ТМС1

ТМС1
Идентификаторы
Псевдонимы	TMC1 , DFNA36, DFNB11, DFNB7, трансмембранный канал типа 1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 606706 ; МГИ : 2151016 ; Гомологен : 23670 ; Генные карты : TMC1 ; ОМА : TMC1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	72,838,297 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 19 (mouse)
End	20,931,566 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	testicle; ; buccal mucosa cell; ; gonad; ; sural nerve; ; C1 segment; ; monocyte; ; right uterine tube; ; stromal cell of endometrium; ; anterior cingulate cortex; ; gastrocnemius muscle;
	Top expressed in
	spermatid; ; spermatocyte; ; Meckel's cartilage; ; utricle; ; sphenoid bone; ; gastrula; ; ciliary body; ; lesser wing of sphenoid bone; ; axial skeleton; ; basilar part of occipital bone;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	voltage-gated calcium channel activity; mechanosensitive ion channel activity; ion channel activity;
Cellular component	integral component of membrane; stereocilium tip; membrane; external side of plasma membrane; plasma membrane; integral component of plasma membrane;
Biological process	vestibular reflex; auditory receptor cell development; ion transport; hearing; calcium ion transmembrane transport; detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of sound; regulation of calcium ion transmembrane transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	117531
	13409
	ENSG00000165091
	ENSMUSG00000024749
	Q8TDI8
	Q8R4P5
	НМ_138691
	НМ_028953
	НП_619636
	НП_083229
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 1, подобный трансмембранным каналам, представляет собой белок , который у человека кодируется TMC1 геном . ^[5]^[6]^[7] TMC1 содержит шесть трансмембранных доменов, C и N-концы которых находятся на эндоплазматической стороне мембраны, а также большую петлю между доменами 4 и 5. Эта топология аналогична топологии временных рецепторных потенциальных каналов (TRP), ^[5] семейство белков, участвующих в восприятии таких чувств, как температура, вкус, давление и зрение. ^[8] TMC1 был расположен в улитке послеродовой мыши, ^[5] а нокаут TMC1 и TMC2 приводит как к слуховым, так и вестибулярным нарушениям (потеря слуха и проблемы с равновесием), что указывает на то, что TMC1 является молекулярной частью слуховой трансдукции. ^[9]

Функция

Этот ген считается членом семейства генов, которые, как предполагается, кодируют трансмембранные белки. До недавнего времени конкретная функция этого гена была относительно неизвестна; было известно, что он необходим только для нормального функционирования волосковых клеток улитки . ^[7] Однако новые исследования показывают, что TMC1 взаимодействует с Tip link белками протокадгерином 15 и кадгерином 23, что указывает на то, что TMC1, наряду с TMC2 , являются необходимыми белками для механотрансдукции волосковых клеток . ^[10] В частности, TMC1 и TMC2 могут быть двумя порообразующими субъединицами канала, который реагирует на отклонение кончиковых звеньев в волосковых клетках. ^[11]

Из-за его участия в функции волосковых клеток улитки и его взаимодействия с кончиками волосковых клеток TMC1 мутирует и подвергается манипуляциям, чтобы лучше понять рецептор и в то же время создать молекулярную модель глухоты. Хотя глухота может возникнуть на любом этапе слуховой обработки, было показано, что DFNA36 (тип прогрессирующей потери слуха) и DFNB7/B11 (врожденная потеря слуха) возникают в результате мутаций TMC1. DFNA36 возникает в результате доминантной миссенс-мутации, а DFNB7/B11 — в результате рецессивной мутации. ^[5] Обе модели были смоделированы на мышах и известны как модель Бетховена и модель dn соответственно. ^[6] Ген TMC1 расположен на хромосоме 9q 31-q21, а доминантная мутация, связанная с DFNA36, возникает в аминокислоте 572. ^[12] что предполагает важность этой аминокислоты в общей функции TMC1. Теперь, когда было показано, что TMC1 взаимодействует с белками кончиковых связей PCDH15 и CDH23, ^[10] Следующий вопрос может заключаться в том, необходима ли аминокислота 572 для взаимодействия кончиковых звеньев TMC1.

