Нуклеопорин 153

НУП153
Доступные структуры
ПДБ	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2EBQ, 2EBR, 2EBV, 2GQE, 4U0C, 4U0D
Идентификаторы
Псевдонимы	NUP153 , HN153, нуклеопорин 153 кДа, нуклеопорин 153
Внешние идентификаторы	Опустить : 603948 ; МГИ : 2385621 ; Гомологен : 68442 ; Генные карты : NUP153 ; ОМА : NUP153 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	17,706,925 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	46,881,416 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; epithelium of nasopharynx; ; cartilage tissue; ; tibia; ; germinal epithelium; ; Epithelium of choroid plexus; ; amniotic fluid; ; skin of thigh; ; parietal pleura; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; primitive streak; ; genital tubercle; ; Gonadal ridge; ; ciliary body; ; Paneth cell; ; abdominal wall; ; medial ganglionic eminence; ; mandibular prominence; ; spermatid;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; protein-membrane adaptor activity; metal ion binding; protein binding; identical protein binding; nuclear localization sequence binding; structural constituent of nuclear pore;
Cellular component	nuclear membrane; nuclear periphery; membrane; nuclear pore; nucleoplasm; nucleolus; nuclear inclusion body; nuclear pore nuclear basket; nucleus; nuclear pore central transport channel; cytosol; host cell;
Biological process	mRNA transport; nuclear pore complex assembly; viral penetration into host nucleus; protein transport; viral entry into host cell; viral process; negative regulation of RNA export from nucleus; mRNA export from nucleus; protein import into nucleus; regulation of glycolytic process; tRNA export from nucleus; protein sumoylation; viral transcription; regulation of gene silencing by miRNA; intracellular transport of virus; regulation of cellular response to heat;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9972
	218210
	ENSG00000124789
	ENSMUSG00000021374
	P49790
	н/д
	НМ_001278209 ; НМ_001278210 ; НМ_005124
	НМ_175749
	НП_001265138 ; НП_001265139 ; НП_005115
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Нуклеопорин 153 ( Nup153 ) представляет собой белок, который у человека кодируется геном NUP153 . Он является важным компонентом корзины комплексов ядерных пор (NPC) у позвоночных и необходим для закрепления NPC. Он также действует как место стыковки импортирующего кариоферина. ^{[ 5 ]} На цитоплазматической стороне NPC Nup358 выполняет аналогичную роль.

Фон

Комплексы ядерных пор представляют собой чрезвычайно сложные структуры, которые обеспечивают регулируемое движение макромолекул между ядром и цитоплазмой. Эти комплексы состоят по меньшей мере из 100 различных полипептидных субъединиц, многие из которых принадлежат к семейству нуклеопоринов. Нуклеопорины представляют собой гликопротеины, специфичные для поровых комплексов, характеризующиеся цитоплазматически ориентированными О-связанными остатками N-ацетилглюкозамина и многочисленными повторами пентапептидной последовательности XFXFG.

Структура

Нуклеопорин 153 имеет массу 153 кДа (отсюда и его название). Он нитевидный и содержит три отдельных домена: N-концевой регион, внутри которого был идентифицирован домен, нацеленный на поры, центральный регион, содержащий несколько мотивов цинковых пальцев , и C-концевой регион, содержащий несколько повторов XFXFG. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что NUP153 взаимодействует с SENP2. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} и КПНБ1 . ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000124789 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021374 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Морояну Дж., Блобель Г., Раду А. (1997). «RanGTP-опосредованный ядерный экспорт кариоферина альфа включает его взаимодействие с нуклеопорином Nup153» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (18): 9699–704. Бибкод : 1997PNAS...94.9699M . дои : 10.1073/pnas.94.18.9699 . ПМК 23253 . ПМИД 9275187 .
^ «Ген Энтреза: нуклеопорин NUP153 153 кДа» .
^ Ханг, Джун; Дассо Мэри (май 2002 г.). «Ассоциация человеческой протеазы SUMO-1 SENP2 с ядерной порой» . Ж. Биол. Хим . 277 (22): 19961–6. дои : 10.1074/jbc.M201799200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 11896061 .
^ Чжан, Хун; Сайто Хисато; Матунис Майкл Дж. (сентябрь 2002 г.). «Ферменты пути модификации SUMO локализуются в нитях комплекса ядерных пор» . Мол. Клетка. Биол . 22 (18): 6498–508. дои : 10.1128/MCB.22.18.6498-6508.2002 . ISSN 0270-7306 . ПМК 135644 . ПМИД 12192048 .
^ Накельный, С; Шейх С; Берк Б; Дрейфус Дж. (апрель 1999 г.). «Nup153 представляет собой M9-содержащий мобильный нуклеопорин с новым Ran-связывающим доменом» . ЭМБО Дж . 18 (7): 1982–95. дои : 10.1093/emboj/18.7.1982 . ISSN 0261-4189 . ПМЦ 1171283 . ПМИД 10202161 .
^ Келенбах, Р.Х.; Джераче Л. (июнь 2000 г.). «Фосфорилирование механизмов ядерного транспорта снижает импорт ядерных белков in vitro» . Ж. Биол. Хим . 275 (23): 17848–56. дои : 10.1074/jbc.M001455200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 10749866 .
^ Бен-Эфраим, я; Джераче Л. (январь 2001 г.). «Градиент возрастающего сродства импортина бета к нуклеопоринам на пути ядерного импорта» . Дж. Клеточная Биол . 152 (2): 411–7. дои : 10.1083/jcb.152.2.411 . ISSN 0021-9525 . ПМК 2199621 . ПМИД 11266456 .

