ФАБП7

ФАБП7
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1FDQ, 1FE3, 1JJX
Идентификаторы
Псевдонимы	FABP7 , B-FABP, BLBP, FABPB, MRG, LTR2-белок 7, связывающий жирные кислоты
Внешние идентификаторы	Опустить : 602965 ; МГИ : 101916 ; Гомологен : 37880 ; Генные карты : FABP7 ; ОМА : FABP7 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	122,784,074 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	57,664,546 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; cerebellar vermis; ; spinal ganglia; ; skin of thigh; ; cerebellar hemisphere; ; right hemisphere of cerebellum; ; paraflocculus of cerebellum; ; amygdala; ; vulva;
	Top expressed in
	olfactory bulb; ; medial ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; trigeminal ganglion; ; barrel cortex; ; optic nerve; ; superior cervical ganglion; ; neural tube; ; olfactory epithelium; ; fossa;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	lipid binding;
Cellular component	cell body; neuronal cell body; cell projection; cell periphery; nucleus; cell-cell junction; cytoplasm; cytosol;
Biological process	negative regulation of cell population proliferation; triglyceride catabolic process; neurogenesis; epithelial cell proliferation; cell proliferation in forebrain; startle response; nervous system development; prepulse inhibition;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	2173
	12140
	ENSG00000164434
	ENSMUSG00000019874
	О15540
	P51880
	НМ_001446 ; НМ_001319039 ; НМ_001319041 ; НМ_001319042
	НМ_021272
	НП_001305968 ; НП_001305970 ; НП_001305971 ; НП_001437
	НП_067247
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 7, связывающий жирные кислоты, мозг ( FABP7 ; также белок, связывающий липиды мозга , BLBP человека ), является геном . ^{[ 5 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой белок, связывающий жирные кислоты мозга. Белки, связывающие жирные кислоты (FABP), представляют собой семейство небольших высококонсервативных цитоплазматических белков, которые связывают длинноцепочечные жирные кислоты и другие гидрофобные лиганды. Считается, что FABP играют роль в жирных кислот . поглощении, транспортировке и метаболизме ^{[ 5 ]}

FABP7 экспрессируется во время развития в радиальной глии путем активации рецепторов Notch . ^{[ 6 ]} Было показано, что рилин индуцирует экспрессию FABP7 в нервных клетках-предшественниках посредством активации Notch-1 . ^{[ 7 ]}

Согласно одному исследованию, FABP7 связывает DHA с самым высоким сродством среди всех FABP. ^{[ 8 ]}

Экспрессия белка Fabp7 в мозге мышей на 16-й день эмбрионального развития (слева) и на 0-й день постнатального развития (справа). На обеих стадиях Fabp7 сильно экспрессируется в желудочковой зоне и радиальной глии , где нейрогенез . выражен

Роль в патологии

FABP7 картируется на человеческой хромосоме 6q22.31, области сцепления шизофрении , что подтверждено метаанализом. ^{[ 9 ]}

По состоянию на 2008 год было проведено два исследования FABP7 как возможного гена риска шизофрении . ^{[ 10 ]} с одним, который протестировал только один SNP, показал отрицательный результат ^{[ 11 ]} и еще один, с семью SNP, ^{[ 12 ]} положительный результат. Эффект гена в последнем исследовании был сильнее у мужчин. Это исследование также связало вариацию FABP7 со слабым предимпульсным торможением у мышей; дефицит ИПП — эндофенотипический признак, наблюдаемый у больных шизофренией и их родственников.

