ТИМП1

ТИМП1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1D2B, 1OO9, 1UEA, 2J0T, 3MA2, 3V96
Идентификаторы
Псевдонимы	TIMP1 , CLGI, EPA, EPO, HCI, TIMP, TIMP-1, ингибитор металлопептидазы TIMP 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 305370 ; МГИ : 98752 ; Гомологен : 36321 ; Генные карты : TIMP1 ; ОМА : ТИМП1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	47,586,789 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	20,740,974 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right coronary artery; ; gallbladder; ; left coronary artery; ; Descending thoracic aorta; ; ascending aorta; ; stromal cell of endometrium; ; islet of Langerhans; ; pericardium; ; beta cell; ; right adrenal gland;
	Top expressed in
	calvaria; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; stroma of bone marrow; ; body of femur; ; ankle joint; ; ankle; ; gastrula; ; lactiferous gland; ; fossa; ; belly cord;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	peptidase inhibitor activity; enzyme inhibitor activity; cytokine activity; metal ion binding; protease binding; protein binding; metalloendopeptidase inhibitor activity; growth factor activity; zinc ion binding;
Cellular component	extracellular matrix; extracellular region; basement membrane; extracellular exosome; platelet alpha granule lumen; extracellular space; endoplasmic reticulum lumen; collagen;
Biological process	response to cytokine; negative regulation of peptidase activity; human ageing; response to peptide hormone; platelet degranulation; wound healing; negative regulation of apoptotic process; extracellular matrix disassembly; negative regulation of trophoblast cell migration; response to organic substance; cell activation; cartilage development; regulation of integrin-mediated signaling pathway; positive regulation of cell population proliferation; response to hormone; negative regulation of membrane protein ectodomain proteolysis; negative regulation of endopeptidase activity; negative regulation of catalytic activity; negative regulation of metallopeptidase activity; post-translational protein modification; regulation of signaling receptor activity; connective tissue replacement involved in inflammatory response wound healing; cytokine-mediated signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7076
	21857
	ENSG00000102265
	ENSMUSG00000001131
	P01033 ; Q6FGX5
	P12032
	НМ_003254
	НМ_001044384 ; НМ_001294280 ; НМ_011593
	НП_003245 ; НП_003245.1
	НП_001037849 ; НП_001281209 ; НП_035723
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ингибитор металлопептидазы TIMP 1 , также известный как TIMP1 , тканевой ингибитор металлопротеиназ , представляет собой гликопротеин с молекулярной массой 28 кДа. ^{[ 5 ]} TIMP1 экспрессируется из нескольких тканей организмов.

Этот белок является членом семейства TIMP . Гликопротеин ( ММП является естественным ингибитором матриксных металлопротеиназ ), группы пептидаз, участвующих в деградации внеклеточного матрикса . В дополнение к своей ингибирующей роли в отношении большинства известных ММП, кодируемый белок способен стимулировать пролиферацию клеток в широком диапазоне типов клеток, а также может обладать антиапоптотической функцией.

Функция

TIMP1 представляет собой ингибирующую молекулу, которая регулирует матриксные металлопротеиназы (MMP) и дезинтегрин-металлопротеиназы (ADAM и ADAMTS). ^{[ 6 ]} В регуляции ММП ТИМП1 играет решающую роль в составе внеклеточного матрикса (ВКМ), заживлении ран, ^{[ 7 ]} и беременность. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Нарушение регуляции активности TIMP1 связано с раком. ^{[ 11 ]} Во время беременности TIMP1 играет регуляторную роль в процессе имплантации, особенно в инвазии цитотрофобластов эндометрия матки. ^{[ 12 ]} Кроме того, он играет роль в регуляции транскрипционного профиля тканей плода и плаценты, связанного с ранними стадиями беременности. ^{[ 13 ]} Исследования объясняют эту роль механизмом, включающим структуру хроматина в области промотора TIMP1, что открывает новые фармацевтические возможности для терапевтической регуляции TIMP1. Соответственно, с TIMP1 можно манипулировать in vitro , используя такие методы, как нокаут TIMP1. ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}

Другие имена

Потенцирующая активность эритроида (EPA)
Ингибитор коллагеназы человека (HCI)

Регуляция экспрессии TIMP

Транскрипция этого гена в высокой степени индуцируется в ответ на действие многих цитокинов и гормонов . Кроме того, экспрессия некоторых, но не всех неактивных -хромосом позволяет предположить, что инактивация этого гена полиморфна у женщин Х . Этот ген расположен в интроне 6 гена синапсин I и транскрибируется в противоположном направлении. ^{[ 17 ]}

