Белок F-бокса
| Домен компоновщика F-box | |||
|---|---|---|---|
 Структура линкерного домена LRR Skp2 в комплексе Skp1-Skp2. [ 1 ] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | F-бокс | ||
| Пфам | PF00646 | ||
| Пфам Клан | CL0271 | ||
| ИнтерПро | ИПР001810 | ||
| УМНЫЙ | SM00256 | ||
| PROSITE | PS50181 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1фс2 / СКОПе / СУПФАМ | ||
| Мембраном | 630 | ||
| |||
Белки F-box представляют собой белки, содержащие по меньшей мере один домен F-box. Первый идентифицированный белок F-box является одним из трех компонентов комплекса SCF , который опосредует убиквитинирование белков, предназначенных для деградации с помощью 26S протеасомы .
Основные компоненты
[ редактировать ]Домен F-box представляет собой белка структурный мотив , состоящий примерно из 50 аминокислот , который опосредует белок-белковые взаимодействия . Он имеет консенсусную последовательность и варьируется в нескольких позициях. Впервые он был идентифицирован в циклине F. [ 2 ] Мотив F-box Skp2, состоящий из трех альфа-спиралей, напрямую взаимодействует с белком SCF Skp1 . [ 3 ] Домены F-box обычно существуют в белках при раке с другими мотивами межбелкового взаимодействия, такими как богатые лейцином повторы (показаны на рисунке) и повторы WD , которые, как полагают, опосредуют взаимодействия с субстратами SCF. [ 4 ]
Функция
[ редактировать ]Белки F-box также связаны с клеточными функциями, такими как передача сигнала и регуляция клеточного цикла . [ 5 ] У растений многие белки F-box представлены в генных сетях, широко регулируемых микроРНК -опосредованным молчанием генов посредством РНК-интерференции . [ 6 ] Белки F-box участвуют в вегетативном и репродуктивном росте и развитии многих растений. Например, белок F-box-FOA1 участвует в передаче сигналов абсцизовой кислоты (АБК), влияющих на прорастание семян. [ 7 ] ACRE189/ACIF1 может регулировать гибель и защиту клеток, когда возбудитель распознается в растении табака и томата. [ 8 ]
В клетках человека в условиях высокого содержания железа два атома железа стабилизируют F-Box FBXL5 , а затем комплекс опосредует убиквитинирование IRP2 . [ 9 ]
Регулирование
[ редактировать ]Уровни белка F-box могут регулироваться различными механизмами. Регуляция может происходить посредством процесса деградации белка и ассоциации с комплексом SCF. Например, у дрожжей белок F-бокс Met30 может быть убиквитинирован куллинозависимым способом. [ 10 ] [11]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Шульман Б.А., Каррано А.С., Джеффри П.Д. и др. (ноябрь 2000 г.). «Изучение убиквитинлигаз SCF на основе структуры комплекса Skp1-Skp2». Природа . 408 (6810): 381–6. Бибкод : 2000Natur.408..381S . дои : 10.1038/35042620 . ПМИД 11099048 . S2CID 4300503 .
- ^ Бай С., Сен П., Хофманн К., Ма Л., Гебл М., Харпер Дж.В., Элледж С.Дж. «SKP1 соединяет регуляторы клеточного цикла с механизмом протеолиза убиквитина посредством нового мотива, F-бокса». Ячейка 86 263-74 1996 г.
- ^ Бай С., Сен П., Хофманн К., Ма Л., Гебл М., Харпер Дж.В., Элледж С.Дж. (июль 1996 г.). «SKP1 соединяет регуляторы клеточного цикла с механизмом протеолиза убиквитина посредством нового мотива, F-бокса». Клетка . 86 (2): 263–74. два : 10.1016/S0092-8674(00)80098-7 . ПМИД 8706131 .
- ^ Кипреос Э.Т., Пагано М. (2000). «Семейство белков F-box» . Геном Биол . 1 (5): ОБЗОРЫ3002. doi : 10.1186/gb-2000-1-5-reviews3002 . ПМЦ 138887 . ПМИД 11178263 .
- ^ Крейг К.Л., Тайерс М. (1999). «F-box: новый мотив убиквитинзависимого протеолиза в регуляции клеточного цикла и передаче сигналов» . Прог. Биофиз. Мол. Биол . 72 (3): 299–328. дои : 10.1016/S0079-6107(99)00010-3 . ПМИД 10581972 .
- ^ Джонс-Роудс М.В., Бартель Д.П., Бартель Б. (2006). «МикроРНК и их регуляторная роль в растениях». Annu Rev Plant Biol . 57 : 19–53. doi : 10.1146/annurev.arplant.57.032905.105218 . ПМИД 16669754 .
- ^ Пэн, Хуан; Ван, Лицюнь; Се, Юань, Цунъин; Ван, Дунъин; Чжао, Лю, Сюаньмин (июнь 2012 г.) «Ген F-бокса FOA1». Передача сигналов ABA». Science China Life Sciences . 55 (6): 497–506. дои : 10.1007/s11427-012-4332-9 . ISSN 1869-1889. ПМИД 22744179.
- ^ Ха, Ван Ден Бург; Цицигианнис, Д.И.; Роуленд, О; Ло, Дж; Раллапалли, Дж; Маклин, Д.; Спасибо, Флорида; Джонс, Джей Ди (2008). «Белок F-box ACRE189/ACIF1 регулирует гибель клеток и защитные реакции, активируемые во время распознавания патогенов в табаке и томатах». Растительная клетка 20 (3): 697.
- ^ Мороиси, Т; Нисияма, М; Такеда, Ю; Иваи, К; Накаяма, К.И. (2011). «Ось FBXL5-IRP2 является неотъемлемой частью контроля метаболизма железа in vivo». Клеточный метаболизм . 14 (3): 339.
- ^ Кайзер, Питер; Су, Нин-Юань; Йен, Джеймс Л.; Оуни, Икрам; Флик, Карин (8 августа 2006 г.). «Дрожжевая убиквитинлигаза SCFMet30: связь условий окружающей среды и внутриклеточных условий с делением клеток». Отделение клеток . 1:16 . дои : 10.1186/1747-1028-1-16 . ISSN 1747-1028 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Хо М, Цай П, Чиен С (2006). «Белки F-box: ключ к деградации белков» . J Biomed Sci . 13 (2): 181–91. дои : 10.1007/s11373-005-9058-2 . ПМИД 16463014 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- F-Box + Proteins в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
- F-box + мотивы Национальной медицинской библиотеки США в медицинских предметных рубриках (MeSH)