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000164434 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019874 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: белок 7, связывающий жирные кислоты FABP7, мозг» .
^ Энтони Т.Э., Мейсон Х.А., Гридли Т., Фишелл Г., Хайнц Н. (май 2005 г.). «Мозговой липидсвязывающий белок является прямой мишенью передачи сигналов Notch в радиальных глиальных клетках» . Гены и развитие . 19 (9): 1028–33. дои : 10.1101/gad.1302105 . ПМЦ 1091737 . ПМИД 15879553 .
^ Кейлани С., Сугая К. (июль 2008 г.). «Рилин индуцирует фенотип радиальной глии в нервных клетках-предшественниках человека путем активации Notch-1» . Биология развития BMC . 8 (1): 69. дои : 10.1186/1471-213X-8-69 . ПМЦ 2447831 . ПМИД 18593473 .
^ Сюй Л.З., Санчес Р., Сали А., Хайнц Н. (октябрь 1996 г.). «Лигандная специфичность липидсвязывающего белка головного мозга» . Журнал биологической химии . 271 (40): 24711–9. дои : 10.1074/jbc.271.40.24711 . ПМИД 8798739 .
^ Льюис СМ, Левинсон Д.Ф., Уайз Л.Х., ДеЛизи Л.Е., Штрауб Р.Э., Оватта И., Уильямс Н.М., Шваб С.Г., Пулвер А.Е., Фараоне С.В., Бжустович Л.М., Кауфманн К.А., Гарвер Д.Л., Гурлинг Х.М., Линдхольм Э., Кун Х., Мойзес Х.В. , Байерли В., Шоу Ш., Месен А., Шеррингтон Р., О'Нил Ф.А., Уолш Д., Кендлер К.С., Экелунд Дж., Паунио Т., Лённквист Дж., Пелтонен Л., О'Донован М.К., Оуэн М.Дж., Вильденауэр Д.Б., Майер В., Нештадт Дж., Блуин Дж.Л., Антонаракис С.Э., Моури Б.Дж., Сильверман Дж.М., Кроу Р.Р., Клонингер Ч.Р., Цуанг М.Т., Маласпина Д., Харкави-Фридман Дж.М., Свракич Д.М., Бассетт А.С., Холкомб Дж., Калси Г., Маккуиллин А., Бриньольфсон Дж., Зигмундссон Т., Петурссон Х., Джазин Э., Зоэга Т., Хельгасон Т. (июль 2003 г.). «Метаанализ сканирования генома шизофрении и биполярного расстройства, часть II: Шизофрения» . Американский журнал генетики человека . 73 (1): 34–48. дои : 10.1086/376549 . ПМК 1180588 . ПМИД 12802786 .
^ Обзор генов всех опубликованных исследований ассоциации шизофрении для FABP7 - база данных SZGene на веб-сайте Форума исследований шизофрении.
^ Юнгериус Б.Дж., Хугендорн М.Л., Баккер СК, Вант Слот Р., Бардоэль А.Ф., Офофф Р.А., Вейменга К., Кан Р.С., Синке Р.Дж. (ноябрь 2008 г.). «Скрининг ассоциаций генов, связанных с миелином, выявил участие гена PIK4CA хромосомы 22q11 в развитии шизофрении» . Молекулярная психиатрия . 13 (11): 1060–8. дои : 10.1038/sj.mp.4002080 . ПМИД 17893707 .
^ Ватанабе А, Тойота Т, Овада Ю, Хаяси Т, Иваяма Ю, Мацумата М, Исицука Ю, Накая А, Маекава М, Ониси Т, Араи Р, Сакураи К, Ямада К, Кондо Х, Хашимото К, Осуми Н, Ёсикава Т (ноябрь 2007 г.). «Fabp7 соответствует локусу количественных признаков эндофенотипа шизофрении» . ПЛОС Биология . 5 (11): е297. doi : 10.1371/journal.pbio.0050297 . ПМК 2071943 . ПМИД 18001149 .

