СРГАП2

СРГАП2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4RTT, 4RUG, 2DL8
Идентификаторы
Псевдонимы	SRGAP2 , ARHGAP34, FNBP2, SRGAP2A, SRGAP3, SLIT-ROBO Белок 2, активирующий Rho ГТФазу
Внешние идентификаторы	Опустить : 606524 ; МГИ : 109605 ; Гомологен : 52683 ; Генные карты : SRGAP2 ; OMA : SRGAP2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	206,464,436 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	131,455,090 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	cerebellar hemisphere; ; right hemisphere of cerebellum; ; sural nerve; ; paraflocculus of cerebellum; ; ventricular zone; ; skin of leg; ; ganglionic eminence; ; skin of abdomen; ; C1 segment; ; monocyte;
	Top expressed in
	lumbar subsegment of spinal cord; ; cerebellar cortex; ; tail of embryo; ; lobe of cerebellum; ; cerebellar vermis; ; stroma of bone marrow; ; Rostral migratory stream; ; superior frontal gyrus; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; lip;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	protein homodimerization activity; protein binding; GTPase activator activity; identical protein binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; postsynaptic membrane; cell projection; membrane; postsynaptic density; dendritic spine; synapse; cell junction; dendritic spine head; phagocytic vesicle; cytoplasmic vesicle; nucleus; lamellipodium; plasma membrane; nucleoplasm;
Biological process	lamellipodium assembly involved in ameboidal cell migration; negative regulation of neuron migration; neuron projection morphogenesis; actin filament severing; filopodium assembly; negative regulation of cell death; nervous system development; dendritic spine development; substrate adhesion-dependent cell spreading; extension of a leading process involved in cell motility in cerebral cortex radial glia guided migration; cell population proliferation; regulation of small GTPase mediated signal transduction; signal transduction; positive regulation of GTPase activity; negative regulation of cell migration;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23380
	14270
	ENSG00000266028
	ENSMUSG00000026425
	О75044
	Q91Z67
showНМ_001042758 ; НМ_001170637 ; НМ_001300952 ; НМ_015326 ; НМ_001377444 ;
	NM_001377445; NM_001377446; NM_001377447
	НМ_001081011 ; НМ_019520
showНП_001164108 ; НП_001287881 ; НП_056141 ; НП_001364373 ; НП_001364374 ;
	NP_001364375; NP_001364376
	НП_001074480
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 2, активирующий ГТФазу Rho SLIT-ROBO ( srGAP2 ), также известный как формин-связывающий белок 2 ( FNBP2 ), представляет собой млекопитающих белок , который у человека кодируется SRGAP2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Он участвует в миграции и дифференцировке нейронов. ^{[ 7 ]} и играет решающую роль в синаптическом развитии , ^{[ 8 ]} масса мозга и количество корковых нейронов. ^{[ 9 ]} Снижение уровня регуляции srGAP2 ингибирует межклеточное отталкивание и увеличивает продолжительность межклеточного контакта.

SRGAP2 димеризуется через свой домен F-BAR . ^{[ 10 ]} SRGAP2C , укороченная версия, обнаруженная у ранних гомининов и людей и имеющая только домен F-BAR, противодействует его действию. Он замедляет созревание некоторых нейронов и увеличивает плотность нейронных отростков. ^{[ 10 ]}