Дальнейшее чтение

Морояну Дж (2000). «Пути ядерного импорта и экспорта». Дж. Селл. Биохим . Приложение 32–33 (S32): 76–83. doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(1999)75:32+<76::AID-JCB10>3.0.CO;2-Q . ПМИД 10629106 . S2CID 45613755 .
Адам С.А. (2002). «Комплекс ядерных пор» . Геном Биол . 2 (9): ОБЗОРЫ0007. doi : 10.1186/gb-2001-2-9-reviews0007 . ПМК 138961 . ПМИД 11574060 .
МакМорроу И., Бастос Р., Хортон Х., Берк Б. (1994). «Анализ последовательности кДНК, кодирующей белок комплекса ядерных пор человека, hnup153». Биохим. Биофиз. Акта . 1217 (2): 219–23. дои : 10.1016/0167-4781(94)90040-X . ПМИД 8110839 .
Ясин Н.Р., Блобель Г. (1997). «Клонирование и характеристика кариоферина бета3 человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (9): 4451–6. Бибкод : 1997PNAS...94.4451Y . дои : 10.1073/pnas.94.9.4451 . ПМК 20743 . ПМИД 9114010 .
Золотухин А.С., Фельбер Б.К. (1999). «Нуклеопорины nup98 и nup214 участвуют в ядерном экспорте вируса иммунодефицита человека типа 1 Rev» . Дж. Вирол . 73 (1): 120–7. doi : 10.1128/JVI.73.1.120-127.1999 . ПМЦ 103815 . ПМИД 9847314 .
Уллман К.С., Шах С., Пауэрс М.А., Forbes DJ (1999). «Нуклеопорин nup153 играет решающую роль во многих видах ядерного экспорта» . Мол. Биол. Клетка . 10 (3): 649–64. дои : 10.1091/mbc.10.3.649 . ПМК 25193 . ПМИД 10069809 .
Накиельни С., Шейх С., Берк Б., Дрейфус Г. (1999). «Nup153 представляет собой M9-содержащий мобильный нуклеопорин с новым Ran-связывающим доменом» . ЭМБО Дж . 18 (7): 1982–95. дои : 10.1093/emboj/18.7.1982 . ПМЦ 1171283 . ПМИД 10202161 .
Бачи А., Браун И.С., Родригес Дж.П. и др. (2000). «С-концевой домен TAP взаимодействует с комплексом ядерных пор и способствует экспорту специфических CTE-несущих РНК-субстратов» . РНК . 6 (1): 136–58. дои : 10.1017/S1355838200991994 . ПМЦ 1369901 . ПМИД 10668806 .
Келенбах Р.Х., Джераче Л. (2000). «Фосфорилирование механизмов ядерного транспорта снижает импорт ядерных белков in vitro» . Ж. Биол. Хим . 275 (23): 17848–56. дои : 10.1074/jbc.M001455200 . ПМИД 10749866 .
Кутай У., Хартманн Э., Трейхель Н. и др. (2001). «Идентификация двух новых RanGTP-связывающих белков, принадлежащих к суперсемейству бета-импортина» . Ж. Биол. Хим . 275 (51): 40163–8. дои : 10.1074/jbc.M006242200 . hdl : 11858/00-001M-0000-0015-3D4E-B . ПМИД 11024021 .
Герольд А., Суяма М., Родригес Дж. П. и др. (2000). «TAP (NXF1) принадлежит к мультигенному семейству предполагаемых факторов экспорта РНК с консервативной модульной архитектурой» . Мол. Клетка. Биол . 20 (23): 8996–9008. дои : 10.1128/MCB.20.23.8996-9008.2000 . ПМК 86553 . ПМИД 11073998 .
Хофманн В., Райхарт Б., Эвальд А. и др. (2001). «Требования к кофакторам для ядерного экспорта ретровирусных РНК, содержащих Rev-ответный элемент (RRE) и конститутивный транспортный элемент (CTE). Неожиданная роль актина» . Дж. Клеточная Биол . 152 (5): 895–910. дои : 10.1083/jcb.152.5.895 . ПМК 2198816 . ПМИД 11238447 .
Бен-Эфраим I, Джерас Л. (2001). «Градиент возрастающего сродства импортина бета к нуклеопоринам на пути ядерного импорта» . Дж. Клеточная Биол . 152 (2): 411–7. дои : 10.1083/jcb.152.2.411 . ПМК 2199621 . ПМИД 11266456 .
Димаано С., Болл-младший, Прунуске А.Дж., Ульман К.С. (2002). «Ассоциация РНК определяет функционально консервативный домен в белке Nup153 ядерной поры» . Ж. Биол. Хим . 276 (48): 45349–57. дои : 10.1074/jbc.M102592200 . ПМИД 11567018 .
Вальтер Т.С., Форнерод М., Пикерсгилл Х. и др. (2001). «Нуклеопорин Nup153 необходим для формирования корзины ядерных пор, закрепления комплекса ядерных пор и импорта подмножества ядерных белков» . ЭМБО Дж . 20 (20): 5703–14. дои : 10.1093/emboj/20.20.5703 . ПМК 125666 . ПМИД 11598013 .
Браунуэлл А.М., Макара И.Г. (2002). «Экспортин-5, новый кариоферин, опосредует ядерный экспорт белков, связывающих двухцепочечную РНК» . Дж. Клеточная Биол . 156 (1): 53–64. дои : 10.1083/jcb.200110082 . ПМК 2173575 . ПМИД 11777942 .
Ханг Дж., Дассо М. (2002). «Ассоциация человеческой протеазы SUMO-1 SENP2 с ядерной порой» . Ж. Биол. Хим . 277 (22): 19961–6. дои : 10.1074/jbc.M201799200 . ПМИД 11896061 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000124789 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021374 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[Moroianu1-5] Морояну Дж., Блобель Г., Раду А. (1997). «RanGTP-опосредованный ядерный экспорт кариоферина альфа включает его взаимодействие с нуклеопорином Nup153» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (18): 9699–704. Бибкод : 1997PNAS...94.9699M . дои : 10.1073/pnas.94.18.9699 . ПМК 23253 . ПМИД 9275187 .