В 2015 году исследователи сообщили, что генетически глухие мыши, получавшие генную терапию TMC1 , частично восстановили слух. ^[13]^[14]

Клиническое значение

Мутации в этом гене связаны с прогрессирующей постлингвальной потерей слуха и несиндромальной глухотой . ^[15] и глубокая прелингвальная глухота . ^[7] Мутации TMC1 не связаны с другими симптомами или отклонениями, которые известны как несиндромальная потеря слуха и указывают на то, что TMC1 функционирует главным образом в слуховых ощущениях. ^[16] Кроме того, рецессивные мутации гена приводят как к потере функции TMC1, так и к глубокой глухоте. ^[12] указывая, что функция TMC1 необходима для обработки слуховых сигналов.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000165091 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024749 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Курима К, Питерс ЛМ, Ян Й, Риазуддин С, Ахмед ЗМ, Наз С, Арно Д, Друри С, Мо Дж, Макишима Т, Гош М, Менон П.С., Дешмукх Д, Одду С, Острер Х, Хан С, Риазуддин С , Дейнингер П.Л., Хэмптон Л.Л., Салливан С.Л., Бэтти Дж.Ф., Китс Б.Дж., Уилкокс Э.Р., Фридман Т.Б., Гриффит А.Дж. (март 2002 г.). «Доминантная и рецессивная глухота, вызванная мутациями нового гена TMC1, необходимого для функции волосковых клеток улитки» . Нат Жене . 30 (3): 277–84. дои : 10.1038/ng842 . ПМИД 11850618 . S2CID 40110588 .
^ Jump up to: ^а ^б Врегде С., Эрвен А., Крос С.Дж., Маркотти В., Фукс Х., Курима К., Уилкокс Э.Р., Фридман Т.Б., Гриффит А.Дж., Баллинг Р., Храбе Де Анжелис М., Авраам К.Б., Стил КП (2002). «Бетховен, мышиная модель доминантной прогрессирующей потери слуха DFNA36». Нат Жене . 30 (3): 257–8. дои : 10.1038/ng848 . ПМИД 11850623 . S2CID 26408685 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтреза: TMC1, подобный трансмембранному каналу 1» .
^ Вриенс Дж., Нилиус Б., Воетс Т. (2014). «Периферическая термочувствительность у млекопитающих» . Обзоры природы Неврология . 15 (9): 573–89. дои : 10.1038/nrn3784 . ПМИД 25053448 . S2CID 27149948 .
^ Кавасима Ю., Гелеок Г.С., Курима К., Лабай В., Лелли А., Асаи Ю., Макишима Т., Ву Д.К., Делла Сантина CC, Холт Дж.Р., Гриффит А.Дж. (2011). «Механотрансдукция в волосковых клетках внутреннего уха мыши требует наличия генов, подобных трансмембранным каналам» . Дж. Клин. Инвестируйте . 121 (12): 4796–809. дои : 10.1172/JCI60405 . ПМЦ 3223072 . ПМИД 22105175 .
^ Jump up to: ^а ^б Маеда Р., Киндт К.С., Мо В., Морган К.П., Эриксон Т., Чжао Х., Клеменс-Гришам Р., Барр-Гиллеспи П.Г., Николсон Т. (2014). «Белок Tip-link протокадгерин 15 взаимодействует с белками, подобными трансмембранным каналам, TMC1 и TMC2» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 111 (35): 12907–12. Бибкод : 2014PNAS..11112907M . дои : 10.1073/pnas.1402152111 . ПМК 4156717 . ПМИД 25114259 .
^ Пан Б., Гелеок Г.С., Асаи Ю., Хорвиц Г.К., Курима К., Исикава К., Кавасима Ю., Гриффит А.Дж., Холт Дж.Р. (2013). «TMC1 и TMC2 являются компонентами канала механотрансдукции в волосковых клетках внутреннего уха млекопитающих» . Нейрон . 79 (3): 504–15. дои : 10.1016/j.neuron.2013.06.019 . ПМЦ 3827726 . ПМИД 23871232 .
^ Jump up to: ^а ^б Китаджири С., Макишима Т., Фридман Т.Б., Гриффит А.Дж. (2007). «Новая мутация в локусе потери слуха DFNA36 раскрывает критическую функцию и потенциальную корреляцию генотип-фенотип для аминокислоты-572 TMC1» . Клин. Жене . 71 (2): 148–52. дои : 10.1111/j.1399-0004.2007.00739.x . ПМИД 17250663 . S2CID 28449072 .
^ Галлахер, Джеймс (9 июля 2015 г.). «Глухота может быть вылечена с помощью вируса, говорят ученые» . Великобритания: Би-би-си . Проверено 9 июля 2015 г.
^ Аскью, Чарльз; и др. (8 июля 2015 г.). «Генная терапия Tmc восстанавливает слуховую функцию у глухих мышей» . Наука трансляционной медицины . 7 (295). Американская ассоциация содействия развитию науки: 295ra108. doi : 10.1126/scitranslmed.aab1996 . ПМК 7298700 . ПМИД 26157030 .
^ Риахи З, Бонне С, Заинин Р, Луха М, Буякуб И, Ларусси Н, Шарги М, Кефи Р, Жонард Л, Дорбоз И, Харделин Дж. П., Салах С.Б., Левильерс Дж., Вейл Д., МакЭлриви К., Беспфлюг ОТ, Бесбес Г. , Абдельхак С, Пети С (2014). «Секвенирование всего экзома идентифицирует новые причинные мутации в тунисских семьях с несиндромальной глухотой» . ПЛОС ОДИН . 9 (6): e99797. Бибкод : 2014PLoSO...999797R . дои : 10.1371/journal.pone.0099797 . ПМК 4057390 . ПМИД 24926664 .
^ Думан Д., Текин М. (2012). «Аутосомно-рецессивные несиндромальные гены глухоты: обзор» . Фронт Биосци . 17 (7): 2213–36. дои : 10.2741/4046 . ПМЦ 3683827 . ПМИД 22652773 .