Дальнейшее чтение

Бёрхерс Т., Хохофф С., Бюльман С., Шпенер Ф. (июль 1997 г.). «Белок, связывающий жирные кислоты сердечного типа - участие в ингибировании роста и дифференцировке». Простагландины, лейкотриены и незаменимые жирные кислоты . 57 (1): 77–84. дои : 10.1016/S0952-3278(97)90496-8 . ПМИД 9250612 .
Сюй Л.З., Санчес Р., Сали А., Хайнц Н. (октябрь 1996 г.). «Лигандная специфичность липидсвязывающего белка головного мозга» . Журнал биологической химии . 271 (40): 24711–9. дои : 10.1074/jbc.271.40.24711 . ПМИД 8798739 .
Янг Дж. К., Бейкер Дж. Х., Мюллер Т. (март 1996 г.). «Иммунореактивность белка, связывающего жирные кислоты головного мозга, в гомори-положительных астроцитах». Глия . 16 (3): 218–26. doi : 10.1002/(SICI)1098-1136(199603)16:3<218::AID-GLIA4>3.0.CO;2-Y . ПМИД 8833192 . S2CID 9757285 .
Ши Й., Ни Дж., Сяо Г., Лю Й. Е., Фукс А., Ю Г., Су Дж., Косгроув Дж. М., Син Л., Чжан М., Ли Дж., Аггарвал Б. Б., Мигер А., Генц Р. (август 1997 г.). «Противоопухолевая активность нового ингибитора роста рака молочной железы человека, гена, связанного с ингибитором роста молочной железы, MRG». Исследования рака . 57 (15): 3084–91. ПМИД 9242429 .
Симидзу Ф., Ватанабэ Т.К., Синомия Х., Накамура Ю., Фудзивара Т. (октябрь 1997 г.). «Выделение и экспрессия кДНК белка, связывающего жирные кислоты головного мозга человека (B-FABP)». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1354 (1): 24–8. дои : 10.1016/S0167-4781(97)00115-2 . ПМИД 9375786 .
Годбаут Р., Бисгроув Д.А., Школьный Д., Дэй Р.С. (апрель 1998 г.). «Корреляция экспрессии B-FABP и GFAP при злокачественной глиоме» . Онкоген . 16 (15): 1955–62. дои : 10.1038/sj.onc.1201740 . ПМИД 9591779 .
Пу Л, Игбавбоа У, Вуд В.Г., Ротс Дж.Б., Кир А.Б., Спенер Ф., Шредер Ф. (август 1999 г.). «Экспрессия белков, связывающих жирные кислоты, изменяется в мозге старых мышей». Молекулярная и клеточная биохимия . 198 (1–2): 69–78. дои : 10.1023/А:1006946027619 . ПМИД 10497880 . S2CID 6180992 .
Балендиран Г.К., Шнутген Ф., Скапен Г., Борчерс Т., Кхонг Н., Лим К., Годбоут Р., Спенер Ф., Саккеттини Дж.К. (сентябрь 2000 г.). «Кристаллическая структура и термодинамический анализ белка, связывающего жирные кислоты головного мозга человека» . Журнал биологической химии . 275 (35): 27045–54. дои : 10.1074/jbc.M003001200 . ПМИД 10854433 .
Радемахер М., Циммерман А.В., Рютерьянс Х., Веркамп Дж.Х., Люке К. (октябрь 2002 г.). «Структура раствора белка, связывающего жирные кислоты, из мозга человека». Молекулярная и клеточная биохимия . 239 (1–2): 61–8. дои : 10.1023/А:1020566909213 . ПМИД 12479569 . S2CID 24296178 .
Миллер С.Дж., Ли Х., Ризви Т.А., Хуанг Й., Йоханссон Дж., Бауэрсок Дж., Сидани А., Витулло Дж., Фогель К., Парысек Л.М., ДеКлю Дж.Э., Ратнер Н. (март 2003 г.). «Мозговой липидсвязывающий белок во взаимодействии аксон-шванновских клеток и опухолеобразовании периферических нервов» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (6): 2213–24. дои : 10.1128/MCB.23.6.2213-2224.2003 . ПМК 149461 . ПМИД 12612091 .
Санчес-Фонт М.Ф., Бош-Комас А., Гонсалес-Дуарте Р., Марфани Г. (июнь 2003 г.). «Сверхэкспрессия FABP7 в мозге плода с синдромом Дауна связана с дисбалансом дозировки гена PKNOX1» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (11): 2769–77. дои : 10.1093/нар/gkg396 . ПМК 156729 . ПМИД 12771203 .
Ван М., Лю Е., Голдберг И.Д., Ши Е. (ноябрь 2003 г.). «Индукция дифференцировки молочных желез у трансгенных мышей с помощью белка MRG, связывающего жирные кислоты» . Журнал биологической химии . 278 (47): 47319–25. дои : 10.1074/jbc.M308131200 . ПМИД 12975368 .
Лян Й., Дин М., Уотсон Н., Боллен А.В., Алдапе К.Д., Николас М.К., Ламборн К.Р. , Бергер М.С., Ботштейн Д., Браун П.О., Израиль, Массачусетс (апрель 2005 г.). «Профилирование экспрессии генов выявляет молекулярно и клинически различные подтипы мультиформной глиобластомы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (16): 5814–9. Бибкод : 2005PNAS..102.5814L . дои : 10.1073/pnas.0402870102 . ПМК 556127 . ПМИД 15827123 .
Лян Й., Боллен А.В., Алдапе К.Д., Гупта Н. (2006). «Ядерная иммунореактивность FABP7 преимущественно выражена при инфильтративной глиоме и связана с плохим прогнозом при глиобластоме со сверхэкспрессией EGFR» . БМК Рак . 6:97 . дои : 10.1186/1471-2407-6-97 . ПМЦ 1479358 . ПМИД 16623952 .
Калоши Г., Мохтари К., Карпентье С., Тайлибер С., Лежен Дж., Мари Ю., Делатр Ж.Ю., Годбаут Р., Сансон М. (сентябрь 2007 г.). «Экспрессия FABP7 в глиобластомах: связь с прогнозом, инвазией и статусом EGFR». Журнал нейроонкологии . 84 (3): 245–8. дои : 10.1007/s11060-007-9377-4 . ПМИД 17415524 . S2CID 23880935 .
Такаока Н., Такаяма Т., Тератани Т., Сугияма Т., Мугия С., Озоно С. (2011). «Анализ регуляции экспрессии белка 7, связывающего жирные кислоты, в клеточных линиях карциномы почки человека» . BMC Молекулярная биология . 12 (1): 31. дои : 10.1186/1471-2199-12-31 . ПМК 3162894 . ПМИД 21771320 .