В клетках коры надпочечников трофический гормон АКТГ индуцирует экспрессию ТИМП-1, причем увеличение экспрессии ТИМП также связано со снижением активности коллагеназы. ^{[ 18 ]}

Было обнаружено, что повышенная экспрессия TIMP1 связана с худшим прогнозом при различных опухолях, таких как рак гортани. ^{[ 19 ]} или меланома . ^{[ 20 ]}

См. также

ТИМП2 , ТИМП3 , ТИМП4

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000102265 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001131 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ни, Ларин Э.; Макморроу, Тара; Кэмпбелл, Эрик; Слэттери, Крейг; Райан, Майкл П. (1 октября 2004 г.). «Регуляция MMP-9 и TIMP-1, опосредованная TNF-α и IL-1β, в клетках проксимальных канальцев почек» . Почки Интернешнл . 66 (4): 1376–1386. дои : 10.1111/j.1523-1755.2004.00900.x . ISSN 0085-2538 . ПМИД 15458430 .
^ Brew K, Nagase H (январь 2010 г.). «Тканевые ингибиторы металлопротеиназ (ТИМП): древнее семейство со структурным и функциональным разнообразием» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1803 (1): 55–71. дои : 10.1016/j.bbamcr.2010.01.003 . ПМЦ 2853873 . ПМИД 20080133 .
^ Брю К., Динакарпандиан Д., Нагасе Х. (март 2000 г.). «Тканевые ингибиторы металлопротеиназ: эволюция, структура и функции». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология . 1477 (1–2): 267–83. дои : 10.1016/S0167-4838(99)00279-4 . ПМИД 10708863 .
^ Грэм Ч., Лала П.К. (август 1991 г.). «Механизм контроля инвазии трофобласта in situ». Журнал клеточной физиологии . 148 (2): 228–34. дои : 10.1002/jcp.1041480207 . ПМИД 1652588 . S2CID 3145982 .
^ Нотник В.Б., Солоуэй П., Карри Т.Е. (май 1997 г.). «Оценка роли тканевого ингибитора металлопротеиназы-1 (ТИМП-1) в периовуляторный период у самок мышей, лишенных функционального гена ТИМП-1» . Биология размножения . 56 (5): 1181–8. дои : 10.1095/biolreprod56.5.1181 . ПМИД 9160717 .
^ Нотник ВБ (сентябрь 2000 г.). «Нарушение тканевого ингибитора гена металлопротеиназы-1 приводит к изменению репродуктивной цикличности и морфологии матки у самок мышей репродуктивного возраста» . Биология размножения . 63 (3): 905–12. дои : 10.1095/biolreprod63.3.905 . ПМИД 10952938 .
^ Ким Ю.С., Ким Ш., Кан Дж.Г., Ко Дж.Х. (2012). «Уровень экспрессии и динамика гликанов определяют суммарное влияние ТИМП-1 на прогрессирование рака» . Отчеты БМБ . 45 (11): 623–8. дои : 10.5483/BMBRep.2012.45.11.233 . ПМК 4133808 . ПМИД 23187000 .
^ Грэм Ч., Лала П.К. (август 1991 г.). «Механизм контроля инвазии трофобласта in situ». Журнал клеточной физиологии . 148 (2): 228–34. дои : 10.1002/jcp.1041480207 . ПМИД 1652588 . S2CID 3145982 .
^ Винсент З.Л., Митчелл, доктор медицинских наук, Поннампалам AP (декабрь 2015 г.). «Регуляция ТИМП-1 в плаценте человека и мембранах плода с помощью липополисахарида и деметилирующего агента 5-аза-2'-дезоксицитидина» . Репродуктивная биология и эндокринология . 13 : 136. дои : 10.1186/s12958-015-0132-y . ПМК 4687108 . ПМИД 26691525 .
^ Гонг Ю, Скотт Э, Лу Р, Сюй Ю, О ВК, Ю Ц (15 октября 2013 г.). «ТИМП-1 способствует накоплению фибробластов, связанных с раком, и прогрессированию рака» . ПЛОС ОДИН . 8 (10): е77366. Бибкод : 2013PLoSO...877366G . дои : 10.1371/journal.pone.0077366 . ПМК 3797040 . ПМИД 24143225 .
^ Журкен Дж., Трембле Э., Бернар А., Чартон Дж., Шайан Ф.А., Маркетти Е., Роман Ф.С., Солоуэй П.Д., Дайв В., Йиотакис А., Крещатиски М., Ривера С. (ноябрь 2005 г.). «Тканевой ингибитор металлопротеиназ-1 (ТИМП-1) модулирует гибель нейронов, пластичность аксонов, а также обучение и память». Европейский журнал неврологии . 22 (10): 2569–78. дои : 10.1111/j.1460-9568.2005.04426.x . ПМИД 16307599 . S2CID 18499513 .
^ Грэм Ч., Лала П.К. (август 1991 г.). «Механизм контроля инвазии трофобласта in situ». Журнал клеточной физиологии . 148 (2): 228–34. дои : 10.1002/jcp.1041480207 . ПМИД 1652588 . S2CID 3145982 .
^ «Ген Энтрез: TIMP1, ингибитор металлопептидазы TIMP 1» .
^ Райхенштейн М., Райх Р., ЛеХу Дж.Г., Ханукоглу И. (февраль 2004 г.). «АКТГ индуцирует экспрессию ТИМП-1 и ингибирует коллагеназу в клетках коры надпочечников». Молекулярная и клеточная эндокринология . 215 (1–2): 109–14. CiteSeerX 10.1.1.538.7614 . дои : 10.1016/j.mce.2003.11.011 . ПМИД 15026182 . S2CID 6836003 .
^ Ма Дж, Ван Дж, Фань В, Пу X, Чжан Д, Фань С, Сюн Л, Чжу Х, Сюй Н, Чен Р, Лю С (декабрь 2013 г.). «Повышенная регуляция ТИМП-1 коррелирует с плохим прогнозом плоскоклеточного рака гортани» . Международный журнал клинической и экспериментальной патологии . 7 (1): 246–54. ПМЦ 3885479 . ПМИД 24427345 .
^ Тархини А.А., Лин Ю, Йеку О, ЛаФрамбуаз В.А., Ашраф М., Сандер С., Ли С., Кирквуд Дж.М. (январь 2014 г.). «Четырехмаркерная сигнатура TNF-RII, TGF-α, TIMP-1 и CRP является прогностическим фактором худшей выживаемости при хирургически резецированной меланоме высокого риска» . Журнал трансляционной медицины . 12:19 . дои : 10.1186/1479-5876-12-19 . ПМЦ 3909384 . ПМИД 24457057 .

