ТИМП2

ТИМП2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1BR9, 1GXD, 2TMP, 4ILW
Идентификаторы
Псевдонимы	TIMP2 , CSC-21K, DDC8, ингибитор металлопептидазы TIMP 2
Внешние идентификаторы	Опустить : 188825 ; МГИ : 98753 ; Гомологен : 2444 ; Генные карты : TIMP2 ; ОМА : ТИМП2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	78,925,387 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	118,246,566 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tendon of biceps brachii; ; synovial joint; ; stromal cell of endometrium; ; tibia; ; urethra; ; Descending thoracic aorta; ; trigeminal ganglion; ; ascending aorta; ; right coronary artery; ; visceral pleura;
	Top expressed in
	calvaria; ; stroma of bone marrow; ; ankle; ; skin of external ear; ; body of femur; ; ventromedial nucleus; ; subiculum; ; anterior amygdaloid area; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; retinal pigment epithelium;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	peptidase inhibitor activity; enzyme inhibitor activity; metal ion binding; integrin binding; protein binding; protease binding; metalloendopeptidase inhibitor activity; zinc ion binding;
Cellular component	growth cone; extracellular region; cell surface; neuronal cell body; neuron projection; extracellular exosome; extracellular matrix; extracellular space; specific granule lumen; tertiary granule lumen; ficolin-1-rich granule lumen; collagen-containing extracellular matrix;
Biological process	negative regulation of proteolysis; response to cytokine; negative regulation of peptidase activity; positive regulation of adenylate cyclase activity; human ageing; extracellular matrix disassembly; negative regulation of Ras protein signal transduction; central nervous system development; positive regulation of neuron differentiation; response to hormone; negative regulation of membrane protein ectodomain proteolysis; positive regulation of MAPK cascade; negative regulation of cell population proliferation; negative regulation of mitotic cell cycle; regulation of Rap protein signal transduction; negative regulation of endopeptidase activity; neutrophil degranulation; negative regulation of metallopeptidase activity; response to organic substance;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7077
	21858
	ENSG00000035862
	ENSMUSG00000017466
	P16035
	P25785
	НМ_003255
	НМ_011594
	НП_003246
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Тканевый ингибитор металлопротеиназ 2 (TIMP2) представляет собой ген и соответствующий ему белок . Ген является членом семейства генов TIMP . Считается, что этот белок подавляет метастазирование . ^{[ нужна ссылка ]}

Функция

Белки, кодируемые этим семейством генов, являются естественными ингибиторами матриксных металлопротеиназ (ММП), группы пептидаз, участвующих в деградации внеклеточного матрикса. Помимо ингибирующей роли в отношении металлопротеиназ, кодируемый белок играет уникальную роль среди членов семейства TIMP, поскольку он способен напрямую подавлять пролиферацию эндотелиальных клеток. В результате кодируемый белок может иметь решающее значение для поддержания тканевого гомеостаза , подавляя пролиферацию покоящихся тканей в ответ на ангиогенные факторы и ингибируя активность протеазы в тканях, подвергающихся ремоделированию внеклеточного матрикса. ^{[ 5 ]} TIMP2 действует как ингибитор и активатор MMP. ТИМП ингибируют активные ММП, но разные ТИМП ингибируют разные ММП лучше, чем другие. Например, ТИМП-1 ингибирует ММП-7, ММП-9, ММП-1 и ММП-3 лучше, чем ТИМП-2, а ТИМП-2 ингибирует ММП-2 более эффективно, чем другие ТИМП. ^{[ 6 ]}

В меланоцитарных клетках экспрессия гена TIMP2 может регулироваться MITF . ^{[ 7 ]}

Недавнее открытие заключается в том, что TIMP2 играет важную роль в функции гиппокампа и когнитивных функциях. Он играет решающую роль в пользе, получаемой старыми мышами при введении человеческой пуповинной крови . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Позже было описано, что его роль в функции гиппокампа связана с его взаимодействием с внеклеточным матриксом для регуляции нейрогенеза и пластичности дендритных отростков . ^{[ 10 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TIMP2 взаимодействует с:

ММП14 ^{[ 11 ]} и
ММП2 . ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}

См. также

ТИМП1 , ТИМП3 , ТИМП4

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000035862 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017466 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: TIMP2, ингибитор металлопептидазы TIMP 2» .
^ Бурбулия Д., Стетлер-Стивенсон WG (июнь 2010 г.). «Матричные металлопротеиназы (ММП) и тканевые ингибиторы металлопротеиназ (ТИМП): положительные и отрицательные регуляторы адгезии опухолевых клеток» . Семинары по биологии рака . 20 (3): 161–168. doi : 10.1016/j.semcancer.2010.05.002 . ПМЦ 2941566 . ПМИД 20470890 .
^ Хук К.С., Шлегель Н.К., Эйххофф О.М., Видмер Д.С., Преториус С., Эйнарссон С.О. и др. (декабрь 2008 г.). «Новые цели MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии микрочипов ДНК» . Исследование пигментных клеток и меланомы . 21 (6): 665–676. дои : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . ПМИД 19067971 . S2CID 24698373 .
^ Кастеллано Дж.М., Мошер К.И., Эбби Р.Дж., Макбрайд А.А., Джеймс М.Л., Бердник Д. и др. (апрель 2017 г.). «Белки плазмы пуповины человека восстанавливают функцию гиппокампа у старых мышей» . Природа . 544 (7651): 488–492. Бибкод : 2017Natur.544..488C . дои : 10.1038/nature22067 . ПМК 5586222 . ПМИД 28424512 .
^ «Кровь человеческих младенцев возвращает молодость мозгу пожилых мышей» . Новый учёный . 29 апреля 2017 г.
^ Феррейра А.С., Хеммер Б.М., Филиппи С.М., Грау-Пералес А.Б., Розенштадт Дж.Л., Лю Х. и др. (сентябрь 2023 г.). «Нейрональный TIMP2 регулирует зависящую от гиппокампа пластичность и сложность внеклеточного матрикса» . Молекулярная психиатрия . 28 (9): 3943–3954. дои : 10.1038/s41380-023-02296-5 . ПМК 10730400 . ПМИД 37914840 .
^ Цукер С., Дрюс М., Коннер С., Фода Х.Д., ДеКлерк Ю.А., Лэнгли К.Э. и др. (январь 1998 г.). «Тканевой ингибитор металлопротеиназы-2 (ТИМП-2) связывается с каталитическим доменом рецептора клеточной поверхности, мембранной металлопротеиназы 1-го типа (MT1-MMP)» . Журнал биологической химии . 273 (2): 1216–1222. дои : 10.1074/jbc.273.2.1216 . ПМИД 9422789 .
^ Моргунова Е, Тууттила А, Бергманн У, Трюггвасон К (май 2002 г.). «Структурное понимание комплексного образования латентной матриксной металлопротеиназы 2 с тканевым ингибитором металлопротеиназы 2» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (11): 7414–7419. Бибкод : 2002PNAS...99.7414M . дои : 10.1073/pnas.102185399 . ПМК 124245 . ПМИД 12032297 .
^ В целом CM, Tam E, McQuibban GA, Morrison C, Wallon UM, Bigg HF и др. (декабрь 2000 г.). «Доменные взаимодействия в комплексе активации желатиназы A.TIMP-2.MT1-MMP. Эктодомен 44-кДа формы мембранной матриксной металлопротеиназы типа 1 не модулирует активацию желатиназы А» . Журнал биологической химии . 275 (50): 39497–39506. дои : 10.1074/jbc.M005932200 . ПМИД 10991943 .
^ Бигг Х.Ф., Ши Й.Е., Лю Й.Е., Штеффенсен Б., общий СМ (июнь 1997 г.). «Специфическое высокоаффинное связывание тканевого ингибитора металлопротеиназ-4 (ТИМП-4) с СООН-концевым гемопексиноподобным доменом человеческой желатиназы А. ТИМП-4 связывает прожелатиназу А и СООН-концевой домен аналогично ТИМП. -2" . Журнал биологической химии . 272 (24): 15496–15500. дои : 10.1074/jbc.272.24.15496 . ПМИД 9182583 .
^ Кай Х.С., Батлер Г.С., Моррисон С.Дж., Кинг А.Е., Пельман Г.Р., общий управляющий директор (декабрь 2002 г.). «Использование новой системы экспрессии рекомбинантного слитого белка миоглобина для характеристики тканевого ингибитора металлопротеиназы (TIMP)-4 и C-концевого домена и хвостов TIMP-2 путем мутагенеза. Важность кислотных остатков в связывании гемопексина C-MMP-2. домен" . Журнал биологической химии . 277 (50): 48696–48707. дои : 10.1074/jbc.M209177200 . ПМИД 12374789 .

Дальнейшее чтение

Лиотта Л.А., Стетлер-Стивенсон В., Стиг П.С. (1991). «Гены-супрессоры метастазов». Важные достижения в онкологии : 85–100. ПМИД 1869284 .
Стетлер-Стивенсон В.Г., Со Д.В. (март 2005 г.). «ТИМП-2: эндогенный ингибитор ангиогенеза». Тенденции молекулярной медицины . 11 (3): 97–103. doi : 10.1016/j.molmed.2005.01.007 . ПМИД 15760767 .

Внешние ссылки

Онлайн-база данных MEROPS . по пептидазам и их ингибиторам: I35.002
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P16035 (ингибитор металлопротеиназы 2) в PDBe-KB .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 17 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000035862 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017466 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] «Ген Энтрез: TIMP2, ингибитор металлопептидазы TIMP 2» .