[entrez-6] «Ген Энтреза: нуклеопорин NUP153 153 кДа» .

[pmid11896061-7] Ханг, Джун; Дассо Мэри (май 2002 г.). «Ассоциация человеческой протеазы SUMO-1 SENP2 с ядерной порой» . Ж. Биол. Хим . 277 (22): 19961–6. дои : 10.1074/jbc.M201799200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 11896061 .

[pmid12192048-8] Чжан, Хун; Сайто Хисато; Матунис Майкл Дж. (сентябрь 2002 г.). «Ферменты пути модификации SUMO локализуются в нитях комплекса ядерных пор» . Мол. Клетка. Биол . 22 (18): 6498–508. дои : 10.1128/MCB.22.18.6498-6508.2002 . ISSN 0270-7306 . ПМК 135644 . ПМИД 12192048 .

[pmid10202161-9] Накельный, С; Шейх С; Берк Б; Дрейфус Дж. (апрель 1999 г.). «Nup153 представляет собой M9-содержащий мобильный нуклеопорин с новым Ran-связывающим доменом» . ЭМБО Дж . 18 (7): 1982–95. дои : 10.1093/emboj/18.7.1982 . ISSN 0261-4189 . ПМЦ 1171283 . ПМИД 10202161 .

[pmid10749866-10] Келенбах, Р.Х.; Джераче Л. (июнь 2000 г.). «Фосфорилирование механизмов ядерного транспорта снижает импорт ядерных белков in vitro» . Ж. Биол. Хим . 275 (23): 17848–56. дои : 10.1074/jbc.M001455200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 10749866 .

[pmid11266456-11] Бен-Эфраим, я; Джераче Л. (январь 2001 г.). «Градиент возрастающего сродства импортина бета к нуклеопоринам на пути ядерного импорта» . Дж. Клеточная Биол . 152 (2): 411–7. дои : 10.1083/jcb.152.2.411 . ISSN 0021-9525 . ПМК 2199621 . ПМИД 11266456 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

v т и Аутоантигены
Дегидрогеназа	Комплекс дегидрогеназы альфа-кетокислот с разветвленной цепью Оксоглутаратдегидрогеназа Пируватдегидрогеназа
Трансглутаминаза	Эпидермальная трансглутаминаза Тканевая трансглутаминаза
Нуклеопорины	НУП35 НУП37 НУП43 НУП50 НУП54 НУП62 НУП85 НУП88 НУП93 НУП98 НУП107 НУП133 НУП153 НУП155 НУП160 НУП188 НУП210 НУП205 НУП214
Другой	Ацетилхолиновый рецептор Актин Аполипопротеин H Кардиолипин Центромера Филагрин (Цитруллинат) Ганглиозиды Ядерный антиген Sp100 Тромбин топоизомераза