Внешние ссылки

Шизофрения, испуганная реакция и Fabp7: будущие изменения в диете для матерей из группы риска? Блог ежедневных новостей о шизофрении, 7 ноября 2007 г.
Гросс Л (2007). «Ген-кандидат в биологический маркер шизофрении у мышей» . ПЛОС Биология . 5 (11): е320. doi : 10.1371/journal.pbio.0050320 . ПМК 2071941 . ПМИД 20076655 . - синопсис для широкой аудитории.
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O15540 (белок, связывающий жирные кислоты, мозг) в PDBe-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000164434 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019874 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: белок 7, связывающий жирные кислоты FABP7, мозг» .

[pmid15879553-6] Энтони Т.Э., Мейсон Х.А., Гридли Т., Фишелл Г., Хайнц Н. (май 2005 г.). «Мозговой липидсвязывающий белок является прямой мишенью передачи сигналов Notch в радиальных глиальных клетках» . Гены и развитие . 19 (9): 1028–33. дои : 10.1101/gad.1302105 . ПМЦ 1091737 . ПМИД 15879553 .

[pmid18593473-7] Кейлани С., Сугая К. (июль 2008 г.). «Рилин индуцирует фенотип радиальной глии в нервных клетках-предшественниках человека путем активации Notch-1» . Биология развития BMC . 8 (1): 69. дои : 10.1186/1471-213X-8-69 . ПМЦ 2447831 . ПМИД 18593473 .

[pmid8798739-8] Сюй Л.З., Санчес Р., Сали А., Хайнц Н. (октябрь 1996 г.). «Лигандная специфичность липидсвязывающего белка головного мозга» . Журнал биологической химии . 271 (40): 24711–9. дои : 10.1074/jbc.271.40.24711 . ПМИД 8798739 .

