Ациловый белок-носитель
| Белок-носитель ацил/пептидила | |||
|---|---|---|---|
 | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | ACP-like_sf | ||
| Пфам | PF00550 | ||
| Пфам Клан | CL0314 | ||
| ИнтерПро | ИПР036736 | ||
| PROSITE | PDOC00012 | ||
| КАТ | 1nq4 | ||
| СКОП2 | 1nq4 / СКОПе / СУПФАМ | ||
| |||
Белок -ацил-носитель ( ACP ) является кофактором механизма биосинтеза жирных кислот и поликетидов . Это один из наиболее распространенных белков в клетках E. coli. [1] В обоих случаях растущая цепь связана с АСР через тиоэфир, полученный из дистального тиола 4'- фосфопантетеинового фрагмента.
Структура
[ редактировать ]ACP представляют собой небольшие отрицательно заряженные белки пучка α-спиралей с высокой степенью структурного и аминокислотного сходства. Структуры ряда белков-переносчиков ацилов были решены с использованием различных методов ЯМР и кристаллографии. ACP по структуре и механизму родственны белкам-переносчикам пептидила (PCP) из нерибосомальных пептидсинтаз . [2] [3] [4] [5]
Биосинтез
[ редактировать ]После экспрессии неактивного апо- АПФ 4'-фосфопантетеиновый фрагмент присоединяется к остатку серина. Это связывание опосредовано ацил-протеинсинтазой-переносчиком (ACPS), 4'-фосфопантетеинилтрансферазой . 4'- Фосфопантетеин представляет собой простетическую группу нескольких ацильных белков-переносчиков, включая ацильные белки-переносчики (ACP) синтаз жирных кислот , ACP поликетидсинтаз , пептидильные белки-переносчики (PCP), а также арильные белки-переносчики (ArCP) нерибосомальных пептидсинтетазы (NRPS).
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Кронан, Джон Э. (2014). «Механизм переворота цепи ACP (белка-ацил-переносчика)-зависимых ферментов кажется универсальным». Биохимический журнал . 460 (2): 157–163. дои : 10.1042/BJ20140239 . ПМИД 24825445 .
- ^ Ружейникова А., Болдок С., Саймон В.Дж., Гилрой Дж., Бейкер П.Дж., Стьютье А.Р., Райс Д.В., Слабас А.Р., Рафферти Дж.Б. (июнь 2002 г.). «Рентгеноструктурные исследования бутирил-АПБ выявили гибкость структуры вокруг предполагаемого сайта связывания ацильной цепи» . Структура . 10 (6). Лондон, Англия: 825–35. дои : 10.1016/s0969-2126(02)00775-x . ПМИД 12057197 .
- ^ Кроуфорд Дж. М., Вагстад А. Л., Эрлих К. К., Удвари Д. В., Таунсенд, Калифорния (июль 2008 г.). «Партнерство ацил-переносчика белка-фосфопантетеинилтрансферазы в синтазах жирных кислот грибов» . ХимБиоХим . 9 (10): 1559–63. дои : 10.1002/cbic.200700659 . ПМК 3189688 . ПМИД 18551496 .
- ^ Волкман Б.Ф., Чжан Ц., Дебабов Д.В., Ривера Э., Крешек Г.К., Нойхаус ФК (июль 2001 г.). «Биосинтез D-аланил-липотейхоевой кислоты: третичная структура белка-переносчика апо-D-аланила». Биохимия . 40 (27): 7964–72. дои : 10.1021/bi010355a . ПМИД 11434765 .
- ^ Вебер Т., Баумгартнер Р., Реннер С., Марахил М.А., Холак Т.А. (апрель 2000 г.). «Структура раствора PCP, прототипа пептидильных доменов-носителей модульных пептидсинтетаз» . Структура . 8 (4): 407–18. дои : 10.1016/s0969-2126(00)00120-9 . ПМИД 10801488 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Ацил-белок-носитель Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)