Дальнейшее чтение

Китаджири С.И., Макнамара Р., Макишима Т., Хуснейн Т., Зафар А.У., Киттлс Р.А., Ахмед З.М., Фридман Т.Б., Риазуддин С., Гриффит А.Дж. (2008). «Идентификация, частота и происхождение мутаций TMC1, вызывающих глухоту DFNB7 / B11 в Пакистане». Клин. Жене . 72 (6): 546–50. дои : 10.1111/j.1399-0004.2007.00895.x . ПМИД 17877751 . S2CID 12936853 .
Калай Э., Карагузель А., Кайлан Р., Хейстер А., Кремерс Ф.П., Кремерс К.В., Бруннер Х.Г., де Брауэр А.П., Кремер Х. (2006). «Четыре новых мутации TMC1 (DFNB7/DFNB11) у турецких пациентов с врожденной аутосомно-рецессивной несиндромальной потерей слуха» . Хм. Мутат . 26 (6): 591. doi : 10.1002/humu.9384 . ПМИД 16287143 . S2CID 7800396 .
Мейер К.Г., Гасмелсид Н.М., Мергани А., Магзуб М.М., Мунтау Б., Тай Т., Хорстманн Р.Д. (2006). «Новые структурные варианты и варианты сплайсинга TMC1, связанные с врожденной несиндромальной глухотой в суданской родословной» . Хм. Мутат . 25 (1): 100. дои : 10.1002/humu.9302 . ПМИД 15605408 . S2CID 24285811 .
Керестес Г., Мутаи Х., Хеллер С. (2003). «Гены TMC и EVER принадлежат к более крупному новому семейству, семейству генов TMC, кодирующему трансмембранные белки» . БМК Геномика . 4 (1): 24. дои : 10.1186/1471-2164-4-24 . ПМК 165604 . ПМИД 12812529 .
Скотт Д.А., Карми Р., Эльбедур К., Йосефсберг С., Стоун Э.М., Шеффилд В.К. (1996). «Аутосомно-рецессивный локус несиндромальной потери слуха, выявленный путем объединения ДНК с использованием двух инбредных родственников бедуинов» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 59 (2): 385–91. ЧВК 1914732 . ПМИД 8755925 .
Джайн П.К., Фукусима К., Дешмукх Д., Рамеш А., Томас Э., Лалвани А.К., Кумар С., Плопис Б., Скарка Х., Срисайлапати Ч.Р. (1996). «Локус рецессивного нейросенсорного несиндромального нарушения слуха человека является потенциальным гомологом мышиного локуса глухоты (dn)» . Хм. Мол. Жене . 4 (12): 2391–4. дои : 10.1093/hmg/4.12.2391 . ПМИД 8634715 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000165091 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024749 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[Kurima_2002-5] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Курима К, Питерс ЛМ, Ян Й, Риазуддин С, Ахмед ЗМ, Наз С, Арно Д, Друри С, Мо Дж, Макишима Т, Гош М, Менон П.С., Дешмукх Д, Одду С, Острер Х, Хан С, Риазуддин С , Дейнингер П.Л., Хэмптон Л.Л., Салливан С.Л., Бэтти Дж.Ф., Китс Б.Дж., Уилкокс Э.Р., Фридман Т.Б., Гриффит А.Дж. (март 2002 г.). «Доминантная и рецессивная глухота, вызванная мутациями нового гена TMC1, необходимого для функции волосковых клеток улитки» . Нат Жене . 30 (3): 277–84. дои : 10.1038/ng842 . ПМИД 11850618 . S2CID 40110588 .