[pmid12802786-9] Льюис СМ, Левинсон Д.Ф., Уайз Л.Х., ДеЛизи Л.Е., Штрауб Р.Э., Оватта И., Уильямс Н.М., Шваб С.Г., Пулвер А.Е., Фараоне С.В., Бжустович Л.М., Кауфманн К.А., Гарвер Д.Л., Гурлинг Х.М., Линдхольм Э., Кун Х., Мойзес Х.В. , Байерли В., Шоу Ш., Месен А., Шеррингтон Р., О'Нил Ф.А., Уолш Д., Кендлер К.С., Экелунд Дж., Паунио Т., Лённквист Дж., Пелтонен Л., О'Донован М.К., Оуэн М.Дж., Вильденауэр Д.Б., Майер В., Нештадт Дж., Блуин Дж.Л., Антонаракис С.Э., Моури Б.Дж., Сильверман Дж.М., Кроу Р.Р., Клонингер Ч.Р., Цуанг М.Т., Маласпина Д., Харкави-Фридман Дж.М., Свракич Д.М., Бассетт А.С., Холкомб Дж., Калси Г., Маккуиллин А., Бриньольфсон Дж., Зигмундссон Т., Петурссон Х., Джазин Э., Зоэга Т., Хельгасон Т. (июль 2003 г.). «Метаанализ сканирования генома шизофрении и биполярного расстройства, часть II: Шизофрения» . Американский журнал генетики человека . 73 (1): 34–48. дои : 10.1086/376549 . ПМК 1180588 . ПМИД 12802786 .

[SZGeneDB-10] Обзор генов всех опубликованных исследований ассоциации шизофрении для FABP7 - база данных SZGene на веб-сайте Форума исследований шизофрении.

[pmid17893707-11] Юнгериус Б.Дж., Хугендорн М.Л., Баккер СК, Вант Слот Р., Бардоэль А.Ф., Офофф Р.А., Вейменга К., Кан Р.С., Синке Р.Дж. (ноябрь 2008 г.). «Скрининг ассоциаций генов, связанных с миелином, выявил участие гена PIK4CA хромосомы 22q11 в развитии шизофрении» . Молекулярная психиатрия . 13 (11): 1060–8. дои : 10.1038/sj.mp.4002080 . ПМИД 17893707 .

[pmid18001149-12] Ватанабе А, Тойота Т, Овада Ю, Хаяси Т, Иваяма Ю, Мацумата М, Исицука Ю, Накая А, Маекава М, Ониси Т, Араи Р, Сакураи К, Ямада К, Кондо Х, Хашимото К, Осуми Н, Ёсикава Т (ноябрь 2007 г.). «Fabp7 соответствует локусу количественных признаков эндофенотипа шизофрении» . ПЛОС Биология . 5 (11): е297. doi : 10.1371/journal.pbio.0050297 . ПМК 2071943 . ПМИД 18001149 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

v т и Белки : белки-носители
Fatty acid	FABP1 FABP2 FABP3 FABP4 FABP5 FABP6 FABP7
Hormone	peptide hormone: Follistatin Growth hormone binding protein Insulin-like growth factor binding protein IGFBP1 IGFBP2 IGFBP3 IGFBP4 IGFBP5 IGFBP6 IGFBP7 Neurophysins Neurophysin I II steroid hormone: Sex hormone binding globulin/Androgen binding protein Transcortin Thyroxine-binding globulin Transthyretin
Metal/element	calcium Calcium-binding protein Calmodulin-binding proteins copper Ceruloplasmin iron Iron-binding proteins Transferrin receptor
Vitamin	Retinol binding protein 1 2 3 4 Transcobalamin
Pigment	Plant Light-Harvesting Complex Orange Carotenoid Protein Phycobiliprotein Photosynthetic Reaction Centers Phytochrome Rhodopsin
Other	Acyl carrier protein Adaptor protein Cholesterylester transfer protein F-box protein GTP-binding protein Latent TGF-beta binding protein Major urinary proteins Membrane transport protein Odorant binding protein