Дальнейшее чтение

Хорнебек В. (декабрь 2003 г.). «Снижение уровня регуляции тканевого ингибитора матриксной металлопротеазы-1 (ТИМП-1) в коже пожилого человека способствует деградации матрикса и нарушению роста и выживания клеток». Патология-Биология . 51 (10): 569–73. дои : 10.1016/j.patbio.2003.09.003 . ПМИД 14622947 .
Гарднер Дж., Горпад А. (декабрь 2003 г.). «Тканевой ингибитор металлопротеиназы (ТИМП)-1: ТИМПированный баланс матриксных металлопротеиназ в центральной нервной системе» . Журнал нейробиологических исследований . 74 (6): 801–6. дои : 10.1002/jnr.10835 . ПМЦ 3857704 . PMID 14648584 .

Внешние ссылки

Онлайн-база данных MEROPS . по пептидазам и их ингибиторам: I35.001
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P01033 (ингибитор металлопротеиназы 1) в PDBe-KB .

Эта статья о гене человека Х-хромосомы и/или связанном с белке незавершена . ним Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000102265 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001131 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] Ни, Ларин Э.; Макморроу, Тара; Кэмпбелл, Эрик; Слэттери, Крейг; Райан, Майкл П. (1 октября 2004 г.). «Регуляция MMP-9 и TIMP-1, опосредованная TNF-α и IL-1β, в клетках проксимальных канальцев почек» . Почки Интернешнл . 66 (4): 1376–1386. дои : 10.1111/j.1523-1755.2004.00900.x . ISSN 0085-2538 . ПМИД 15458430 .

[6] Brew K, Nagase H (январь 2010 г.). «Тканевые ингибиторы металлопротеиназ (ТИМП): древнее семейство со структурным и функциональным разнообразием» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1803 (1): 55–71. дои : 10.1016/j.bbamcr.2010.01.003 . ПМЦ 2853873 . ПМИД 20080133 .

[7] Брю К., Динакарпандиан Д., Нагасе Х. (март 2000 г.). «Тканевые ингибиторы металлопротеиназ: эволюция, структура и функции». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология . 1477 (1–2): 267–83. дои : 10.1016/S0167-4838(99)00279-4 . ПМИД 10708863 .

[8] Грэм Ч., Лала П.К. (август 1991 г.). «Механизм контроля инвазии трофобласта in situ». Журнал клеточной физиологии . 148 (2): 228–34. дои : 10.1002/jcp.1041480207 . ПМИД 1652588 . S2CID 3145982 .

[9] Нотник В.Б., Солоуэй П., Карри Т.Е. (май 1997 г.). «Оценка роли тканевого ингибитора металлопротеиназы-1 (ТИМП-1) в периовуляторный период у самок мышей, лишенных функционального гена ТИМП-1» . Биология размножения . 56 (5): 1181–8. дои : 10.1095/biolreprod56.5.1181 . ПМИД 9160717 .