Эволюция

SRGAP2 — один из 23 генов, которые, как известно, дублируются у людей, но не у других приматов . ^{[ 11 ]} SRGAP2 трижды дублировался в геноме человека за последние 3,4 миллиона лет: одно дублирование 3,4 миллиона лет назад (млн лет назад) под названием SRGAP2B , за которым последовали два, которые копировали SRGAP2B 2,4 млн лет назад в SRGAP2C и ~1 млн лет назад в SRGAP2D . Все три дупликации также присутствуют у денисовцев и неандертальцев . ^{[ 12 ]} Они укорачиваются таким же образом, сохраняя домен F-box , но теряя домены RhoGAP и SH3 . ^{[ 13 ]} Все люди обладают SRGAP2C. ^{[ 14 ]} SRGAP2C ингибирует функцию предковой копии SRGAP2A путем гетеродимеризации и обеспечивает более быструю миграцию нейронов, препятствуя образованию филоподий , а также замедляя скорость синаптического созревания и увеличивая плотность синапсов в коре головного мозга . ^{[ 8 ]} SRGAP2B экспрессируется на очень низком уровне, а SRGAP2D является псевдогеном . Не у всех людей есть SRGAP2B или SRGAP2D. ^{[ 13 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000266028 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026425 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Мадура Т., Ямасита Т., Кубо Т., Цудзи Л., Хосокава К., Тохьяма М. (апрель 2004 г.). «Изменения в мРНК белка 2, активирующего ГТФазу Slit-Robo, после перерезки лицевого нерва». Исследования мозга. Молекулярные исследования мозга . 123 (1–2): 76–80. doi : 10.1016/j.molbrainres.2004.01.002 . PMID 15046868 .
^ Вонг К., Рен XR, Хуан Ю.З., Се Ю., Лю Г., Сайто Х., Тан Х., Вэнь Л., Брейди-Калнай С.М., Мэй Л., Ву Цзюй, Сюн В.К., Рао Ю. (октябрь 2001 г.). «Передача сигнала при миграции нейронов: роль белков, активирующих ГТФазу, и небольшой ГТФазы Cdc42 в пути Slit-Robo» . Клетка . 107 (2): 209–21. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00530-X . ПМИД 11672528 . S2CID 2458943 .
^ Герье С., Коутиньо-Бадд Дж., Сасса Т., Грессет А., Джордан Н.В., Чен К., Джин В.Л., Фрост А., Полле Ф. (сентябрь 2009 г.). «Домен F-BAR srGAP2 индуцирует выпячивания мембраны, необходимые для миграции и морфогенеза нейронов» . Клетка . 138 (5): 990–1004. дои : 10.1016/j.cell.2009.06.047 . ПМЦ 2797480 . ПМИД 19737524 .
^ Jump up to: ^а ^б Чарьер С, Джоши К., Коутиньо-Бадд Дж., Ким Дж. Э., Ламберт Н., де Марчена Дж., Джин В. Л., Вандерхэген П., Гош А., Сасса Т., Поллё Ф. (май 2012 г.). «Подавление функции SRGAP2 его паралогами, специфичными для человека, вызывает неотению во время созревания позвоночника» . Клетка . 149 (4): 923–35. дои : 10.1016/j.cell.2012.03.034 . ПМЦ 3357949 . ПМИД 22559944 .
^ Тивари, БК (2016). «Эволюция гена SRGAP2 связана с интеллектом млекопитающих» . Биомедицинский центр . 1 (1). Каргер: 1–12. дои : 10.1159/000443947 . ПМЦ 6945801 . ПМИД 31988884 .
^ Jump up to: ^а ^б Чанг, Синь-Ю (22 сентября 2017 г.). «Что такое обезьяна» . Блог ИнтерПро . Проверено 27 марта 2019 г.
^ Судмант П.Х., Кицман Дж.О., Антоначчи Ф., Алкан С., Малиг М., Цаленко А., Сампас Н., Брюн Л., Шендуре Дж., Эйхлер Э.Э. (октябрь 2010 г.). «Разнообразие вариаций числа копий человека и многокопийных генов» . Наука . 330 (6004): 641–6. Бибкод : 2010Sci...330..641S . дои : 10.1126/science.1197005 . ПМК 3020103 . ПМИД 21030649 .
^ Мартинс, Педро Джеймс; Мари, Матиес; Бёккс, Седрик (01 января 2018 г.). «SRGAP2 и постепенная эволюция современного человеческого языкового факультета» . Журнал эволюции языка . 3 (1): 67–78. дои : 10.1093/jole/lzx020 . ISSN 2058-4571 .
^ Jump up to: ^а ^б Спорный, М; Гес-Хаддад, Дж; Креуш, А; Шакарци, С; Незнанский А; Кросс, А; Исупов, Миннесота; Квалманн, Б; Кессельс, ММ; Опатовский, Ю. (1 июня 2017 г.). «Структурная история белков SRGAP2 человека» . Молекулярная биология и эволюция . 34 (6): 1463–1478. дои : 10.1093/molbev/msx094 . ПМК 5435084 . ПМИД 28333212 .
^
Деннис М.Ю., Наттл Икс, Судмант П.Х., Антоначчи Ф., Грейвс Т.А., Нефедов М., Розенфельд Дж.А., Саджадян С., Малиг М., Коткевич Х., Карри С.Дж., Шафер С., Шаффер Л.Г., де Йонг П.Дж., Уилсон Р.К., Эйхлер Э.Э. (май 2012). «Эволюция специфических для человека нейронных генов SRGAP2 путем неполной сегментной дупликации» . Клетка . 149 (4): 912–22. дои : 10.1016/j.cell.2012.03.033 . ПМЦ 3365555 . ПМИД 22559943 .
- Разместить резюме в: Хесман Саэй Т (13 октября 2011 г.). «Удвоенный ген означает дополнительный ум» . Новости науки .

Внешние ссылки

Генные карты

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000266028 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026425 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid15046868-5] Мадура Т., Ямасита Т., Кубо Т., Цудзи Л., Хосокава К., Тохьяма М. (апрель 2004 г.). «Изменения в мРНК белка 2, активирующего ГТФазу Slit-Robo, после перерезки лицевого нерва». Исследования мозга. Молекулярные исследования мозга . 123 (1–2): 76–80. doi : 10.1016/j.molbrainres.2004.01.002 . PMID 15046868 .

