 (5): 1136–49. ПМК   1682840 . ПМИД   1415255 .
  7. ^ Перейти обратно: а б с «Ген Энтреза: ATRX альфа-талассемия/синдром умственной отсталости, сцепленный с Х-хромосомой (гомолог RAD54, S. cerevisiae)» .
  8. ^ Вонг Л.Х., МакГи Дж.Д., Сим М., Андерсон М.А., Ан С., Ханнан Р.Д. и др. (март 2010 г.). «ATRX взаимодействует с H3.3, поддерживая структурную целостность теломер в плюрипотентных эмбриональных стволовых клетках» . Геномные исследования . 20 (3): 351–60. дои : 10.1101/гр.101477.109 . ПМК   2840985 . ПМИД   20110566 .
  9. ^ Вун Х.П., Хьюз Дж.Р., Роде С., Де Ла Роса-Веласкес И.А., Дженувейн Т., Фейл Р. и др. (апрель 2015 г.). «ATRX играет ключевую роль в поддержании молчания интерстициальных гетерохроматических локусов и импринтированных генов» . Отчеты по ячейкам . 11 (3): 405–18. дои : 10.1016/j.celrep.2015.03.036 . ПМЦ   4410944 . PMID   25865896 .
  10. ^ Эльсэссер С.Дж., Нох К.М., Диас Н., Эллис К.Д., Банашински Л.А. (июнь 2015 г.). «Гистон H3.3 необходим для подавления эндогенных ретровирусных элементов в эмбриональных стволовых клетках» . Природа . 522 (7555): 240–4. Бибкод : 2015Natur.522..240E . дои : 10.1038/nature14345 . ПМК   4509593 . ПМИД   25938714 .
  11. ^ Удугама М., М. Чанг Ф.Т., Чан Ф.Л., Тан М.К., Пикетт Х.А., Р. МакГи Дж.Д. и др. (декабрь 2015 г.). «Вариант гистона H3.3 обеспечивает гетерохроматическую метку триметилирования лизина 9 H3 на теломерах» . Исследования нуклеиновых кислот . 43 (21): 10227–37. дои : 10.1093/nar/gkv847 . ПМК   4666390 . ПМИД   26304540 .
  12. ^ Перейти обратно: а б Хифи К.М., де Уайлд Р.Ф., Цзяо Ю., Кляйн А.П., Эдил Б.Х., Ши С. и др. (июль 2011 г.). «Измененные теломеры в опухолях с мутациями ATRX и DAXX» . Наука . 333 (6041): 425. Бибкод : 2011Sci...333..425H . дои : 10.1126/science.1207313 . ПМК   3174141 . ПМИД   21719641 .
  13. ^ Шварцентрубер Дж., Коршунов А., Лю XY, Джонс Д.Т., Пфафф Е., Джейкоб К. и др. (январь 2012 г.). «Драйверные мутации гистона H3.3 и генов ремоделирования хроматина при детской глиобластоме». Природа . 482 (7384): 226–31. Бибкод : 2012Natur.482..226S . дои : 10.1038/nature10833 . ПМИД   22286061 . S2CID   4312169 .
  14. ^ Каннан К., Инагаки А., Зильбер Дж., Горовец Д., Чжан Дж., Кастенхубер Э.Р. и др. (октябрь 2012 г.). «Секвенирование всего экзома идентифицирует мутацию ATRX как ключевую молекулярную детерминанту глиомы низкой степени злокачественности» . Онкотаргет . 3 (10): 1194–203. дои : 10.18632/oncotarget.689 . ПМЦ   3717947 . ПМИД   23104868 .
  15. ^ Чен X, Бахрами А., Паппо А., Истон Дж., Далтон Дж., Хедлунд Э. и др. (апрель 2014 г.). «Рецидивирующие соматические структурные изменения способствуют онкогенезу при остеосаркоме у детей» . Отчеты по ячейкам . 7 (1): 104–12. дои : 10.1016/j.celrep.2014.03.003 . ПМК   4096827 . ПМИД   24703847 .
  16. ^ Сеть исследований Атласа генома рака (ноябрь 2017 г.). «Комплексная и интегрированная геномная характеристика сарком мягких тканей взрослых» . Клетка . 171 (4): 950–965. дои : 10.1016/j.cell.2017.10.014 . ПМИД   29100075 .
  17. ^ Комино-Мендес, I (июнь 2016 г.). «Мутация драйвера ATRX при сложной злокачественной феохромоцитоме». Генетика рака . 209 (6): 272–7. doi : 10.1016/j.cancergen.2016.04.058 . ПМИД   27209355 .
  18. ^ Льюис П.В., Эльзессер С.Дж., Но К.М., Стадлер СК, Эллис КД (август 2010 г.). «Daxx является H3.3-специфичным шапероном гистонов и взаимодействует с ATRX в независимой от репликации сборке хроматина на теломерах» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (32): 14075–80. Бибкод : 2010PNAS..10714075L . дои : 10.1073/pnas.1008850107 . ПМЦ   2922592 . ПМИД   20651253 .
  19. ^ Кардосо С., Тимсит С., Виллар Л., Крещатиский М., Фонтес М., Колло Л. (апрель 1998 г.). «Специфическое взаимодействие между продуктом гена XNP/ATR-X и доменом SET человеческого белка EZH2» . Молекулярная генетика человека . 7 (4): 679–84. дои : 10.1093/hmg/7.4.679 . ПМИД   9499421 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: d271611a072a536015eb256986491f43__1715214600
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/d2/43/d271611a072a536015eb256986491f43.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
ATRX - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)