[10] Нотник ВБ (сентябрь 2000 г.). «Нарушение тканевого ингибитора гена металлопротеиназы-1 приводит к изменению репродуктивной цикличности и морфологии матки у самок мышей репродуктивного возраста» . Биология размножения . 63 (3): 905–12. дои : 10.1095/biolreprod63.3.905 . ПМИД 10952938 .

[pmid23187000-11] Ким Ю.С., Ким Ш., Кан Дж.Г., Ко Дж.Х. (2012). «Уровень экспрессии и динамика гликанов определяют суммарное влияние ТИМП-1 на прогрессирование рака» . Отчеты БМБ . 45 (11): 623–8. дои : 10.5483/BMBRep.2012.45.11.233 . ПМК 4133808 . ПМИД 23187000 .

[12] Грэм Ч., Лала П.К. (август 1991 г.). «Механизм контроля инвазии трофобласта in situ». Журнал клеточной физиологии . 148 (2): 228–34. дои : 10.1002/jcp.1041480207 . ПМИД 1652588 . S2CID 3145982 .

[13] Винсент З.Л., Митчелл, доктор медицинских наук, Поннампалам AP (декабрь 2015 г.). «Регуляция ТИМП-1 в плаценте человека и мембранах плода с помощью липополисахарида и деметилирующего агента 5-аза-2'-дезоксицитидина» . Репродуктивная биология и эндокринология . 13 : 136. дои : 10.1186/s12958-015-0132-y . ПМК 4687108 . ПМИД 26691525 .

[14] Гонг Ю, Скотт Э, Лу Р, Сюй Ю, О ВК, Ю Ц (15 октября 2013 г.). «ТИМП-1 способствует накоплению фибробластов, связанных с раком, и прогрессированию рака» . ПЛОС ОДИН . 8 (10): е77366. Бибкод : 2013PLoSO...877366G . дои : 10.1371/journal.pone.0077366 . ПМК 3797040 . ПМИД 24143225 .

[15] Журкен Дж., Трембле Э., Бернар А., Чартон Дж., Шайан Ф.А., Маркетти Е., Роман Ф.С., Солоуэй П.Д., Дайв В., Йиотакис А., Крещатиски М., Ривера С. (ноябрь 2005 г.). «Тканевой ингибитор металлопротеиназ-1 (ТИМП-1) модулирует гибель нейронов, пластичность аксонов, а также обучение и память». Европейский журнал неврологии . 22 (10): 2569–78. дои : 10.1111/j.1460-9568.2005.04426.x . ПМИД 16307599 . S2CID 18499513 .

[16] Грэм Ч., Лала П.К. (август 1991 г.). «Механизм контроля инвазии трофобласта in situ». Журнал клеточной физиологии . 148 (2): 228–34. дои : 10.1002/jcp.1041480207 . ПМИД 1652588 . S2CID 3145982 .

[17] «Ген Энтрез: TIMP1, ингибитор металлопептидазы TIMP 1» .

[pmid15026182-18] Райхенштейн М., Райх Р., ЛеХу Дж.Г., Ханукоглу И. (февраль 2004 г.). «АКТГ индуцирует экспрессию ТИМП-1 и ингибирует коллагеназу в клетках коры надпочечников». Молекулярная и клеточная эндокринология . 215 (1–2): 109–14. CiteSeerX 10.1.1.538.7614 . дои : 10.1016/j.mce.2003.11.011 . ПМИД 15026182 . S2CID 6836003 .

[pmid_=_24427345-19] Ма Дж, Ван Дж, Фань В, Пу X, Чжан Д, Фань С, Сюн Л, Чжу Х, Сюй Н, Чен Р, Лю С (декабрь 2013 г.). «Повышенная регуляция ТИМП-1 коррелирует с плохим прогнозом плоскоклеточного рака гортани» . Международный журнал клинической и экспериментальной патологии . 7 (1): 246–54. ПМЦ 3885479 . ПМИД 24427345 .

[pmid_=_24457057-20] Тархини А.А., Лин Ю, Йеку О, ЛаФрамбуаз В.А., Ашраф М., Сандер С., Ли С., Кирквуд Дж.М. (январь 2014 г.). «Четырехмаркерная сигнатура TNF-RII, TGF-α, TIMP-1 и CRP является прогностическим фактором худшей выживаемости при хирургически резецированной меланоме высокого риска» . Журнал трансляционной медицины . 12:19 . дои : 10.1186/1479-5876-12-19 . ПМЦ 3909384 . ПМИД 24457057 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]