[Vreugde_2002-6] Jump up to: ^а ^б Врегде С., Эрвен А., Крос С.Дж., Маркотти В., Фукс Х., Курима К., Уилкокс Э.Р., Фридман Т.Б., Гриффит А.Дж., Баллинг Р., Храбе Де Анжелис М., Авраам К.Б., Стил КП (2002). «Бетховен, мышиная модель доминантной прогрессирующей потери слуха DFNA36». Нат Жене . 30 (3): 257–8. дои : 10.1038/ng848 . ПМИД 11850623 . S2CID 26408685 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтреза: TMC1, подобный трансмембранному каналу 1» .

[8] Вриенс Дж., Нилиус Б., Воетс Т. (2014). «Периферическая термочувствительность у млекопитающих» . Обзоры природы Неврология . 15 (9): 573–89. дои : 10.1038/nrn3784 . ПМИД 25053448 . S2CID 27149948 .

[pmid22105175-9] Кавасима Ю., Гелеок Г.С., Курима К., Лабай В., Лелли А., Асаи Ю., Макишима Т., Ву Д.К., Делла Сантина CC, Холт Дж.Р., Гриффит А.Дж. (2011). «Механотрансдукция в волосковых клетках внутреннего уха мыши требует наличия генов, подобных трансмембранным каналам» . Дж. Клин. Инвестируйте . 121 (12): 4796–809. дои : 10.1172/JCI60405 . ПМЦ 3223072 . ПМИД 22105175 .

[Maeda_2014-10] Jump up to: ^а ^б Маеда Р., Киндт К.С., Мо В., Морган К.П., Эриксон Т., Чжао Х., Клеменс-Гришам Р., Барр-Гиллеспи П.Г., Николсон Т. (2014). «Белок Tip-link протокадгерин 15 взаимодействует с белками, подобными трансмембранным каналам, TMC1 и TMC2» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 111 (35): 12907–12. Бибкод : 2014PNAS..11112907M . дои : 10.1073/pnas.1402152111 . ПМК 4156717 . ПМИД 25114259 .

[pmid23871232-11] Пан Б., Гелеок Г.С., Асаи Ю., Хорвиц Г.К., Курима К., Исикава К., Кавасима Ю., Гриффит А.Дж., Холт Дж.Р. (2013). «TMC1 и TMC2 являются компонентами канала механотрансдукции в волосковых клетках внутреннего уха млекопитающих» . Нейрон . 79 (3): 504–15. дои : 10.1016/j.neuron.2013.06.019 . ПМЦ 3827726 . ПМИД 23871232 .

[Kitajiri_2007-12] Jump up to: ^а ^б Китаджири С., Макишима Т., Фридман Т.Б., Гриффит А.Дж. (2007). «Новая мутация в локусе потери слуха DFNA36 раскрывает критическую функцию и потенциальную корреляцию генотип-фенотип для аминокислоты-572 TMC1» . Клин. Жене . 71 (2): 148–52. дои : 10.1111/j.1399-0004.2007.00739.x . ПМИД 17250663 . S2CID 28449072 .

[13] Галлахер, Джеймс (9 июля 2015 г.). «Глухота может быть вылечена с помощью вируса, говорят ученые» . Великобритания: Би-би-си . Проверено 9 июля 2015 г.

[14] Аскью, Чарльз; и др. (8 июля 2015 г.). «Генная терапия Tmc восстанавливает слуховую функцию у глухих мышей» . Наука трансляционной медицины . 7 (295). Американская ассоциация содействия развитию науки: 295ra108. doi : 10.1126/scitranslmed.aab1996 . ПМК 7298700 . ПМИД 26157030 .

[15] Риахи З, Бонне С, Заинин Р, Луха М, Буякуб И, Ларусси Н, Шарги М, Кефи Р, Жонард Л, Дорбоз И, Харделин Дж. П., Салах С.Б., Левильерс Дж., Вейл Д., МакЭлриви К., Беспфлюг ОТ, Бесбес Г. , Абдельхак С, Пети С (2014). «Секвенирование всего экзома идентифицирует новые причинные мутации в тунисских семьях с несиндромальной глухотой» . ПЛОС ОДИН . 9 (6): e99797. Бибкод : 2014PLoSO...999797R . дои : 10.1371/journal.pone.0099797 . ПМК 4057390 . ПМИД 24926664 .

[pmid22652773-16] Думан Д., Текин М. (2012). «Аутосомно-рецессивные несиндромальные гены глухоты: обзор» . Фронт Биосци . 17 (7): 2213–36. дои : 10.2741/4046 . ПМЦ 3683827 . ПМИД 22652773 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]