[6] Бурбулия Д., Стетлер-Стивенсон WG (июнь 2010 г.). «Матричные металлопротеиназы (ММП) и тканевые ингибиторы металлопротеиназ (ТИМП): положительные и отрицательные регуляторы адгезии опухолевых клеток» . Семинары по биологии рака . 20 (3): 161–168. doi : 10.1016/j.semcancer.2010.05.002 . ПМЦ 2941566 . ПМИД 20470890 .

[pmid19067971-7] Хук К.С., Шлегель Н.К., Эйххофф О.М., Видмер Д.С., Преториус С., Эйнарссон С.О. и др. (декабрь 2008 г.). «Новые цели MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии микрочипов ДНК» . Исследование пигментных клеток и меланомы . 21 (6): 665–676. дои : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . ПМИД 19067971 . S2CID 24698373 .

[8] Кастеллано Дж.М., Мошер К.И., Эбби Р.Дж., Макбрайд А.А., Джеймс М.Л., Бердник Д. и др. (апрель 2017 г.). «Белки плазмы пуповины человека восстанавливают функцию гиппокампа у старых мышей» . Природа . 544 (7651): 488–492. Бибкод : 2017Natur.544..488C . дои : 10.1038/nature22067 . ПМК 5586222 . ПМИД 28424512 .

[9] «Кровь человеческих младенцев возвращает молодость мозгу пожилых мышей» . Новый учёный . 29 апреля 2017 г.

[10] Феррейра А.С., Хеммер Б.М., Филиппи С.М., Грау-Пералес А.Б., Розенштадт Дж.Л., Лю Х. и др. (сентябрь 2023 г.). «Нейрональный TIMP2 регулирует зависящую от гиппокампа пластичность и сложность внеклеточного матрикса» . Молекулярная психиатрия . 28 (9): 3943–3954. дои : 10.1038/s41380-023-02296-5 . ПМК 10730400 . ПМИД 37914840 .

[pmid9422789-11] Цукер С., Дрюс М., Коннер С., Фода Х.Д., ДеКлерк Ю.А., Лэнгли К.Э. и др. (январь 1998 г.). «Тканевой ингибитор металлопротеиназы-2 (ТИМП-2) связывается с каталитическим доменом рецептора клеточной поверхности, мембранной металлопротеиназы 1-го типа (MT1-MMP)» . Журнал биологической химии . 273 (2): 1216–1222. дои : 10.1074/jbc.273.2.1216 . ПМИД 9422789 .

[pmid12032297-12] Моргунова Е, Тууттила А, Бергманн У, Трюггвасон К (май 2002 г.). «Структурное понимание комплексного образования латентной матриксной металлопротеиназы 2 с тканевым ингибитором металлопротеиназы 2» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (11): 7414–7419. Бибкод : 2002PNAS...99.7414M . дои : 10.1073/pnas.102185399 . ПМК 124245 . ПМИД 12032297 .

[pmid10991943-13] В целом CM, Tam E, McQuibban GA, Morrison C, Wallon UM, Bigg HF и др. (декабрь 2000 г.). «Доменные взаимодействия в комплексе активации желатиназы A.TIMP-2.MT1-MMP. Эктодомен 44-кДа формы мембранной матриксной металлопротеиназы типа 1 не модулирует активацию желатиназы А» . Журнал биологической химии . 275 (50): 39497–39506. дои : 10.1074/jbc.M005932200 . ПМИД 10991943 .

[pmid9182583-14] Бигг Х.Ф., Ши Й.Е., Лю Й.Е., Штеффенсен Б., общий СМ (июнь 1997 г.). «Специфическое высокоаффинное связывание тканевого ингибитора металлопротеиназ-4 (ТИМП-4) с СООН-концевым гемопексиноподобным доменом человеческой желатиназы А. ТИМП-4 связывает прожелатиназу А и СООН-концевой домен аналогично ТИМП. -2" . Журнал биологической химии . 272 (24): 15496–15500. дои : 10.1074/jbc.272.24.15496 . ПМИД 9182583 .

[pmid12374789-15] Кай Х.С., Батлер Г.С., Моррисон С.Дж., Кинг А.Е., Пельман Г.Р., общий управляющий директор (декабрь 2002 г.). «Использование новой системы экспрессии рекомбинантного слитого белка миоглобина для характеристики тканевого ингибитора металлопротеиназы (TIMP)-4 и C-концевого домена и хвостов TIMP-2 путем мутагенеза. Важность кислотных остатков в связывании гемопексина C-MMP-2. домен" . Журнал биологической химии . 277 (50): 48696–48707. дои : 10.1074/jbc.M209177200 . ПМИД 12374789 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]