[pmid11672528-6] Вонг К., Рен XR, Хуан Ю.З., Се Ю., Лю Г., Сайто Х., Тан Х., Вэнь Л., Брейди-Калнай С.М., Мэй Л., Ву Цзюй, Сюн В.К., Рао Ю. (октябрь 2001 г.). «Передача сигнала при миграции нейронов: роль белков, активирующих ГТФазу, и небольшой ГТФазы Cdc42 в пути Slit-Robo» . Клетка . 107 (2): 209–21. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00530-X . ПМИД 11672528 . S2CID 2458943 .

[7] Герье С., Коутиньо-Бадд Дж., Сасса Т., Грессет А., Джордан Н.В., Чен К., Джин В.Л., Фрост А., Полле Ф. (сентябрь 2009 г.). «Домен F-BAR srGAP2 индуцирует выпячивания мембраны, необходимые для миграции и морфогенеза нейронов» . Клетка . 138 (5): 990–1004. дои : 10.1016/j.cell.2009.06.047 . ПМЦ 2797480 . ПМИД 19737524 .

[Charrier_C,_Johi_K,_Charrier_C,_Joshi_K,_Coutinho-Budd_J,_Kim_JE,_Lambert_N,_de_Marchena_J,_Jin_WL,_Vanderhaeghen_P,_Ghosh_A,_Sassa_T,_Polleux_F._923–935-8] Jump up to: ^а ^б Чарьер С, Джоши К., Коутиньо-Бадд Дж., Ким Дж. Э., Ламберт Н., де Марчена Дж., Джин В. Л., Вандерхэген П., Гош А., Сасса Т., Поллё Ф. (май 2012 г.). «Подавление функции SRGAP2 его паралогами, специфичными для человека, вызывает неотению во время созревания позвоночника» . Клетка . 149 (4): 923–35. дои : 10.1016/j.cell.2012.03.034 . ПМЦ 3357949 . ПМИД 22559944 .

[9] Тивари, БК (2016). «Эволюция гена SRGAP2 связана с интеллектом млекопитающих» . Биомедицинский центр . 1 (1). Каргер: 1–12. дои : 10.1159/000443947 . ПМЦ 6945801 . ПМИД 31988884 .

[:0-10] Jump up to: ^а ^б Чанг, Синь-Ю (22 сентября 2017 г.). «Что такое обезьяна» . Блог ИнтерПро . Проверено 27 марта 2019 г.

[11] Судмант П.Х., Кицман Дж.О., Антоначчи Ф., Алкан С., Малиг М., Цаленко А., Сампас Н., Брюн Л., Шендуре Дж., Эйхлер Э.Э. (октябрь 2010 г.). «Разнообразие вариаций числа копий человека и многокопийных генов» . Наука . 330 (6004): 641–6. Бибкод : 2010Sci...330..641S . дои : 10.1126/science.1197005 . ПМК 3020103 . ПМИД 21030649 .

[12] Мартинс, Педро Джеймс; Мари, Матиес; Бёккс, Седрик (01 января 2018 г.). «SRGAP2 и постепенная эволюция современного человеческого языкового факультета» . Журнал эволюции языка . 3 (1): 67–78. дои : 10.1093/jole/lzx020 . ISSN 2058-4571 .

[pmid28333212-13] Jump up to: ^а ^б Спорный, М; Гес-Хаддад, Дж; Креуш, А; Шакарци, С; Незнанский А; Кросс, А; Исупов, Миннесота; Квалманн, Б; Кессельс, ММ; Опатовский, Ю. (1 июня 2017 г.). «Структурная история белков SRGAP2 человека» . Молекулярная биология и эволюция . 34 (6): 1463–1478. дои : 10.1093/molbev/msx094 . ПМК 5435084 . ПМИД 28333212 .

[Dennis_2012-14] Деннис М.Ю., Наттл Икс, Судмант П.Х., Антоначчи Ф., Грейвс Т.А., Нефедов М., Розенфельд Дж.А., Саджадян С., Малиг М., Коткевич Х., Карри С.Дж., Шафер С., Шаффер Л.Г., де Йонг П.Дж., Уилсон Р.К., Эйхлер Э.Э. (май 2012). «Эволюция специфических для человека нейронных генов SRGAP2 путем неполной сегментной дупликации» . Клетка . 149 (4): 912–22. дои : 10.1016/j.cell.2012.03.033 . ПМЦ 3365555 . ПМИД 22559943 .
Разместить резюме в: Хесман Саэй Т (13 октября 2011 г.). «Удвоенный ген означает дополнительный ум» . Новости науки .

[15] Разместить резюме в: Хесман Саэй Т (13 октября 2011 г.). «Удвоенный ген означает дополнительный ум» . Новости науки .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]